首張拓撲異構酶II全基因組剪切圖譜
DNA切割酶對基因結構調節起著關鍵作用。研究人員發現,它在導致癌癥的(如白血病和實體瘤)易位(translocations)異常重排中表現活躍。 II型拓撲異構酶(type II topoisomerase, TOP2)通過斷裂DNA雙鏈磷酸二酯鍵,來更正DNA連環數,使細胞DNA正常轉錄、復制。TOP2也會與其剪斷的DNA鏈再連接,但是如果這個過程出錯,不匹配的DNA末端容易引起易位。易位產生的融合蛋白導致白細胞出現異常,使機體呈現白血病標志。 醫生研究學者和RNA生物學家聯手創建了一個新的DNA測序工具,可識別人類白血病細胞整條基因組上TOP2特定剪切位點,“該項工具為更好地理解和最終操控TOP2剪切,預防白血病異常重排開辟了新可能。”本研究共同領導人Carolyn A. Felix醫學博士說。 在過去幾年里,Felix團隊一直與賓夕法尼亞大學的生物學家Brian D. Gregory領導的一個小組合作。利用全基因......閱讀全文
首張拓撲異構酶II全基因組剪切圖譜
DNA切割酶對基因結構調節起著關鍵作用。研究人員發現,它在導致癌癥的(如白血病和實體瘤)易位(translocations)異常重排中表現活躍。 II型拓撲異構酶(type II topoisomerase, TOP2)通過斷裂DNA雙鏈磷酸二酯鍵,來更正DNA連環數,使細胞DNA正常轉錄、復
OPGEN全基因組圖譜應用系列——鞭蟲全基因組測序
鞭蟲是一種常見的土壤傳播寄生蟲,地理分布廣,感染率高,寄生于人體盲腸,導致人體慢性感染,對人類危害巨大。鞭蟲的全基因組測序研究由著名的桑格研究院(Wellcome Trust Sanger Institute)完成,發表在世界頂級期刊《Nature Genetics》上。該研究通過對2種不同
小須鯨全基因組圖譜獲破譯
11月25日,韓國海洋科學技術研究所、深圳華大基因研究院等宣布成功破譯了小須鯨全基因組圖譜,并對鯨類獨特生理習性的遺傳學機制進行了分析。相關成果在線發表于《自然—遺傳學》雜志。 人們一直癡迷于海洋生物是如何演化為陸生生物的。鯨類的進化卻反其道而行之,由陸生向水生演化,和陸生偶蹄動物如牛、豬等
Cell子刊:一種新的基因組保護機制
來自北京生命科學研究所的研究人員發表了題為“SUMO-Targeted DNA Translocase Rrp2 Protects the Genome from Top2-Induced DNA Damage”的文章,發現一個名為 Rrp2 的 DNA 移位酶通過阻止 DNA 拓撲異構酶Ⅱ(T
人類基因組“primiRNA”剪切位點圖譜繪制
人體的基因表達是一個復雜的過程,那么多的基因不可能都總是持續表達。指揮基因表達的功臣之中就包括幾種RNA分子。MicroRNA(miRNA)是一類真核生物內源性的小分子單鏈RNA,它是一種古老的、生死攸關的基因調節因素,30-60%的哺乳動物蛋白質編碼基因都受miRNA的調控(主要是基因沉默調控
牡蠣全基因組序列圖譜繪制完成
牡蠣基因組部分序列及其分析牡蠣基因組計劃(OGP)團隊成員在深圳華大基因研究院討論項目中國科學院海洋研究所和深圳華大基因研究院簽約儀式牡蠣是產量最大的海水養殖動物 牡蠣養殖 近日,牡蠣基因組計劃(Oyster Genome Project,OGP)項目組宣布,
草魚全基因組序列圖譜繪制完成
近日,記者從中國科學院水生生物研究所獲悉,該所魚類功能基因組學學科組負責的草魚全基因組序列圖譜繪制完成。該成果由水生生物研究所、中國科學院國家基因研究中心和中山大學等機構合作完成,相關研究成果于5月4日在線發表于《自然—遺傳學》雜志。 據該所研究員汪亞平介紹,該研究采用鳥槍法測序策略,分別對一
我國完成朱鹮全基因組序列圖譜繪制
?????? 4月15日,深圳華大基因研究院與西安交通大學聯合在西安公布了瀕危野生動物朱鹮的全基因組序列圖譜,這是繼雞基因組、珍珠鳥基因組、火雞基因組之后,我國完成 的第四個鳥類基因組測序項目和全基因組序列圖譜。朱鹮這種被稱為“東方寶石”的珍稀鳥類目前世界僅存千余只,這一研究成果將對于挽救和保護朱
首張非洲人全基因組圖譜問世
