青島能源所提出“微生物組影響指數”
微生物組是微生物在自然界的存在形式,與人體、空氣、土壤與海洋的健康息息相關。因此,微生物組科學與產業已經成為國際科技合作與競爭的“戰略高地”。然而,大數據挖掘工具的匱乏,阻礙著微生物組研究從“數據分析”向“數據科學”的跨越。2010年,來自43個國家的500多名研究人員聯合啟動了“地球微生物組計劃”(Earth Microbiome Project; EMP),對全球微生物組的多樣性進行系統性調查,已經發表了第一階段的成果(Thompson, et al., Nature, 2017)。而各國政府歷年來陸續啟動的“人體微生物組計劃”(Human Microbiome Project; HMP)與“美國國家微生物組計劃”(National Microbiome Initiative; NMI)等,也同樣產出了海量的菌群數據。這些以元基因組為代表的微生物組數據類型多樣、來源迥異、體量龐大,而且其數量正在以指數型增長。但是,大數據......閱讀全文
口腔、腸道微生物菌群元基因組關聯分析
2015年7月28日,北京協和醫院和華大基因等機構的研究人員共同合作完成了類風濕關節炎(RA)口腔和腸道微生物元基因組研究。本項研究揭示口腔和腸道微生物菌群異常是RA病理生理和疾控的重要環節,并且為元基因組學輔助的RA個性化診療方案提供基礎。研究成果于今日發表在《自然醫學》雜志。 RA是一種致
新生兒腸道微生物菌群研究
腸道微生物菌群被認為與人類健康息息相關。但是微生物菌群是如何穩定建立的,還沒有很好的定量研究。在近期的《Cell Host & Microbe》上,通過宏基因組測序分析,科學家們分析了新生兒和母親腸道菌群,分析了新生兒出生第一年腸道微生物菌群的建立。他們發現,自然生成的嬰兒和剖腹產嬰兒的腸道菌群
What腸道微生物菌群能夠促進器官發育?
腸道是一個復雜的生態系統,也是多種寄生微生物與動物宿主微生物之間相互共生的地點。動物的宿主微生物菌群能夠促進動物胃腸道發育的作用已經不容置疑。 然而,動物體內的寄生微生物菌群對消化器官發育所產生的影響仍然難以捉摸。 在本文中,研究人員Hill 等人提出腸道微生物菌群在斑馬魚早期幼魚發育過程中,
微生物所發表中國微生物組數據平臺
10月26日,《核酸研究》(Nucleic Acids Research)在線發表中國科學院微生物研究所微生物資源與大數據中心、世界微生物數據中心馬俊才團隊題為gcMeta: a Global Catalogueof Metagenomics platform to support the ar
抗菌牙膏不會影響腸道菌群和口腔微生物
根據小型隨機試驗測定,一些含有抗生素三氯生的個人衛生用品,如肥皂和牙膏,對微生物群落或內分泌功能沒有重大影響。這項研究結果在線發表在mSphere上。 “有很多人害怕三氯生,但在我們的研究中我們沒有發現任何相關的支持論點。“醫學博士Julie Parsonnet說,“當大多數抗生素應用到人類中
微生物檢測方法專有酶法測定大腸菌群
微生物專有酶法測定大腸菌群:大腸菌群哦看產生β-半乳糖苷酶,分解液體培養基中的酶底物——4-甲基傘形酮-β-D-半乳糖苷,使4-甲基傘形酮游離,因而在366nm的紫外光燈下呈現藍色熒光。
人體內的微生物菌群與出生方式有關?
