代謝途徑延伸策略為生物標記物的鑒定提供新思路
隨著精準醫學等概念的提出,代謝組學技術在生物標記物的發現及相關疾病的診斷、治療和預后等環節中的重要作用日益彰顯。盡管分析儀器的發展極大推動了生物標記物的測定,目前代謝物的首要鑒定手段仍依賴于將樣品中所獲得的一級、二級信息與在線數據庫如HMDB、METLIN中所含標準品的信息進行比對。然而,數據庫僅能滿足生物樣品中約30%化合物的鑒定;如何對數據庫中不包含的生物標記物進行快速、可靠的鑒定儼然成為制約代謝組學發展的瓶頸。 近日,中國藥科大學郝海平教授團隊建立了一種不依賴于數據庫搜索的新策略——“代謝途徑延伸策略”能夠高效地解決生物標記物鑒定困難的問題。該策略基于一個“亞代謝組”的核心概念,即全代謝組是由數量有限的核心代謝物(如葡萄糖、脂肪酸、膽汁酸等)通過各種代謝反應(氧化、脫羧、甲基化等)衍生而成的亞代謝組構成;理論上,亞代謝組能夠通過確定的核心物質和代謝反應橋連為網絡。從核心化合物的結構出發,通過代謝反應的延伸能夠推導整個......閱讀全文
代謝途徑延伸策略為生物標記物的鑒定提供新思路
隨著精準醫學等概念的提出,代謝組學技術在生物標記物的發現及相關疾病的診斷、治療和預后等環節中的重要作用日益彰顯。盡管分析儀器的發展極大推動了生物標記物的測定,目前代謝物的首要鑒定手段仍依賴于將樣品中所獲得的一級、二級信息與在線數據庫如HMDB、METLIN中所含標準品的信息進行比對。然而,數據庫
新型癌癥生物標記物
近日,復旦大學的研究人員稱,他們已證實IgG半乳糖基化(galactosylation)分布是多種癌癥類型中用于癌癥篩查的一個有前景的生物標記物。這一研究成果發布在7月1日的Cell Research雜志上。復旦大學的顧建新(Jian-Xin Gu)教授是這篇論文的通訊作者。顧教授的主要科研
什么是代謝途徑?代謝途徑的過程
習慣上把這種連續的化學反應叫作代謝途徑。如酵解途徑,三羧酸循環途徑,戊糖磷酸途徑,糖原合成途徑,糖異生途徑,脂肪酸合成途徑等。中間代謝也稱為細胞內代謝。在中間代謝過程中,機體借助于各種反應從營養素或消化產物中獲得能量,以及機體構成所需要的“原材料”。整個中間代謝可以劃分為兩個過程,即分解代謝和合成代
生物體代謝途徑主要特征
概括生物體代謝途徑的重要特征為(1)由代謝的中間體產生許多分支,從而構成了復雜的代謝網;(2)正反應(A→X)與逆反應(X→A)的途徑往往是不同的,因此防止達到單純的平衡狀態;(3)在代謝途徑的一些中間過程有各種代謝調節作用。把代謝途徑以線路圖案形式來表示就是代謝圖(metabolic map)。
γ氨酪酸的微生物代謝途徑
在微生物中,GABA代謝是通過GABA支路完成的,利用微生物體內較高的GAD活性,將Glu脫羧形成 GABA,然后在GABA-T、SSADH作用下,GABA進入下游的分解過程生成琥珀酸半醛、琥珀酸參與微生物的生理代謝。微生物富集GABA就是通過對培養基的優化以及菌株的改良使其具有較高的GAD活性
腫瘤生物標記物的定義
目前,如何定義腫瘤生物標記物尚存在爭議,美國國家癌癥研究所(NCI)將生物標記物定義為“在血液、其他體液或組織中發現的生物分子,該分子能夠作為異常過程或疾病的征兆,生物標記物還可以用于判斷機體對于治療的應答。生物標記物或被稱為分子標志物或分子標記”。 [21] 我們可以認為,腫瘤生物標記物是能夠
生物標記物:識別腫瘤侵襲
早期結腸癌患者將來可以從特定額基因測試中獲益,并幫助他們在化療方面做出正確的決定。其中兩種生物標記物是MACC1基因,高水平促進腫瘤的生長和腫瘤的轉移,以及一種有缺陷的DNA不匹配修復(dMMR)系統,它在腫瘤的形成中起著重要的作用。患有dMMR腫瘤和低MACC1基因活性的患者的預期壽命更長。
概述腫瘤生物標記物的作用
腫瘤生物標記物的作用貫串整個腫瘤診療過程,從腫瘤風險預測、診斷到治療方案選擇和療效預測都離不開它。更重要的是,腫瘤生物標記物的發現和應用,使得靶向治療和免疫治療成為可能并有效改善療效。 (1) 腫瘤風險預測 目前已經發現一些可用于預測腫瘤高危的生物標記物,例如BRCA1/2基因突變陽性的患者
利用代謝組學發現中醫黃疸病證候的關鍵生物標記物
國際蛋白質組學領域權威雜志《Molecular & Cellular Proteomics》(5-Year IF:9.392)2012年第8期發表了黑龍江中醫藥大學中藥血清藥物化學國家中醫藥管理局重點研究室王喜軍課題組利用代謝組學全面解析中醫黃疸證的研究論文《尿液代謝組學分析黃疸證的關鍵生物
代謝組生物標記物與腎功能下降及高尿酸發病風險的關系
最近,國際臨床醫學研究期刊《美國腎臟病學會臨床雜志》(Clinical Journal of the American Society of Nephrology)和《關節炎護理與研究》(Arthritis Care & Research)先后發表了中國科學院上海營養與健康研究所林旭研究組和中科
膽綠素的代謝途徑
血紅素氧合酶(Heme Oxygenase,HO)是血紅素降解的限速酶,能將血紅素轉變為膽綠素,CO和鐵,膽綠素隨即被還原為膽紅素,己知HO有3種同工酶,HO-1,HO-2,HO-3。HO-2和HO-3呈組成型大量表達,它們可能為正常細胞內的血紅素結合而分別發揮其功能。而HO-1屬誘導型,廣泛分布于
什么是代謝途徑?
