多級質譜解析為何難？

首先我們要明白為什么質譜，尤其是多級質譜的解析很難，甚至比核磁還難？！這是因為其提供的信息非常有限，NMR可以提供原子層次的信息，而質譜只能提供到基團（多個原子構成的特定組成）層次。這些有限的信息，少到從理論上就不可能推測出一個唯一的結構！是啊，確實如此，就像我們遇到了無解的方程，難道還有比這更難的嗎？

舉個例子，對絕大多少小分子化合物來說，一套NMR圖譜(1H, 13C, HMQC, HMBC)，有經驗的人就可以推測出其結構；而拿來一套小分子的多級質譜，即便有10級的數據，如果解析的人不知道其他背景知識的話，比如樣品是天然產物，還是合成的，若是天然產物，來自什么植物或藥材，有沒有紫外吸收等等，絕大多數情況沒有人可以確切的推出化合物的結構。

看到這里，是不是感覺很失望？既然這么難，為什么非要用質譜分析呢？用NMR不就得啦！不然，質譜的優勢在于其靈敏度高，同時在其與LC聯用以后，就成為一種強大的混合物分子工具（LC-MS），這是NMR不可比擬的。LC-MS成熟以前，若要研究清楚一味藥材中有哪些成份，不花幾年功夫，基本沒戲，一般一個植化的碩士或博士研究清楚一個藥材就可以畢業了!但有了LC-MS，這個過程可能只需要幾個月，甚至幾周就可以獲得以前需要幾年才能獲得的信息！因此，質譜是其他技術暫時無法替代的！