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  • 發布時間:2018-07-06 14:05 原文鏈接: 怎樣快速而準確地閱讀科學論文(3)——引言

    吳崇明 中國醫學科學院藥用植物研究所 chomingwu@163.com

    接上文。閱讀理解了論文的標題和摘要,我們已經對整篇論文的主要內容有了整體了解,并形成了自己對論文質量,以及是否對自己的研究有參考價值的判斷。如果我們認為該論文的研究質量上乘,研究方法或結果對我們自己的研究有重要參考價值,或者論文的結論很有趣味,就會想進一步閱讀論文的正文。

    研究論文的正文一般由引言、方法、結果與討論等部分構成。按照順序,我們首先讀到的是論文的引言。那么引言我們該如何閱讀呢?應該注意哪些細節?怎樣才能通過閱讀引言把握作者的寫作邏輯呢?在回答這些問題之前,我們首先應該知道引言的作用是什么?作者為什么要寫作引言。

    一般而言,引言的目的主要有兩個:(1) 告訴讀者,我的研究是有價值的;(2) 讓主編/編輯清楚論文的相關研究背景,確認研究內容符合期刊發表的范疇。為了實現這個目的,作者在寫作引言時,通常會講述如下幾個問題:

      研究的問題/領域是什么?

      研究為什么重要?

      目前的主要研究或發現的成果?

      尚未解決的問題?或已有問題沒有被科學解釋清楚?

      本篇論文的研究目標和方法?即將提供什么新方法/數據/模型/理論去解決問題?

    了解了作者寫作引言的目的,我們只需要逐條進行解讀即可。以上問題中,我們至少應該關注兩點:(1) 這個工作的意義和價值何在?(2) 有哪些背景是我們讀懂論文含義所必需,而我們尚未掌握的?

    對于第一點,很容易理解。而對于第二點,則是我們能夠讀懂論文結果所需要的基礎知識。由于每個人的知識背景不同,作者為了讓讀者能夠理解論文所列舉的結果數據的意義,從而能夠評價和認同作者的推理邏輯,因此會把理解這些數據所需的基本概念在引言中做一交代。如果我們在閱讀的時候,對這些背景都比較熟悉,則在后續的結果和討論閱讀中不會遇到太大困難,但如果發現自己對引言介紹的背景或者某些專業知識不熟悉,則需要延伸閱讀一些相關背景論文,以幫助自己真正讀懂這篇故事。

    具體應該怎樣做呢,還是以一個實例進行說明。

     

    Cox LM, et al. Altering the intestinal microbiota during a critical developmental window has lasting metabolic consequences. Cell. 2014;158(4):705-721.


    這是2014年發表在Cell上一篇論文。題目是:(在發育的關鍵期)改變腸道菌群會造成(長久)的代謝后果。主干是研究主體,括號中的修飾語是論文的關鍵點。從題目我們可以得知,這篇論文研究的是腸道菌群對代謝的影響,其主要關注點在于,生命早期的干預對成年以后的影響。

    論文摘要的內容:腸道菌群從出生開始獲取,并逐漸形成穩定的菌群結構。(發育期間)(暴露于低劑量的抗生素)破壞腸道菌群會改變宿主代謝和肥胖。我們發現,(從出生開始)給予低劑量青霉素會改變代謝和影響免疫基因的表達。(生命早期的)低劑量青霉素會(短暫)干擾菌群,但足以造成(持續的)影響,表明(嬰兒時期)菌群互作對(長期)宿主代謝具有關鍵影響。此外,低劑量青霉素會提高高脂飲食的增肥效果,這種表型可以被(抗生素選擇的微生物)轉移給無菌動物,因此菌群(而非抗生素本身)發揮關鍵作用。這些研究表征了(生命早期微生物-宿主代謝互作)的重要變量,并鑒定了(與代謝改變相關的)菌屬分類。

    主干閱讀可以讓我們快速領會摘要的故事梗概,而括號中的修飾詞是理解本篇論文創新點的關鍵所在。

     

    下面是引言。由于引言目的是強調論文的重要性和相關背景,不需要我們讀的過于深入透徹。所以,通讀大概即可。主要是尋找上述的5個問題。

    第一段,我們只需要看到:肥胖增加糖尿病。腸道菌群會促進肥胖。胖子和瘦子的腸道菌群不同,并且胖瘦表型能夠轉移給無菌動物。因此,需要對腸道菌群-宿主代謝互作有更深的理解。這段話點明了論文的研究領域——菌群-宿主代謝互作;論文的重要性——與肥胖和糖尿病密切相關。

    第二段,生命早期是代謝發育的關鍵時期,此時的菌群改變會導致體重改變。(由剖腹產或抗生素導致的)生命早期菌群擾動伴隨(兒童期)超重。但是在小鼠中,抗生素可能增加或降低體重(取決于隨著劑量、飲食或菌株的不同)。這段話點明了論文的要點——生命早期菌群擾動對體重具有深遠影響。

    第三段,農民已經使用低劑量抗生素促進家畜生長(使用得越早效果越好)。我們曾采用這種方法研究宿主-微生物代謝關系,發現早期低劑量抗生素會增加脂肪,改變代謝激素、肝臟代謝以及菌群組成。這段話介紹了前人的研究情況。這里,我們使用低劑量青霉素干擾菌群,檢查(1)限時抗生素暴露是否關鍵;(2)青霉素和飲食的效果是否協同;(3)改變的菌群是否足以導致代謝表型。這段話介紹了本文的研究目的和方法

    第四段,停止抗生素處理后菌群結構恢復正常,但是代謝表型依然持續,所以生命早期的微生物對于生長和發育有重要意義。這段話強調了論文的最重要發現和亮點

    可能是由于這個工作屬于原創性研究,可供參考借鑒的資料很少,因此,作者并未在引言中敘述過多別人的研究情況,只是在不斷強調此工作的重要性,以及開展這個研究的合理性。只要我們讀懂了這篇工作的重要意義和創新之處,就足夠了。


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