據《自然》雜志報道,2月6日,美國加州Illumina生物技術公司宣布,他們首次對一位非洲男子進行了完整的基因組測序。?在此之前,科學家已經對兩位白人男性(James Watson和Craig Venter)和一位中國男性進行了全基因組測序,但從未對非洲人進行研究。因此,這位匿名的尼日利亞約魯巴人男
云南怒江草果全基因組精細圖譜繪制成功
??從20世紀70年代開始,云南省怒江州就開始種植草果,到2020年,種植面積已達111萬畝,不僅是全國草果的核心產區,也是當地群眾脫貧致富的重要經濟作物。 為了加快提高草果遺傳改良效率,培育高產、抗病、優質、安全新品種,對從源頭創新保障草果產業健康可持續發展,2019年9月,怒江州聯合華南農業
香港中大破解鼻咽癌全基因組圖譜
香港中文大學7日宣布,該校醫學院研究人員成功破解鼻咽癌的全基因組圖譜,這一突破性發現有助評估鼻咽癌病人的預后情況,并向鼻咽癌的個人化治療邁出一大步。 鼻咽癌是華南地區常見的癌癥,也是一種極具侵略性的頭頸癌。據介紹,鼻咽癌大多與感染EB病毒相關。由于缺乏早期病征,60%至70%患者于確診時已屆晚
科學家繪制褐牙鲆全基因組精細圖譜
近日,中國水產研究院黃海水產研究所研究員陳松林領導的研究組與上海海洋大學、德國維爾茨堡大學、葡萄牙阿爾加夫大學、深圳華大基因研究院等單位合作,破譯了褐牙鲆全基因組序列,通過與半滑舌鰨全基因組比較分析,初步揭示了比目魚變態發育的分子機制。該研究成果發表于《自然—遺傳學》。 通過與半滑舌鰨全基因組
科學家繪制褐牙鲆全基因組精細圖譜
近日,中國水產研究院黃海水產研究所研究員陳松林領導的研究組與上海海洋大學、德國維爾茨堡大學、葡萄牙阿爾加夫大學、深圳華大基因研究院等單位合作,破譯了褐牙鲆全基因組序列,通過與半滑舌鰨全基因組比較分析,初步揭示了比目魚變態發育的分子機制。該研究成果發表于《自然—遺傳學》。 通過與半滑舌鰨全基因組
我國科學家發布大黃魚全基因組圖譜
由浙江海洋學院、上海交通大學、復旦大學等高校研究機構聯合破譯的大黃魚全基因組圖譜,日前在世界權威期刊——《自然》周刊發表。這是繼半滑舌鰨之后,我國公布的第二個海水魚類的基因組圖譜,也是世界上第一個石首科魚類基因組圖譜,標志著我國海洋生物學的研究真正進入基因組時代。 自1985年大黃魚人工養殖
我國完成首部高原瀕危物種全基因組序列圖譜
12月25日,由青海大學和深圳華大基因研究院共同發起并承擔的藏羚羊基因組序列圖譜在青海大學醫學院宣告繪制完成,這是世界上第一部繪制完成的高原瀕危物種全基因組序列圖譜,也是中國科學家對全球基因組科學的又一重大貢獻。 藏羚羊是我國青藏高原特有的物種,其生存環境高寒、缺氧,自然條件極為嚴酷。在喜
多國科學家破解硬粒小麥全基因組圖譜
近日,來自意大利、加拿大、德國等多國科研機構的科學家共同在Nature Genetics上發表了題為“Durum wheat genome highlights past domestication signatures and future improvement targets”的文章,繪制
我國科研機構聯合破譯白公式豚全基因組圖譜
南京師范大學、華大基因等單位的科研人員成功破譯了白鱀豚全基因組圖譜,為解析白鱀豚獨特的生活習性及進化歷程奠定了重要的遺傳學基礎,同時也為哺乳動物尤其是鯨類的研究與保護提供了寶貴資源。最新研究成果今天在《自然·通訊》雜志發表。 科研人員對一只雄性白鱀豚進行了全基因組測序,并構建了高質量基因組
我國科學家繪制完成鯉魚全基因組序列圖譜
鯉科魚類是我國最重要的水產養殖種類,年產量占我國淡水養殖總產量的70%以上,其中鯉魚不僅是我國也是世界性的重要養殖魚類。5月6日,中國“鯉魚基因組計劃”學術報告會暨新聞發布會在京舉行。由中國水產科學研究院水產生物應用基因組研究中心、黑龍江水產研究所和中科院北京基因組研究所共同實施
科研人員首繪小黃魚全基因組精細圖譜
17日,記者從浙江省農科院獲悉,該院水生生物研究所小黃魚科研團隊與美國奧本大學、廈門大學合作,首次完成小黃魚全基因組組裝注釋與精細圖譜繪制,為建立小黃魚基因組選擇育種、培育高產抗病優質良種提供了基因資源和技術手段,相關研究論文近日在線發表于學術期刊《分子生態學資源》上。 小黃魚是中國重要的海產經
科學家首次繪制小鼠全基因組沉默子圖譜
