研究揭示擬南芥組蛋白去甲基化酶JMJ13的結構功能
3月21日，《自然-通訊》（Nature Communications）雜志在線發表了中國科學院分子植物科學卓越創新中心/植物生理生態研究所上海植物逆境生物學研究中心杜嘉木研究組、中科院遺傳與發育生物學研究所曹曉風研究組和河北師范大學孫大業研究組合作完成的題為The Arabidopsis H3K27me3 demethylase JUMONJI 13 is a temperature and photoperiod dependent flowering repressor 的研究論文。 組蛋白修飾在植物生長發育過程中發揮著至關重要的作用，它與基因沉默、基因激活、染色體形態建成以及遺傳物質修復等生物學問題密切相關。組蛋白去甲基化酶在組蛋白修飾的動態調控中起著重要作用。之前杜嘉木課題組和曹曉風課題組合作完成了擬南芥H3K4me3去甲基化酶JMJ14的復合物結構和功能，該研究于2018年發表在Plant Cell 雜志上。......閱讀全文
Polycomb組蛋白與染色質相互作用的關鍵機制
2021年6月，Genome Research雜志在線發表了法國巴黎薩克雷大學植物科學研究所Moussa Benhamed教授為通訊作者題為“Polycomb-dependent differential chromatin compartmentalization determines gen
植物所發現蛋白構象改變介導開花新機制
開花是高等植物進入生殖發育的重要標志，受關鍵基因以及組蛋白修飾的精確調控，甾醇類激素(BRs)和赤霉素(GAs)參與其中，但激素信號分子與蛋白質構象的瞬時改變如何聯動調控開花尚不清楚。 中科院植物研究所種康研究組及其合作者發現，BRs信號途徑中核心轉錄因子BZR1通過直接抑制組蛋白去甲基化
含砷中藥去甲基化機理首次闡明
近日，在含砷中藥治療骨髓增生異常綜合征（MDS）取得臨床療效的基礎上，以中國中醫科學院西苑醫院教授麻柔為首的研究團隊深入研究發現：MDS病人存在明顯的DNA異常甲基化，含砷中藥治療不能改變MDS患者的細胞遺傳學――染色體核型，但經含砷中藥治療后，MDS患者的表觀遺傳學――甲基化顯著減低。相關成果日前
DNA去甲基化的兩種方式
本公司提供專業的DNA甲基化修飾服務，有需要的客戶請與本公司的工作人員。 作為發現較早的一種修飾途徑，DNA甲基化能夠引起染色質結構、DNA構象、DNA穩定性及DNA與蛋白質相互作用方式的改變，從而控制基因表達。DNA甲基化修飾過程會使甲基添加到DNA分子上，例如在胞嘧啶環的5'碳上：這種
研究發現植物光形態建成的表觀遺傳調控機制
光是植物光合作用的能量來源。作為重要的環境信號，光廣泛參與調控植物生長發育的各個階段。當植物幼苗出土見光后，光信號迅速激活光形態建成，表現為下胚軸生長抑制、子葉張開變綠以啟動光合作用。這是植物早期生長的關鍵性階段之一。植物在進化過程中形成復雜而精密的光信號轉導系統，通過精細調控光形態建成，實現對
科學家實現單細胞水平甲基化和去甲基化調控
原文地址：http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2023/9/507595.shtm
最新進展：RNA的甲基化與去甲基化修飾
德國慕尼黑的路德維希-馬克西米利安大學（LMU）研究人員發現了細菌RNA中一種新型的化學修飾形式。顯然，只有當細胞處于應激狀態時，這種修飾才會附著在分子上，并且在恢復過程中會迅速去除。 核糖核酸（RNA）在化學形式上與DNA密切相關，而DNA是所有細胞中遺傳信息的載體。實際上，RNA本身在將遺
揭露CG甲基化的遺傳性和相互作用
