科學家發表非編碼RNA相互作用數據庫NPInterv4.0

　　非編碼RNA對生物分子的調控作用，一直是RNA功能研究的前沿。在以往的研究中，非編碼RNA被發現可以和蛋白質、RNA以及基因組相互作用，調控復雜生物過程。比如經典的長非編碼RNA Xist可以和X染色體相互作用并影響劑量補償效應。理解非編碼RNA和生物分子的相互作用對于研究非編碼RNA的功能以及生物分子調控網絡的構建是非常重要的。

　　10月31日，《核酸研究》（Nucleic Acids Research）在線發表了中國科學院生物物理研究所健康大數據研究中心題目為NPInter v4.0： An integrated database of ncRNA interactions 的論文，發布了最新版的NPInter（NPInter v4.0)。該數據庫系統地收錄了絕大多數種類非編碼RNA的相互作用，并對相互作用以及相關分子進行了詳細的注釋以及可視化，提供了一個全面、系統的非編碼RNA相互作用的研究平臺。

　　中科院院士陳潤生課題組于2006年發布了NPInter數據庫的第一個版本（Nucleic Acids Research），在過去的十多年中，該數據庫一直獲得業內的廣泛認可，被RNAcentral收錄為專家數據庫。迄今為止，已經更新過三個版本。此次的v4.0更新，整合了近幾年來發表的非編碼RNA相互作用文獻以及高通量RNA相互作用測序數據，環狀RNA（circRNA）的相互作用和ChIRP-seq獲得的非編碼RNA-基因組的相互作用首次被收錄進來。總數據量上升到11萬條，涵蓋了35個物種。相互作用以及作用分子還增加了疾病注釋，旨在幫助研究者更好地理解相互作用的功能。除了整合數據之外，整個數據庫的網站也進行了重新構建，提高了原有搜索模塊的易用性，并增加了很多新的功能性模塊如biocircos.js。網站收錄整理了大量具有特定功能的基因集合，并提供了基于這些基因集合的個性化搜索。