盤點食品界中漸漸崛起的基因測序
2015年可謂是基因測序的元年，自精準醫療概念提出以來，基因測序在我國曾幾度被央視報道。隨著人類基因組計劃的完成，基因測序技術不斷提高，價格也不斷降低，人類完成各種基因組測序成為了可能。無論在醫療行業還是在農業等領域，基因測序技術均大放光彩，殊不知，近年來基因測序在食品行業也漸漸崛起。本文綜述了近期國內基因測序的新研究成果，同時盤點了發生在食品領域的基因測序事件。 近期我國基因測序科研領域所獲的成就 基因測序在醫療界可謂是如火如荼，國家對醫療領域基因測序的政策出臺速度和密度史無前例，國內測序市場規模也迅猛增長，預計未來市場規模可破千億元。除了受醫療領域青睞，農業也鐘情于基因測序，目前我國已完成了水稻、小麥、玉米以及黃瓜等大概70%到80%重要的作物基因組測序，初步掌握了這些作物遺傳基因的功能性狀，研究水平已走在國際前列。 基因測序不僅受到我國企業家們的青睞，同時也是科研界的寵兒，近期我國有關基因測序的研究成果頻頻發表于......閱讀全文
基因組測序揭示家鴿起源史
2月1日，由美國猶他大學、深圳華大基因研究院等單位合作完成的鴿子基因組研究成果在《科學》雜志在線發表。該研究從分子層面揭示了家鴿的起源歷史，并發現了鴿子羽冠多樣性的遺傳基礎。 據悉，鴿子是目前為數不多的已完成測序的鳥類之一，其基因組與家雞、火雞、斑馬雀及虎皮鸚鵡的基因組一起，將為鳥類的群體
Nature發布基因組測序驚人發現
來自沖繩科學技術研究院大學(OIST)的一支研究團隊與合作者們，完成了對兩個稱作為柱頭蟲(acorn worm)的小水生生物物種的測序，顯示相比于許多其他動物，我們與柱頭蟲共享了更多的基因，確立了它們是我們的遠親。研究結果發布在《自然》（Nature）雜志上。 研究發現，所有后口動物（deut
全基因組測序的診斷價值
根據《Nature Genetics》上發表的一項新成果，全基因組測序有望用于臨床上的遺傳病診斷。這項研究評估了影響全基因組測序在臨床診斷中取得成功的因素。 這個國際研究小組由英國的研究人員領導，對156個病例或家庭開展了臨床基因組測序。這些病例有著遺傳疾病的特征，但無法通過之前的篩查檢測來解
最新基因組測序成果盤點
近來，各大雜志上陸續發表了不少重要的基因組測序成果。the scientist雜志對此進行了盤點，以饗讀者。 種屬：野鴨，綠頭鴨(Anas platyrhynchos) 基因組：約13 billion bp 鴨子是幾乎所有甲型流感病毒的天然宿主(包括H5N1)。日前，研究人員測
美洲大蠊基因組測序完成
中科學院上海生命科學研究院植物生理生態研究所詹帥及同事對美洲大蠊進行了基因組測序和分析，表明在已測基因組的昆蟲中，其基因組規模僅次于蝗蟲。這項研究3月21日在線發表于《自然—通訊》，文章揭示了該物種成功適應城市環境的遺傳學基礎的相關洞察。 美洲大蠊（Periplaneta americana
Science公布最新基因組測序結果
來自法國農業科學研究院（Institut National de Recherche Agronomique）的研究人員發表了題為“Early allopolyploid evolution in the post-Neolithic Brassica napus oilseed genome”
基因組高通量測序的原理
測序方案建立在雙脫氧測序法(Sanger等，1977)的基礎上。為了從每一克隆插入片段兩端成對地進行測序，每一個質粒模板DNA板應配備兩個384孔循環測序反應板。測序反應采用Big Dye Terminator chemistry version 3．1(AppliedBiosystems)和標準M
PNAS：基因組測序的驚人發現
科學家們發現，水母（平凡的海洋生物）經過漫長的進化變成了生活在其它動物體內的奇特寄生蟲。這項研究發表在本周的美國國家科學院院刊PNAS雜志上。 Myxozoa是感染無脊椎動物和脊椎動物宿主的微小寄生蟲，由少數幾個細胞組成。美國堪薩斯大學的研究人員對這種生物進行了基因組測序，發現它們實際上是高度
盤點基因組測序的最新成果
