尹鵬團隊不到三個月連發《Nature》、《Nature》子刊
合成生物學家和納米生物學家門正在利用DNA重建，設計由自我組裝材料構建的藥物釋放納米結構。這些分子期間可感知周圍環境，采取恰當的應對策略。如檢測身體環境中的炎癥或毒素等。盧冠達團隊報道新型基因電路，自動觸發癌細胞免疫攻擊 雖然這些納米級應用設備往往涉及數以千計的DNA序列，但目前為止，研究人員還缺乏一種工具讓大型單鏈序列自發生長，然后再尾對尾的互相連接，組合為多功能結構或設備。 今天《Nature Chemistry》發表文章，哈佛威斯生物工程研究所的Peng Yin（尹鵬）團隊開發了一種讓預先設計的DNA序列自主成長，并沿特定裝配路徑連接。這為新一代可編程分子器件開發提供了一個可用工具。 為了檢驗這一名為“引物交換反應（Primer Exchange Reaction，PER)”的新概念。研究人員用它成功設計了一組具有不同功能的設備，如能感知、放大、記錄或對環境信號進行合理評估的自我構建DNA折紙和DNA納米結構。 ......閱讀全文
隨機引物法標記－DNA
利用寡核苷酸作引物，DNA 聚合酶可沿單鏈模板起始 DNA 的合成（Gotilian 1969)。如果寡核苷酸的序列不均一，它們就可在模板的多位點上與模板雜交。因此模板上每一核苷酸（5' 端的核苷酸除外）的互補物將以同樣的頻率摻入產物。本實驗來源「分子克隆實驗指南第三版」黃培堂等譯。實驗方法
隨機引物法標記－DNA
? ? ? ? ? ? 實驗方法原理 利用寡核苷酸作引物，DNA 聚合酶可沿單鏈模板起始 DNA 的合成（Gotilian 1969)。如果寡核苷酸的序列不均一，它們就可在模板的多位點上與模板雜交。因此模板上每一核苷酸（5' 端的核苷酸除外）的互補物將以同樣
隨機引物法標記－DNA
實驗方法原理 利用寡核苷酸作引物，DNA 聚合酶可沿單鏈模板起始 DNA 的合成（Gotilian 1969)。如果寡核苷酸的序列不均一，它們就可在模板的多位點上與模板雜交。因此模板上每一核苷酸（5' 端的核苷酸除外）的互補物將以同樣的頻率摻入產物。實驗材料 大腸桿菌 DNA 聚合酶Ⅰ Kl
長片段DNA如何設計測序引物
如果是測序引物的話，因為目前的測序技術一端只能到800bp左右，所以一對引物差不多能測1.5kb左右的片段，超出這個范圍測出來的也不太可信了。所以如果你的目的片段在這個范圍內，設計1對引物就行了，如果超出這個范圍，比如說有6k左右，那就要設計四對引物，設計方法跟常規的一樣，只是把握這個間隔就好了。1
雙鏈DNA探針隨機引物合成法
? 隨機引物合成雙鏈探針是使寡核苷酸引物與DNA模板結合,在Klenow酶的作用下,合成DNA探針。合成產物的大小、產量、比活性依賴于反應中模板、引物、dNTP和酶的量。通常,產物平均長度為400-600個核苷酸。利用隨機引物進行反應的優點是：(1)Klenow片段沒有5'→3'外切
DNA合成由RNA引物引發過程
DNA聚合酶不能發動新鏈的合成，只能催化已有鏈的延長；RNA聚合酶則不同，只要有模板存在，不需引物，就可以合成新RNA鏈。因此在體內先由RNA聚合酶合成RNA引物，DNA聚合酶再從RNA引物的3‘-OH端開始合成新的DNA鏈。催化RNA引物合成的酶稱為引物合成酶。引物長度通常只有幾個~10多個核苷酸
隨機引物法介紹DNA探針的標記方法
變性的探針溶液加入6個核苷酸的隨機DNA小片段，作為引物，當后者與單鏈DNA多個部位互補結合后，按堿基互補原則不斷在其3'-OH端添加同位素標記的單核苷酸，這樣也可以獲得放射性比活性很高的DNA探針。
隨機引物合成法雙鏈DNA探針標記法
隨機引物合成雙鏈探針是使寡核苷酸引物與DNA模板結合,在Klenow酶的作用下,合成DNA探針。合成產物的大小、產量、比活性依賴于反應中模板、引物、dNTP和酶的量。通常,產物平均長度為400-600個核苷酸。利用隨機引物進行反應的優點是：(1)Klenow片段沒有5'→3'外切酶活
AluPCR:用重復序列引物擴增來源復雜的人DNA
