Nature子刊:神秘蛋白質引發代謝紊亂分子機制
根據最近來自南卡羅琳娜大學的研究者們發表在《Nature Structural & Molecular Biology》雜志上的一篇文章,細胞對錯誤折疊的蛋白質的反應或許是引發代謝紊亂的原因,而非結果。在這一研究中,作者們鑒定出了一中此前很少被報道的啟動代謝紊亂效應的分子。 蛋白質的錯誤折疊與代謝紊亂之間存在這千絲萬縷的聯系,但此前我們并不清楚兩者之間的因果關系。這些研究證明蛋白質的折疊會引發特定的代謝紊亂效應。 當未正確折疊的分子進入細胞中之后,在內質網中會引發一種叫做"UPR(unfolded protein response)"的現象。眾所周知,內質網是蛋白質合成與修飾的重要細胞器結構。其中一種叫做GRP78的蛋白質是UPR的核心成分。當未折疊或錯誤折疊的蛋白質與GRP78相遇之后,后者將會與其原本相連的蛋白解離,進而激活UPR反應。進一步,UPR則會將這些分子重新折疊或降解,以保證其不會進入其它部位行使功......閱讀全文
蛋白質分子的組成
? 一、蛋白質的元素組成 單純蛋白質的元素組成為碳50~55%、氫6%~7%、氧19%~24%、氮13%~19%,除此之外還有硫0~4%。有的蛋白質含有磷、碘。少數含鐵、銅、鋅、錳、鈷、鉬等金屬元素。 各種蛋白質的含氮量很接近,平均為16%。由于體內組織的主要含氮物是蛋白質,因此,只要測定生物樣
JBC:分子伴侶幫助蛋白質折疊的分子機理
分子伴侶是一種協助蛋白質進行折疊的分子助手,其中一種伴侶分子是所謂的熱激蛋白60(Hsp60),這種蛋白可以在線粒體中形成一種類似于“桶狀”的結構,從而便于蛋白折疊過程的發生,近日刊登于the Journal of Biological Chemistry上的一篇研究論文中,來自弗萊堡大學的研究
球狀蛋白質的分子特性
球狀蛋白質分子形狀接近球形,水溶性較好,種類很多,可行使多種多樣的生物學功能。具有球形或近于橢球體分子形狀的蛋白質之總稱。是纖維狀蛋白質的對應詞。凡不屬于纖維狀蛋白質,而一般的單純蛋白質(清蛋白、球蛋白等)和許多復合蛋白質均屬于此類,與纖維狀蛋白質相比,溶液的粘度低,流動雙折射弱。
球狀蛋白質的分子特性
球狀蛋白質分子形狀接近球形,水溶性較好,種類很多,可行使多種多樣的生物學功能。具有球形或近于橢球體分子形狀的蛋白質之總稱。是纖維狀蛋白質的對應詞。凡不屬于纖維狀蛋白質,而一般的單純蛋白質(清蛋白、球蛋白等)和許多復合蛋白質均屬于此類,與纖維狀蛋白質相比,溶液的粘度低,流動雙折射弱。
蛋白質根據蛋白質分子的外形進行分類
1.球狀蛋白質分子形狀接近球形,水溶性較好,種類很多,可行使多種多樣的生物學功能。2.纖維狀蛋白質分子外形呈棒狀或纖維狀,大多數不溶于水,是生物體重要的結構成分,或對生物體起保護作用。3.膜蛋白質一般折疊成近球形,插入生物膜,也有一些通過非共價鍵或共價鍵結合在生物膜的表面。生物膜的多數功能是通過膜蛋
蛋白質芯片技術生物分子反應
使用時將待檢的含有蛋白質的標本如尿液、血清、精液、組織提取物等,按一定程序做好層析、電泳、色譜等前處理,然后在每個芯池里點入需要的種類。一般樣品量只要2-10μL即可。根據測定目的不同可選用不同探針結合或與其中含有的生物制劑相互作用一段時間,然后洗去未結合的或多余的物質,將樣品固定一下等待檢測即可。
質譜法鑒定蛋白質分子量
質譜法鑒定蛋白質分子量對樣品的消耗很少,且具有更高的靈敏度、分辨率和準確度,有利于對復雜混合物樣品的分析。目前廣泛使用的用干蛋白質鑒定的質譜分析主要使用兩種類型質譜:一種是MALDI-TOF直接對分子量進行測量,MALIDI離子源產生的離子多帶單電荷,質譜圖中的峰與樣品各組分質量數是一-對應的,不用
蛋白質與生物小分子結合
生物大分子,首先先說一下什么是生物大瘋子,生物大分子指的是作為生物體內主要活性成分的各種分子量達到上萬或更多的有機分子.高相對分子量的生物有機化合物(生物大分子)主要是指蛋白質、核酸以及高相對分子量的碳氫化合物.常見的生物大分子包括蛋白質、核酸、多糖.但是,這只是相對的說法,這個定義只是概念性的,與
蛋白質分子穩定性測量