近日，the scientist雜志發表文章盤點了最近發布的幾項基因組測序成果，一起來看看吧。 昏睡病傳播者 種屬：采采蠅(Glossina morsitans morsitans) 基因組：360 million bp 國際舌蠅基因組計劃(International G
全基因組測序各步驟工具
全基因組測序（WGS）是下一代測序技術，用于快速，低成本地確定生物體的完整基因組序列。基因組的深度測序對于臨床研究的意義重大，解讀WGS數據并了解基因組突變在健康和疾病中的重要性是精準醫療的基石。WGS分析流程能分為三大塊，數據處理、檢測變異和綜合分析，具體如下圖所示：由于WGS現在已經非常成熟了，
454測序用于美洲奶牛種牛基因組測序項目
一只名為Pawnee Farm Arlinda Chief的種牛和它的兒子Walkway Chief Mark大約有60000個后代，其后代是牛奶生產的主力。最近一項研究中1，科學家通過454全基因組測序，掌握了他們的基因組中控制重要性狀的基因，包括抗病能力、牛奶產量，這些性狀已通過北美的當
科學家進行基因組測序－成功破譯金雕基因組
?? 作為一種知名度極高的猛禽，金雕經常以威猛霸氣的形象出現在影視作品和小說中。現在，英國研究人員完成了對金雕的基因組測序工作，希望從基因層面深入了解這一物種，以便更好地保護它們。 金雕以巨大的體型和敏捷有力的飛行等特征而著名，其成鳥的翼展平均超過2米，體長可達1米。金雕一般生活于多山或丘陵地區
宏基因組學技術測序木乃伊的肺結核基因組
來自華威大學的研究者使用宏基因組學技術發現215年之久的木乃伊的肺結核基因組。 由Mark Pallen帶領的研究團隊試圖用技術來發現組織學標本中的肺結核的DNA。 宏基因組學是一種從樣本中檢測DNA序列的技術，并且樣本不需要培養或擴增。這種方法避免了與細菌培養或DNA擴增
Nature：全基因組測序重新定義癌癥之王基因組突變藍圖
近日，一項發表于國際著名雜志Nature上的研究論文中，來自英國和澳大利亞的研究人員對100位胰腺癌患者癌癥組織的基因組進行了深入分析，結果發現了4種不同的亞型，這或許可以幫助后期開發治療胰腺癌患者的新型療法。文章中研究人員利用全基因組測序技術揭示了腫瘤基因組結構性改變的光譜模式，該技術可以幫助
胡蘿卜基因組序列草圖繪出－特有基因決定顏色營養價值
來自美國的一個研究小組稱，他們完成了對30余種胡蘿卜樣品的測序，繪制出了胡蘿卜基因組序列草圖。這很可能是迄今最完整的蔬菜基因組序列草圖。研究人員稱，這一研究闡明了胡蘿卜的起源和演化過程，對改善胡蘿卜和其他農作物的營養價值提供了可能。相關論文在線發表在《自然·遺傳學》雜志網站上。 胡蘿卜和生菜、
中國科學家Nature子刊發布藏羚羊基因組草圖
來自青海大學、深圳華大基因研究院和中科院昆明動物研究所等處的研究人員成功繪制出了藏羚羊(Tibetan antelope)的基因組序列草圖，揭示出了高原適應的遺傳機制。相關論文“Draft genome sequence of the Tibetan antelope”發表在5月14日的
法國擬建高速基因組測序分析平臺
法國總理菲利普17日在巴黎宣布，法國在法蘭西島大區（又稱“巴黎大區”）和中部奧弗涅—羅訥—阿爾卑斯大區啟動建設兩個高速基因組測序分析平臺，以推動法國基因組相關研究的發展。 法國政府去年6月提出“法國基因組醫學2025”計劃，這兩個基因組測序分析平臺的建設就隸屬該計劃，預計將于2018年正式開始
科學家完成柑橘基因組測序
美國佛羅里達大學研究人員帶領的一個國際研究小組日前完成了對甜橙和克萊門氏小柑橘（為柑橘與酸柑雜交的品種）樹的基因測序工作，并公布了相關基因圖譜，這在柑橘屬果樹中尚屬首次。 研究人員稱，該基因圖譜的公布將有助于科學家找到新方法來對抗包括柑橘黃龍病（又稱黃枯病、青果病，對柑橘危
《自然》封面：大熊貓基因組測序
由深圳華大基因研究院發起，中國科學院昆明動物研究所、中國科學院動物研究所、成都大熊貓繁育研究基地和中國保護大熊貓研究中心參與的合作研究成果《大熊貓基因組測序和組裝》，1月21日以封面故事形式在國際權威雜志《自然》上發表。 在國家林業局、深圳市政府、深圳市鹽田區政府及相關企業的支持下，“
