潘學文博士Nature解析DNA修復
生物通報道：來自貝勒醫學院的研究人員指出了一種核小體重構因子：Fun30在DNA雙鏈端粒末端切除過程中扮演的重要角色，為進一步解析DNA雙鏈斷裂修復過程提供了新思路，相關成果公布在Nature雜志上。 文章的通訊作者之一是華裔科學家潘學文博士(Xuewen Pan，生物通音譯)，其早年畢業于華中農業大學，2001年獲得杜克大學醫學中心的博士學位，之后赴約翰霍普金斯醫學院進行博士后研究，目前任貝勒醫學院生化與分子生物學，分子與人類遺傳學系的副教授。 DNA作為細胞生命活動最重要的遺傳物質，保持其分子結構的完整性和穩定性對于細胞的存活和正常生理功能的發揮具有重要意義。包括電離輻射、化療藥物及細胞代謝產物在內的多種外源和內源性因素都能引起不同形式的DNA損傷，其中DNA雙鏈斷裂(DSBs)是一種最嚴重的DNA損傷形式。DNA雙鏈斷裂可以導致突變、基因組不穩定性和細胞死亡，因此DNA雙鏈斷裂的修復對保持基因組的完整性......閱讀全文
美醫學院審查研究人員“問題”論文
美國紐約州的一所醫學院近日表示，將對一名涉嫌違紀的教職員工進行調查。日前，加州某聯邦法院公布的內部文件稱，該研究人員署名的一篇論文部分由孟山都公司職員代筆。 紐約醫學院副主席Jennifer Riekert表示，“現在我們意識到出了問題，并獲取了一些相關材料。” 據悉，問題論文于2000年出
哈佛醫學院6名研究人員中毒
據香港《星島日報》10月26日報道，近期公布的一份美國哈佛大學內部文件顯示，哈佛大學醫學院曾發生一起中毒案，有6名醫學研究人員中毒，目前尚不清楚是否有人蓄意下毒。 哈佛大學一份內部文件透露，今年8月26日該校發生6名研究人員中毒事件，這6名研究人員都是哈佛大學醫學院病理學學科的師生。當時，
北京大學Cell子刊探究明星抑癌基因新功能
來自北京大學、康奈爾大學Weill醫學院的研究人員在新研究中證實，PTEN通過與組蛋白H1相互作用控制了染色質凝聚，這一研究發現發表在9月4日的《Cell Reports》雜志上。 北京大學基礎醫學院的尹玉新（Yuxin Yin）教授以及康奈爾大學Weill醫學院的Wen H. Shen是這篇
潘學文博士Nature解析DNA修復
生物通報道：來自貝勒醫學院的研究人員指出了一種核小體重構因子：Fun30在DNA雙鏈端粒末端切除過程中扮演的重要角色，為進一步解析DNA雙鏈斷裂修復過程提供了新思路，相關成果公布在Nature雜志上。 文章的通訊作者之一是華裔科學家潘學文博士(Xuewen Pan，生物通音譯)，其早年
上海交大教授Cell－Stem－Cell新發現：干細胞表觀代謝新機制
生物通報道：我們的機體在不斷地發生改變：新細胞不斷替換特化細胞來維持皮膚、腸、血液和其他組織，或在損傷后修復它們。由于分化細胞通常無法分裂，更新幾乎總是由組織特異性的干細胞來完成，它們能夠不斷地生成新細胞。但是這其中具體的機制至今科學家們并不是十分清楚。 近期來自中科院上海生科院，上海交通大學
研究人員繪出蘋果基因組草圖
一個國際科研小組8月29日在英國《自然—遺傳學》（Nature Genetics）雜志上報告說，他們繪出了蘋果的基因組草圖，這將有助于從基因水平上分析蘋果性狀，培育更多蘋果新品種。 意大利、美國、新西蘭等國研究人員報告說，他們繪出的是廣受人們喜愛的“金冠蘋果”的基因組草圖。結果
張強峰博士Nature解析全基因組蛋白互作
來自美國哥倫比亞大學，同濟大學等處的研究人員發表了題為“Structure-based prediction of proteinCprotein interactions on a genome-wide scale”的文章，提出了一種基于三維結構信息的全基因組蛋白質相互作用計算預測方
復旦大學發表Nature表觀遺傳學新文章
來自復旦大學、中國科學院等機構的研究人員在新研究中揭示出了，從頭甲基化轉移酶DNMT3A自抑制以及組蛋白H3誘導DNMT3A激活的機制。研究結果發表在11月10日的《自然》（Nature）雜志上。 領導這一研究的是復旦大學上海醫學院，生科院的徐彥輝(Yanhui Xu)教授，其早年畢業于清華大
吉林大學Cell子刊發表表觀遺傳學研究成果
高等生物的基因組DNA圍繞著由四種組蛋白組成的八聚體，形成碟狀的核小體結構。基因組DNA以這樣的形式包裝成為染色質，使DNA受到良好的保護。染色質的結構和動態受到組蛋白表觀遺傳學修飾的調控，比如最近發現的組蛋白賴氨酸巴豆酰化。這種組蛋白修飾在基因表達、DNA損傷應答等重要的細胞過程中起到了關鍵性
