青藏高原低氧、低溫和營養匱乏等極端環境，對野生動物的生理調節與生態適應提出了挑戰。腸道菌群作為宿主的“第二基因組”，在營養代謝、免疫調控與環境適應中發揮關鍵作用。尤其在大型食草動物中，腸道菌群的多樣性與功能對植物性飼料的高效利用至關重要。西藏盤羊與巖羊為典型的高寒低氧地區大型食草動物，前者主要棲息于開闊的高山草甸且食物譜相對單一，后者多分布于陡峭山地或懸崖地形且食性更為廣泛。兩者在棲息地選擇與取食行為策略上存在差異。已有研究表明，除空間分化外，食性和腸道菌群結構的差異可能驅動其生態位分化。因此，探究兩者腸道菌群與食性之間的相互關系，有助于揭示其營養適應機制及物種共存策略，為青藏高原野生動物在極端環境下的協同進化研究提供新視角。
中國科學院西北高原生物研究所研究團隊在青海省昆侖山地區采集了西藏盤羊與巖羊的新鮮糞便樣本，結合宏基因組測序與植物trnL片段的高通量測序技術，分析了兩者腸道菌群組成、功能特征以及食性結構與腸道菌群在生態適應和營養生態位分化中的潛在作用。
研究發現，西藏盤羊與巖羊共棲于高寒生態環境中，但其腸道菌群在組成結構與功能特征方面表現出差異。西藏盤羊食性相對單一但其腸道菌群多樣性更高，具有更強的代謝適應性與纖維降解能力；巖羊擁有更廣泛的植物攝食譜，卻表現出在糖類代謝相關功能上更強的腸道菌群代謝適應能力。腸道菌群與食性之間的協同作用可能在推動兩物種營養生態位分化中發揮重要作用。同時，兩種動物在抗生素耐藥基因組成方面也存在差異，提示該類指標在未來野生動物健康評估中具有潛在應用價值。
上述研究揭示了腸道菌群作為宿主環境適應和生態位分化的重要調控因子，其與食性協同作用推動了高原野生動物的生態位分化。同時，這一成果為理解大型食草動物腸道菌群與環境適應及生態位分化提供了新視角，并為瀕危物種保護和高原生態系統可持續發展提供了參考。
相關研究成果發表在《通訊-生物學》（Communications Biology）上。研究工作得到青海省自然科學基金的支持。
論文鏈接：https://doi.org/10.1038/s42003-025-08185-7
食性與腸道微生物組關聯分析圖
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