近年來,人體內微生物菌群的數量及它們的重要性逐漸引起人們的關注。 人體內生存著數以萬億計的細菌及其他單細胞微生物,例如古生菌和原生生物,其中大多數位于腸道內。據估計,它們的數量甚至超過了人體自身細胞的數量。 眾所周知,人體內的微生物生態系統對我們的健康有深遠的影響。 人體微生物研究工程(H
研究開發基于菌群大數據搜索的新疾病檢測方法
基于菌群大數據搜索引擎實現疾病檢測的原理 微生物組具有服務疾病診治與生態監控的巨大潛力,但是其影響因素錯綜復雜。如何通過菌群檢測實現快速精準的疾病診斷呢?中科院青島生物能源與過程研究所單細胞中心發明了基于菌群大數據搜索的疾病檢測方法,為此共性問題提供了原創解決方案。該研究成果近日在線發表于《美國微
中科院最新文章解析人類母乳微生物菌群
母乳是嬰兒最健康、理想的營養來源, 也是人類進化和文明最重要的特征之一. 最新的宏基因組學研究表明母乳含有高達數百種細菌, 而且包括一些常見的病原菌. 母乳微生物菌群是人類與微生物協同進化相互適應的產物, 而“微生物群落-宿主”生態系統的動態平衡則應是保持健康母乳的基礎. 然而, 迄今為止, 從
新冠病毒與兒童體內微生物菌群關系被揭開
新冠病毒肆虐全球已有一年半的時間,隨著人們對新冠病毒的深入了解,新冠病例的治愈康復率在不斷提高,不過,其康復后的后遺癥也應該受到重視。曾發表在 Nature 的一篇文獻指出,多數COVID-19康復者面臨著眾多健康問題,新冠病毒不僅僅影響著呼吸道系統,還可能長期影響著神經系統、代謝系統、心血管系
從腸道菌群到腸道病毒群
腸道菌群早以已經成為熱點科技新聞概念,其核心要點是腸道內細菌是維持健康的重要因素。其實腸道菌群自己身體內也有另外一種生命,就是細菌病毒,又稱為噬菌體。最近有研究發現,腸道內細菌感染的噬菌體對人體健康也具有重要價值,這些病毒無法裸露生活,都必須隱藏在細菌體內寄生。這里形成一個非常有趣的現象,人的腸
耐熱大腸菌群跟糞大腸菌群是一種菌嗎
大腸菌群并非細菌學分類命名,而是衛生細菌領域的用語,它不代表某一個或某一屬細菌,而指的是具有某些特性的一組與糞便污染有關的細菌,需氧及兼性厭氧、在37℃能分解乳糖產酸產氣的革蘭氏陰性無芽胞桿菌。 腸埃希氏菌(E. coli)通常稱為大腸桿菌,根據不同的生物學特性將致病性大腸桿菌分為5類:致病性
多樣性增加281%,人類腸道菌群基因組圖譜公布!
近兩年來,以免疫檢查點為藥物靶點的免疫檢查點抑制劑治療癌癥受到越來越多科研工作者的青睞。但是臨床研究結果表明,許多癌癥患者因接受免疫藥物治療而出現不同程度的免疫相關不良反應,最終出現不得不提前終止治療的情況。 而寄居在人體內的腸道菌群可以影響免疫檢查點抑制劑治療癌癥,能夠極大地改善患者對該療法
研究揭示環境對人腸道菌群和耐藥基因組影響
華南農業大學、嶺南現代農業科學與技術廣東省實驗室和國家獸醫微生物耐藥性風險評估實驗室劉雅紅教授團隊與中外合作者,發現人體和環境間存在廣泛的菌株和基因交換,而且環境對人腸道菌群的影響可能會持續4~6個月。相關研究3月18日在線發表于《自然—通訊》。 生物圈中的微生物種類眾多,其分布無處不在。同樣
美學者研究稱吃蟋蟀可改善人體微生物菌群
據美國合眾國際社8月13日報道,一項新的研究表明,吃蟋蟀有助于改善腸道中的微生物菌群,減少體內的炎癥。 此次研究的主要負責人是威斯康星大學麥迪遜分校的瓦萊莉·斯特爾(Valerie Stull),是該校可持續和地球環境研究中心的一名研究人員。 她表示,即使是思想最開放的美國人也在與吃昆蟲的想
使用冷凍分裝技術提高糞便微生物菌群研究的效...(一)
使用冷凍分裝技術提高糞便微生物菌群研究的效率和質量:突破處理糞便樣本難題作者:Graham S. Long, Joseph M. Fraone, and Larry Chin?摘要?目前,腸道微生物菌群研究已經成為科學研究領域越來越重要的一個方向,腸道微生物菌群研究在藥物研發、營養學研究、疾病預防和
沼氣發酵核心菌群及微生物網絡研究中獲進展
近年來,戶用沼氣技術在我國農村地區得到廣泛應用。了解戶用沼氣發酵核心菌群的共發生(co-occurrence)關系,以及它們與環境因子之間的關系,將有助于提高戶用沼氣發酵系統的效率和穩定性。 中國科學院成都生物研究所研究員李香真課題組芮俊鵬、李家寶等用高通量測序方法調查了43個沼液樣本中的微生
使用冷凍分裝技術提高糞便微生物菌群研究的效...(二)
使用冷凍分裝技術提高糞便微生物菌群研究的效率和質量:突破處理糞便樣本難題冷凍樣品取樣技術介紹?任何腸道微生物研究工作的起點都是從患者和志愿者那里收集糞便樣本,收集方法會根據操作流程和容器的不同而有所差異。考慮到研究項目的性質、規模以及存儲要求,樣本會被保存為原始狀態或者進行懸浮處理。考慮到收集容器的
概述有害菌菌群的生理功能
如果有害菌菌群“勝利”了,腸內黏膜粗糙,血液不流通而呈暗紅色。 1、排泄不順暢,腸內囤積糞便 為幫助排便,糞便的軟硬程度要適中,但不健康的腸則因膳食纖維的不足,導致糞便囤積大腸,無法順利排泄;又或者是因壞菌的繁殖引起細菌感染,而產生腹瀉的發生。 2、蠕動過快或太慢 腸不健康,可能會影響腸
全球最大的海洋微生物組數據庫建立
9月4日,《自然》在線發表中外科學家的合作成果,該成果建立了全球最大的海洋微生物組數據庫,從中發掘塑料降解酶、基因編輯工具、抗菌肽等重要基因資源。山東大學微生物技術國家重點實驗室教授李盛英為文章共同通訊作者,助理研究員劉琨為文章共同第一作者。 微生物已在生物制造、生物醫藥、生物農業、環境治理等
全球最大的海洋微生物組數據庫建立
9月4日,《自然》在線發表中外科學家的合作成果,該成果建立了全球最大的海洋微生物組數據庫,從中發掘塑料降解酶、基因編輯工具、抗菌肽等重要基因資源。山東大學微生物技術國家重點實驗室教授李盛英為文章共同通訊作者,助理研究員劉琨為文章共同第一作者。該成果在《自然》報道? ?山東大學供圖微生物已在生物制造、
全球微生物組大數據搜索引擎上線
日前,中國科學院青島生物能源與過程研究所單細胞研究中心正式發布首個微生物組大數據搜索引擎——MSE(Microbiome Search Engine; http://mse.single-cell.cn),使得以整個微生物組為分析單元的智能搜索和大數據挖掘成為現實。 微生物組,又稱“菌群”。
什么是大腸菌群?