將表觀遺傳標記（例如DNA甲基化）靶向特定位點的能力在基礎研究和作物植物工程中都很重要。但是，靶向DNA甲基化的遺傳性，其如何影響基因表達以及正確建立所需的表觀遺傳特征尚不清楚。 2021年5月25日，浙江大學劉琬璐及加利福尼亞大學洛杉磯分校Steven E. Jacobsen共同通訊在Nat
組蛋白去乙酰化酶抑制劑的簡介
組蛋白去乙酰化酶抑制劑（histone deacetylase inhibitor，HDACI），簡稱HDACIs，是一類化合物，有干擾與組蛋白去乙酰化酶的功能。 組蛋白去乙酰化酶抑制劑通常可分為兩大類：NAD + -依賴性酶和Zn2 +依賴性酶。Zn2+依賴性蛋白酶包括HDACsI、II、IV
上海生科院揭示等位遺傳調控機制
5月14日，國際學術期刊Cell Reports在線發表了中國科學院上海生命科學研究院植物逆境生物學研究中心朱健康研究組題為Involvement of multiple gene silencing pathways in a paramutation-like phenomenon in A
揭示DNA甲基化與基因沉默的關系
DNA 甲基化與真核基因和轉座子的轉錄抑制有關，但基因沉默的下游機制在很大程度上是未知的。 2021年6月3日，加州大學洛杉磯分校Steven E. Jacobsen團隊在Science 在線發表題為“MBD5 and MBD6 couple DNA methylation to gene s
PLoS－Genet：何新建等模式植物擬南芥研究獲進展
2014年1月22日，北京生命科學研究所何新建實驗室在《PLOS Genetics》雜志在線發表題為“The SET domain proteins SUVH2 and SUVH9 are required for Pol V occupancy at RNA-directed DNA me
組蛋白的修飾是怎么樣影響基因表達的
組蛋白甲基化誘導了DNA的甲基化:組蛋白甲基化是招募DNA甲基化酶DNMT的信號，在異染色質蛋白HP1的協助下，DNA發生甲基化。DNA的甲基化又誘導組蛋白的去乙酰化:甲基CpG結合蛋白MeCP2可以特定地結合到甲基化的DNA.上，在組蛋白去乙酰化酶的作用下，將組蛋白.上的乙酰基去掉。而組蛋白去乙酰
組蛋白的修飾是怎么樣影響基因表達的
組蛋白甲基化誘導了DNA的甲基化:組蛋白甲基化是招募DNA甲基化酶DNMT的信號，在異染色質蛋白HP1的協助下，DNA發生甲基化。DNA的甲基化又誘導組蛋白的去乙酰化:甲基CpG結合蛋白MeCP2可以特定地結合到甲基化的DNA.上，在組蛋白去乙酰化酶的作用下，將組蛋白.上的乙酰基去掉。而組蛋白去乙酰
研究發現組蛋白去乙酰化酶1的新作用
研究發現組蛋白去乙酰化酶1在特定上皮細胞向間質細胞轉化過程中的作用 中科院上海生命科學研究院生化與細胞所宋建國研究組研究發現，組蛋白去乙酰化酶1（Histone deacetylase 1，HDAC1）在轉化生長因子-β1 (TGF-β1) 誘導的上皮細胞向間質細胞的轉變（Epith
組蛋白去乙酰化酶抑制劑的種類介紹
組蛋白去乙酰化酶抑制劑（HDACIs）包括結構不同的化合物，是一組有針對性的抗癌藥物。 當下發現的HDACi按其結構分為4類： 一、脂肪酸，如丁酸鹽、丁酸苯酯和丙戊酸，其中丙戊酸被用作抗癲癇藥物； 二、氧肟酸鹽，如TSA是被發現的第1個能抑制HDACs的天然氧肟酸，SAHA [3] 與TS
組蛋白去乙酰化酶抑制劑的作用介紹
IPF是一種慢性進展性、生存期短且病因不明的肺部疾病。肌成纖維細胞活化、增殖、分化是致纖維化的關鍵因素，轉化生長因子β1（ TGF-β1）是主要的促纖維化因子。研究表明TGF-β1在體內外均可促進成纖維細胞分化為肌成纖維細胞（通過 SMAD2、SMAD3磷酸化途徑）及上皮細胞轉化為間質成分（通過
