陳柱成/李雪明/李明組揭示SNF2染色質重塑中DNA滑移的機理
染色質重塑復合物利用ATP的能量移動核小體在基因組上的位置和組成成分,在控制染色質結構、調節基因轉錄等方面具有重大作用,主要可以分四大類:SWI/SNF、CHD、ISWI和INO80【1】。這些分子機器的運行機理,即如何利用ATP水解的能量推動核小體移動和組蛋白交換,一直是一個未解的科學問題。利用冷凍電鏡技術,近年來對于這個問題的解答有了突飛猛進【2-6】,其中清華大學陳柱成實驗室在領域也做出了重要的工作【2】。此外,美國哈佛大學Cigall Kadoch課題組在Cell上的工作還揭示了mSWI/SNF復合物的模塊組織和組裝通路,并分析了人類疾病相關的突變影響mSWI/SNF的分子機制【7】。(專家解讀Science+Cell丨近期系列染色質重塑復合物相關重大成果) 陳柱成實驗室長期從事染色質重塑的相關分子機理研究,近幾年該課題組發表了一系列重要成果,包括解析了Snf2蛋白基態晶體結構,闡釋了Snf2的自抑制機理【8】;解......閱讀全文
陳柱成/李雪明/李明組揭示SNF2染色質重塑中DNA滑移的機理
染色質重塑復合物利用ATP的能量移動核小體在基因組上的位置和組成成分,在控制染色質結構、調節基因轉錄等方面具有重大作用,主要可以分四大類:SWI/SNF、CHD、ISWI和INO80【1】。這些分子機器的運行機理,即如何利用ATP水解的能量推動核小體移動和組蛋白交換,一直是一個未解的科學問題。利
陳柱成/李雪明-SNF2介導的染色質重塑中DNA滑移的機理
2019年3月13日,清華大學生命科學學院陳柱成課題組、李雪明課題組以及中科院物理所李明課題組合作在Nature上發表了題為Mechanism of DNA translocation underlying chromatin remodeling by Snf2的研究論文,析了不同核苷酸狀態下
不同核苷酸狀態下Snf2核小體復合物的冷凍電鏡結構
SWI/SNF家族蛋白利用ATP水解產生的能量移動核小體在基因組DNA的位置,重塑染色質。這對于控制遺傳物質的開放性,調節基因轉錄等方面發揮重要作用。陳柱成實驗室近期報道了Snf2與核小體結合的結構。但這個早期的工作并沒有明確檢測到DNA移位。?染色質重塑蛋白如何利用ATP水解的能量推動核小體滑移依
時隔兩年-清華大學青年學者再發Nature解析染色質重塑
在真核生物細胞內,DNA纏繞著組蛋白八聚體形成染色質的基本組成單位,核小體。染色質在包裝、保護遺傳物質方面發揮著關鍵作用。 染色質形成同時對細胞內的一些生理過程,如DNA復制、轉錄、修復等產生了巨大的障礙。為此SWI/SNF家族染色質重塑復合物通過利用ATP水解的能量調控染色質的結構,廣泛參與
清華大學生科院在Nature上發表論文闡述染色質重塑機理
2017年4月19日,清華大學生命科學學院陳柱成課題組和李雪明課題組合作在《自然》(Nature)雜志上以長文(Research Article)形式在線發表題為《Snf2-核小體復合物結構揭示的染色質重塑機理》(Mechanism of chromatin remodelling reveal
清華大學生科院最新Nature子刊文章
2016年7月11日,清華大學生命科學學院陳柱成課題組在《Nature Structural & Molecular Biology》在線發表題為《染色質重塑因子SWI/SNF基態的結構》(Structure of chromatin remodeler Swi2/Snf2 in the res
CHD1蛋白的結構特點及作用
CHD蛋白家族的特征是存在染色質組織修飾域和SNF2相關的螺旋酶/ATPase結構域chd基因可能通過改變染色質結構來改變基因表達,從而改變轉錄設備對其染色體dna模板的訪問。
CHD1基因突變與藥物因子介紹
CHD蛋白家族的特征是存在染色質組織修飾域和SNF2相關的螺旋酶/ATPase結構域chd基因可能通過改變染色質結構來改變基因表達,從而改變轉錄設備對其染色體dna模板的訪問。[由RefSeq提供,2008年7月]The CHD family of proteins is characterized
CHD1基因編碼功能及結構描述
