GenBank數據庫概述（二）
FTP GenBank and Daily Updates：1. GenBank普通文件格式 — 參見GenBank記錄樣本和在GenBank公布通知中的詳細描述，下載大多數最近的完全公告和日常積累或非積累更新數據。 2. ASN.1格式 — 摘要句法記號1，國際標準組織（ISO）數據表示格式，下載大多數最近的完全公告和日常積累或非積累更新數據。 3. FASTA格式 — 定義行號后只跟隨序列數據（示例），參見描述數據庫的readme文件，包括nt.Z（每天更新的非冗余BLAST核酸數據庫，包括GenBank+EMBL+DDBJ+PDB序列，但是不包括EST, STS, GSS, or HTGS序列），nr.Z（每日更新的非冗余蛋白質），est.Z, gss.Z, htg.Z, sts.Z,和其它文件。 分子數據庫：1. 核酸序列1、 Entrez核酸： 用accession number,作者姓名，物種，基......閱讀全文
GenBank數據庫概述（二）
FTP GenBank and Daily Updates：1. GenBank普通文件格式 — 參見GenBank記錄樣本和在GenBank公布通知中的詳細描述，下載大多數最近的完全公告和日常積累或非積累更新數據。 2. ASN.1格式 — 摘要句法記號1，國際標準組織（ISO）數據表示格式，下載
GenBank數據庫概述（三）
結構： 1、 結構主頁 — 關于NCBI結構小組的一般信息和他們的研究計劃，另外也可以訪問分子模型數據庫（MMDB）和用來搜索和顯示結構的相關工具。 2、 MMDB：分子模型數據庫 — 一個關于三維生物分子結構的數據庫，結構來自于X-ray晶體衍射和NMR色譜分析。MMDB是來源于Brook
GenBank數據庫概述（四）
NCBI站點地圖---其他基因組數據介紹：1、 小鼠基因組 1) 小鼠基因組資源向導 ：把從各個中心來的各種小鼠相關的資源整合在一起，包括序列，圖譜，和克隆信息以及指向小鼠種系和突變資源的指針。 2) 小鼠基因組測序：小鼠基因組計劃的測序進展，HTG序列contigs（可以用大小和染色體號來瀏覽）由
GenBank數據庫概述（一）
1. GenBank屬于一個序列數據庫的國際合作組織，包括EMBL和DDBJ。是NIH遺傳序列數據庫，一個所有可以公開獲得的DNA序列的注釋過的收集。GenBank同日本和歐洲分子生物學實驗室的DNA數據庫共同構成了國際核酸序列數據庫合作。唯一人類基因序列集合（UniGene），人類基因組基因圖
Using－GenBank
GenBank(R) is a comprehensive database of publicly available DNA sequences for more than 205,000 named organisms and for more than 60,000 within t
NCBI－GenBank數據庫的起源、功能和常遇問題及解答
GenBank數據庫功能為一、提交獲取的基因序列；二、查找已知基因的序列生物學特性信息，例如編碼區，科學命名等。那么Genebank ID 和Gene cluster ID又是什么呢？ GenBank數據庫起源 GenBank數據庫是1982年由美國國立生物技術信息中心(NCBI)建
Using－GenBank－for－Genomic－Authentication:－A－Tutorial
The GenBank? database is perhaps one of the most important repositories of genetic information. A researcher working in the field of genomic authe
－震驚！Genbank參考基因組序列多處錯誤！
?震驚！Genbank參考基因組序列多處錯誤！ 隨著基因組測序技術的飛速發展以及測序成本的快速降低，全基因組數據也在急速增加。盡管參考基因組數據是非常有價值的資源，但是由于測序過程中的外源污染或者研究者對數據組裝方法的誤用，使得基因組數據面臨很多問題。 近日，約翰霍
