甘肅農業大學張金文課題組,運用miRNA測序、降解組測序技術,研究土豆葉片和塊莖經紅光照射12、24、48h后,miRNA及靶基因表達情況,并通過實時定量RT-PCR技術,探究miRNA在次生代謝中的調控作用。小RNA文庫結果表示,葉片中共發現有31個差異表達miRNA,塊莖中有48個差異表達miRNA。紅光刺激下,土豆葉片中有1353個基因上調表達,1595個基因下調表達;塊莖中有1841個基因上調表達,897個基因下調表達。富集分析顯示,土豆葉片和塊莖中,與MVA通路、生物堿類、苯基丙烷、黃酮類化合物和類胡蘿卜素代謝相關的基因顯著上調表達,而與CHO新陳代謝相關的基因表達受到抑制。miRNA及其靶基因研究結果顯示,光響應miRNA在生物堿代謝,UMP salvage,脂類的生物合成和纖維素分解代謝中發揮重要的調控作用。此外,一些miRNA可能通過茉莉酸信號傳導途徑,尿苷二磷酸葡糖生物合成和羥基化反應,參與糖苷生物堿代謝調控。

圖 光刺激下馬鈴薯葉和塊莖中的初級和次級代謝途徑
這項研究提供了土豆應對光刺激的較全面的miRNA及其靶基因表達譜。結果表明,miRNA在次生代謝途徑,尤其是在糖苷生物堿的生物合成中可能發揮重要的作用。
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