我國率先完成棗樹全基因組測序
在科技部“十一五”和“十二五”科技支撐計劃項目的持續資助下，河北農業大學劉孟軍教授研究團隊在世界上率先完成了棗樹的高質量全基因組測序，組裝出總長4.38億個堿基的棗基因組序列，達估測基因組的98.6%，使棗樹成為世界鼠李科植物（近千種）和我國干果樹種中第一個完成基因組測序的物種。 相關論文
我國率先完成菊花全基因組測序
中國中醫科學院中藥研究所和安利植物研發中心對外發布消息稱，由他們共同發起的科研團隊，在菊花全基因組計劃獲重大進展的同時，還完成了重要的藥用菊花品種——杭白菊的全長轉錄組遺傳信息發掘。此舉使我國成為世界上首次完成菊屬植物菊花全基因組測序的國家。 據了解，菊屬植物染色體結構復雜，包含從2n=18到
中藥材“甘草”基因組測序完成
科技日報東京10月27日電 （記者陳超）日本理化學研究所、千葉大學、高知大學和大阪大學等組成的一個研究小組宣布，他們對中藥材“甘草”進行了全基因組測序，成功取得了推測的全部基因94.5%的基因信息。 甘草是一種豆科植物，廣泛應用于各種中藥中，是重要的中藥原料。它具有改善肝功能、治療消化性潰瘍
Nature新聞：基因組測序追蹤超級病菌
研究人員通過基因組測序最終了解了去年困擾英國劍橋一家新生兒特護病房達數月之久的超級細菌疫情。他們將這一案例報告在11月14日的《柳葉刀傳染病》(Lancet Infectious Disease)雜志上，標志著首次科學家們通過測序病原體基因組積極控制了一場持續爆發的疫情。 在兩天內Ro
當宏基因組遇上單細胞測序
日前，科學家們通過宏基因組測序和單細胞測序鑒定了一類新細菌。 16S rRNA基因序列的保守性和普遍性，使其成為了微生物檢測和分類鑒定的強有力工具。這種方法為科學家們揭示了微生物群體的高度復雜性，但它還是有所遺漏。美國能源部聯合基因組研究所上周的一次會議上，研究者人員向人們展示了在四個溫泉樣本
個人基因組測序預測能力遭質疑
一項新的研究給全基因組測序對每個人都很有用的說法潑了一盆冷水。圖片來源：N.J. Roberts等，《科學—轉化醫學》 ?“每個人都將擁有自己的基因組序列，并且可以將這些信息裝在一個U盤中”——生物醫學家曾這樣給我們描繪一幅美妙的藍圖，當脫氧核糖核酸（DNA）測序變得很廉價時，這一
近期最受關注的基因組測序研究
想象一下有人遞給你一杯奶昔，要你鑒別出里面所有的東西。或許你能夠辨別出有一點點的草莓或是酸奶的味道。但總體上它的味道就像是無法分辨的成分構成的混成品。 現在再想象一下，這杯奶昔是由來自大腦的2萬個碾碎了的細胞所組成。你可以通過測試來確定樣本中有什么分子，這就是科學家們現在所做的事情。這當然會提
簡述全基因組測序的技術路線
全基因組測序的技術路線：提取基因組DNA，然后隨機打斷，電泳回收所需長度的DNA片段（0.2~5Kb），加上接頭, 進行DNA簇（Cluster）制備，最后利用Paired-End（Solexa）或者Mate-Pair（SOLiD）的方法對插入片段進行測序。然后對測得的序列組裝成Contig，通
關于全基因組測序的應用介紹
全基因組測序的應用：通過生物信息手段，分析不同個體基因組間的結構差異，同時完成SNP及基因組結構注釋。 DNA突變可誘發癌癥。吸煙過程中所釋放的>60種致癌化學物質可與DNA結合并對DNA鏈上的鳥嘌呤和腺嘌呤進行化學修飾從而產生大的加合物，該加合物改變了DNA雙螺旋的結構，如果不被核苷酸剪切修復
近期最熱門的基因組測序成果
生物通報道：The scientist雜志對近期最熱門的一些基因組測序成果進行了盤點，包括瀕臨滅絕的幾維鳥和極其聰明的章魚。 種屬：甜瓜（Cucumis melo） 西班牙和意大利的研究團隊在Molecular Biology and Evolution雜志上率先發布了七個甜瓜品種的基因組分
個人基因組測序收費將大幅降價
新華社倫敦2月9日電針對個人的基因組測序服務剛出現時，測序費用高達上百萬美元，普通人望塵莫及。不過，美國一家公司計劃從今年6月開始，推出低價個人基因組測序業務，顧客只需支付5000美元，就可向這家公司預約基因組測序服務。 據英國《新科學家》雜志網站報道，這家名為“完全基因組”的公司位于美國