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  • 發布時間:2009-03-26 12:12 原文鏈接: MCP同期刊發BPRC三篇研究論文

         MCP一期發表我中心三篇文章      
          
    蛋白質組學頂級刊物同期刊發北京蛋白質組研究中心三篇研究論文
    《分子與細胞蛋白質組學》(Molecular & Cellular Proteomics, MCP)是蛋白質組學領域全球影響力最大的專業性刊物,最新一期同時發表了北京蛋白質組研究中心/蛋白質組學國家重點實驗室三篇研究論文,創該刊單期同一單位發文數之最。

    1、姜穎副研究員課題組劉坤博士等發現乙型肝炎病毒相關疾病治療的潛在靶點。乙型肝炎病毒(HBV)感染是一種嚴重危害人類健康的重大疾病,目前治療手段有限,其重要原因是缺乏有效的治療靶點。他們用先進的蛋白質復合體分離和鑒定方法,發現熱休克蛋白HSP90 和HSP70/HSP60形成的內源性分子伴侶復合體參與了HBV的復制及分泌,并用RNAi和小分子抑制劑證明它們可作為治療HBV相關疾病的潛在靶點。此研究結果為系統了解HBV的生命周期及研發相關疾病的治療藥物提供了新的思路。

    2、朱云平研究員課題組張紀陽博士等大幅提升蛋白質組質譜數據的利用率。大規模、高通量的蛋白質組研究產生了海量的數據,其中包含了大量的噪聲,而高可靠的數據是進一步生物學分析的基礎,故目前的分析方法均采用了過嚴的標準,但在降低假陽性的同時也人為地造成了數據較高的假陰性及較低的利用率。因此,“在保證高可信度的前提下,最大限度地利用實驗數據”一直是蛋白質組學界的追求。“鳥槍法”是目前蛋白質組鑒定中地位最重要、應用最廣泛的技術策略。他們基于隨機數據庫策略、非參概率密度模型和貝葉斯公式,建立了串聯質譜數據過濾的多元貝葉斯非參模型。通過標準蛋白和復雜樣品的嚴格考核,表明該模型具有良好的靈敏性和普適性,可將質譜數據的利用率提高10~40%,創本領域最好水平。

    3、錢小紅研究員課題組合作發現亨廷頓疾病潛在生物標志物。該研究以患者腦脊液為樣本,通過6國實驗室合作,規模化篩選和鑒定與亨廷頓疾病(HD)發生、發展密切相關的蛋白質。通過對基因組和蛋白質組數據的整體研究發現,人腦脊液中可檢測到的在腦中高表達的蛋白(腦特異性蛋白)是血漿中的1.8倍。與正常人腦脊液相比,HD患者腦脊液中的腦特異性蛋白含量呈下調趨勢,其中81%的蛋白量變與不同腦區mRNA轉錄水平變化一致,同時發現HD患者腦脊液中的肝相關蛋白含量上調。腦脊液中高表達的蛋白大多與免疫系統相關,這些蛋白的變化與HD特征性的神經退行性變、小神經膠質細胞增生和星形膠質細胞增生現象相吻合,提示其可作為HD的潛在生物標志物。

    關于北京蛋白質組研究中心
    北京蛋白質組研究中心位于中關村生命科學園,由軍事醫學科學院、中國科學院、中國醫學科學院、清華大學、北京大學、江中集團及北京生物技術和新醫藥產業促進中心共同創建,致力于具有自主知識產權的蛋白質組和功能基因組的研究與開發,目標是建設國際一流的集蛋白質組科學研究與開發、技術創新、人才培養、成果轉化、信息交流與技術服務于一體的國家級研究中心和基地。該中心作為蛋白質組學國家重點實驗室的主體組成部分,已成為國家蛋白質科學研究的重要基地,是國際人類肝臟蛋白質組計劃(HLPP)的執行總部和數據中心,曾在Nature系列刊物發表文章7篇、在MCP上發表文章10余篇。
     
    參考文獻

    1.         Kun Liu, Lu Qian, Jinglan Wang, Wenrui Li, Xinyu Deng, Xilin Chen, Wei Sun, Handong Wei, Xiaohong Qian, Ying Jiang, Fuchu He. Two-dimensional Blue Native/SDS PAGE analysis reveals HSPs chaperone machinery involved in HBV production in HepG2.2.15 cells. Mol Cell Proteomics 8:495-505, 2009

    2.         Jiyang Zhang, Jie Ma, Lei Dou, Songfeng Wu, Xiaohong Qian, Hongwei Xie, Yunping Zhu, and Fuchu He. Bayesian nonparametric model for the validation of peptide identification in shotgun proteomics. Mol Cell Proteomics 8:547-57, 2009

    3.         Qiaojun Fang, Andrew Strand, Wendy Law, Vitor M. Faca, Matthew P. Fitzgibon, Nathalie Hamel, Benoit Houle, Xin Liu, Damon H. May, Gereon Poschmann, Line Roy, Kai Stühler, Wantao Ying, Jiyang Zhang, Zhaobin Zheng, John J. M. Bergeron, Sam Hanash, Fuchu He, Blair R. Leavitt, Helmut E. Meyer, Xiaohong Qian, and Martin W. McIntosh. Brain-specific proteins decline in the cerebrospinal fluid of humans with Huntington's disease. Mol Cell Proteomics 8:451-66, 2009.
     

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