代謝中的化學反應幾乎都是在酶的催化下進行的,而且許多酶連續地按順序地起作用,形成多酶體系,使第一個酶促反應產物變成第二個酶促反應的底物,依此類推。
糖的代謝途徑
在人體內,葡萄糖代謝除了無氧酵解途徑以外還有很多其他方式,比如有氧氧化、磷酸戊糖途徑、糖原的合成與分解途徑、糖異生、糖醛酸途徑等。 (一)糖的有氧氧化途徑: 1.概念:葡萄糖在有氧條件下徹底氧化成水和二氧化碳的過程 2.過程 有氧氧化可分為兩個階段: 第一階段:胞液反應階段:從葡萄糖到丙酮酸,反
糖的代謝途徑
在人體內,葡萄糖代謝除了無氧酵解途徑以外還有很多其他方式,比如有氧氧化、磷酸戊糖途徑、糖原的合成與分解途徑、糖異生、糖醛酸途徑等。 (一)糖的有氧氧化途徑: 1.概念:葡萄糖在有氧條件下徹底氧化成水和二氧化碳的過程 2.過程 有氧氧化可分為兩個階段: 第一階段:胞液反應階段:從葡萄糖到丙酮
人體脂肪代謝途徑
人體脂肪代謝途徑:人體代謝最終也是通過生成脂肪酶的方式,將脂肪分解為脂肪酸,后者β氧化為乙酰輔酶A,再經過呼吸作用,生物降解為代謝廢物(二氧化碳和水)排出。膽固醇等脂質小分子具有重要的生物學功能,但過量的膽固醇會引起動脈粥樣硬化,進而導致冠心病和腦中風等一系列嚴重疾病。因此,體內脂質水平必須受到嚴密
糖的代謝途徑
在人體內,葡萄糖代謝除了無氧酵解途徑以外還有很多其他方式,比如有氧氧化、磷酸戊糖途徑、糖原的合成與分解途徑、糖異生、糖醛酸途徑等。(一)糖的有氧氧化途徑:1.概念:葡萄糖在有氧條件下徹底氧化成水和二氧化碳的過程2.過程有氧氧化可分為兩個階段:第一階段:胞液反應階段:從葡萄糖到丙酮酸,反應過程同糖酵解
蘇氨酸代謝途徑
蘇氨酸在機體內的代謝途徑和其他氨基酸不同,是唯一不經過脫氫酶作用和轉氨基作用,而是通過蘇氨酸脫水酶(TDH)和蘇氨酸脫酶(TDG)以及醛縮酶催化而轉變為其他物質的氨基酸。途徑主要有3條:通過醛縮酶代謝為甘氨酸和乙醛;通過TDG代謝為氨基丙酸、甘氨酸、乙酰COA;通過TDH代謝為丙酸和α-氨基丁酸。
代謝途徑的特征
概括生物體代謝途徑的重要特征為(1)由代謝的中間體產生許多分支,從而構成了復雜的代謝網;(2)正反應(A→X)與逆反應(X→A)的途徑往往是不同的,因此防止達到單純的平衡狀態;(3)在代謝途徑的一些中間過程有各種代謝調節作用。把代謝途徑以線路圖案形式來表示就是代謝圖(metabolic map)。上
戊糖的代謝途徑
磷酸戊糖途徑,是糖有氧氧化的重要支路。它提供生物合成所需要的NADPH,為核酸代謝提供戊糖,并通過酵解的中間產物為生物提供能量。磷酸戊糖途徑可劃分為先后兩個階段,氧化為第一階段,從葡萄糖開始通過脫氫和脫羧作用生成磷酸戊糖;非氧化為第二階段,磷酸戊糖經過酶的轉換和縮合作用(分子重排)又形成六碳糖和三碳
生物大分子藥物代謝消除途徑及體外代謝研究方法進展
摘要由于理化及生物學性質的差異,生物大分子藥物與傳統小分子藥物相比,藥代動力學機制更加復雜,在體內表現出不同的吸收、分布、代謝、排泄過程。大分子藥物一般不經CYP 450 酶代謝,其體內消除途徑主要有腎小球濾過、酶水解、受體介導的胞吞消除和抗藥物抗體介導的消除。近年來,除了常用的免疫分析法、放射性同
指甲代謝標記物或可預測阿爾茨海默病
