基因組測序新公司工作全靠機器人
CG公司的基因組測序工作完全由機器人完成工作人員正在藍色幽暗的“車間”內操作檢測設備 美國加州的山景城是“硅谷”的重要組成部分。現在,一個與硅芯片相關的潛力大產業正在這里興起,那就是基因組測序技術產業。這個產業的發展是隨著多家大公司的激烈競爭開始的。不過,一家名為“整合基因”(Complete Genomics,CG)的公司不像別的公司一樣研發和銷售測序儀器,而是為科學家提供外包的測序服務,更絕的是,在這家公司里做測序的,并不是研究人員,而是一排排的機器人。近日,《新科學家》雜志探秘了這家充滿科幻意味的公司。 前臺都是“機器人” 走進CG公司,連前臺都由計算機終端出任。它會主動向來客問好,詢問姓名、身份和來訪意圖。旁邊連接的一臺打印機則自動打出訪客掛牌。與此同時,一份電子郵件已經發送到內部接應人員的電腦上。 這家公司的生產線更像科幻電影里的實驗室,昏暗藍色的房間里到處都是高級......閱讀全文
基因組測序新公司工作全靠機器人
CG公司的基因組測序工作完全由機器人完成工作人員正在藍色幽暗的“車間”內操作檢測設備 美國加州的山景城是“硅谷”的重要組成部分。現在,一個與硅芯片相關的潛力大產業正在這里興起,那就是基因組測序技術產業。這個產業的發展是隨著多家大公司的激烈競爭開始的。不過,一家名為“整
美首次對老鼠基因組的調控序列測序
美國科學家在7月1日出版的英國《自然》雜志上撰文表示,他們首次詳細標示出了老鼠基因組功能序列中一個重要部分――調控序列的詳細情況。老鼠是生物醫學研究中最廣泛使用的哺乳動物模型,因此,最新研究也將有助于我們進一步解讀人類基因組。 加州大學圣地亞哥分校路德維格癌癥研究所基因調控實驗室主任任兵教
《自然》:美首次對老鼠基因組調控序列測序
美國科學家在7月1日出版的英國《自然》雜志上撰文表示,他們首次詳細標示出了老鼠基因組功能序列中一個重要部分——調控序列的詳細情況。老鼠是生物醫學研究中最廣泛使用的哺乳動物模型,因此,最新研究也將有助于我們進一步解讀人類基因組。 加州大學圣地亞哥分校路德維格癌癥研究所基因調控實驗
CG、GP開放共享至今最大實驗單體型定相全基因組測序成果
2016年10月11日,美國加州山景城——華大基因子公司Complete Genomics(簡稱CG)與個人基因組計劃項目(簡稱PGP)共同發布了過百人的實驗單體型定相全基因組測序結果。這組數據采用長片段閱讀技術(簡稱LFR)讀取,是目前最大的有全面實驗確認單體型的高覆蓋度全基因組組裝。“絕大多
Science公布三個低成本完整人類基因組測序結果
來自Complete Genomics公司,華盛頓大學,哈佛醫學院等處的研究人員在11月6日《科學》(Science)雜志上發表論文,描述其ZLDNA測序平臺,并公布了對三個完整人類基因組序列分析的結果,文章還報道了不同樣本的測序成本,包括了從$8,005(87x coverage)到$1,72
基因組測序
如果樓主指的是人類基因組計劃,那時用的方法叫做雙脫氧終止法,也叫做sanger法。它的原理是在DNA合成過程中,DNA聚合酶能夠使用ddNTP(雙脫氧核苷酸)來作為原料,但它的反應會在加入ddNTP的時候終止。具體實驗是通過PCR來完成的,但與普通PCR不同,它只需要一個引物而不是一對。在4個相同的
基因測序的操作設備
過長的測序周期以及上萬美元的儀器成本,成了阻礙基因測序進入尋常百姓家的障礙。而運用新技術的基因測序儀大大降低了基因組測序的門檻,使得更多研究人員能夠使用這項技術開發多種應用。 總部位于美國加州的生命技術公司(Life Technologies),最近正在中國推出臺式基因測序儀Ion Proto
基因測序操作設備
過長的測序周期以及上萬美元的儀器成本,成了阻礙基因測序進入尋常百姓家的障礙。而運用新技術的基因測序儀大大降低了基因組測序的門檻,使得更多研究人員能夠使用這項技術開發多種應用。 總部位于美國加州的生命技術公司(Life Technologies),最近正在中國推出臺式基因測序儀Ion Proto
關于新型基因檢測技術—基因測序的操作設備介紹
