甲基化試驗有助于區分原發腫瘤類型

　　未知性癌癥（CUP）在轉移性腫瘤患者中占比10%，然而這些癌癥的原發腫瘤位置通常無法確定。由于無法分辨究竟是哪種腫瘤類型，這些患者的生存率很低。

　　“傳統方法只能鑒定30%不明病灶的轉移性腫瘤的原發腫瘤位置，一些分子生物學方法可以提高這一比例，但往往造價昂貴，并且，所使用的RNA樣本比較脆弱容易在醫院進行解剖操作時被損壞，”文章作者、Bellvitge生物醫學研究所（IDIBELL）表觀遺傳學與腫瘤生物學項目協調人Manel Esteller博士解釋道。

　　“EPICUP?檢測則是基于更穩定的DNA分子，允許醫務人員以更簡單的方式進行采集、保存和運輸。一周之內即可出具檢測報告。”

　　革命性的EPICUP?檢測將使CUP的檢測和治療更加有效。正如文中總結：“正確的、更特異性的、低侵襲性診斷試驗可使CUP患者從中受益。”

EPICUP?檢測流程

　　表觀遺傳學機制通常被理解為“在不改變DNA序列的條件下的基因表達水平調控機制”。盡管染色質重塑、非編碼RNAs、DNA-蛋白質相互作用、轉座因子流動性抑制、細胞分化、X染色體失活和基因印記等因素也能調控基因表達，但是哺乳動物細胞中的胞嘧啶碳五的甲基化共價修飾仍起主導表觀遺傳學作用。

　　可遺傳的、在發育過程中具有持續表現力的表觀遺傳標簽變化已被證明是同一基因型下生成多種表型的重要原因。在不恰當的時間地點添加錯誤類型的表觀遺傳學標記與許多疾病（包括癌癥）的發生息息相關。更重要的是，DNA甲基化抑制許多抑癌基因表達，如CDKN2A，CDKN2B，MLH1，MGMT和CDH1等，從而影響癌癥進程。

　　具有相同組織病理學和遺傳特征的腫瘤可能表現出完全不同的表型。舉一個明顯的例子，同樣是BRAFV600E 突變型黑色素瘤，雖然低甲基化賦予了機體對BRAF和MEK抑制劑的更大敏感性，但是TBC1D16-47KD轉錄本的表觀遺傳學再活化將導致更差（高出4倍風險）預后。

　　因此，揭示腫瘤特異性指紋甲基化CpG島的DNA甲基化譜不僅能識別腫瘤類型，還可預測患者預后和抗腫瘤治療反應。

　　科學家們使用高通量方法，首次探訪了超過1000名患者組織樣品的1505個CpG位點，繪制了DNA甲基化圖譜，鑒定出24種不同腫瘤類型的特定指紋。在此之前的大多數DNA甲基化模式研究僅局限于少數患者的、屈指可數的特定基因組位點。

　　根據文中展望，DNA甲基化分子檢測平臺將成為癌癥臨床診斷的必要趨勢。