近日,中國農業科學院農業基因組研究所豬基因組設計育種創新團隊構建了小鼠全基因組沉默子圖譜,闡明了其基本特征,并發現了影響細胞重編程效率的重要沉默子。相關研究成果發表在《先進科學》(Advanced Science)上。轉錄調控在生物體發育和細胞分化中至關重要,而沉默子作為關鍵的順式調控元件,通過結合
科學家首次繪制小鼠全基因組沉默子圖譜
近日,中國農業科學院農業基因組研究所豬基因組設計育種創新團隊構建了小鼠全基因組沉默子圖譜,闡明了其基本特征,并發現了影響細胞重編程效率的重要沉默子。相關研究成果發表在《先進科學》(Advanced Science)上。轉錄調控在生物體發育和細胞分化中至關重要,而沉默子作為關鍵的順式調控元件,通過結合
我國科學家完成鯉魚全基因組序列圖譜繪制
近日,由中國水產科學研究院首席科學家孫效文牽頭,中國水產科學研究院聯合黑龍江水產研究所、中科院基因組研究所、哈佛大學、奧本大學等單位組建的國際合作研究團隊,完成了鯉魚全基因組序列圖譜繪制,在國際上首個完成全面解析的異源四倍體硬骨魚類基因組圖譜。該研究成果于9月21日在國際生物學權威期刊《自然—
我國繪制完成世界首個鵝全基因組序列圖譜
6月3日,深圳華大基因研究院和浙江省農業科學院、象山縣浙東白鵝研究所聯合召開新聞發布會,宣布“鵝全基因組序列圖譜繪制完成”。這是我國獨立研究完成的全世界首個鵝全基因組序列圖譜,這一研究成果對于揭示家鵝繁殖、抗逆、生長、肉質、羽色等性狀的遺傳基礎,鵝的馴化、不同鵝種的生物學分類、中國家鵝
最大動物基因組圖譜——南極磷蝦基因組圖譜破譯
原文地址:http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2023/3/495141.shtm ??? Cell官網截圖。黃海水產研究所供圖 ? 日前,由中國水產科學研究院黃海水產研究所聯合青島華大基因研究院、德國阿爾弗雷德?魏格納研究所、澳大利亞聯邦科學
絨毛狀煙草和林煙草全基因組序列圖譜完成
絨毛狀煙草和林煙草全基因組序列圖譜已經由中國煙草完成。這是全球第一套煙草全基因組序列圖譜,也是繼馬鈴薯和番茄基因組之后全球完成的第三種茄科植物全基因組序列圖譜。該絨毛狀煙草和林煙草全基因組序列圖譜是目前已知植物基因組序列圖譜中基因組最大、組裝精度最高、組裝結果最好的2個圖譜。絨毛
我國科學家完成普通野生稻全基因組框架圖譜繪制
2010年8月,中國科學院昆明植物研究所植物種質資源與基因組學研究中心中科院“百人計劃”和云南省首屆高端科技人才入選者研究員帶領的植物種質資源、基因組學與生物信息學團隊,歷時一年,運用新一代高通量測序技術以及基于高性能超算的生物信息學分析,對野生稻全基因組測序取得了階段性重大成果。日前
Nature:科學家繪成高質量油棕櫚全基因組圖譜
日前,一支國際聯合研究小組確定了一種稱之為 Shell 的基因調控了油棕櫚樹的產量。油棕櫚的果實和種子是全球近一半食用植物油的供應源,并且是最有前景的生物燃料來源之一。 新研究為我們提供了高質量的油棕櫚全基因組圖譜,并且還搜索了對于科學和工業均極為重要的基因序列。這一付諸多年努力所取得
新研究構建出小麥屬全基因組遺傳變異圖譜
小麥是人類歷史上最成功的作物之一,它起源于新月沃地一個狹小的核心區域,一萬年間,從地區性的野生植物迅速轉變成為全球種植面積最廣的作物之一,在多種多樣的環境下為人類提供大量的碳水化合物和蛋白質。然而,小麥對自然環境和人類糧食需求兩方面同時適應的遺傳機制尚不清楚,理解小麥適應性進化對氣候變化條件下小
谷子單倍體型圖譜及全基因組關聯分析研究出爐
由中國農科院作物所、中科院上海生科院植生生態所國家基因中心、中科院遺傳發育所等8家單位合作,在國際上率先完成了谷子單倍體型圖譜的構建和大量農藝性狀的全基因組關聯分析,該成果于6月24日在Nature Genetics(自然-遺傳學)發表,標志著我國在谷子遺傳學研究領域取得了重要的突破。
北京林大等完成世界首張梅花全基因組變異圖譜
北京林業大學教授張啟翔領銜的國家花卉工程技術研究中心與青島華大基因研究院、深圳華大生命科學研究院及美國賓夕法尼亞州立大學等單位合作,完成了首個梅花全基因組重測序研究,構建了世界首張梅花全基因組變異圖譜。該成果對梅花重要觀賞性狀的遺傳解析具有里程碑的作用。既為其分子標記輔助育種研究提供了重要的理論