過長的測序周期以及上萬美元的儀器成本,成了阻礙基因測序進入尋常百姓家的障礙。而運用新技術的基因測序儀大大降低了基因組測序的門檻,使得更多研究人員能夠使用這項技術開發多種應用。 總部位于美國加州的生命技術公司(Life Technologies),最近正在中國推出臺式基因測序儀Ion Proto
解析現代月季基因組序列
科學家研究現代月季基因。圖片來源:monticelloshop.org 近日,法國農業科學研究院、里昂大學、法國國家科學研究中心的研究人員解密了現代月季的基因組序列。現代月季擁有獨特的顏色與香味,廣受稱贊,這項研究幫助人們從分子角度了解這背后的基因和代謝流程。4月30日,相關論文在線刊登于《自然
基因組序列草圖的概念
中文名稱基因組序列草圖英文名稱draft genome sequence定 義已測定序列占到90%以上、測序精度在1%的基因組序列圖。應用學科遺傳學(一級學科),基因組學(二級學科)
基因測序操作設備
過長的測序周期以及上萬美元的儀器成本,成了阻礙基因測序進入尋常百姓家的障礙。而運用新技術的基因測序儀大大降低了基因組測序的門檻,使得更多研究人員能夠使用這項技術開發多種應用。[2]?總部位于美國加州的生命技術公司(Life Technologies),最近正在中國推出臺式基因測序儀Ion P
西北農林科技大學PLOSGenetics發表紅棗基因組序列測序結果
高品質的干棗基因組序列,以及從其近緣種樹木的基因序列,能夠闡明這種人類已經種植超過7000年的古老果樹的馴化歷史。近期,西北農林科技大學與美國康奈爾大學Boyce Thompson植物研究(BTI)以及北京林業大學的研究人員合作,對中國干棗進行了基因組測序,相關結果發表在12月22日的《PLOS G
華大回應證實暫緩推出Revolocity?測序系統
11月23日,Genomeweb網站上一則關于“華大戰略轉移”的新聞一時間引起了各大媒體的興致。那么到底是怎樣的戰略轉移使得華大基因再次被外媒推到風尖浪口上?華大基因又為何選擇此般戰略?為此生物探索采訪了華大基因的相關負責人。事件回顧 根據外媒報道,華大基因此次戰略轉移與其自主研發的
-華大基因收購美國上市公司CG-奠定基因大數據基礎
對深圳華大基因,騰訊馬化騰有一段評價:用大數據的算法,與以前的醫學理論不一樣。看一個人的疾病,只是看他得病的特征與哪種病吻合,推導出具體對哪個部 位對癥下藥。到時,藥可能是治基因的某一段。基因哪一段出問題,就拿相應的藥去治。這個思路很開放,用了大數據,是一個很好的案例。 帶領華大基因建
中國基因測序儀往事
9月9日,來自深圳的消息,國產基因測序儀DNBSEQ-T7(原命名MGISEQ-T7)正式交付商用。從去年10月發布以來,諸多業內人士和媒體將T7譽為中國基因產業突破上游技術壁壘,實現跨越發展的現實注腳。 從關山難越,到部分引領,中國基因測序儀的研制開發攀越關山、跋涉荊棘,經歷了起伏跌宕的20
中國基因測序儀往事
9月9日,來自深圳的消息,國產基因測序儀DNBSEQ-T7(原命名MGISEQ-T7)正式交付商用。從去年10月發布以來,諸多業內人士和媒體將T7譽為中國基因產業突破上游技術壁壘,實現跨越發展的現實注腳。 從關山難越,到部分引領,中國基因測序儀的研制開發攀越關山、跋涉荊棘,經歷了起伏跌宕的20
概述釀酒酵母的基因組序列
1996年6月,在國際互聯網的公共數據庫中公布了釀酒酵母的完整基因組順序,它被稱為遺傳學上的里程碑。因為首先,這是人們第一次獲得真核生物基因組的完整核苷酸序列;其次,這是人們第一次獲得一種易于操作的實驗生物系統的完整基因組。 [10] 在釀酒酵母測序計劃開始之前,人們通過傳統的遺傳學方法已確定
首次測定玉米蛇基因組序列
在現有的5000種哺乳動物中,有超過100種已經進行了基因組測序,但是,只有9種爬行動物(在10000個物種當中)的基因組對科學界來說是可用的。最近,瑞士日內瓦大學(UNIGE)的一個研究小組,構建了一個大的數據庫,其中就包括一種爬行動物——玉米蛇的新基因組測序,這種蛇越來越多地被用來了解爬行動
認識泛基因組測序
