全球最大數字微生物數據庫建成
來自愛爾蘭、法國和意大利的科學家攜手，成功構建了全球最大的數字微生物庫——“阿波羅”（APOLLO）。“阿波羅”囊括了247092個計算模型，其中包含迄今為止最全面的人體微生物組計算模型，有望增進科學家對人體微生物組及其對健康影響的理解。相關論文發表于最新一期《細胞系統》雜志。 研究團隊重點關注了細菌微生物組，即那些棲息于人體內外的細菌群落。他們基于真實樣本，創建了14451個微生物群落的計算模型，每個模型都展示了這些群落內不同微生物代謝如何隨身體部位、年齡和健康狀況的變化而變化。這些計算模型依據的樣本分布身體不同部位，跨越不同年齡，是迄今最全面的人類微生物組計算模型的集合。“阿波羅”還預測了與克羅恩病、帕金森病和兒童營養不良有關的關鍵代謝物，為開發診斷和治療新策略提供了寶貴線索。 研究團隊表示，這一數據庫將成為科學家探索微生物在人體內功能、微生物與健康和疾病相互作用的新利器，降低對繁瑣的活體生物實驗的依賴。 這一成果......閱讀全文
全球首個冰川微生物數據庫
青藏高原被稱為世界“第三極”和“亞洲水塔”。除南北極外，它是全球最大的冰川分布區，現有冰川2萬條以上，面積超過2萬平方公里，也是我國及亞洲20億人賴以生存的十多條大江大河的源頭。青藏高原冰川是微生物的天然存儲器，封存了不同歷史時期的微生物。 現在，中國科學家構建的
全球最大的海洋微生物組數據庫建立
9月4日，《自然》在線發表中外科學家的合作成果，該成果建立了全球最大的海洋微生物組數據庫，從中發掘塑料降解酶、基因編輯工具、抗菌肽等重要基因資源。山東大學微生物技術國家重點實驗室教授李盛英為文章共同通訊作者，助理研究員劉琨為文章共同第一作者。該成果在《自然》報道? ?山東大學供圖微生物已在生物制造、
全球最大的海洋微生物組數據庫建立
9月4日，《自然》在線發表中外科學家的合作成果，該成果建立了全球最大的海洋微生物組數據庫，從中發掘塑料降解酶、基因編輯工具、抗菌肽等重要基因資源。山東大學微生物技術國家重點實驗室教授李盛英為文章共同通訊作者，助理研究員劉琨為文章共同第一作者。 微生物已在生物制造、生物醫藥、生物農業、環境治理等
全球最大數字微生物數據庫建成
來自愛爾蘭、法國和意大利的科學家攜手，成功構建了全球最大的數字微生物庫——“阿波羅”（APOLLO）。“阿波羅”囊括了247092個計算模型，其中包含迄今為止最全面的人體微生物組計算模型，有望增進科學家對人體微生物組及其對健康影響的理解。相關論文發表于最新一期《細胞系統》雜志。 研究團隊重點關
中國科學家建立全球首個冰川微生物數據庫
青藏高原被稱為世界“第三極”和“亞洲水塔”。除南北極外，它是全球最大的冰川分布區，現有冰川2萬條以上，面積超過2萬平方公里，也是我國及亞洲20億人賴以生存的十多條大江大河的源頭。青藏高原冰川是微生物的天然存儲器，封存了不同歷史時期的微生物。 現在，中國科學家構建的
中國科學家建立全球首個冰川微生物數據庫
青藏高原被稱為世界“第三極”和“亞洲水塔”。除南北極外，它是全球最大的冰川分布區，現有冰川2萬條以上，面積超過2萬平方公里，也是我國及亞洲20億人賴以生存的十多條大江大河的源頭。青藏高原冰川是微生物的天然存儲器，封存了不同歷史時期的微生物。 現在，中國科學家構建的全球首個青藏高原冰川微生物
微生物領域數據庫及其分析系統建設研究取得進展
中國科學院計算機網絡信息中心大數據技術與應用發展部與中科院微生物研究所等，在微生物領域數據庫及其分析系統建設方面取得新進展，提出了一種利用語義網技術構建知識圖譜的方法，可將冠狀病毒相關的毒株、基因組、蛋白序列、蛋白結構、抗體、文獻和ZL等多源異構數據映射至資源描述框架（RDF），并構建了基于語義網框
解碼“基因寶藏”：最全海洋微生物基因數據庫出爐
9月4日晚，華大生命科學研究院（簡稱“華大”）聯合山東大學、英國東安格利亞大學、中國海洋大學、廈門大學、丹麥哥本哈根大學等機構，在《自然》上發表研究成果。他們通過對目前已公開的海洋微生物宏基因組數據進行分析和深度挖掘，構建了迄今為止最完整的海洋微生物基因數據庫，并從中發現了大量具有應用潛力的基因資源
