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  • 發布時間:2020-03-30 18:52 原文鏈接: 如何追蹤“敵人”關鍵的基因特性?

      隨著COVID-19疫情在全球范圍內肆虐,來自蒙特利爾大學的生物信息學家如今開始使用人工智能手段來追蹤引發這次大流行的冠狀病毒的遺傳圖譜及特性,研究者Julie Hussin表示,自從SARS-CoV-19在中國出現以來,其已經發生了進化,因此我們需要深入了解它,以便能開發出個體化的疫苗和療法策略。

      如今研究人員發起了一項ColCorona研究來對6000名加拿大COVID-19患者進行相關的藥物測試,他們想通過研究來追蹤SARS-CoV-19的基因特性;研究者表示,病毒的遺傳進化圖譜就好像樹一樣,樹干的基礎是最原始的第一種病毒,其是從蝙蝠傳染給人類的,然而會發生許多變異,從樹干向上延伸到所有樹枝,研究人員將會嘗試利用收集自全球不同地區活病毒中的RNA來對病毒進行非常準確的描述和圖譜繪制。

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    圖片來源:CC0 Public Domain

      研究者利用其在群體遺傳學、統計遺傳學和深度學習方面的專業知識,并與其它研究人員進行合作,最終他們將會在病毒不同的進化階段來進行病毒遺傳序列進行分析,同時他們將會靶向作用與地理區域相關的指標,在這些區域中,患者的COVID-19檢測結果均為陽性。具體而言,研究者非常感興趣的是可能影響人類的病毒毒株與人類宿主之間的相互作用,其或許會依賴于種族、性別、年齡、共患病、處方藥及個人基因等信息,相關知識對于理解流行病學的進化以及設計新型治療手段至關重要。

      計算生物學

      顧名思義,生物信息學旨在通過計算機計算的方式來解決生物學問題,由于病毒是一種活的有機體,生物信息學家相信他們能利用強大的計算機來縮小對病毒遺傳組成和多種突變的研究,目前研究結果尚未公布,但在全球成千上萬個專業的實驗室中,這種病毒引起了很多科學家們極大的關注。

      研究者Hussin的實驗室首先開始檢索關于COVID-19大量的文獻報道,其中有400多項與SARS-CoV-19的病毒基因組相關,研究者解釋道,很多中國研究團隊專注于該病毒的研究,而且在非常短的時間里發表了他們的研究結果,這對于我們而言非常有用,但后期我們需要開展更為廣泛的研究。

      一種吸引人的病毒

      由于其傳播方式的效率,SARS-CoV-19讓研究人員非常著迷,在短短幾個月內,SARS-CoV-19已經傳播到了多個國家,而且如今其還在全球繼續擴散蔓延中,組成病毒DNA的大量堿基已經發生了突變,病毒會對自然選擇產生響應,從而使得最適合的突變得以保留并繼續傳播,這就會使得病毒的傳播更加有效。這一過程也正是研究人員研究的重點,目前研究人員正在通力合作來進行病毒進化及突變的相關研究,后期他們將會專注于研究與人類健康相關的病毒基因組進化相關的研究。


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