實驗方法原理 酚為有效的蛋白質變性劑,并且飽和的酚與水相有效的分開.因此,在含核酸的樣品加入酚,可將樣品中的蛋白質變性后形成沉淀層,位于水相與有機相的界畫,從而達到純化核酸的目的.但酚不能完全抑制RNA酶的活性,而且酚層中含有10-15%的水,從而溶解一部分poly-(A)RNA。將酚與氯仿聯合使用即可克服這兩方面的不足.氯仿除可使蛋白質變性外,還能加速水相與有機相的分層.在氯仿中加入少許異戊醇可減少油提生產生的泡沫.在酚-氯仿聯合抽提核酸后,再加氯仿抽提一次;可除去樣品中的痕量酚.
試劑、試劑盒 熏蒸酚氧仿異戊醇氯仿異戊醇混合液
實驗步驟
實驗試劑:
l. 飽和的熏蒸酚:市售AR經酚須在182度用空氣冷凝管進行重蒸餾,冷卻后加入8一羥基喹啉,使其濃度達到1g/L,向液體酚中加入等體0.5mlTris-HCL緩沖液(PH8.0),置磁力攪拌15min,抽取上層(水層)液體再加入等體積0.lmol/LTris-HCL緩沖液(pH8.0),同樣攪拌15min,分相完全后吸取上層液體,最后向酚層(下層)加入1/10體積的含2g/L巰基二醇的0.1mol/LTris-HCL緩沖進(pH8.0),分裝后避光20度保存,至少可用一個月,
2. 氧仿
3. 異戊醇
4. 氯仿/異戊醇混合液,比例為24:1或9:1
①8一羥基喹啉為黃色化合物,是一種抗氧化劑.又是酶的部分抑制劑和金屬離子的弱結合劑.加入8一羥基喹啉使酚層呈黃色,又可作為識別的標記.
實驗操作:
l. 樣品加入等體積和酚或酚/氯仿(1:1)混合液.
2. 上下顛倒很勻.
3. 室溫,12000轉/分鐘,離心5分鐘.如蛋白質較多或分界不清時,可離心10分鐘。
4. 吸取上層(水層)移置另一新的離心管中.
5. 加入等體積酚/氯仿/異戊酸(25:24:1)溶液.重復步驟2、 3、 4.
6. 加入等體積氯仿/異戊酸(24:1)溶液.重復步驟2、3、 4。
7. 乙醇沉淀核酸(見核酸的沉淀純化).
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