Nature:風險!微生物組可能泄露個人隱私
研究人員發現,通過寄居人體的微生物集成DNA,能夠特異性地識別出個人的身份,這就產生了個人隱私問題。 這項發現刊登于5月11日的《美國國家科學院期刊》(Proceedings of the National Academy of Sciences)上。文章指出,在一項匿名試驗研究中,通過寄生于人體的微生物(即其微生物組),很有可能識別出個人身份,從而泄露某人的健康狀況、飲食以及種族等細節信息。無獨有偶,4月29日發表于《基因組研究》(Genome Research)的一項研究也聲稱,在由NIH維護的公開性微生物組DNA數據中,也含有具備潛在辨識性的人類DNA。 當然,兩篇論文均未依據微生物組的信息披露出受試者的姓名——估計目前這么做也會很困難——但他們有提出,這種具有引導性的微生物組研究應該得到備案。 來自馬薩諸塞州波斯頓哈佛陳曾熙公共衛生學院(Harvard T. H. Chan School of Public H......閱讀全文
國際微生物大數據聯合研究中心在京掛牌
近日,國家“863”計劃“微生物數字化信息系統集成關鍵技術研發”項目推進會在京舉行。其間,由中科院微生物所、中科院上海生命科學研究院、上海生物信息技術研究中心等單位組成的國際微生物大數據聯合研究中心掛牌。 隨著信息技術的發展,我國微生物大數據研究步入世界前列。據主持“微生物數字化信息系統集成關
人類腸道微生物基因集-為研究提供精準數據支持
7月7日,由華南理工大學生物科學與工程學院博士研究生李俊樺為第一作者,與深圳華大基因研究院、丹麥哥本哈根大學等單位共同合作完成的《人腸道微生物組參考基因集》研究成果在《自然—生物技術》上發表。這是“華工—華大”基因組科學創新班學子在國際頂級學術期刊上以第一作者身份發表的第二篇文章。 據介紹,人
微生物所發表中國微生物組數據平臺
10月26日,《核酸研究》(Nucleic Acids Research)在線發表中國科學院微生物研究所微生物資源與大數據中心、世界微生物數據中心馬俊才團隊題為gcMeta: a Global Catalogueof Metagenomics platform to support the ar
世界微生物數據中心落戶微生物所
在近日召開的第12屆國際菌種保藏大會上,經過大會專家委員會評審并經世界菌種保藏聯合會理事會審議通過,中國科學院微生物研究所在眾多的競爭者中脫穎而出,成為世界微生物數據中心(World Data Center for Microorganisms, WDCM)新的主持單位。 W
微生物領域數據庫及其分析系統建設研究取得進展
中國科學院計算機網絡信息中心大數據技術與應用發展部與中科院微生物研究所等,在微生物領域數據庫及其分析系統建設方面取得新進展,提出了一種利用語義網技術構建知識圖譜的方法,可將冠狀病毒相關的毒株、基因組、蛋白序列、蛋白結構、抗體、文獻和ZL等多源異構數據映射至資源描述框架(RDF),并構建了基于語義網框
全球首個冰川微生物數據庫
青藏高原被稱為世界“第三極”和“亞洲水塔”。除南北極外,它是全球最大的冰川分布區,現有冰川2萬條以上,面積超過2萬平方公里,也是我國及亞洲20億人賴以生存的十多條大江大河的源頭。青藏高原冰川是微生物的天然存儲器,封存了不同歷史時期的微生物。 現在,中國科學家構建的
我國微生物大數據平臺建設獲進展
近日,中國科學院微生物研究所微生物資源與大數據中心、世界微生物數據中心團隊題為World Data Centre for Microorganisms: an information infrastructure to explore and utilize preserved microbia
首個國際ISO微生物數據標準正式發布
微生物資源是國家的重要戰略資源,微生物數據資源則是微生物資源共享和開發的關鍵環節,數據資源的豐富性、準確性和共享水平,決定著微生物學領域研究和應用的綜合能力。 2020年11月9日,國際標準化組織生物技術委員會(ISO/TC 276)正式發布微生物資源中心數據管理和數據發布標準(ISO 217
研究構建綿羊和山羊腸道高質量微生物基因組數據庫
近日,西北農林科技大學羊遺傳改良與生物育種團隊攜手國內外多家科研機構,在綿羊和山羊腸道微生物基因組數據庫構建及腸道粘蛋白和多糖代謝功能菌種挖掘方面取得進展,研究成果發表在Microbiome上。研究團隊在全國范圍內的32個羊場收集了來自21個綿羊和山羊品種共計320個腸道樣本,分別構建了包含1.6億
北京大數據研究院成立擬推動數據研究成果轉化
8月27日,國內首個整合了政府、大學和市場三方面資源的大數據研究機構——北京大數據研究院今天在北京大學揭牌。北京大數據研究院是在北京市委市政府的支持與指導下,由中關村管委會、海淀區政府、北京大學、北京工業大學四方共同支持中科院院士、北京大學教授鄂維南牽頭籌建。目標是吸引國際一流大數據研究人員來京
呼吁數據共享!數據爛手里,何談研究話語權?