最大的海洋微生物基因數據庫有助于藥物發現
迄今對包括細菌、病毒和真菌在內的海洋微生物基因進行的最全面分析，可為研究人員發現抗生素、追蹤氣候變化影響和保護瀕危物種奠定基礎。1月16日，相關成果發表于《科學前沿》。據《自然》報道，2021年，研究人員構建了一個目錄，其中包含約3億組陸地微生物和海洋微生物的基因。現在，沙特阿拉伯阿卜杜拉國王科技大
“百萬微生態”計劃將構建全球最大人體微生物組數據庫
2019年10月26日，“百萬微生態”國際合作計劃（MMHP）在深圳第14屆國際基因組學大會（ICG-14）上正式啟動，來自中國、瑞典、丹麥、法國、拉托維亞等多國科學家將合作開展微生物宏基因組研究，致力于在未來三至五年內對100萬份來自腸道、口腔、皮膚、生殖道等器官的微生物組樣品進行測序分析，繪
最大的海洋微生物基因數據庫有助于藥物發現
原文地址：http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2024/1/516176.shtm迄今對包括細菌、病毒和真菌在內的海洋微生物基因進行的最全面分析，可為研究人員發現抗生素、追蹤氣候變化影響和保護瀕危物種奠定基礎。1月16日，相關成果發表于《科學前沿》。據《自然》報道，
融智生物發布全球首個商用化生物組學微生物質譜數據庫
近日，融智生物宣布建設完成基于全新生物組學理念的微生物質譜數據庫。這是全球首次發布商品化生物組學微生物質譜數據庫。 傳統上，基于不同的細菌或真菌內蛋白組成分特別是核糖體蛋白有顯著的差異，對核糖體蛋白組的質譜測試，可用于快速、高準確度鑒定微生物。基質輔助激光解吸電離飛行時間質譜（MALDI-TO
期刊數據庫更新
圖片來源：B. DOUTHITT/SCIENCE 期刊影響因子多年來備受批評，認為其扭曲了學術出版。近日，美國賓夕法尼亞州克拉尼特分析公司推出了其期刊引用報告（JCR）數據庫的更新版本，并表示它提供了理解期刊特征和受眾的背景信息。 影響因子代表期刊文章的引用次數，除以其兩年間發表的文章數量，
期刊數據庫更新
圖片來源：B. DOUTHITT/SCIENCE 期刊影響因子多年來備受批評，認為其扭曲了學術出版。近日，美國賓夕法尼亞州克拉尼特分析公司推出了其期刊引用報告（JCR）數據庫的更新版本，并表示它提供了理解期刊特征和受眾的背景信息。 影響因子代表期刊文章的引用次數，除以其兩年間發表
研究構建綿羊和山羊腸道高質量微生物基因組數據庫
近日，西北農林科技大學羊遺傳改良與生物育種團隊攜手國內外多家科研機構，在綿羊和山羊腸道微生物基因組數據庫構建及腸道粘蛋白和多糖代謝功能菌種挖掘方面取得進展，研究成果發表在Microbiome上。研究團隊在全國范圍內的32個羊場收集了來自21個綿羊和山羊品種共計320個腸道樣本，分別構建了包含1.6億
超4000種－融智生物發布商用化生物組學微生物質譜數據庫
近日，融智生物宣布建設完成基于全新生物組學理念的微生物質譜數據庫。這是全球首次發布商品化生物組學微生物質譜數據庫。 傳統上，基于不同的細菌或真菌內蛋白組成分特別是核糖體蛋白有顯著的差異，對核糖體蛋白組的質譜測試，可用于快速、高準確度鑒定微生物。基質輔助激光解吸電離飛行時間質譜（MALDI-TO
中外科學家合作建立全球最大海洋微生物組數據庫
9月4日，國際頂級期刊《自然》（Nature）在線發表中外科學家的合作成果“ Global marine microbial diversity and its potential in bioprospecting ”。該成果建立了全球最大的海洋微生物組數據庫，從中發掘塑料降解酶、基因編輯工具、抗
中外科學家合作建立全球最大海洋微生物組數據庫
9月4日，國際頂級期刊《自然》（Nature）在線發表中外科學家的合作成果“ Global marine microbial diversity and its potential in bioprospecting ”。該成果建立了全球最大的海洋微生物組數據庫，從中發掘塑料降解酶、基因編輯工具
GenBank數據庫概述（四）