糖異生概述（二）
?? 三、糖異生的調節 糖異生的限速酶主要有以下4個酶：丙酮酸羧化酶、磷酸烯醇式丙酮酸羧激酶、果糖二磷酸酶和葡萄糖磷酸酶。 (一)激素對糖異生的調節 激素調節糖異生作用對維持機體的恒穩狀態十分重要，激素對糖異生調節實質是調節糖異生和糖酵解這兩個途徑的調節酶以及控制供應肝臟的脂肪酸，更大量的脂肪
核酸序列的檢索實驗
實驗方法原理掌握核酸序列檢索的操作方法；熟悉GenBank數據庫序列格式及其主要字段的含義；了解EMBL數據庫序列格式及其主要字段的含義；熟悉GenBank數據庫序列格式的FASTA序列格式顯示與保存；實驗材料電腦儀器、耗材筆記本筆實驗步驟1. ?使用Entrez信息查詢系統檢索核酸序列BC0608
凝膠成像概述（二）
凝膠成像一般操作步驟 1．打開凝膠成像系統開關。 2．打開電腦，系統自動打開并進入成像軟件。 3．打開凝膠成像系統前面板，選擇使用紫外透射光源或者白光透射光源，將相應光源安放到位。 4．將樣品放置在透射光源的樣品臺上。 5．在成像操作界面里面選擇使用Upper wh
生物氧化概述（二）
? 加單氧酶主要分布在肝、腎組織微粒體中，少數加單氧酶也存在于線粒體中，加單氧酶主要參與類固醇激素(性激素、腎上腺皮質激素)、膽汁酸鹽、膽色素、活性維生素D的生成和某些藥物、毒物的生物轉化過程。加單氧酶可受底物誘導，而且細胞色素P450基質特異性低，一種基質提高了加單氧酶的活性便可同時加快幾種物質的
凝膠成像概述（二）
凝膠成像一般操作步驟1．打開凝膠成像系統開關。2．打開電腦，系統自動打開并進入成像軟件。3．打開凝膠成像系統前面板，選擇使用紫外透射光源或者白光透射光源，將相應光源安放到位。4．將樣品放置在透射光源的樣品臺上。5．在成像操作界面里面選擇使用Upper white光源，點擊綠色（即時成像）按鈕。常見問
磷脂代謝概述（二）
? (二)甘油磷脂的合成 合成全過程可分為三個階段，即原料來源、活化和甘油磷脂生成。甘油磷脂的合成在細胞質滑面內質網上進行，通過高爾基體加工，最后可被組織生物膜利用或成為脂蛋白分泌出細胞。機體各種組織(除成熟紅細胞外)即可以進行磷脂合成。 1.原料來源 合成甘油磷脂的原料為磷脂酸與取代基團。磷
如何快速查找LncRNA序列？
查找LncRNA序列的網站有很多，包括Genebank，Ensembl，RefSeq，UCSC數據庫等。今天，小編就給大家講講如何通過LncRNA ID號查找LncRNA的序列。一．根據LncRNA來源數據庫，進入相應鏈接。?Genebank：https://www.ncbi.nlm.nih.gov
安全輸血概述（二）
（五）人群免疫水平。如果某病毒可以經血傳播，并且在感染人體后可能引起嚴重的損傷和后果，這種情況下，人群中對此病毒的免疫水平將成為決定這種病毒經血傳播危險大小的重要因素。如果人群對此病毒的免疫力低，大多數人感染后將發病，則該病毒輸血傳播危險大。反之，如果人群免疫水平高，則輸血傳播病毒并造成危害的危險就
分析化學概述（二）
色譜法也稱層析法。1906年俄國茨維特將綠葉提取汁加在碳酸鈣沉淀柱頂部，繼用純溶劑淋洗，從而分離出葉綠素。此項研究發表在德國《植物學》雜志上，但未能引起人們注意。直到1931年德國的庫恩和萊德爾再次發現本法并顯示其效能，人們才從文獻中追溯到茨維特的研究和更早的有關研究，如1850年韋曾利用土壤柱進行
血脂及其代謝概述（二）
? (三)脂蛋白的代謝 1.乳糜微粒(CM) 乳糜微粒是在小腸粘膜細胞中生成的，食物中的脂類在細胞滑面內質網上經再酯化后與粗面內質網上合成的載脂蛋白構成新生的(nascent)乳糜微粒(包括甘油三酯、膽固醇酯和磷脂以及poB48)，經高爾基復合體分泌到細胞外，進入淋巴循環最終進入血液。 新生乳
二妙丸的概述
二妙丸，中成藥名。為祛濕劑，具有燥濕清熱功效。用于濕熱下注，足膝紅腫熱痛，下肢丹毒，白帶，陰囊濕癢。
色譜法概述（二）