引言 聚合酶鏈反應PCR使不同來源的特異核酸片段的分離及分析發生了革命，但應用PCR分 離，分析特定DNA區域需要了解靶區域的邊側序列，這使擴增局限于已知DNA序列。我 們研究了從復雜的人和其他種DNA混合物中擴增未知DNA序列。特別是，我們應用PCR 分離出了在嚙齒類細胞背景中含有人染色體片段的
引物溶解引物保存
1. 如何測定引物的OD值？用紫外分光光度計在260nm波長測定溶液的吸光度來定量，請注意紫外分光光度計的使用，測定時溶液的吸光度最好稀釋到0.2~0.8之間（吸光度太高或太低會有較大的誤差）。DNA干粉用一定體積的水充分振蕩溶解以后，取部分溶液稀釋到1 ml 并在1 ml 標準比色皿中測定其吸光度
引物溶解引物保存
1. ?如何測定引物的OD值？ 用紫外分光光度計在260nm波長測定溶液的吸光度來定量，請注意紫外分光光度計的使用，測定時溶液的吸光度最好稀釋到0.2~0.8之間（吸光度太高或太低會有較大的誤差）。DNA干粉用一定體積的水充分振蕩溶解以后，取部分溶液稀釋到1 ml 并在1 ml 標準比色皿中測定其
Nature解析癌癥與“垃圾”DNA
癌癥是由多次遺傳改變（或突變）而引起的一類疾病。我們從父母那里繼承了或強或弱的形成某些癌癥類型的遺傳易感性；此外，在我們的一生中我們的細胞內也會不斷地累積新的突變。盡管已開展了很長一段時間的癌癥遺傳起源研究，直到現在研究人員仍無法估量基因組一些非編碼區域的作用。 來自日內瓦大學(UNIGE)的
Nature：被丟失的“垃圾”DNA
在人類基因組中，基因只占據2%的序列，其余的均是由稱作非編碼DNA的遺傳物質構成。科學家們多年來一直試圖解開這一謎團：為何基因組中會存在如此龐大數量的這種遺傳物質？ 現在，一項新研究帶來了出乎意料的新發現：絕大多數的非編碼DNA也許確實并非復雜生命所需。這一研究發表在 5月12日的《自然》（N
存在有自然中生物的DNA復制引物類型
存在有自然中生物的DNA復制引物（RNA引物）和聚合酶鏈式反應(PCR)中人工合成的引物（通常為DNA引物）。一般所說引物，指DNA引物，以下簡稱引物。
Nature子刊：DNA“籠子”的妙用
來自麥吉爾大學的研究人員在最新一項研究中指出，DNA鏈制成的納米結構可以用于封裝小分子藥物，并在特定的刺激下釋放藥物，這一研究成果公布在9月1日的Nature Chemistry雜志上。 這項研究將有助于生物納米結構在藥物遞送方面的應用，也將為設計以DNA為基礎的納米材料開辟新的道路。
Nature：DNA復制過程的關鍵奧秘
最近，沙特國王科技大學（King Abdullah University of Science and Technology，KAUST）的研究人員，揭開了DNA復制過程中的一個關鍵奧秘。相關研究結果發表在最近的國際頂級學術刊物《Nature》。 在一個細菌分裂之前，它必須通過一個稱為DNA復
潘學文博士Nature解析DNA修復
生物通報道：來自貝勒醫學院的研究人員指出了一種核小體重構因子：Fun30在DNA雙鏈端粒末端切除過程中扮演的重要角色，為進一步解析DNA雙鏈斷裂修復過程提供了新思路，相關成果公布在Nature雜志上。 文章的通訊作者之一是華裔科學家潘學文博士(Xuewen Pan，生物通音譯)，其早年
引物設計的引物設計原則
1、長度：15—30bp，其有效長度[Ln=2(G十C)十(A十T)]一般不大于38，否則PCR的最適延伸溫度會超過Taq酶的最佳作用溫度(74度)，從而降低產物的特異性。2、G十C含量：應在40%一60%之間，PCR擴增中的復性溫度一般較Tm值低等于引物的Tm值減去5—10度。引物長度小于20時，
引物設計的引物設計原則
1、引物長度一般為15-30bp，常用的為18-27bp，但不能大于38bp；2、引物GC含量一般為40%-60%，以45-55%為宜，上下游引物GC含量和Tm值要保持接近；3、引物所對應的模板序列的Tm值最好在72℃左右，至少要在55-80℃之間，Tm值曲線以選取72度附近為佳，5'到 3
引物設計的引物設計原則