? ? ? 采用標準 ? ? ? 測量類型:溫度中點Tm測量類型:焓?H測量類型:熱容變化?CpSample capacity:576(六個96-孔板)樣品量:370μL樣品池容積:130μL樣品展示選件:96-孔板Sample capacity:50個樣品 / 24小時(自動系統
Nature構建蛋白質分子“搜索網”
來自華盛頓大學的科學家們,在實驗室中利用計算機設計并建造出了能夠識別和結合小分子的蛋白質分子“搜索網”。 用計算機設計出能夠識別生物學小分子并能與之相互作用的蛋白質現在成為了現實。科學家們成功地構建出了一種蛋白質分子,其編程后可以結合三種不同的類固醇。這一成果有可能更廣泛地應用于醫學和其他
蛋白質的分子量是多少
一般來說,蛋白質的分子量需在8000以上。若分子量再小一些就屬于多肽的范圍了。分子質量:設氨基酸的平均相對分子質量為a,含b個二硫鍵,蛋白質的相對分子質量=ma-18(m-n)-2b,也即氨基酸的平均分子量x氨基酸總的分子數(肽鏈數+肽鍵數)-18x脫水縮合的水分子數(和肽鍵數相等)。
蛋白質分子檢測技術取得突破進展
據德國卡塞爾大學網站報道,近日,該校科學家研制的一種帶磁場的微型傳感器獲得突破,樣機在年內即能完成。該傳感器通過遙控牽引磁化納米生物分子,可將檢測液中極少量的蛋白質分子檢測出來。該技術有望革新醫療診斷方式,其中利用磁性納米粒子運送生物分子的方法已申請了ZL。 一般情況下,病人體內某些蛋白質
“分子膠水”可黏住促癌蛋白質
多倫多大學密西索加分校研究人員開發出一種“分子膠水”,能將促癌蛋白質黏在細胞膜上,從而阻斷癌細胞的生長,但不會影響正常細胞。該研究作為封面文章發表在最新出版的《應用化學》雜志上。 如果在滿是油脂的水池里加入些肥皂,肥皂中的憎水基會排開水,吸附油脂退居到水池邊緣。倘若水池是癌細胞,一滴滴的油
蛋白質折疊的分子伴侶的介紹
1978 年,Laskey 在進行組蛋白和DNA 在體外生理離子強度實驗時發現,必須要有一種細胞核內的酸性蛋白———核質素(nucleoplasmin) 存在時,二者才能組裝成核小體,否則就發生沉淀。據此Laskey 稱它為“分子伴侶”。分子伴侶是指能夠結合和穩定另外一種蛋白質的不穩定構象,并能
生物分子蛋白質核磁共振光譜
利用核磁譜研究蛋白質,已經成為結構生物學領域的一項重要技術手段。X射線單晶衍射和核磁都可獲得高分辨率的蛋白質三維結構,不過核磁常局限于35kDa以下的小分子蛋白,盡管隨著技術的進步,稍大的蛋白質結構也可以被核磁解析出來。另外,獲得本質上非結構化(Intrinsically Unstructured)
怎么算蛋白質的分子量
蛋白質的分子量可以通過多種方法計算,包括使用在線工具、軟件或手動計算。蛋白質是由氨基酸殘基通過肽鍵連接的大分子,其分子量是蛋白質的一個重要理化參數,通常以道爾頓(Da)為單位。下面將詳細探討計算蛋白質分子量的不同方法和步驟:基礎估算法氨基酸數量估算:一個基本的估算方法是將氨基酸的數量乘以一個平均分子
蛋白質結構預測和分子動力學
作為結構基因組研究的互補,蛋白質結構預測的目標是發展出有效的能夠提供未知結構(未通過實驗方法得到)蛋白質的可信的結構模型。目前最為成功的結構預測方法是同源建模;這一方法是利用序列相似的蛋白質(已知結構)的結構作為“模板”。而結構基因組的目標正是通過解析大量蛋白質的結構來為同源建模提供足夠的模板
蛋白質分子量測定的相關介紹
隨著質譜技術的發展,分子量的測定已從傳統的有機小分子擴展到了生物大分子。MALDI-MS技術以及極高的靈敏度、精確度在蛋白質分析中得到了廣泛的應用。該技術不僅可測定各種疏水性、親水性和糖蛋白的分子量,還可以測定蛋白質混合物的分子量。這可認為是蛋白質分析領域的一項重大突破。
新型小分子開關可控制蛋白質活性
蛋白質分子(示意圖) 據美國匹茲堡大學網站最近報道,該校研究團隊開發出一種新技術,利用小分子磷化氫作為“開關”能控制蛋白質的活性。該技術為人們更好地研究生物過程中的分子行為提供了一種有力工具。 蛋白質是生物體內種類最多、最重要的成分之一,從牙齒、骨骼、皮膚,到器官的生長和酶與激素的產生,都離不開
測定蛋白質分子量的常用方法