12月6日,記者從重慶醫科大學附屬第一醫院獲悉,該院老年醫學科副主任呂洋教授團隊近日在國際知名期刊《先進研究雜志》上發布最新研究成果。該研究顯示,指甲代謝標記物或可早期診斷并預測阿爾茨海默病,這為未來診斷和預測阿爾茨海默病提供了新方法。 阿爾茨海默病是一種進行性發展的、以記憶障礙為主要表現的神
關于γ氨基丁酸的微生物代謝途徑介紹
在微生物中,GABA代謝是通過GABA支路完成的,利用微生物體內較高的GAD活性,將Glu脫羧形成 GABA,然后在GABA-T、SSADH作用下,GABA進入下游的分解過程生成琥珀酸半醛、琥珀酸參與微生物的生理代謝。微生物富集GABA就是通過對培養基的優化以及菌株的改良使其具有較高的GAD活性
概述膽綠素的代謝途徑
血紅素氧合酶(Heme Oxygenase,HO)是血紅素降解的限速酶,能將血紅素轉變為膽綠素,CO和鐵,膽綠素隨即被還原為膽紅素,己知HO有3種同工酶,HO-1,HO-2,HO-3。HO-2和HO-3呈組成型大量表達,它們可能為正常細胞內的血紅素結合而分別發揮其功能。而HO-1屬誘導型,廣泛分
脂蛋白代謝的途徑
外源性代謝途徑指飲食攝入的膽固醇和甘油三酯在小腸中合成CM及其代謝過程;內源性代謝途徑由肝臟合成VLDL,后者轉變為IDL和LDL,LDL被肝臟或其他器官代謝的過程。膽固醇逆轉運途徑:即HDL的代謝。血漿中的脂質和載脂蛋白一起構成各種脂蛋白顆粒,顆粒中的脂質和蛋白質處在經常不斷的交換變化之中,來完成
甘露糖的代謝途徑
甘露糖在人體內不能很好的代謝。所以,口服后甘露糖進入糖類代謝過程并不明顯,即使從外部進入的g甘露糖,都會被身體內的組織發覺。哺乳動物內使用放射性標記物發現, 攝入的甘露糖90%都會在30-60分鐘內原封不動地通過尿道排出體外。殘余部分中 99%含量會在未來8小時內排出。這個過程中,血糖濃度不會顯著升
脂蛋白的代謝途徑
外源性代謝途徑指飲食攝入的膽固醇和甘油三酯在小腸中合成CM及其代謝過程;內源性代謝途徑由肝臟合成VLDL,后者轉變為IDL和LDL,LDL被肝臟或其他器官代謝的過程。膽固醇逆轉運途徑:即HDL的代謝。血漿中的脂質和載脂蛋白一起構成各種脂蛋白顆粒,顆粒中的脂質和蛋白質處在經常不斷的交換變化之中,來完成
瓜氨酸的代謝途徑
精氨酸會被氧化為N-羥基-精氨酸,再行氧化成瓜氨酸并釋出一氧化氮。
代謝途徑的原理簡介
習慣上把這種連續的化學反應叫作代謝途徑。如酵解途徑,三羧酸循環途徑,戊糖磷酸途徑,糖原合成途徑,糖異生途徑,脂肪酸合成途徑等。 中間代謝也稱為細胞內代謝。在中間代謝過程中,機體借助于各種反應從營養素或消化產物中獲得能量,以及機體構成所需要的“原材料”。整個中間代謝可以劃分為兩個過程,即分解代謝
蘇氨酸的代謝途徑
蘇氨酸在機體內的代謝途徑和其他氨基酸不同,是唯一不經過脫氫酶作用和轉氨基作用,而是通過蘇氨酸脫水酶(TDH)和蘇氨酸脫酶(TDG)以及醛縮酶催化而轉變為其他物質的氨基酸。途徑主要有3條:通過醛縮酶代謝為甘氨酸和乙醛;通過TDG代謝為氨基丙酸、甘氨酸、乙酰COA;通過TDH代謝為丙酸和α-氨基丁酸
蘇氨酸的代謝途徑
蘇氨酸在機體內的代謝途徑和其他氨基酸不同,是唯一不經過脫氫酶作用和轉氨基作用,而是通過蘇氨酸脫水酶(TDH)和蘇氨酸脫酶(TDG)以及醛縮酶催化而轉變為其他物質的氨基酸。途徑主要有3條:通過醛縮酶代謝為甘氨酸和乙醛;通過TDG代謝為氨基丙酸、甘氨酸、乙酰COA;通過TDH代謝為丙酸和α-氨基丁酸 。