1、引物長度一般為15-30bp，常用的為18-27bp，但不能大于38bp；2、引物GC含量一般為40%-60%，以45-55%為宜，上下游引物GC含量和Tm值要保持接近；3、引物所對應的模板序列的Tm值最好在72℃左右，至少要在55-80℃之間，Tm值曲線以選取72度附近為佳，5'到 3
引物設計的引物設計原則
1、引物長度一般為15-30bp，常用的為18-27bp，但不能大于38bp；2、引物GC含量一般為40%-60%，以45-55%為宜，上下游引物GC含量和Tm值要保持接近；3、引物所對應的模板序列的Tm值最好在72℃左右，至少要在55-80℃之間，Tm值曲線以選取72度附近為佳，5'到 3
快速了解反轉錄引物隨機引物
隨機引物是指當特定mRNA由于含有使逆轉錄酶終止的序列而難于拷貝其全長序列時，可采用隨機六聚體這一非特異的引物來拷貝全長mRNA。 1.特異性引物一般在增低豐度目的基因才選擇使用，用得比較少。一般都推薦用Oligo(dT)或隨機引物代替基因特異性引物。由于rna的二級結構破壞不完全，導致特異性
什么是上游引物和下游引物
雖然這個問題很簡單，但我怎么發覺挺難回答的......上游引物就是和要擴增基因片斷上游序列結合的引物（引物就是單鏈寡聚核苷酸，基因擴增需要從引物開始），同理，下游引物指與目的基因片斷下游序列結合者。具體示意如下：（上下兩條長線代表DNA模板）5'-----------------------
－Nature：DNA講述歷史－基因中發掘細節
英德研究人員在14日出版的美國《科學》雜志上報告說，絲綢之路的貿易、成吉思汗的西征乃至歐洲的殖民擴張等重大歷史事件的影響，都反映在現代人類的基因中。 研究人員利用世界各地95個民族近1500人的DNA(脫氧核糖核酸)數據，繪制出一幅過去4000年中的人類基因交流地圖，為人類通過基因分析的方
Nature：撥慢人類DNA分子時鐘
人類祖先的故事一直只是寫在骨骼化石中，不過自上個世紀60年代DNA檢測介入其中，我們就了解的更加深入了，比如說一些研究結果表明，所有現代人類都源自10多萬年前生活在非洲人，但其中人類進化的一些關鍵事件與考古學相悖。 現在，考古學家和遺傳學家又開始重新解析這些事件，由于DNA突變率――基于遺
Nature－Nanotechnology：DNA環狀分子的自主復制
生物系統中存在很多的自主復制的例子。然而，人工制造這樣的生物系統的自主復制系統卻是相當困難，這是因為生物系統很復雜。在其他領域，人類可以創造某些自我復制系統，比如磁場系統以及模塊化機器人等等。我們很少將這些人造的自我復制系統和生物系統中的自我復制系統進行比較。因而，如果能從理論上將人工的自主復制
Nature－Methods發布首個DNA精確模擬平臺
模擬可以將實驗手段無法直接觀察到的活動呈現在人們眼前。科學家們日前開發了首個能夠精確模擬DNA的平臺，有助于研究DNA的結構改變，以及DNA與蛋白和藥物的互作。 分子動力學可以解析發生在不同時間尺度上的過程（從皮秒到分鐘），適用于不同規模的分析體系（從納米到米）。這一技術能用來模擬DNA的各種
Nature：從結構上揭示DNA解鏈機制
DNA是一本含有構建生命指令的分子手冊。與任何手冊一樣，如果DNA保持未打開且未讀取的狀態，那么它完全是沒有用的。為了讓DNA進行轉錄，RNA聚合酶（RNA polymerase, RNAP）必須撬開DNA的兩條鏈，這一過程稱為“解鏈”或“解旋”。圖片來自CC0 Public Domain。
Nature：修復線粒體DNA損傷逆轉衰老
在醫療技術日趨完善的今天，健康不再是人們唯一所追求的，養生、保養等越來越成為人們津津樂道的話題，人人都想要永葆青春，而這其中最大的敵人便是“衰老”。之前《Science》雜志有報道稱衰老與線粒體DNA損傷相關，一直以來，科學家們將衰老歸因于遺傳及基因的損傷，卻并未深思過這種損傷是否可逆。而來自阿
Nature子刊：DNA損傷應答又成禍首
密歇根大學研究發現了一個慢性腎臟病的一個新致病基因，研究指出慢性腎臟病的致病機制涉及了此前認為與之無關的DNA損傷應答，文章發表在7月8日的Nature Genetics雜志上。 “在發達國家，慢性腎臟病的發病率在持續上升，而人們還不了解這一現象的原因。慢性腎臟病已經成為影響健康的主要