大腸菌群并非細菌學分類命名,而是衛生細菌領域的用語,它不代表某一個或某一屬細菌,而指的是具有某些特性的一組與糞便污染有關的細菌,這些細菌在生化及血清學方面并非完全一致,其定義為:需氧及兼性厭氧、在37℃能分解乳糖產酸產氣的革蘭氏陰性無芽胞桿菌。一般認為該菌群細菌可包括大腸埃希氏菌、檸檬酸桿菌、產
腸道菌群誘發機體衰老
多年以來,科學家們一直在研究棲息于人類機體腸道中的不同細菌群落是如何對機體功能產生顯著影響的,包括機體免疫系統等;腸道菌群有時被稱為“共生菌”,其存在于所有生活在一定功能平衡下的動物機體中,當這種平衡被打破后就會誘發宿主機體出現共生失調(commensal dysbiosis)的表現,比如疾病或
大腸菌群是什么
大腸菌群并非細菌學分類命名,而是衛生細菌領域的用語,它不代表某一個或某一屬細菌,而指的是具有某些特性的一組與糞便污染有關的細菌,這些細菌在生化及血清學方面并非完全一致,其定義為:需氧及兼性厭氧、在37℃能分解乳糖產酸產氣的革蘭氏陰性無芽胚桿菌。一般認為該菌群細菌可包括大腸埃希氏菌、檸檬酸桿菌、產氣克
腸道菌群隨季節改變
對現存為數不多的其中一個狩獵—采集者群體開展的研究表明,生活在人類腸道中的微生物隨著季節發生變化。相關成果日前發表于《科學》雜志。 來自“人類食物工程”的Jeff Leach及其團隊用一年多時間收集了生活在坦桑尼亞的350名哈扎人的糞便樣本。“人類食物工程”是一個非營利性機構,旨在研究微生物組
口腔中的正常菌群
口腔中有弱堿性唾液、食物殘渣等,為正常菌群的繁衍提供了合適條件。最常見的菌群是甲型鏈球菌和厭氧鏈球菌,其次是表皮葡萄球菌、奈瑟氏菌(Neisseria)、乳桿菌(Lactobacillus)、螺旋體(Spirochaeta)、假絲酵母(Candida)等。當拔牙時,甲型鏈球菌可通過傷口進入血流。一般
腸道菌群的影響因素
影響腸道菌群的主要因素有4個方面:人體自身的因素(腸道的酸堿性,膽汁及消化酶的分泌,腸道的蠕動,腸道黏液的分泌,腸道表皮的脫離等)以及人所處的環境因素(壓力,出差等);人體攝入的飲食(可消化的食物與不可消化的纖維、藥物等);細菌自身因素(細菌的黏附能力,繁殖能力,營養需求量,抗消化酶能力等);細
腸道菌群的基本介紹
腸道菌群,人體腸道的正常微生物,如雙歧桿菌,乳酸桿菌等能合成多種人體生長發育必須的維生素,如B族維生素(維生素B1、B2、B6、B12),維生素K,煙酸、泛酸等,還能利用蛋白質殘渣合成必需氨基酸,如天門冬氨酸、苯丙氨酸、纈氨酸和蘇氨酸等,并參與糖類和蛋白質的代謝,同時還能促進鐵、鎂、鋅等礦物元素
腸道菌群的分類介紹
根據可培養細菌的數量分類在腸道菌群中,可以培養到的細菌有400余種,依據其數量多少可以分為主要(優勢)菌群(predominant microflora)和次要菌群(sub—dominant microflora)。 ①主要(優勢)菌群:指腸道菌群中數量大或種群密集度大的細菌,一般在10~10