采用粘末端連接必須對目的DNA分子和載體分子進行酶切以獲得相應的粘末端進行連接。酶切可以是單酶切也可以是雙酶切。單酶切操作比較簡單,但雙酶切如果兩種酶所用緩沖液成分不同(主要是鹽離子濃度不同)或反應溫度不同,這時可以采用如下措施解決:
1)先用一種酶切,然后乙醇沉淀回收DNA分子后再用另外一種酶切;
2)先進行低鹽要求的酶酶切,然后添加鹽離子濃度到高鹽的酶反應要求,加入第二種酶進行酶切;
3)使用通用緩沖液進行雙酶切。具體要根據酶的反應要求進行,盡量避免星號活力。
一、 材料、試劑和儀器
1 材料:質粒DNA
2 試劑:限制性內切酶、ddH2O
3 儀器:微量移液槍,離心機,水浴鍋, 電泳儀,紫外透射觀測儀
注:酶切的選擇原則一般是盡量擴大酶切體系,這樣抑制因素得以稀釋;基因組DNA或質粒DNA酶的用量較一般DNA大,一般為1μg/10U;所加酶的體積不能超過酶切總體積的1/10,否則甘油濃度會超過5%,會產生星號活力;對難切的質粒或基因組DNA應延長反應時間4—5hr, 甚至過夜。滅火限制性內切酶活性可以采用加熱滅活,乙醇沉淀,酚/氯仿抽提,添加EDTA或SDS等方法,具體每一種酶可能有些方法不能完全滅活,這一點需要注意。
二、 結果與分析
假若一種酶在環狀質粒DNA中只有一個酶切位點, 且酶切徹底,紫外燈下檢測電泳結果, 則單酶切應為一條帶, 而雙酶切則為兩條帶。如果條帶數目多于理論值,那么有可能是酶切不完全。如果酶切結果與酶切前的質粒條帶一樣(超螺旋、線性和開環三條帶),則說明質粒完全沒有被切開。
重組質粒用HindIII XbaI雙酶切后釋放出插入片斷,因此空載體處于同一水平位置,而插入片斷長度分別為0.8 ,2.1 ,1.6 ,1.2 ,0.7和 0.3kb。
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