導 讀 在大氣、海洋、冰川等需要國際合作的研究領域,中國普遍缺乏拿得出手的高質量數據。問題出在了哪里? “我們國家在數據方面基本沒有話語權。” 在談到IPCC報告里鮮有來自中國的數據時,A學者不無感慨地告訴《知識分子》。這位要求匿名的研究者舉例說,在2013年第五次IPCC報告中,為決策者
大數據研究推翻常規認識
近年來,科學創新日漸進入"大數據"時代,各種高通量的分析手段以及各類"組學"的發展,使得我們對生命科學的基本原理以及與人類健康有關的疾病發生機制方面有了更加深入的認識。針對最近一段時間以來科學家們利用"大數據"的手段產生的科學進展,我們進行簡要的盤點,希望大家能夠喜歡。 1. Nat Gene
全球最大的海洋微生物組數據庫建立
9月4日,《自然》在線發表中外科學家的合作成果,該成果建立了全球最大的海洋微生物組數據庫,從中發掘塑料降解酶、基因編輯工具、抗菌肽等重要基因資源。山東大學微生物技術國家重點實驗室教授李盛英為文章共同通訊作者,助理研究員劉琨為文章共同第一作者。 微生物已在生物制造、生物醫藥、生物農業、環境治理等
全球最大的海洋微生物組數據庫建立
9月4日,《自然》在線發表中外科學家的合作成果,該成果建立了全球最大的海洋微生物組數據庫,從中發掘塑料降解酶、基因編輯工具、抗菌肽等重要基因資源。山東大學微生物技術國家重點實驗室教授李盛英為文章共同通訊作者,助理研究員劉琨為文章共同第一作者。該成果在《自然》報道? ?山東大學供圖微生物已在生物制造、
全球最大數字微生物數據庫建成
來自愛爾蘭、法國和意大利的科學家攜手,成功構建了全球最大的數字微生物庫——“阿波羅”(APOLLO)。“阿波羅”囊括了247092個計算模型,其中包含迄今為止最全面的人體微生物組計算模型,有望增進科學家對人體微生物組及其對健康影響的理解。相關論文發表于最新一期《細胞系統》雜志。 研究團隊重點關
全球微生物組大數據搜索引擎上線
日前,中國科學院青島生物能源與過程研究所單細胞研究中心正式發布首個微生物組大數據搜索引擎——MSE(Microbiome Search Engine; http://mse.single-cell.cn),使得以整個微生物組為分析單元的智能搜索和大數據挖掘成為現實。 微生物組,又稱“菌群”。
大數據時代:海量數據為科學研究帶來重大機遇
“大數據的概念聽上去和云計算一樣,有些‘高大上’,但是大數據絕不是一個空泛的口號,事實上它不僅改變了人們的生存面貌,更為科學研究帶來重大的機遇。”中國科學院遙感與數字地球所研究員郭華東說。 依托海量的數據狀態和云級別的數據處理能力,大數據以其Volume(大量)、Velocity(高速)、Va
科學家研究認為:大數據時代“小數據”仍有未來
原文地址:http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2023/7/504106.shtm大數據時代,“小數據”有未來嗎?武漢紡織大學數理科學學院江健教授團隊與美國密歇根州立大學Guo-wei Wei教授團隊共同研究認為:“有!”相關研究成果日前在線發表在國際期刊《化學評論
聚焦微生物研究(系列二)
活菌 PCR 是一項嶄新的技術,能夠選擇性地擴增存活細胞的 DNA。這使得研究人員能夠快速、可靠地區分存活和死亡細胞,而不再依賴耗時的培養方法進行判斷。傳統 PCR 法的缺陷傳統 PCR 法的一個主要缺點就是無法分辨存活和死亡的微生物。這會導致誤導性結果的生成,例如高估污染水平。此外僅對于存活微生物
聚焦微生物研究(系列三)
BLU-V Viability PMA Kit、BLU-V 系統和 BLU-V Incubation Box(孵育盒)共同組成了 BLU-V 產品套裝。它們組合在一起,為您提供了一個開始活菌 PCR 應用的簡化工作流程。BLU-V Viability PMA KitBLU-V Viability P