知道蛋白質分子量、氨基酸組成計算器http://www.proteomics.com.cn/tools/mwcal/一般的方法:SDS-聚丙烯酰胺凝膠電泳法測定蛋白質的分子量[原理]十二烷基硫酸鈉(Sodium dodecyl sulfate, 簡稱SDS)-聚丙烯酰胺凝膠電泳法測定蛋白質的分子量,
蛋白質復性人工分子伴侶的介紹
受蛋白質分子伴侶輔助蛋白質復性的啟發,Rozema和Gellman對人工分子伴侶體系(去污劑+環糊精)輔助碳酸酐酶和雞蛋白溶菌酶復性進行了研究[17、18]。與分子伴侶GroEL+ATP輔助復性的作用機制相似,其復性過程分為兩步進行:第一步捕獲階段,在變性蛋白質溶液中加入去污劑,去污劑分子通過疏
如何查找蛋白質的分子量大小
www.uniprot.orgUniProt是一個集中收錄蛋白質資源并能與其它資源相互聯系的數據庫,也是目前為止收錄蛋白質序列目錄最廣泛、功能注釋最全面的一個數據庫。 UniProt是由歐洲生物信息學研究所(European Bioinformatics Institute)、美國蛋白質信息資源(P
分子遺傳學詞匯TATA結合蛋白質
中文名稱:TATA結合蛋白質英文名稱:TATA-binding protein;TBP定 義:轉錄因子TFⅡD的組分之一,特異地與TATA框結合并指導起始復合體的形成,也可以是與RNA聚合酶Ⅲ或RNA聚合酶Ⅰ共同發揮作用的轉錄因子之一。即使基因無TATA框,也能通過與TBP結合因子間相互作用而起調
如何查找蛋白質的分子量大小
www.uniprot.orgUniProt是一個集中收錄蛋白質資源并能與其它資源相互聯系的數據庫,也是目前為止收錄蛋白質序列目錄最廣泛、功能注釋最全面的一個數據庫。 UniProt是由歐洲生物信息學研究所(European Bioinformatics Institute)、美國蛋白質信息資源(P
應用ScanLater免疫印跡蛋白質梯估計蛋白質的分子量
優點: ·簡單的一套的標準品就可以滿足凝膠可視、膜定位和時間分辨熒光檢測 ? ·蛋白質都已經被生物素標記 ? ·可以檢測待測物的分子量 ? ·無需混勻和加熱 簡介 ScanLater免疫印跡蛋白質梯是ScanLater免疫印跡蛋白質檢測系統必不可少的
應用ScanLater免疫印跡蛋白質梯估計蛋白質的分子量
優點:·簡單的一套的標準品就可以滿足凝膠可視、膜定位和時間分辨熒光檢測 ?·蛋白質都已經被生物素標記 ?·可以檢測待測物的分子量 ?·無需混勻和加熱 簡介ScanLater免疫印跡蛋白質梯是ScanLater免疫印跡蛋白質檢測系統必不可少的一項組成。蛋白質梯最初始是應用于蛋白質分子定量,凝膠電泳的可
SDSPAGE測定蛋白質分子量及蛋白質的純度鑒定
一、實驗目的與原理蛋白質在聚丙烯酰胺凝膠中電泳時,它的遷移取決于它所帶電荷以及分子大小和形狀等因素。1967年Shapiro等人發現,如果在聚丙烯酰胺系統中加入陰離子去污劑十二烷基磺酸鈉(SDS),大多數蛋白質能與SDS按一定比例結合,即每克蛋白質結合1.4g的SDS-復合物都帶上相同密度的負電荷,
蛋白質分子中氨基酸的連接方式
?? 在蛋白質分子中,氨基酸之間是以肽鍵(peptide bond)相連的。肽鍵就是一個氨基酸的α-羧基與另一個氨基酸的α-氨基脫水縮合形成的鍵。 氨基酸之間通過肽鍵聯結起來的化合物稱為肽(peptide)。兩個氨基酸形成的肽叫二肽,三個氨基酸形成的肽叫三肽……,十個氨基酸形成的肽叫十肽,一般將十
Nature:用于蛋白質分析的單分子DNA技術
George Church 及同事開發出用于并行蛋白相互作用分析、借助用于蛋白功能分析的單分子DNA方法的一個“單分子相互作用測序”(SMI-seq)技術。 SMI-seq的工作原理是,通過核糖體顯示或酶結合將蛋白耦合到DNA識別符或“條碼”上。 這些條碼化的蛋白然后在水溶液中被一起分析,并
凝膠層析法測定蛋白質相對分子質量
實驗目的掌握凝膠層析的基本原理。學習利用凝膠層析法測定蛋白質相對分子質量的實驗技能。實驗原理凝膠層析法也稱分子篩層析法,是利用具有一定孔徑大小的多孔凝膠作固定相的層析技術。當混合物隨流動相經過凝膠層析柱時,其中各組分按其分子大小不同而被分離的技術。該法設備簡單、操作方便、重復性好、樣品回收率高。凝膠