重磅∣首屆“中國蛋白質組學十大進展”正式發布

2025年10月14日，首屆“中國蛋白質組學十大進展”正式發布。評選活動由π-HuB& CNHUPO組織，經多輪專家篩選，并經CNHUPO理事會投票，從2023年8月至2025年7月產生的近 200 項成果中評選出來十項成果，覆蓋發展戰略、技術創新、科學研究、應用轉化等多個領域。

中國蛋白質組學十大進展

一、人體蛋白質組導航計劃白皮書

研究團隊：國家蛋白質科學中心賀福初/ETH Ruedi Aebersold等

2024年12月11日， Nature在線發布了中國科學家領銜發起、十八位兩院院士和十八國科學家團隊聯合署名的人體蛋白質組導航國際大科學計劃（Proteomic Navigator of the Human Body，簡稱“π-HuB”計劃）白皮書，標志著該計劃在重大科學問題凝練和全球合作共識凝聚方面取得重大突破，其主要科學目標和實施路徑被國際主流科技界正式認可。

原文鏈接：https://doi.org/10.1038/s41586-024-08280-5

二、整合人工智能深度學習算法與微流控技術實現空間蛋白質組的高通量原位組學

研究團隊：中國科學院動物研究所趙方慶

2025年1月23日，中國科學院動物研究所的趙方慶團隊在Cell發表了題為“High-resolution spatially resolved proteomics of complex tissues based on microfluidics and transfer learning”的研究論文，提出了全新的空間蛋白組學技術框架——PLATO，通過整合人工智能深度學習算法與微流控技術，實現了全組織切片水平的高分辨率空間蛋白質組檢測（25微米分辨率，數千個蛋白），突破了高通量原位組學技術的瓶頸。

原文鏈接：https://doi.org/10.1016/j.cell.2024.12.023

三、開發出在復雜體系中可同時鑒定配體靶蛋白質和結合位點的蛋白質組學新方法

研究團隊：中科院大化所葉明亮/中科院上海藥物研究所羅成

2024年12月10日，中科研大連化物所葉明亮團隊在Nat Methods發表題為 “A peptide-centric local stability assay enables proteome-scale identification of the protein targets and binding regions of diverse ligands”的研究論文，利用蛋白質在結合配體后局部穩定性的變化，開發了一種在復雜體系中可以同時高靈敏鑒定配體結合蛋白和結合位點的蛋白質組學新方法。該方法無需對配體進行化學修飾，廣譜適用于包括代謝物、藥物、污染物等不同結構配體的靶蛋白質分析。

原文鏈接：https://www.nature.com/articles/s41592-024-02553-7 

四、基于納升級微流控液體處理機器人，實現了單細胞的精準捕獲、前處理以及自動進樣

研究團隊：浙江大學化學系方群

2024年2月10日，浙江大學方群教授團隊在Nature Communications發表了題為“Pick-up single-cell proteomic analysis for quantifying up to 3000 proteins in a Mammalian cell”的研究論文，開發了“點取式”單細胞蛋白質組分析（PiSPA）工作流程和基于納升級微流控液滴操控機器人，實現了單細胞的精準捕獲、前處理以及自動進樣，首次在單個哺乳動物細胞中實現了高達3000種蛋白質的超高定量深度。

原文鏈接：https://www.nature.com/articles/s41467-024-45659-4

五、繪制人體衰老蛋白質分子編年史

研究團隊：中國科學院動物研究所劉光慧/國家生物信息中心張維綺/曲靜/四川大學華西醫院楊家印

2025 年 7 月 25 日，中國科學院動物研究所劉光慧研究員等團隊合作在 Cell 發表了題為“Comprehensive Human Proteome Profiles Across a 50-Year Lifespan Reveal Aging Trajectories and Signatures ”的研究論文，首次融合超高靈敏度質譜技術與機器學習算法，系統構建了橫跨人類 50 年生命周期的蛋白質組衰老圖譜，涵蓋七大生理系統、13 種關鍵組織，從蛋白視角呈現了機體增齡性演變的全景式動態景觀。