聚焦微生物研究(系列一)
適用于您微生物學應用的活菌 PCR 技術對存活微生物實施快速、敏感和特異性檢測是許多微生物學研究和質控對照領域的基本需求。real-time PCR 等基于 DNA的擴增技術能夠提供所需的速度和特異性。活菌 PCR 是微生物學研究的新一代技術,它將細胞的存活信息與 PCR 類檢測法的速度和
世界微生物數據中心與泰國國家微生物資源保藏中心合作
9月11日至15日,世界微生物數據中心(World Data Center for Microorganisms,簡稱WDCM)主任、中科院微生物研究所信息中心主任馬俊才研究員赴泰國國家基因工程及生物技術中心(National Center for Genetic Enginee
遙感數據智能重構研究獲進展
近日,中國科學院南海海洋研究所研究員唐世林團隊與自然資源部南海預報減災中心正高級工程師楊超宇合作,在遙感數據智能重構研究方面取得新進展,實現了南海多源遙感高分辨率海表葉綠素逐日產品的精準重構。相關成果發表于《地球系統科學數據》(Earth System Science Data)。?OI-SwinU
“大數據”助力人類疾病研究
近年來,科學家們依托“大數據”在改善人類健康、助力人類疾病研究上取得了重大進展,本文中,小編就對近期相關研究成果進行整理,分享給大家! 圖片來源:CC0 Public Domain 【1】Front Immunol:大數據幫助設計更好的流感疫苗 doi:10.3389/fimmu.2019
癌癥學研究公布最新數據集
據英國《自然》雜志10月17日在線發表的一項癌癥研究,美國俄勒岡健康與科學大學公布了一個數據集,揭示了此前未發現的、急性髓性白血病(AML)患者的特定突變與藥物敏感性之間的關聯。這些發現將增進對急性髓性白血病的生物學和臨床方面的理解。 急性髓性白血病是一種非常多樣化的疾病,目前已在患者中觀察到
藥品研究色譜數據工作站及色譜數據管理要求
? 本文規定了藥品注冊申報研究工作采用的色譜數據工作站的基本要求和色譜數據的管理要求。同時,為保證色譜數據的完整性和可靠性,色譜數據工作站需建立信息安全管理體系。 1、色譜數據工作站基本要求 色譜數據工作站獲得的色譜數據應當可靠、安全、完整、可溯源。 鼓勵采用經規范和系統驗證的色譜數據工作站進
藥品研究色譜數據工作站及色譜數據管理要求
1、色譜數據工作站基本要求????? 色譜數據工作站獲得的色譜數據應當可靠、安全、完整、可溯源。????? 鼓勵采用經規范和系統驗證的色譜數據工作站進行研究工作。????? 色譜數據工作站驗證可由工作站制造商進行,注冊申請人依據工作站制造商的評估和驗證報告對工作站獲得色譜數據的完整性、可靠性、安全性
微生物所舉辦第二屆世界微生物數據中心研討會
6月7日至8日,在中科院國際合作局和中科院生物局的支持下,由世界微生物數據中心(WDCM)、世界菌種保藏中心聯合會(WFCC)、聯合國教科文組織(UNESCO)、中科院應用微生物研究網絡(RNAM)、中科院微生物研究所、國際科技數據委員會(CODATA)、亞洲微生物資源保藏和可持
中科院應用微生物研究網絡農業微生物研究中心啟動會召開
近日,中國科學院應用微生物研究網絡農業微生物研究中心啟動會暨學術研討會在武漢召開。本次會議由農業微生物研究中心依托單位中國科學院武漢病毒研究所主辦。上海交通大學鄧子新院士,中科院生物局副局長蘇榮輝,生物局工業生物技術處處長邢雪榮、副處長劉斌,應用微生物研究網絡總中心主任
揚州環保局公布上半年微生物監測數據
昨天,我市環保局環境監測中心站公布了我市上半年度主要河流、重點湖泊、城市飲用水源地和市區空氣微生物監測工作,并編制完成《2015年上半年揚州市生物監測報告》(下簡稱《報告》)。記者昨天了解到,我市上半年空氣微生物輕微污染,主要由于濕度較大,今年霉菌總數比去年增加6.5倍。 最新發布 上半