什么是泛基因組?2005年,Tettelin等人提出了微生物泛基因組概念(pangenome,pan源自希臘語‘παν’,全部的意思),泛基因組即某一物種全部基因的總稱。2009 年,Li等人首次采用新全基因組組裝方法對多個人類個體基因組進行拼接,發現了個體獨有的DNA序列和功能基因,并首次提出了“
PNAS:甜瓜基因組測序
甜瓜在世界范圍具有很高的經濟價值,日前西班牙的九個研究中心通力合作,利用羅氏454平臺完成了甜瓜基因組的測序。除了甜瓜的全基因組,科學家還得到了 7個特定甜瓜品種的基因組,文章發表在Proceedings of the National Academy雜志上。 聯合國糧農組織2009年
基因組測序儀簡介
基因組測序儀是一種用于生物學領域的分析儀器,于2012年12月19日啟用。 技術指標 個體化基因組測序儀主機/ION TORRENT主機。 主要功能 樣品處理、快速的運行時間以分析單個或多個樣品 支持多重文庫,從而實現最大的效率和經濟性 可在必要時禁用個別測序通道,以節約試劑用量。
基因診斷:“奶酪”還在路上
基因診斷“奶酪”溢出的香味越來越濃。 對于關注生物技術領域的投資者來說,談到近日最熱鬧的生物并購,就不得不說深圳華大基因完成對美國CompleteGenomics(以下簡稱“CG”)的收購。 這一越洋牽手,或將令國內基因測序產業引爆一輪競技。然而,也有業內投資人士指出,雖然基因診斷的
HiFi測序助力第一個完整的人類基因組序列
讀這篇文章,你無疑會感到有些似曾相識的感覺。畢竟,人類基因組參考在2000年、2001年和2003年都被宣布“完成”。 但是從那時起,任何使用過參考資料的科學家都知道,從來沒有一個完整的人類基因組測序。直到現在。 HiFi測序助力第一個完整的人類基因組序列 端粒到端粒(T2T)聯盟是一
基因測序格局初定,得技術者得天下
據統計,中國每4秒就有一個1個新生兒出生,對應這個數字,中國孕婦是一個十分龐大的群體。多年前,為了防止新生兒出生缺陷,準媽媽們選擇羊水穿刺的方式進行產前檢查,但是這種方式準確率較低,且存在10%的流產風險,這令不少家庭望而卻步,而如今依托于基因檢測技術的無痛產檢得到越來越多人的追捧。 目前將
胡蘿卜基因組序列草圖成功繪出
來自美國的一個研究小組稱,他們完成了對30余種胡蘿卜樣品的測序,繪制出了胡蘿卜基因組序列草圖。這很可能是迄今最完整的蔬菜基因組序列草圖。研究人員稱,這一研究闡明了胡蘿卜的起源和演化過程,對改善胡蘿卜和其他農作物的營養價值提供了可能。相關論文在線發表在《自然·遺傳學》雜志網站上。 胡蘿卜和生菜
新軟件按需組裝無縫基因組序列
原文地址:http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2023/2/494014.shtm 科技日報北京2月16日電?(記者張夢然)美國國立衛生研究院研究人員發布了一種創新的軟件工具,用于組裝來自各種物種的真正完整(即無縫)的基因組序列。這種名為Verkko的軟件在芬蘭
馬鈴薯基因組序列框架圖全球發布
中國科學家的創新性思路助推測序工作提前完成 9月23日,由14國科學家組成的“國際馬鈴薯基因組測序協作組”分別在北京、阿姆斯特丹、倫敦、紐約、利馬等地同時宣布了馬鈴薯基因組序列框架圖的完成。此次公布的馬鈴薯基因“藍圖”繪制工作的中國參與單位主要來自中國農業科學院蔬菜花卉所和深圳華大基因研究院。
-震驚!Genbank參考基因組序列多處錯誤!
?震驚!Genbank參考基因組序列多處錯誤! 隨著基因組測序技術的飛速發展以及測序成本的快速降低,全基因組數據也在急速增加。盡管參考基因組數據是非常有價值的資源,但是由于測序過程中的外源污染或者研究者對數據組裝方法的誤用,使得基因組數據面臨很多問題。 近日,約翰霍
白菜甘藍油菜全基因組序列測定
? 由中國科學家領銜的白菜、甘藍和油菜全基因組測序項目取得階段性重大成果,獲得了白菜全基因組的精細圖,甘藍和油菜全基因組的框架圖。 研究表明,白菜、甘藍和油菜的基因組大小分別約為5億、6.5億和11億個堿基對,白菜和甘藍含有的基因總數目分別約4.2萬和4.5萬個,油菜基因覆蓋度85%以上。該