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  • 發布時間:2021-05-28 16:54 原文鏈接: 揭示了腸道病毒D68型感染的雙抗體雞尾酒療法的機理

      5月18日,國際學術期刊Nature Communications在線發表了中國科學院分子細胞科學卓越創新中心(生物化學與細胞生物學研究所)叢堯研究組與中國科學院上海巴斯德研究所黃忠研究組、廣州市婦女兒童醫療中心龔四堂課題組的合作研究論文“Functional and structural characterization of a two-MAb cocktail for delayed treatment of enterovirus D68 infections”。該研究開發了一種可用于治療腸道病毒D68型感染的雙抗體雞尾酒療法,基于冷凍電鏡及生化分析,闡明了8F12/2H12抗體的中和機制,揭示了其表位相似但對病毒的作用機制不同,并捕捉到了新的脫衣殼中間狀態,具有重要的理論意義和臨床轉化價值。

      腸道病毒D68型(EV-D68)是小RNA病毒科腸道病毒屬D族成員,與兒童嚴重呼吸道感染、急性遲緩性脊髓炎(AFM)密切相關。在過去十年中,EV-D68在全世界范圍內流行,引起了眾多的暴發和散發。EV-D68已成為全球公共健康問題,然而目前尚無疫苗和藥物。

      黃忠團隊針對EV-D68病毒樣顆粒制備了兩個單克隆抗體2H12和8F12。這兩個單抗在抗原結合上有明顯的偏好性,2H12更高效地結合免疫原—病毒樣顆粒(空心的膨脹構象),而單抗8F12更高效地結合成熟病毒顆粒(實心的緊湊構象)。2H12和8F12在中和不同型別EV-D68毒株上也有明顯偏好性,而雙抗體組合表現出平衡、高效的中和(圖A)。此外,雙抗體組合可在小鼠中賦予比單抗更廣譜的保護,且在感染發病時(3天)給藥依然有效。研究表明兩個抗體主要在病毒侵染細胞前起作用,并能阻止病毒與唾液酸受體作用介導的紅細胞凝集的發生,提示抗體結合可以阻斷受體結合。

      叢堯團隊解析了抗體8F12結合EV-D68成熟病毒形成復合體的冷凍電鏡結構,分辨率為2.89埃。揭示了8F12與病毒的峽谷區(canyon)結合,進而對唾液酸受體結合產生空間位阻,且該區域為未報道過的EV-D68抗原位點(圖B-C)。此外,在對抗體2H12與EV-D68成熟病毒復合體進行冷凍電鏡研究過程中,發現2H12結合可以使一部分EV-D68病毒顆粒破碎,暗示2H12可以破壞病毒顆粒完整性,影響其感染性。對EV-D68/2H12的進一步三維分組和重構獲得了三個不同的構象狀態,命名為S1、S2和S3(圖D-F)。S1中的病毒顆粒呈現成熟病毒構象(圖D,G),而S2和S3中的病毒顯示出明顯的構象差異,包括病毒顆粒的膨脹、二次軸孔洞的打開、病毒RNA基因組的減少(S3狀態)(圖D-L),說明2H12結合可以觸發過早的病毒脫衣殼,影響其感染性。S3狀態是一種未報道過的脫衣殼中間態,可能發生在從135S A顆粒(帶有病毒RNA的經典脫衣殼中間體)到80S空顆粒(沒有基因組RNA)的過渡中。

      綜上,該研究研發了一對獨特的EV-D68中和性單抗,揭示了它們表位相似,但結合特性、中和特性、作用機制不同。這對抗體的組合可作為抗人類EV-D68感染的廣譜治療劑展開進一步開發,具有重要的理論意義和潛在的臨床轉化價值。

      上海巴斯德所副研究員張超,中科院分子細胞科學卓越創新中心博士生徐聰,上海巴斯德所畢業博士生代文龍為本文并列第一作者。上海巴斯德所黃忠研究員、中科院分子細胞科學卓越創新中心(生化與細胞所)叢堯研究員、廣州市婦女兒童醫療中心龔四堂教授為本文共同通訊作者。該研究得到了中國科學院、國家科技部、國家自然科學基金、上海市科委等的資金支持。該研究還得到國家蛋白質科學研究(上海)設施冷凍電鏡系統的大力協助。

      (A)單抗2H12、8F12及其組合的中和譜差異。(B)EV-D68/8F12復合體的冷凍電鏡結構。(C)8F12在病毒表面的投影與唾液酸受體的結合位點有重疊。(D-F)EV-D68/2H12的冷凍電鏡結構(包括S1、S2和S3狀態),說明2H12可誘導病毒顆粒發生變構。(G-I)S1/S2/S3病毒衣殼的二次軸區域的結構差異,顯示S2和S3二次軸孔洞被打開。(J-L)三種狀態密度圖的中央切片,顯示S3所含病毒RNA量顯著降低。


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