CHD蛋白家族的特征是存在染色質組織修飾域和SNF2相關的螺旋酶/ATPase結構域chd基因可能通過改變染色質結構來改變基因表達,從而改變轉錄設備對其染色體dna模板的訪問。[由RefSeq提供,2008年7月]The CHD family of proteins is characterized
?DNA損傷修復信號通路CHD4基因的臨床解釋
CHD家族蛋白的特征是存在染色質(染色質組織修飾劑)結構域和SNF2相關解旋酶/ ATPase結構域。 CHD基因可能通過修飾染色質結構來改變基因表達,從而改變轉錄設備對其染色體DNA模板的訪問。 已經發現該基因的編碼不同同工型的剪接的轉錄變體。
CHD2基因的結構特點和作用
CHD家族蛋白的特征是存在染色質(染色質組織修飾劑)結構域和SNF2相關解旋酶/ ATPase結構域。 CHD基因可能通過修飾染色質結構來改變基因表達,從而改變轉錄設備對其染色體DNA模板的訪問。 已經發現該基因的編碼不同同工型的剪接的轉錄變體。
DNA修飾CHD2基因信號通路介紹
CHD家族蛋白的特征是存在染色質(染色質組織修飾劑)結構域和SNF2相關解旋酶/ ATPase結構域。 CHD基因可能通過修飾染色質結構來改變基因表達,從而改變轉錄設備對其染色體DNA模板的訪問。 已經發現該基因的編碼不同同工型的剪接的轉錄變體。
CHD8-基因的結構特點和作用
該基因編碼一個色域螺旋酶DNA結合蛋白家族成員,其特征是一個SNF2樣結構域和兩個染色質組織修飾結構域編碼的蛋白質還包含婆羅門和基斯米特結構域,這些結構域是該蛋白質所屬的色域螺旋酶DNA結合蛋白亞家族的共同結構域。該基因在轉錄調控、表觀遺傳重塑、促進細胞增殖和RNA合成等過程中發揮著重要作用該基因的
CHD2基因突變與藥物因子介紹
CHD家族蛋白的特征是存在染色質(染色質組織修飾劑)結構域和SNF2相關解旋酶/ ATPase結構域。 CHD基因可能通過修飾染色質結構來改變基因表達,從而改變轉錄設備對其染色體DNA模板的訪問。 已經發現該基因的編碼不同同工型的剪接的轉錄變體。 [由RefSeq提供,2008年7月]The CHD
與DNA白修飾相關因子介紹CHD2
CHD家族蛋白的特征是存在染色質(染色質組織修飾劑)結構域和SNF2相關解旋酶/ ATPase結構域。 CHD基因可能通過修飾染色質結構來改變基因表達,從而改變轉錄設備對其染色體DNA模板的訪問。 已經發現該基因的編碼不同同工型的剪接的轉錄變體。 [由RefSeq提供,2008年7月]The CHD
CHD2基因編碼功能及結構描述
CHD家族蛋白的特征是存在染色質(染色質組織修飾劑)結構域和SNF2相關解旋酶/ ATPase結構域。 CHD基因可能通過修飾染色質結構來改變基因表達,從而改變轉錄設備對其染色體DNA模板的訪問。 已經發現該基因的編碼不同同工型的剪接的轉錄變體。 [由RefSeq提供,2008年7月]The CHD
CHD2基因編碼功能及結構描述
CHD家族蛋白的特征是存在染色質(染色質組織修飾劑)結構域和SNF2相關解旋酶/ ATPase結構域。 CHD基因可能通過修飾染色質結構來改變基因表達,從而改變轉錄設備對其染色體DNA模板的訪問。 已經發現該基因的編碼不同同工型的剪接的轉錄變體。 [由RefSeq提供,2008年7月]The CHD
DNA損傷修復信號通路相關因子CHD2
CHD家族蛋白的特征是存在染色質(染色質組織修飾劑)結構域和SNF2相關解旋酶/ ATPase結構域。 CHD基因可能通過修飾染色質結構來改變基因表達,從而改變轉錄設備對其染色體DNA模板的訪問。 已經發現該基因的編碼不同同工型的剪接的轉錄變體。 [由RefSeq提供,2008年7月]The CHD
清華大學陳柱成課題組Nature發表結構生物學重要研究成果
生物通報道:染色質重塑蛋白ISWI與Snf2、Chd1、Ino80同屬于SWI2/SNF2 家族。ISWI是一些染色質重塑復合體的催化亞基,這些復合物沿著基因組DNA移動核小體,協助復制前進、轉錄抑制、異染色質形成和其他細胞核過程。 ISWI的ATPase馬達是一個自主的重塑機器,其C端HSS
CHD8基因編碼功能及結構描述