上海交大LncRNA研究刊登國際期刊
長非編碼RNA（lncRNA）不編碼蛋白質，最初被認為是基因組“暗物質”的一部分。最近，有研究表明，lncRNAs在染色質修飾復合物的招募過程中發揮作用，并能影響基因的表達。然而，是否lncRNAs以類似的方式在癌癥中發揮作用，尚不明確。延伸閱讀：中美學者JBC解析lncRNA在EMT中的作用。
《科學》雜志精選：人類基因組蛋白產物仍是謎
幾近完成的普通小麥基因組測序 研究人員已經展示了普通小麥基因組的序列草圖，從而在通往創制世界上種植最廣泛谷物作物之一的完整參考序列的道路上到達了一個主要的里程碑。他們的工作給了科學家們一個可在小麥個體染色體上快速定位特定基因的工具，這一資源可幫助他們改良小麥育種以滿足從未有過的對食物的更高需求
Nature：解析核小體的重塑機制
在細胞核中，基因組DNA緊緊包裹在核小體上形成染色質，但基因在如此緊密的包裝中是無法表達的。現在德國慕尼黑大學LMU的研究團隊，揭示了局部釋放核小體DNA的分子機制，正是這一機制使染色體DNA得以轉錄。文章發表在本期的Nature雜志上。 高等生物的細胞核負責儲存基因組DNA，這些DNA環
Cell子刊：“垃圾”DNA的陰暗面
在基因之間的DNA片段，散布著重復序列，曾經被認為是“基因組垃圾”，但現在科學家們了解到，一些這樣的垃圾DNA并不是無害的。在《Cell Reports》發表的一項研究中，來自北卡羅來那大學（UNC）Lineberger綜合癌癥中心的研究人員報道稱，某些短的DNA重復序列，或“垃圾DNA”，在尤文肉
Polycomb組蛋白與染色質相互作用的關鍵機制
2021年6月，Genome Research雜志在線發表了法國巴黎薩克雷大學植物科學研究所Moussa Benhamed教授為通訊作者題為“Polycomb-dependent differential chromatin compartmentalization determines gen
上海同濟大學Cell子刊揭示細胞信號切換開關
來自上海同濟大學醫學院、美國Mayo臨床中心的研究人員在新研究中證實，SIRT1-TopBP1信號軸發揮轉換開關作用，調控了代謝檢查點反應和DNA損傷檢查點反應。這一研究發現在線發表在《分子細胞》（Molecular cell）雜志上。 上海同濟大學醫學院的袁健（Jian Yuan）教授以及美
曹雪濤院士、王青青教授Nature子刊發布免疫新成果
來自浙江大學、中國醫學科學院、第二軍醫大學等機構的研究人員證實，甲基轉移酶Dnmt3a上調HDAC9使得TBK1激酶脫乙酰化激活了天然免疫。這一重要的免疫發現發布在5月30日的《自然免疫學》（Nature Immunology）雜志上。 我國著名的免疫學家曹雪濤（Xuetao Cao）院士和浙
癌癥研究人員聯手匯集腫瘤基因組數據
研究人員希望，數據分享將為利用諸如這些腦部腺癌細胞等腫瘤的基因組信息帶來更好的方法。 這是為大型癌癥研究中心的很多病人提供的最新希望：“讓我們測序你的腫瘤，或許我們能將其同擊敗這種惡性疾病的藥物匹配。”不過，現實是基因組分析仍然僅為癌癥病人提供了一小部分幫助。“我們多半時候不知道如何處理這些
首次繪制紫外輻射誘導的細胞應答遺傳互作圖譜
美國加利福尼亞大學圣地亞哥醫學院的研究人員，與荷蘭和英國的合作者一起，首次繪制了紫外輻射誘導的細胞應答反應背后的詳細的遺傳互作圖譜。這項研究成果將在12月26日的Cell Reports雜志上刊出。 加利福尼亞大學圣地亞哥醫學院的研究人員，與荷蘭、英國的合作者一起，首次繪制了紫外(UV
放大四千倍細胞解開基因組秘密
基因調控是發生在分子水平上的過程，傳統顯微鏡很難觀察到。在最新一期《科學》雜志在線發表的一篇論文中，美國耶魯大學研究人員開發了一種名為染色質擴張顯微鏡（ChromExM）的新技術，成功地將斑馬魚胚胎細胞核的物理體積擴大了4000倍，從而大幅提高了圖像分辨率。這項技術讓研究人員第一次看到了單個分子
原子力顯微鏡研究λDNA組蛋白的相互作用
? ? ?對DNA與組蛋白的相互作用的認識是我們進一步了解其功能和探討生命現象的重要基礎。原子力顯微鏡(AFM)成像分辨率高、成像直觀,且樣品制備簡單,不需要經過脫水、抽真空、染色、包埋等 這些會使生物分子結構發生一定改變的復雜處理過程,并可對生物分子在近生理條件下檢測它們的動態結構信息。? ? ?
