荷蘭Leiden大學的科學家們開發了一個新工具,可以通過比對未成熟干細胞與人類胎兒細胞的基因表達,確定這些干細胞的分化潛能。他們在五月二十八日的Stem Cell Reports雜志上發布了這個被命名為KeyGenes的平臺。
現在研究者們只需要分析基因活性,就可以預測自己的細胞能發展成什么樣的器官或組織。此外,KeyGenes還可以用來測試干細胞移植物的質量。
“確定細胞的身份,是干細胞生物學中最大的困難之一,”文章的資深作者,Leiden大學醫學中心的Susana Chuva de Sousa Lopes說。“KeyGenes有助于開發更好的分化方案,讓我們獲得的細胞更類似于活體細胞。”
美國的研究團隊去年夏天也發布了一個類似的平臺,CellNet。CellNet是將組織與芯片數據進行比較,以此評估分化為人類成體組織的方案。KeyGenes主要以基因表達為基礎,該平臺整合了人類胎兒和成體組織的數據,會為細胞給出評分。
“我們在人類胎兒發育過程中收集了大量的基因表達數據,涵蓋了多個器官和不同發育階段。KeyGenes能夠鑒定人類干細胞衍生物的身份,并且評估其正確的發育年齡,”文章的共同作者,Leiden大學的Christine Mummery說。
研究人員指出,KeyGenes用于臨床可以找到發育過程中出現異常的組織。這個工具還可以幫助人們更好的分化患者干細胞,用于移植或者藥物測試。
KeyGenes還為研究者們揭示了決定細胞命運的基因。這些基因主要是轉錄因子,以及與細胞粘附和形態有關的基因。“KeyGenes識別的還有長非編碼RNA,說明這類分子的確起到了重要的作用,”Lopes說。
除了測試更多的細胞類型和器官,Lopes等人還在公開KeyGenes平臺,以便研究者們
Lopes等人目前正在測試更多的細胞類型和器官。他們還公開了KeyGenes平臺,讓廣大研究者們可以免費使用。Lopes打算最終將表觀遺傳學數據整合到這個平臺中,闡明干細胞是否殘留有表觀遺傳學記憶,以及這些記憶是否會影響細胞分化的能力。
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