猴痘基因組研究公布：14種序列皆來源這里

　　對來自正在進行的全球爆發的猴痘病毒 (MPXV) 基因組的分析發現，這些樣本聚集在一起，表明它們的來源單一。

　　根據世界衛生組織的數據，從今年年初到 6 月中旬，已有 2100 多例經實驗室確診的猴痘病例，其中大部分是自 5 月初以來報告的。其中 80% 以上的病例出現在歐洲，12% 出現在美洲，那里的病毒不是地方病，而且這些病例與流行地區沒有已知的聯系。

　　根據歐洲疾病預防和控制中心的數據，葡萄牙的研究人員現在已經對 2022 MPXV 進行了系統發育分析，發現該疫情可能與 2017/2018 年爆發的單一來源有關。尼日利亞。他們周五在《自然醫學》雜志上還報道說，病毒樣本似乎正在加速進化，可能受到宿主 APOBEC3 的影響，這是一類有助于抵御病毒的 mRNA 編輯酶。

　　“加速進化是一個觀察結果，但我們還不知道這是如何發生的。在 2022 MPXV 中發現如此多的突變是非常出乎意料的，”里斯本國立衛生研究院的資深作者 Jo?o Paulo Gomes Doutor Ricardo Jorge 說在一封電子郵件中。

　　他和他的同事分析了他們于 5 月 19 日公開發布的首個 2022 年爆發的 MPXV 基因組，以及其他 14 個 MPXV 基因組序列，其中大部分也來自葡萄牙。

　　系統發育分析將 2022 年爆發的樣本置于進化枝 3 中，即以前稱為“西非”進化枝的部分。所有暴發樣本都緊密聚集在一起，表明持續暴發的單一來源。

　　與此同時，暴發樣本形成了一個分支，與 2018 年和 2019 年與英國、以色列和新加坡的病例相關的病毒不同，這些病毒本身源于 2017/2018 年尼日利亞的暴發。這向研究人員表明，2022 年的爆發可能是由于尼日利亞爆發的病毒持續傳播和演變所致。

　　然而，2022 MPXV 與 2018/2019 病毒平均相差 50 個 SNP，Gomes 指出這比預期的要多得多。他說，對于這種類型的病毒，預計每年會出現一兩個突變。由于 2022 MPXV 很可能是 2017/2018 年尼日利亞疫情的后裔——這導致了 2018/2019 年英國、以色列和新加坡的病例——預計會出現大約 5 到 10 個額外的突變，而不是 50 個。

　　“因此，毫無疑問，我們正面臨著加速進化的局面，”戈麥斯說。

　　這些變化也傾向于遵循某種模式，將更多的腺嘌呤和胸腺嘧啶納入已經富含 A/T 的病毒基因組，這表明人類 APOBEC3 系統可能參與了這種加速進化。

　　APOBEC3 是一種宿主抗病毒機制，可誘導病毒突變，但如果酶不能完全限制病毒，則可能導致超突變。 Gomes 指出，這種機制已經在 HIV 和 HPV 中得到描述。

　　“我們不知道后果，但我們知道，例如，這些突變中的 [一些] 正在影響與人類免疫系統相互作用相關的病毒蛋白，因此，假設免疫逃避機制不能完全被丟棄，”他補充道。

　　總之，研究人員表示，對暴發樣本進行病毒基因組測序可能使科學家能夠更好地了解 2022 MPXV 的傳播方式，并深入了解控制這種傳播的方法。 “我們將專注于識別和監測在持續傳播過程中實時出現的突變，以便更好地了解宿主的適應情況，”戈麥斯說。