研究揭示組蛋白變體調控早期胚胎發育新機制
近日，華中農業大學動物科學技術學院、動物醫學院苗義良團隊研究成果在Advanced Science在線發表。研究針對鼠豬早期胚胎系統地揭示了H2A.Z在早期胚胎發育過程中的動態分布規律，并首次證實了H2A.Z的分級富集參與調節哺乳動物早期胚胎的基因表達和組蛋白修飾狀態。 在哺乳動物早期胚胎發育
CRISPR新應用：尋找基因調控元件
人體內所有的組織都是由蛋白質構成的，每一種蛋白質都是由人類基因組中一段DNA“編碼”的。 但是這些編碼區僅占基因組的大約百分之1，而分散在基因組中的其他百分之99的序列，參與了調節基因的表達，或決定哪些編碼區將被翻譯成蛋白質，以及何時被翻譯。 1月25日在《Nature Biotechnol
Nature發表表觀遺傳學新成果揭示與生育有關的重要機制
高等生物的基因組DNA圍繞著由四種組蛋白組成的八聚體，形成碟狀的核小體結構。基因組DNA以這樣的形式包裝成為染色質，使DNA受到良好的保護。通過“讀取”模塊識別組蛋白修飾是表觀遺傳學調控的一個主要機制。十一月十四日Nature Communications雜志發表的一項新研究揭示了小鼠生殖細胞生成中
新研究揭示乙肝病毒DNA與人基因組互作景觀圖
乙型肝炎病毒（hepatitis B virus，HBV）感染是全球性重大公共衛生健康問題之一，目前，全球乙肝病毒慢性感染者人數較多。HBV屬嗜肝DNA病毒科，在人體肝臟細胞核內可形成cccDNA、整合入人體基因組等病毒DNA形式穩定存在，這是HBV維持長期慢性感染的關鍵。因此，研究乙肝病毒與宿
Cell發布突破性染色質檢測技術
來自美國麻省大學醫學院的研究人員開發出了一項新技術，可以提供真核生物基因組的詳細三維（3-D）圖像，這有可能幫助科學家們解答一些有關染色質結構的關鍵問題。在發表于《細胞》（Cell）雜志上的研究論文中，這一稱作為Micro-C的新技術使得研究人員能夠以核小體分辨率來分析染色體折疊，填補了以往一些
彌補ChIPseq缺陷的新工具
來自美國麻省大學醫學院的研究人員開發出了一項新技術，可以提供真核生物基因組的詳細三維（3-D）圖像，這有可能幫助科學家們解答一些有關染色質結構的關鍵問題。在發表于《細胞》（Cell）雜志上的研究論文中，這一稱作為Micro-C的新技術使得研究人員能夠以核小體分辨率來分析染色體折疊，填補了以往一些
Cell發布突破性基因組研究技術
來自美國麻省大學醫學院的研究人員開發出了一項新技術，可以提供真核生物基因組的詳細三維（3-D）圖像，這有可能幫助科學家們解答一些有關染色質結構的關鍵問題。在發表于《細胞》（Cell）雜志上的研究論文中，這一稱作為Micro-C的新技術使得研究人員能夠以核小體分辨率來分析染色體折疊，填補了以往一些
研究人員破譯香蕉“美食蕉”品種香蕉基因組
原文地址：http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2023/11/512730.shtm廣東省農業科學院研究員易干軍領銜的香蕉遺傳改良團隊與廣西大學教授陳玲玲團隊合作，破譯了香蕉“美食蕉”品種香蕉基因組，首次在國際上組裝染色體級別的異源三倍體香蕉栽培種（AAB）參考基因
研究人員成功構建首個圭亞那柱花草基因組
在國家自然科學基金等項目的資助下，華南農業大學副教授陳曙團隊成功完成首個圭亞那柱花草染色體水平基因組組裝，從基因組、轉錄組及表觀遺傳組多維度解析其抗逆分子機制，為熱帶牧草分子育種與抗逆研究提供關鍵理論支撐與基因資源。相關成果近日發表于《植物雜志》（The Plant Journal）。圭亞那柱花草比
中科院新成果揭示癌癥干細胞中的表觀遺傳學調控
癌癥干細胞能夠通過自我更新和分化，啟動并維持癌癥的發生和發展。人們已經在越來越多的腫瘤中分離和鑒定到了癌癥干細胞，比如結腸癌、肝癌、乳腺癌和胰腺癌。 Metadherin (MTDH)廣泛參與了腫瘤生長、藥物抗性、腫瘤復發和轉移，但此前人們并不了解其分子機制。中科院的研究團隊通過深入研究，揭示