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  • 發布時間:2013-12-13 10:53 原文鏈接: 青年華人科學家Science建立CRISPR人細胞敲除體系

      來自麻省理工學院,哈佛醫學院,Broad研究院等處的研究人員完成了人類細胞全基因組范圍內CRISPR-Cas9敲除篩選,這對于CRISPR-Cas9技術的發展具有重要意義。這一研究成果公布在12月13日Science雜志在線版上。

      文章的通訊作者是麻省理工學院腦與認知科學助理教授、McGovern 腦研究所和Broad研究所核心成員張鋒(Feng Zhang,音譯),今年七月,Feng Zhang榮獲了美國生物醫學大獎:瓦利基金青年研究家獎(Vallee Foundation Young Investigator Award),獎金25萬美元。其研究組研究方向為設計新的分子工具來操控活體大腦。

      CRISPRs-Cas9技術成為了最近的新寵兒,這種基因組編輯技術更易于操作,也具有更強的擴展性。此前Zhang研究組曾利用細菌RNA,引導Cas9核酸酶在小鼠和人類基因組的特定基因位點上進行切割,完成了精確的目標鏈斷裂。他表示,“CRISPR系統即使在從細菌細胞中取出酶和RNA,然后再插入到哺乳動物細胞中之后,依然能如此有效的工作,這令人驚訝。”

      在此基礎上,研究人員發現靶向18,080個基因(64,751個獨特靶向序列)的全基因組范圍CRISPR - Cas9敲除(GeCKO)文庫慢病毒傳遞,能進行在人類細胞中的正向和負向選擇性篩選。

      研究人員先利用GeCKO文庫鑒定了對癌癥和多能干細胞細胞活力必不可少的基因,其次他們還在一個黑素瘤模型中,篩選出了涉及藥物維羅非尼(Vemurafenib)耐藥性的基因。

      從中研究人員篩選出了多個有效的基因,比如之前曾發現的NF1和MED12,以及未曾發現過的NF2,CUL3,TADA2B和TADA1 。

      作者指出靶向同一基因的獨立導向RNAs之間存在高度的一致性和高命中確認率,這對于Cas9基因組范圍內篩選具有重要意義。

      目前靶向基因組編輯技術已廣泛用于基礎研究和臨床應用。CRISPR-CAS系統中的Cas9核酸酶能通過20nt導向序列靶向特異性基因組位點,允許某些與DNA靶標的錯配,從而促進一些意外脫靶突變的形成。

      Zhang研究組此前還揭示了一種增加基因組編輯特異性的新方法,即利用RNA導向的CRISPR-Cas9系統形成雙切口,在未影響靶向切割效率的前提下,方便小鼠受精卵基因敲除研究。

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