GenBank數據庫概述（一）
1. GenBank屬于一個序列數據庫的國際合作組織，包括EMBL和DDBJ。是NIH遺傳序列數據庫，一個所有可以公開獲得的DNA序列的注釋過的收集。GenBank同日本和歐洲分子生物學實驗室的DNA數據庫共同構成了國際核酸序列數據庫合作。唯一人類基因序列集合（UniGene），人類基因組基因圖譜，分類學瀏覽器，同國立癌癥研究所合作的癌癥基因組剖析計劃（CGAP）等數據庫。GenBank以指數形式增長，核酸堿基數目大概每14個月就翻一個倍。2. 紀錄樣本 - 關于GenBank的各個字段的詳細描述，以及同Entrez搜索字段的交叉索引。3. 訪問GenBank - 通過Entrez Nucleotides來查詢。用accession number，作者姓名，物種，基因/蛋白名字，還有許多其他的文本術語來查詢。關于Entrez更多的信息請看下文。用BLAST來在GenBank和其他數據庫中進行序列相似搜索。用E-mai......閱讀全文
GenBank數據庫概述（一）
1. GenBank屬于一個序列數據庫的國際合作組織，包括EMBL和DDBJ。是NIH遺傳序列數據庫，一個所有可以公開獲得的DNA序列的注釋過的收集。GenBank同日本和歐洲分子生物學實驗室的DNA數據庫共同構成了國際核酸序列數據庫合作。唯一人類基因序列集合（UniGene），人類基因組基因圖
GenBank數據庫概述（三）
結構： 1、 結構主頁 — 關于NCBI結構小組的一般信息和他們的研究計劃，另外也可以訪問分子模型數據庫（MMDB）和用來搜索和顯示結構的相關工具。 2、 MMDB：分子模型數據庫 — 一個關于三維生物分子結構的數據庫，結構來自于X-ray晶體衍射和NMR色譜分析。MMDB是來源于Brook
GenBank數據庫概述（四）
NCBI站點地圖---其他基因組數據介紹：1、 小鼠基因組 1) 小鼠基因組資源向導 ：把從各個中心來的各種小鼠相關的資源整合在一起，包括序列，圖譜，和克隆信息以及指向小鼠種系和突變資源的指針。 2) 小鼠基因組測序：小鼠基因組計劃的測序進展，HTG序列contigs（可以用大小和染色體號來瀏覽）由
GenBank數據庫概述（二）
FTP GenBank and Daily Updates：1. GenBank普通文件格式 — 參見GenBank記錄樣本和在GenBank公布通知中的詳細描述，下載大多數最近的完全公告和日常積累或非積累更新數據。 2. ASN.1格式 — 摘要句法記號1，國際標準組織（ISO）數據表示格式，下載
Using－GenBank
GenBank(R) is a comprehensive database of publicly available DNA sequences for more than 205,000 named organisms and for more than 60,000 within t
NCBI－GenBank數據庫的起源、功能和常遇問題及解答
GenBank數據庫功能為一、提交獲取的基因序列；二、查找已知基因的序列生物學特性信息，例如編碼區，科學命名等。那么Genebank ID 和Gene cluster ID又是什么呢？ GenBank數據庫起源 GenBank數據庫是1982年由美國國立生物技術信息中心(NCBI)建
Using－GenBank－for－Genomic－Authentication:－A－Tutorial
The GenBank? database is perhaps one of the most important repositories of genetic information. A researcher working in the field of genomic authe
－震驚！Genbank參考基因組序列多處錯誤！
?震驚！Genbank參考基因組序列多處錯誤！ 隨著基因組測序技術的飛速發展以及測序成本的快速降低，全基因組數據也在急速增加。盡管參考基因組數據是非常有價值的資源，但是由于測序過程中的外源污染或者研究者對數據組裝方法的誤用，使得基因組數據面臨很多問題。 近日，約翰霍