原文鏈接：https://www.cell.com/cell/abstract/S0092-8674(25)00749-4

六、采用臨床功能蛋白質組技術解析PDAC 微環境中癌細胞和基質細胞之間的信號傳導

研究團隊：南方科技大學田瑞軍/同濟醫院秦仁義/中科院分子細胞卓越中心高棟/美國索爾克生物研究所史宇

2024年11月13日，南方科技大學理學院化學系田瑞軍等團隊合作在Nature 發表了題為“Clinical functional proteomics of intercellular signaling in pancreatic cancer”的研究論文，開發了多維度臨床功能蛋白質組學分析策略，并應用于系統解析胰腺癌腫瘤微環境中的細胞間信號轉導網絡，為發現新的胰腺癌標志物和藥物靶點提供了系統功能蛋白質組大數據和新思路。

原文鏈接：https://www.nature.com/articles/s41586-024-08225-y

七、繪制健康與多種疾病狀態的成人血漿蛋白組圖譜

研究團隊：復旦大學郁金泰/毛穎/程煒/馮建峰

2024年11月22日，復旦大學附屬華山醫院的郁金泰等團隊合作在Cell上發表了題為“Atlas of the plasma proteome in health and disease in 53,026 adults”的研究論文，全面繪制了人類健康與疾病蛋白質組圖譜，并結合人工智能大數據分析方法構建了疾病診斷預測模型以及發現了26個藥物治療新靶點，為精準醫學的實施提供了重要科學依據。

論文鏈接：https://www.cell.com/cell/fulltext/S0092-8674(24)01268-6

八、水熊蟲耐受超強輻射的多組學景觀和分子基礎

研究團隊：國家蛋白質科學中心（北京）張令強/楊冬、陜西學前師范學院王立志

2024年10月25日，國家蛋白質科學中心（北京）張令強等團隊合作在Science發表了題為“Multi-omics landscape and molecular basis of radiation tolerance in a tardigrade”的研究論文，報道了一種高生屬新種——河南高生熊蟲，并建立了其實驗室培養體系，繪制了高質量基因組圖譜，在國際上首次整合轉錄組、蛋白質組響應超強輻射的動態變化及分子進化和功能特征分析，揭示了河南高生熊蟲耐受超強輻射的三類機制，并分別對代表性關鍵分子進行了深入的功能和機制研究。

原文鏈接：https://www.science.org/doi/10.1126/science.adl0799

九、古蛋白質組分析證明近乎完整的哈爾濱古人類頭骨為丹尼索瓦人

研究團隊：中科院古脊椎所付巧妹/河北地質大學季強

2025年6月18日，中國科學院付巧妹科研等團隊合作在Science上發表題為“The proteome of the late Middle Pleistocene Harbin individual”的研究論文，對距今至少14.6萬年的哈爾濱古人類顱骨開展了分子古生物學研究，首次建立了古蛋白全自動化鑒定人群的方法體系，產生了迄今最高質量的古人類蛋白組數據，發現哈爾濱古人類其實是丹尼索瓦人，且線粒體屬于已知早期丹尼索瓦人支系。

十、全球首個低分辨臨床蛋白質譜診斷產品——胰島素樣生長因子Ⅰ（IGF-Ⅰ）檢測試劑盒（液相色譜-串聯質譜法）

研究團隊：西湖歐米（杭州）生物科技有限公司

2025年7月15日，西湖歐米（杭州）生物科技有限公司自主研發的全球首個低分辨臨床蛋白質譜診斷產品——胰島素樣生長因子Ⅰ（IGF-Ⅰ）檢測試劑盒（液相色譜-串聯質譜法），正式獲得浙江省藥品監督管理局頒發的二類體外診斷試劑注冊證，標志著臨床質譜精準醫學體外診斷（IVD）領域取得重大突破，為臨床蛋白質組學技術的廣泛應用奠定了關鍵基石。