布魯克發布全新空間單細胞代謝組學研究策略

　　摘要

　　* 創新的無偏原位空間單細胞代謝組學（SSCM）能夠以單細胞分辨率實現高通量代謝組織樣本表征；

　　* 基于 timsTOF fleX MALDI 的全新 5 μm microGRID 技術可在大視場內提供幾乎無偽影的小分子圖像；

　　* 創新的 4D-代謝組學可通過 CCS-Predict Pro AI/DL 功能預測分子碰撞橫截面（CCS），進一步豐富脂質、代謝物和糖苷的數據庫.

　　2022年6月21日西班牙瓦倫西亞  --在第 18 屆代謝組學學會國際會議上，布魯克公司（納斯達克股票代碼：BRKR）宣布了空間多組學的關鍵創新是無偏空間單細胞代謝組學（SSCM），它被用于探測基于組織和單細胞代謝特征的差異細胞表型。

　　SSCM 與最近發布的 MALDI HiPLEX-IHC 工作流程相結合，可用于原位單細胞免疫代謝組學研究，從而實現了將基于代謝組學的免疫重編程與靶向蛋白質組學的整合。這種單細胞多組學工作流程基于 timsTOF fleX 系統的新型 microGRID smartbeam 3D MALDI 源，可用于亞微米定位、空間分辨率低至 5 微米（5 μm），幾乎消除了 MALDI 分子圖像與光學顯微鏡共定位中的任何偽影。

　　單細胞技術徹底改變了人們對癌癥、再生醫學、衰老和肝病背后的生物過程的異質性的理解。研究細胞間組織變異可以加強轉化研究，例如，在癌癥研究方法領域，開發針對罕見腫瘤細胞的治療方法。

　　德國海德堡 EMBL 代謝組學核心設施和分子醫學合作部門負責人 Theodore Alexandrov 教授，將在丹麥哥本哈根生物創新研究所 BioStudio 工作室主持名為 SpaceM 的新項目，重點研究用于藥物開發和精準醫學的單細胞代謝組學。

　　Alexandrov 博士評論說：“我們正在將 EMBL 海德堡開發的 SpaceM 空間單細胞代謝組學技術，開發成為快速藥物發現的平臺。作為哥本哈根生物創新研究所 BioStudio 項目的一部分，我們將使用 timsTOF fleX MALDI-2 成像系統對單細胞進行快速、靈敏和特異性原位分析，以確定其代謝狀態。此外，最新的 microGRID 技術將為我們提供精準檢測單個細胞所需的高空間分辨率。

　　布魯克公司還推出了用于代謝組學分析與定量的新一代 MetaboScape? 和 TASQ? 軟件。MetaboScape 2022b 集成了 CCS-Predict Pro 機器學習算法，timsTOF 平臺上測量的準確且可重復的 CCS 值可以與從化合物庫或 biotransformation 算法中預測的 CCS 值相匹配，從而為化合物注釋添加了一個正交維度，使注釋結果更加可靠。

　　TASQ 2022b 的目標物篩查與定量的工作流程增加了同位素示蹤工作流程，同樣支持 CCS 值的匹配。由于提供了天然同位素的矯正方法和同位素標記分數貢獻等關鍵算法，大規模穩定同位素示蹤實驗的數據處理得到簡化。