核酸序列的檢索實驗
實驗方法原理掌握核酸序列檢索的操作方法；熟悉GenBank數據庫序列格式及其主要字段的含義；了解EMBL數據庫序列格式及其主要字段的含義；熟悉GenBank數據庫序列格式的FASTA序列格式顯示與保存；實驗材料電腦儀器、耗材筆記本筆實驗步驟1. ?使用Entrez信息查詢系統檢索核酸序列BC0608
一步一步教你使用NCBI數據庫資源
相關專題隨著ncbi 數據庫各種資源的涌現，NCBI已經成為科研工作者必不可少的資料查找，數據分析的工具。那么NCBI數據如何使用，新手入門一步一步教你認識和使用NCBI數據庫。一 綜合數據庫NCBI數據庫集美國國立生物技術信息中心(National Center for Biotechnology
一步一步教你使用NCBI數據庫資源2
6 基因組信息6.1 數據庫6.1.1 Entrez GenomeEntrez Genome數據庫收錄了850多種微生物、3100多種病毒以及1600多種真核生物細胞器的完整基因組數據以及將近50種動物、綠色植物和真菌的700多條染色體信息，總共收錄有6200多條序列，其中有882條是去年新增的序列
生命科學國外重要數據庫
EMBL數據庫結構EMBL數據庫的基本單位也是序列條目，包括核甘酸堿基排列順序和注釋兩部分。序列條目由字段組成，每個字段由標識字起始，后面為該字段的具體說明。有些字段又分若干次子字段，以次標識字或特性表說明符開始，最后以雙斜杠“//”作本序列條目結束標記。條目的關鍵字包括ID（序列名稱），DE（序列
糖異生概述（一）
? 非糖物質轉變為葡萄糖或糖原的過程稱為糖異生（gluconeogenesis)。非糖物質主要有生糖氨基酸(甘、丙、蘇、絲、天冬、谷、半胱、脯、精、組等)、有機酸(乳酸、丙酮酸及三羧酸循環中各種羧酸等)和甘油等。不同物質轉變為糖的速度不同。 進行糖異生的器官，首推肝臟，長期饑餓和酸中毒時腎臟中的糖
RNAi技術專有名詞(2)
21.Homologous Chromosome：同源染色體一對染色體，分別來自父本和母本，染色體上有著相同的線性基因序列。 22.Recombinant Clone：重組克隆將不同來源的DNA片段合成在一個DNA分子中，這種技術稱為重組，得到的分子為重組克隆。 23.Ribonucleic
蛋白質組學常用數據庫一覽
一蛋白質數據庫 1.UniProt (The Universal Protein Resource) 網址：http://www.uniprot.org/ http://www.ebi.ac.uk/uniprot/ 簡介：由EBI(歐洲生物信息研究所)、PIR(蛋白信息資源)和SIB(瑞
又一國產高分數據庫，堪稱lncRNA神器
之前我們介紹了好用的CRN數據庫，可以在線分析差異表達lncRNA并繪制與差異mRNA聯系的網絡圖。那么有沒有能直接出lncRNA與預后相關的生存曲線圖的工具呢？答案當然是有的！這次我們就一起來看一下這個數據庫！ lnCAR數據庫（https://lncar.renlab.org/）是由中山大
如何快速查找LncRNA序列？
查找LncRNA序列的網站有很多，包括Genebank，Ensembl，RefSeq，UCSC數據庫等。今天，小編就給大家講講如何通過LncRNA ID號查找LncRNA的序列。一．根據LncRNA來源數據庫，進入相應鏈接。?Genebank：https://www.ncbi.nlm.nih.gov
凝膠成像概述（一）
凝膠成像定義?凝膠成像即對dna/rna/蛋白質等凝膠電泳不同染色（如eb、考馬氏亮藍、銀染、sybr green）及微孔板、平皿等非化學發光成像檢測分析。凝膠成像系統可以應用于分子量計算,密度掃描,密度定量, PCR定量等生物工程常規研究。凝膠成像系統的原理樣品在電泳凝膠或者其他載體上的遷移率不一
磷脂代謝概述（一）
? 磷脂是一類含有磷酸的脂類，機體中主要含有兩大類磷脂，由甘油構成的磷脂稱為甘油磷脂(phosphoglyceride)；由神經鞘氨醇構成的磷脂，稱為鞘磷脂(sphingolipid)。其結構特點是：具有由磷酸相連的取代基團(含氨堿或醇類)構成的親水頭(hydrophilic head)和由脂肪