第七課 液相色譜儀?氣相色譜法是一種很好的分離、分析方法，它具有分析 速度快、分離效能好和靈 敏度高等優點。但是氣相色 譜僅能分析在操作溫度下能汽化而不分解的物質。據估 計，在已知化合物中能直接進行氣相色譜分析的化合物 約占15％，加上制成衍生物的化合物，也不過20％左右。 對于高沸點化合物；難揮發
血液輻照儀概述（二）
2 技術特性2.1 主要性能1、允許最大裝源活度：2000Ci。2、放射源幾何尺寸：φ30mm×70mm。3、輻照方式：時間控制、劑量控制。4、具有多項安全聯鎖（參見“安全保護及事故處理”）。5、具有劑量計算功能，可根據放射源衰減系數自動計算當前放射源活度并實時顯示；可顯示預置時間、已照時間、剩余時
多肽合成儀概述（二）
3、固相多肽合成的應用——多肽合成儀 多肽固相合成技術的發明同時促進了多肽合成的自動化。世界上第一臺真正意義上的多肽合成儀出現在1980年代初期，它是利用氮氣鼓泡來對反應物進行攪拌，用計算機程序控制來實現有限度的自動合成。雖然在各項功能方面有著明顯的缺陷，但是它畢竟把人從實驗室里解放出來，極大地提高
血型與輸血概述（二）
2．ABO抗原的生物合成：基因ABO及H控制著A、B抗原的形成。每個人從父母處分別獲得ABO基因，它們決定闃紅細胞膜上有抗原。O基因為無效基因，它沒有相應的答產生。H位點的兩個等位基因之一，H產生一種酶，在其作用下生成A或B抗原的前身物質。ABH血型抗原決定簇的前身物質是紅細胞膜上含4個糖的低聚
基因敲除技術概述（二）
2.1.2條件性基因敲除法條件性基因敲除法可定義為將某個基因的修飾限制于小鼠某些特定類型的細胞或發育的某一特定階段的一種特殊的基因敲除方法[2]。它實際上是在常規的基因敲除的基礎上，利用重組酶Cre介導的位點特異性重組技術，在對小鼠基因修飾的時空范圍上設置一個可調控的“按鈕”，從而使對小鼠基因組的修
層析技術概述（二）
分辨率： 由上式可見，Rs值越大，兩種組分分離的越好。當Rs = 1時，兩組分具有教好的分離，互相沾染約2%，即每種組分的純度約為98%。當Rs=1.5時，兩組分基本完全分開，每種組分的純度可達到99.8%。如果兩種組分的濃度相差較大時，尤其要求較高的分辨率。 為了提高分辨率Rs 的值，可采用以下方
基因突變概述（二）
? （二)移碼突變 移碼突變（frame-shift mutation)是指DNA鏈上插入或丟失1個、2個甚至多個堿基（但不是三聯體密碼子及其倍數)，在讀碼時，由于原來的密碼子移位，導致在插入或丟失堿基部位以后的編碼都發生了相應改變。移碼突變造成的肽鏈延長或縮短，取決于移碼終止密碼子推后或提前
生命科學國外重要數據庫
EMBL數據庫結構EMBL數據庫的基本單位也是序列條目，包括核甘酸堿基排列順序和注釋兩部分。序列條目由字段組成，每個字段由標識字起始，后面為該字段的具體說明。有些字段又分若干次子字段，以次標識字或特性表說明符開始，最后以雙斜杠“//”作本序列條目結束標記。條目的關鍵字包括ID（序列名稱），DE（序列
基因表達輪廓（gene－expressed－profile）技術2
經過這輪ＲＤＡ過程,Tester中的目的DNA將得到第一次富集。將第一輪產物更換新接頭,進行第二輪RDA過程,目的DNA可得到進一步的富集。該技術假陽性很低。但仍不能解決個體mRNA在豐度上存在巨大差異的問題,當靶序列濃度較低時,其富集受抑制。3：抑制消減雜交（suppression subtrac
RNAi技術專有名詞(2)
21.Homologous Chromosome：同源染色體一對染色體，分別來自父本和母本，染色體上有著相同的線性基因序列。 22.Recombinant Clone：重組克隆將不同來源的DNA片段合成在一個DNA分子中，這種技術稱為重組，得到的分子為重組克隆。 23.Ribonucleic
旋轉蒸發器概述（二）
? 四、旋轉蒸發儀的優點:? 1.所有的旋轉蒸發儀都內置了一個升降馬達，該裝置可以在斷電的時候自動將燒瓶提升到加熱鍋以上的位置。? 2.由于液體樣品和蒸發瓶間的向心力和摩擦力的作用，液體樣品在蒸發瓶內表面形成一層液體薄膜，受熱面積大;? 3.樣品的旋轉所產生的作用力有效抑制樣品的沸騰。綜上特征