
今日,頂尖學術期刊《細胞》雜志刊登了一篇來自麻省理工學院(MIT)的研究論文。科學家們通過一種深度學習系統,讓人工智能“慧眼識珠”,發現了一種潛在糖尿病藥物的抗菌潛力。在動物實驗中,這種全新的抗生素能有效殺死一種對已知所有抗生素都耐藥的超級細菌。這一重磅發現也登上了當期《細胞》雜志的封面。
科學家們是怎么想到用人工智能來尋找新型抗生素的呢?在論文的開頭,他們介紹說自青霉素誕生以來,抗生素已經成為了現代醫學的基石之一。然而隨著抗生素的濫用,越來越多的細菌對抗生素產生了耐藥性。不幸的是,過去許多抗生素都來自于土壤中的微生物,用開發傳統藥物的方式來開發抗生素并不容易。這也就不難理解,為何在過去的幾十年里,誕生的新型抗生素寥寥無幾,且結構上與過去已有的抗生素大同小異。
為了改變這一困境,研究人員們開發了一種機器學習的模型。具體來看,這種模型能夠自動學習不同藥物分子里的結構,不但可以掌握這些分子的不同位置是否存在特定的化學基團,還能夠預測這些分子的特性。
隨后,研究人員們給這種模型提供了2335個用于“學習”的不同分子,這些分子中有美國FDA已經批準的藥物,也有不少具有廣泛生物活性的天然分子。研究人員們希望在訓練之后,這種模型能夠學會識別能有效殺死大腸桿菌的藥物。
訓練完畢后,是檢驗這套機器學習模型學習能力的時候了。研究人員們使用Broad研究所的一個化合物庫,讓這套模型從其中6111個分子里,尋找具有潛在抗菌潛力的分子。從中,這種模型認為一個分子具有很強的抗菌活性。有意思的是,這種分子原先是作為一種糖尿病藥物而開發出來的,在結構上和已有的任何一種抗生素都明顯不同。后續的一些研究,也表明該分子對人類細胞的毒性較低。
據麻省理工學院的新聞透露,研究人員們致敬經典科幻片《2001太空漫游》(2001: A Space Odyssey),將該分子命名為halicin(電影里的人工智能系統叫做HAL 9000)。隨后,他們在培養皿里測試了halicin對多種耐藥菌的殺菌效果,而結果令人欣喜!除了銅綠假單胞菌(Pseudomonas aeruginosa,一種難治的肺部病原體)之外,halicin對所有測試的耐藥菌都有殺傷作用。
當然,培養皿中的結果,還不能代表活體動物上的抗菌療效。于是,研究人員們又讓小鼠感染上了一種超級耐藥的鮑氏不動桿菌(A. baumannii)。同樣據麻省理工學院的新聞介紹,這種超級細菌能耐受已知所有的抗生素!而halicin再次顯現出了神奇的效果——含有halicin的軟膏在24小時內,就徹底清除了感染。
基于以上這些結果,研究人員們指出,halicin具有廣譜的抗菌活性。而從機理上看,這是因為它能干擾細菌,不讓它們形成跨膜的電化學梯度。一般情況下,這種電化學梯度能協助細菌產生能量。如果沒有這種梯度,細菌就會死亡。研究人員們也提到,重塑電化學梯度的過程非常復雜,不是簡單的幾個突變就能完成的,因此這也最大程度上杜絕了耐藥性的產生。
利用這套系統,研究人員們進一步在另一個數據庫里篩選了數億個分子,并從中找到了23個與現有抗生素結構迥異,且對人類細胞無毒性的潛在抗菌分子。這一篩選過程,只用了短短的3天時間。后續的研究也表明,其中8個分子的確有抗細菌的活性,2個分子的活性尤其強。科學家們也計劃繼續對這些分子進行研究和評估。
正如一些科學家所言,這項突破性的研究是抗生素藥物研發的一個范式改變,有望提高我們發現新型抗生素的效率,給我們帶來更多抗擊超級細菌的武器。
近日,西安交通大學第一附屬醫院感染科教授何英利團隊在《醫學微生物學雜志》發表研究成果,明確抗生素暴露會通過破壞腸道菌群平衡、誘發繼發性肝損傷,進而加重慢加急性肝衰竭(ACLF)患者病情并降低其生存率。......
抗生素耐藥性已成為威脅全球公共衛生的重大挑戰。據估計,每年有數百萬人死于耐藥菌感染。在這一背景下,國家現代農業技術體系四川生豬創新團隊糞污處理技術研究崗位、四川農業大學動物科技學院教授白林團隊在環境耐......
抗生素耐藥性已成為威脅全球公共衛生的重大挑戰。據估計,每年有數百萬人死于耐藥菌感染。在這一背景下,國家現代農業技術體系四川生豬創新團隊糞污處理技術研究崗位、四川農業大學動物科技學院教授白林團隊在環境耐......
一項研究顯示,干旱可能會增加土壤中天然抗生素的濃度,促進耐抗生素微生物生長。利用116個國家的臨床數據,研究人員還報告了干旱程度和醫院中抗生素耐藥性平均發生率之間的關聯,提出了氣候變化對公共健康影響的......
仔豬斷奶通常伴隨腸道健康失衡和嚴重的腹瀉問題。養殖場為應對這一挑戰,大多依賴抗生素等進行被動防治,但這一方案面臨藥物殘留與耐藥性的雙重困局,且抗生素會威脅食品安全與生態平衡,甚至陷入“用藥—耐藥—加量......
安徽師范大學教師李想首次從細胞層面系統揭示了低濃度抗生素如何影響微生物氮循環并促進溫室氣體氧化亞氮的排放,為認識抗生素污染的氣候效應提供了新的科學證據。研究成果發表于《環境科學與技術》。環境濃度四環素......
近日,西安交通大學第一附屬醫院教授劉冰團隊在《先進科學》封面發表了研究論文。該研究從細菌的天敵“噬菌體”入手,基于噬菌體天然的抑菌機制,創新性地開發出一類可精準靶向細菌類核相關蛋白HU的小分子候選藥物......
每毫升1微克就能殺死耐藥菌通過研究土壤細菌——天藍色鏈霉菌合成抗生素次甲霉素A 的過程,研究人員發現了一種中間化合物——premethylenomycinClactone,其抗菌活性是最終產......
在人工智能(AI)的輔助下,麻省理工學院研究人員成功設計出新型抗生素,可快速、精準殺滅耐藥淋病奈瑟菌和耐甲氧西林金黃色葡萄球菌(MRSA)等耐藥菌。研究團隊運用生成式人工智能算法設計了超過3600萬種......
在人工智能(AI)的輔助下,麻省理工學院研究人員成功設計出新型抗生素,可快速、精準殺滅耐藥淋病奈瑟菌和耐甲氧西林金黃色葡萄球菌(MRSA)等耐藥菌。研究團隊運用生成式人工智能算法設計了超過3600萬種......