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  • 發布時間:2021-06-18 16:29 原文鏈接: 迄今為止規模最大的靈長類基因組調控元素研究

      雖然每個生物體都有一個獨特的基因組,一個單一的基因序列,但每個個體都有許多表觀基因組。表觀基因組由化合物和蛋白質組成,它們可以與DNA結合并調節基因活動,可以激活或失活這些化合物和蛋白質,也可以產生器官或組織特異性蛋白質。由于它是一種高度動態的材料,它可以提供大量的信息來闡明組成身體的各種組織和器官的進化。

      現在,來自西班牙國家研究委員會(CSIC)和龐培法布拉大學(Pompeu Fabra University)聯合中心進化生物學研究所(IBE)的一個團隊,對靈長類動物基因組的調控元素進行了迄今為止規模最大的研究。詳盡分析托馬斯Marques-Bonet領導的研究小組進行的比較基因組學研究小組的首席研究員IBE,分析了廣泛的信號調節基因在類人猿和人類,包括弱活動信號,在先前的研究被忽視。這項由IBE研究員大衛·胡安(David Juan)共同領導的研究表明,在人類中,通常不被研究的最弱的調控信號在與大腦相關的基因調控中發揮著重要作用。這項研究為破譯這些信號可能對人類和其他靈長類動物的進化產生的影響打開了一扇門。

      該研究實驗室開展了迄今為止規模最大的靈長類基因組調控元素研究。

      該研究小組使用高分辨率分析大猩猩和人類細胞系的表觀基因組信號。特別是,這項研究為四種類人猿和其他靈長類動物提供了新的表觀基因組數據:黑猩猩、大猩猩、猩猩和獼猴。

      “在這項研究中,我們使用了來自人類和其他靈長類動物的淋巴母細胞系,因為它們作為模型提供了堅實的基礎。然后我們比較了不同物種之間的表觀基因組信號,包括我們分析中最弱的活性信號。”Raquel評論道,Raquel是IBE比較基因組組的博士,也是這篇文章的第一作者。

      “當我們專注于在最弱的表觀基因組信號中檢測人類的那些特定特征時,我們發現它們與大腦功能有關,”Marquès-Bonet團隊的博士生、該研究的合著者保拉·埃斯特勒解釋說。“這為深入研究弱表觀基因組信號的作用打開了大門,因為它們可能在人類和其他靈長類動物的各種器官中發揮重要作用。”

      這項研究包括了通常被忽略的微弱的表觀基因組信號,而且已經發現,在人類中,它們與大腦功能有關。

      利用淋巴母細胞進行的這項研究表明,該模型可以提供其他更難獲取的組織的信息,比如大腦。淋巴母細胞容易獲得,也容易培養。這項研究有助于理解靈長類動物的細胞是如何被調節的,以及哪些機制在進化過程中被保存了下來。該研究還提供了靈長類動物基因組和表觀基因組數據的全面資源,可供整個科學界使用。


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