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  • 發布時間:2024-08-22 18:49 原文鏈接: 關于全基因組測序的測序指標介紹

      一、全基因組測序的測序指標— 深度

      測序深度(Sequencing depth)是指測序得到的堿基總量(bp)與基因組大小的比值,它是評價測序量的指標之一。測序深度與基因組覆蓋度之間是一個正相關的關系,測序帶來的錯誤率或假陽性結果會隨著測序深度的提升而下降。測序的個體,如果采用的是雙末端或Mate-Pair方案,當測序深度在50X~100X以上時,基因組覆蓋度和測序錯誤率控制均得以保證,后續序列組裝成染色體才能變得更容易與精準。

      二、全基因組測序的測序指標— 覆蓋度

      測序覆蓋度:基因組被測序得到的堿基覆蓋的比例;測序覆蓋度是反映測序隨機性的指標之一;測序序深度與覆蓋度之間的關系可以過Lander-Waterman Model(1988)來確定。當深度達到5X時,則可覆蓋基因組的約99.4%以上。

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