NCBI站點地圖---其他基因組數據介紹：1、 小鼠基因組 1) 小鼠基因組資源向導 ：把從各個中心來的各種小鼠相關的資源整合在一起，包括序列，圖譜，和克隆信息以及指向小鼠種系和突變資源的指針。 2) 小鼠基因組測序：小鼠基因組計劃的測序進展，HTG序列contigs（可以用大小和染色體號來瀏覽）由
核酸數據庫的概念
中文名稱核酸數據庫英文名稱nucleic acid data bank定 義DNA、RNA序列的資料庫，主要包括已知序列名稱、DNA或RNA全序列及其特性，如啟動區、起始和終止密碼的位置、編碼區、限制酶切位點以及推導的翻譯產物蛋白質序列等。應用學科生物化學與分子生物學（一級學科），方法與技術（二級
GenBank數據庫概述（三）
結構： 1、 結構主頁 — 關于NCBI結構小組的一般信息和他們的研究計劃，另外也可以訪問分子模型數據庫（MMDB）和用來搜索和顯示結構的相關工具。 2、 MMDB：分子模型數據庫 — 一個關于三維生物分子結構的數據庫，結構來自于X-ray晶體衍射和NMR色譜分析。MMDB是來源于Brook
GenBank數據庫概述（一）
1. GenBank屬于一個序列數據庫的國際合作組織，包括EMBL和DDBJ。是NIH遺傳序列數據庫，一個所有可以公開獲得的DNA序列的注釋過的收集。GenBank同日本和歐洲分子生物學實驗室的DNA數據庫共同構成了國際核酸序列數據庫合作。唯一人類基因序列集合（UniGene），人類基因組基因圖
GenBank數據庫概述（二）
FTP GenBank and Daily Updates：1. GenBank普通文件格式 — 參見GenBank記錄樣本和在GenBank公布通知中的詳細描述，下載大多數最近的完全公告和日常積累或非積累更新數據。 2. ASN.1格式 — 摘要句法記號1，國際標準組織（ISO）數據表示格式，下載
漢語語言產生數據庫發表
原文地址：http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2024/2/517976.shtm
QP2010農藥數據庫
Shimadzu氣質聯用的多種農藥庫 QP2010農藥數據庫
美國更新食品摻假數據庫
9月5日食品安全新聞網消息，美國藥典委員會（USP）更新了食品摻假數據庫（FFD2.0）。食品摻假數據庫主要為行業、監管部門以及消費者預防和應對食品摻假事件發生提供技術支持。最新的FFD2.0涵蓋了科研文獻、媒體信息、食品監管記錄、司法裁決記錄中涉及食品摻假事件的各種信息。新版食品摻假數據庫將于
生命科學常用數據庫
The NationalCenter for Biotechnology Information.?http://www.ncbi.nlm.nih.gov/National Center for GenomeResources.http://www.ncgr.org/ncgr/ncgr.html?T
全球危險病毒數據庫上線
一個供研究人員共享危險病毒基因組的新數據庫，有望解決許多阻礙現有方法的問題。但前提是，必須說服研究人員使用它。據《自然》報道，這一名為Pathoplexus的數據庫于上個月啟動，數據庫背后的科學家團隊希望有更多研究人員分享已知和新出現的對公共衛生具有重要意義的基因序列。澳大利亞悉尼大學病毒學家Edw
拉曼光譜免費數據庫
拉曼數據庫在物質鑒定和化學分析方面具有重要的作用。關于拉曼數據，我們一般會關注兩個峰的位置，分別是D峰和G峰。D峰和G-峰均是C原子晶體的 Raman特征峰，分別在1350cm-1和 1580 cm-1附近，D峰反應的是晶格的碳缺陷，G峰反應的是材料的碳化程度。I(D) / I(G) 是 D峰和G峰
“敦煌遺書數據庫”建成投用
3月10日，在十四屆全國人大二次會議甘肅代表團開放團組活動上，敦煌研究院黨委委員、保護研究部副部長汪萬福代表介紹，該院“流失海外敦煌文物數字化復原項目”邁出實質步伐，“敦煌遺書數據庫”業已建成投用。 汪萬福說，敦煌研究院還組建了甘肅省敦煌文物保護研究中心，建成國內首座文物保護領域多場耦合實驗室