NatureGenetics：東亞的乳腺癌GWAS研究

　　美國范德堡大學（Vanderbilt University）領導的一個國際研究小組對數萬名東亞婦女開展了三階段的全基因組關聯研究（GWAS），在1號、5號和15號染色體上找到了3個乳腺癌風險位點。這項成果于7月20日發表在《Nature Genetics》上。

　　研究小組最初的工作是鑒定風險位點附近基因和調控區域的相關功能。這些位點不僅適用于評估此群體的乳腺癌風險，也有助于了解疾病新的生物學特征。文章的資深作者，范德堡大學Ingram癌癥中心的流行病學研究人員Wei Zheng認為，有必要開展進一步的機制研究，以便了解這些位點如何參與了乳腺癌的發生。

　　作為發現乳腺癌風險位點工作中的一部分，亞洲乳腺癌聯盟（ABCC）匯集了亞洲各個國家過去十幾項研究工作中的數據。總共，研究小組考慮了近23,000個東亞乳腺癌病例和超過24,000個群體匹配對照的信息。

　　在這項研究的發現階段，研究人員直接比較了2,867名中國乳腺癌患者和2,285名中國對照的測定和估算的SNP圖譜，這些樣本已利用Affymetrix的SNP 6.0芯片進行過基因分型。他們還評估了2,246名韓國乳腺癌患者和2,052名韓國對照，這些也利用相同的Affymetrix芯片分析過。

　　利用Illumina的Infinium芯片，研究小組對另外3,944名上海的乳腺癌患者和3,980名對照開展分析，成功分型了約4,000個可疑的SNP位點，這些位點來自研究的第一階段。此后，研究人員又對14,195個乳腺癌病例和16,249個對照進行檢測，對脫穎而出的幾十個變異進行了分析，他們發現11個SNP仍與乳腺癌存在關聯。

　　在整個病例和對照組的分析中，僅僅3個位點上的變異表現出全基因組的意義，它們分別是1號染色體ZC3H11A基因上的rs4951011、5號染色體ARRDC3基因上的rs10474352和15號染色體PRC1基因上的rs2290203。

　　在16,003個歐洲血統的乳腺癌病例和41,335個對照的后續分析中，研究小組追蹤了相同位點上的變異，盡管關聯較弱，但表明這些位點可能也導致其他群體的乳腺癌易感性。

　　來自ENCODE項目的數據表明，rs4951011和rs10474352變異可能分別位于增強子區域和轉錄因子結合位點。研究人員認為，這項研究的結果為乳腺癌的遺傳學和生物學提供了更多的見解。