使用譜庫檢索時應注意的問題

為了使檢索結果正確，在使用譜庫檢索時應注意以下幾個問題。
①質譜庫中的標準質譜圖都是在電子轟擊電離源中，用70eV電子束轟擊得到的，所以被檢索的質譜圖也必須是在電子轟擊電離源中，用70eV電子束轟擊得到的，否則檢索結果是不可靠的。
②質譜譜庫中標準質譜圖都是用純化合物得到的，所以被檢索的質譜圖也應該是純化合物的。本底的干擾往往使被檢索的質譜圖發生畸變，所以扣除本底的干擾對檢索的正確與否十分重要。現在的質譜數據系統都帶有本底扣除功能，重要的是如何確定（即選擇）本底，這就要靠實踐經驗。在GC-MS分析中，有時要扣除色譜峰一側的本底，有時要扣除峰兩側的本底。本底扣除時扣除的都是某一段本底的平均值，選擇這一段的長短及位置也是憑經驗決定。
③在總離子流圖中選擇哪次掃描的質譜圖進行檢索，對檢索結果的影響也很重要。當總離子流的峰很強時，選擇峰頂的掃描進行檢索，可能由于峰頂時進入離子源的樣品量太大，在離子源內發生分子-離子反應，使質譜圖發生畸變，得不到正確的檢索結果。筆者就曾發現，當選擇總離子流強度很大的掃描時，由于分子離子反應，出現了（2M+1）⁺，（2M）⁺或（2M-1）⁺的情況。當被檢索的峰前干擾嚴重時（如檢索主峰后的峰時），往往在峰的后沿處選擇質譜圖進行檢索；當被檢索的峰后干擾嚴重時（如檢索主峰前的峰時），往往在峰的前沿處選擇質譜圖進行檢索。這樣做就是要盡可能避免被檢索的質譜圖被其他物質所干擾。
④要注意檢索后給出的匹配度（相似度）最高的化合物并不一定就是要檢索的化合物，還要根據被檢索質譜圖中的基峰，分子離子峰及其已知的某些信息（如是否含某些特殊元素—F、Cl、Br、I、S、N等等，該物質的穩定性、氣味等等），從檢索后給出的一系列化合物中確定被檢索的化合物。