GenomeBiol：DNA破裂或會重新調節癌癥基因的控制機制

　　理解介導癌癥基因組中廣泛DNA損傷的機制一直以來都是癌癥研究人員非常感興趣的研究領域，近日，一項刊登在國際雜志Genome Biology上的研究報告中，來自貝勒醫學院等機構的科學家們通過研究發現，基因組結構的變異或許能作為人類癌癥中DNA甲基化改變（基因控制的一種形式）的一種特殊機制。

　　文章中，研究人員收集了1400多個人類癌癥的全基因組測序、基因表達和DNA甲基化數據，他們發現，結構變異會不斷改變DNA的甲基化，從而影響數百個基因的表達，這從總體上降低了癌癥DNA甲基化的整體水平。研究者Chad Creighton教授說道，當基因組中一個部位的DNA片段移動到另一個位置上時就會出現基因組結構的變異，因此，當對DNA片段進行測序后研究者就會發現來自兩個DNA片段在基因組上會發生融合，這就會干擾DNA編碼的遺傳指令。

　　研究者分析了基因組結構變異對人類癌癥中DNA甲基化和基因表達的影響，他們對人類癌癥基因組圖譜和全基因組胰腺癌分析計劃中的數據進行分析，這些數據包括貫穿整個基因組的分子改變，即包括多種癌細胞中的蛋白編碼基因和調節區域，同時還以來自非癌變組織的相同信息作為研究對照。研究者發現，在相當一部分癌癥類型中，基因組結構變異在改變DNA甲基化上扮演著非常關鍵的角色，DNA甲基化是一種能控制基因表達的特殊方式，同時其也是表觀基因組的一部分，表觀基因組涉及對DNA的所有化學修飾，同時還與調節基因組中基因表達的蛋白直接相關。

　　研究者Creighton說道，在多種癌癥類型中，甲基化的改變往往會以一種非隨機的方式發生，這些基因中的一部分此前就發現與癌癥有關，但研究者還鑒別出了一些此前認為與癌癥并無關聯的基因，一些基因可能會直接參與患者發病。總的來說，結構變異與DNA甲基化的整體水平下降有關。在癌癥中，表觀基因組會發生改變，而在當前研究中，結構變異就是改變表觀基因組的一種重要機制。研究者認為，在不同的癌癥中，特定癌癥中存在的結構變異數量是并不相同的，一些癌癥可能并不會發生很大改變，而有些癌癥則會出現廣泛的結構變異，這就能幫助研究人員根據癌癥的結構變異程度對其進行有效分類。

　　相關分析還能為研究者提供其它信息，比如研究者就發現，攜帶高水平DNA改變的癌癥往往趨向于免疫細胞的浸潤水平下降，這對于癌癥免疫療法的開發或許意義重大；本文研究結果表明，結構變異不僅在音符DNA序列錯誤上扮演關鍵角色，其還能在表觀遺傳學水平下影響DNA的表達，后期當研究者尋找癌癥遺傳誘因時，他們或許可以考慮一下結構變異對DNA甲基化的影響效應。