該基因編碼一個色域螺旋酶DNA結合蛋白家族成員,其特征是一個SNF2樣結構域和兩個染色質組織修飾結構域編碼的蛋白質還包含婆羅門和基斯米特結構域,這些結構域是該蛋白質所屬的色域螺旋酶DNA結合蛋白亞家族的共同結構域。該基因在轉錄調控、表觀遺傳重塑、促進細胞增殖和RNA合成等過程中發揮著重要作用該基因的
CHD8基因突變與藥物因子介紹
該基因編碼一個色域螺旋酶DNA結合蛋白家族成員,其特征是一個SNF2樣結構域和兩個染色質組織修飾結構域編碼的蛋白質還包含婆羅門和基斯米特結構域,這些結構域是該蛋白質所屬的色域螺旋酶DNA結合蛋白亞家族的共同結構域。該基因在轉錄調控、表觀遺傳重塑、促進細胞增殖和RNA合成等過程中發揮著重要作用該基因的
韓國研發出新型鈉離子電池材料
韓國科學技術研究院(KIST)發布消息稱,該院能源融合研究組成功開發出以新型納米復合體(氟化錫SnF2)和碳素為基礎的鈉離子電池用負極材料。該研究結果刊登在納米技術領域《Nano Energy》雜志上。 研究組通過調節制造環境,用較厚的碳素層制作密封的納米復合體后,將SnF2和高導電性乙炔在
韓國研發出新型鈉離子電池材料
韓國科學技術研究院(KIST)發布消息稱,該院能源融合研究組成功開發出以新型納米復合體(氟化錫SnF2)和碳素為基礎的鈉離子電池用負極材料。該研究結果刊登在納米技術領域《Nano Energy》雜志上。 研究組通過調節制造環境,用較厚的碳素層制作密封的納米復合體后,將SnF2和高導電性乙炔在
著名學者莊小威Nature解析核小體重塑
來自哈佛大學的研究人員在新研究中探究了ISWI染色質重塑因子協調重塑核小體的機制。研究結果發表在6月29日的《自然》(Nature)雜志上。 文章的通訊作者之一是著名的華裔女科學家,哈佛大學莊小威(Xiaowei Zhuang)教授,莊教授早年畢業于中國科技大學少年班,34歲的時候就成為了哈佛
酵母雙雜交系統的研究過程
Fields等人的工作標志雙雜交系統的正式建立。他們以與調控SUC2基因有關的兩個蛋白質Snf1和Snf2為模型,將前者與Gal4的BD結構域融合,另外一個與Gal4的AD結構域的酸性區域融合,由BD和AD形成的融合蛋白一般分別稱之為“誘餌”(bait)和“獵物”或靶蛋白(prey or tar
酵母雙雜交系統的研究過程
Fields等人的工作標志雙雜交系統的正式建立。他們以與調控SUC2基因有關的兩個蛋白質Snf1和Snf2為模型,將前者與Gal4的BD結構域融合,另外一個與Gal4的AD結構域的酸性區域融合,由BD和AD形成的融合蛋白一般分別稱之為“誘餌”(bait)和“獵物”或靶蛋白(prey or targe
DNA重組(DNA-recombination)技術:DNA序列測定2
目前應用的兩種快速序列測定技術是Sanger等(1977)提出的酶法(雙脫氧鏈終止法)和Maxam(1977)提出的化學降解法。雖然其原理大相徑庭,但這兩種方法都同樣生成相互獨立的若干組帶放射性標記的寡核苷酸,每組核苷酸都有共同的起點,卻隨機終止于一種(或多種)特定的殘基,形成一系列以某一特定核苷酸
DNA重組(DNA-recombination)技術:DNA序列測定1
㈣ DNA聚合酶 如前所述,選用合適的DNA聚合酶進行測序反應也是保證測序質量的重要因素之一。常用于雙脫氧末端終止法測序的有幾種不同的酶: 1.大腸桿菌DNA聚合酶Ⅰ大片段(Klenow片段) 此酶是最早用于建立Sanger測序的酶。但通常會有兩個問題:①Klenow片段的持續合成能力較
DNA重組(DNA-recombination)技術:DNA序列測定3
2.利用末端轉移酶和α-32P-ddNTP標記DNA的3ˊ-末端 在二價陽離子存在下,末端轉移酶催化dNTP加入DNA分子的3ˊ-羥基末端,如果作為底物的核苷酸經過修飾(如ddNTP),則可以在DNA的3ˊ-OH上僅加入一個核苷酸。對于雙鏈DNA片段,亦存在DNA的兩側均被標記問題,可通過上述同
DNA重組技術(DNA-Recombination)
一、DNA 的酶切與連接(1)酶切反應:同質粒DNA 的鑒定,只不過是質粒DNA 換為載體DNA 。若大量酶切,則成比例增加。(2)加2倍體積的預冷無水乙醇和1/10體積的3mol/l NaAc混勻,-20℃2h以上。(3)15000rpm離心15min,棄上清。(4)加入75%乙醇洗滌2次,離心棄