生物氧化概述（一）
? 體內大部分物質都可進行氧化反應，在生物體內進行的氧化反應與體外氧化反應有許多共同之處：它們都遵循氧化反應的一般規律，常見的氧化方式有脫電子、脫氫和加氧等類型；最終氧化分解產物是CO2和H2O，同時釋放能量。但是生物氧化反應又有其特點：①體外氧化反應主要以熱能形式釋放能量；而生物氧化主要以生成AT
凝膠成像概述（一）
凝膠成像定義 凝膠成像即對dna/rna/蛋白質等凝膠電泳不同染色（如eb、考馬氏亮藍、銀染、sybr green）及微孔板、平皿等非化學發光成像檢測分析。 凝膠成像系統可以應用于分子量計算,密度掃描,密度定量, PCR定量等生物工程常規研究。 凝膠成像系統的原理 樣
我國發現世界首例缺失型α地中海貧血突變基因
記者5日從廣西壯族自治區人民醫院獲悉，經過近2年的研究，該院檢驗科主管技師李友瓊等醫務人員發現了世界首例缺失型α地中海貧血突變基因，并于日前在美國DNA數據庫成功注冊。這一新突變基因的發現，不僅豐富了世界地中海貧血突變基因數據庫，同時為在臨床上避免地貧患兒的降生及科學研究提供了新的參考信息。
中國發現世界首例缺失型α地中海貧血突變基因
從廣西壯族自治區人民醫院獲悉，經過近2年的研究，該院檢驗科主管技師李友瓊等醫務人員發現了世界首例缺失型α地中海貧血突變基因，并于日前在美國DNA數據庫成功注冊。這一新突變基因的發現，不僅豐富了世界地中海貧血突變基因數據庫，同時為在臨床上避免地貧患兒的降生及科學研究提供了新的參考信息。 據介
cDNA－法推斷蛋白質的一級結構實驗5
實驗材料cDNA實驗步驟1. 首先是對所得 cDNA 進行同源性的比較。通常是在 NCBl 的 GenBank 數據庫中來完成，利用 Blast 程序，比較其與已知基因的同源性。2. 判斷是否為完整的 cDNA 序列：如有無 polyA，有無起始和終止密碼尋找開放性閱讀框架（ORF，open rea
生物信息學應用：序列分析，電子克隆等初探
生物信息學可指利用信息技術管理和分析生物學數據。這就意味著生物信息學所涉及的范圍相當廣泛，從人工智能、機器人一直到基因組(genome)分析。就基因組分析這一角度來看，生物信息學主要是指核酸和蛋白質序列數據的計算機處理和分析。近年來，蛋白質結構數據的快速增長，使蛋白質三維結構的處理分析也歸入到生物信
基因表達輪廓（gene－expressed－profile）技術2
經過這輪ＲＤＡ過程,Tester中的目的DNA將得到第一次富集。將第一輪產物更換新接頭,進行第二輪RDA過程,目的DNA可得到進一步的富集。該技術假陽性很低。但仍不能解決個體mRNA在豐度上存在巨大差異的問題,當靶序列濃度較低時,其富集受抑制。3：抑制消減雜交（suppression subtrac
期刊數據庫更新
圖片來源：B. DOUTHITT/SCIENCE 期刊影響因子多年來備受批評，認為其扭曲了學術出版。近日，美國賓夕法尼亞州克拉尼特分析公司推出了其期刊引用報告（JCR）數據庫的更新版本，并表示它提供了理解期刊特征和受眾的背景信息。 影響因子代表期刊文章的引用次數，除以其兩年間發表
期刊數據庫更新
圖片來源：B. DOUTHITT/SCIENCE 期刊影響因子多年來備受批評，認為其扭曲了學術出版。近日，美國賓夕法尼亞州克拉尼特分析公司推出了其期刊引用報告（JCR）數據庫的更新版本，并表示它提供了理解期刊特征和受眾的背景信息。 影響因子代表期刊文章的引用次數，除以其兩年間發表的文章數量，
血型與輸血概述（一）
第一節 血型 最早，血型是指存在于紅細胞上特異性同種抗原而言，后來發現紅細胞上具有的同種抗原遠較想象的復雜，而且除紅細胞外，白細胞、血小板上也都有同種抗原，這就使血型的概念有所擴大。目前可發理解為血型是血液系統的一種遺傳多態性，是產生氣壯山河原體抗體的遺傳性狀，池給缺乏某種抗原體的個體輸入此種抗原
血脂及其代謝概述（一）
血漿中含有的脂類統稱為血酯，包括甘油三酯、磷脂、膽固醇及其酯和非酯化脂肪(nonesterified fatty acid)，亦稱游離脂肪酸(free fatty acid,簡寫FFA)。血脂在脂類的運輸和代謝上起著重要作用。血脂只占體重的0.04%，其含量受到飲食、營養、疾病等因素的影響