中科大破譯植物組蛋白特有修飾位點調節擬南芥開花時間
中國科學技術大學生命科學學院及中國科學院分子卓越中心教授丁勇課題組，發現植物組蛋白H2A第95絲氨酸磷酸化修飾位點，該位點系植物特有的位點，經磷酸化的95絲氨酸，能夠調節擬南芥的開花時間，以及組蛋白變化H2A.Z的富集。相關結果以Phosphorylation of histone H2A se
新研究揭示水稻組蛋白甲基化調控根系核心菌群
根系微生物組與植物的養分吸收、抗病抗逆等生長發育過程密切相關，其在植物根系的定殖和組裝受環境和植物遺傳途徑等因素的影響。表觀遺傳調控是調節染色體行為和基因表達的重要機制，探究表觀遺傳途徑與植物根系微生物的關系能夠更系統地揭示植物生長發育過程。表觀遺傳調控與宿主微生物組的關系已在動物模型中得到研究
關于組蛋白修飾的方式—甲基化的基本信息介紹
組蛋白甲基化是由組蛋白甲基化轉移酶（histonemethyl transferase，HMT）完成的。甲基化可發生在組蛋白的賴氨酸和精氨酸殘基上，而且賴氨酸殘基能夠發生單、雙、三甲基化，而精氨酸殘基能夠單、雙甲基化，這些不同程度的甲基化極大地增加了組蛋白修飾和調節基因表達的復雜性。甲基化的作用
擬南芥精氨酸甲基轉移酶AtPRMT5功能研究獲新進展
蛋白質是生物體結構與功能的基本單位，是所有生命活動的物質基礎和生理功能的重要執行者。蛋白質翻譯后修飾是調節蛋白質生物學功能的關鍵步驟之一。作為基因產物，幾乎所有的蛋白質都要經過翻譯后的剪切修飾才能成為成熟蛋白質。目前已發現的蛋白質翻譯后修飾形式已經多達100種以上，其中蛋白質精氨酸
研究揭示受精卵DNA去甲基化重要機制
近日，中科院上海生科院生化與細胞所一項最新研究發現，小鼠早期胚胎中母源和父源基因組在單細胞的受精卵階段，均會發生大規模的DNA主動和被動去甲基化，DNA雙加氧酶Tet3介導了主動去甲基化的發生，而糖苷酶TDG并不參與該過程。相關研究成果在線發表于學術期刊《細胞—干細胞》。 該研究由中科院上海生
陳柏仰博士Cell揭示DNA去甲基化動態
精子和卵子融合是動物個體發育的起點，不過這一過程并不僅僅是簡單的融合。人們發現，在哺乳動物胚胎的早期發育中，全基因組的甲基化模式會發生明顯的變化。在小鼠胚胎受精之前，雌雄生殖細胞具有較高的甲基化水平，受精后父源基因組迅速的發生主動去甲基化，而母源基因組發生被動的去甲基化。 為了了解人類生殖細胞
DNA去甲基化酶催化作用介紹
DNA去甲基化由DNA去甲基化酶催化。DNA去甲基化是在DNA糖苷酶的作用下脫掉甲基化堿基的反應，等同于被損傷的DNA在糖苷酶及無堿基核酸酶酶切偶聯催化下的修復反應。5一甲基胞嘧啶糖基化酶是體內侯選去甲基化酶。此外，甲基化CpG結合蛋白如MBD2等也具有去甲基化酶的活性。
中國學者發表RNA甲基化重要成果
基因組DNA和組蛋白上存在可逆的表觀遺傳學修飾，這些修飾可以調控基因的表達，由此決定細胞的狀態，影響細胞的分化和發育。近年來人們發現，mRNA和其他RNA也存在類似的表觀遺傳學調控，比如m6A（N6-methyladenosine）。 西北農林科技大學、中科院上海植物逆境生物學研究中心和美國普
中國學者發表RNA甲基化重要成果
基因組DNA和組蛋白上存在可逆的表觀遺傳學修飾，這些修飾可以調控基因的表達，由此決定細胞的狀態，影響細胞的分化和發育。近年來人們發現，mRNA和其他RNA也存在類似的表觀遺傳學調控，比如m6A（N6-methyladenosine）。 西北農林科技大學、中科院上海植物逆境生物學研究中心和美國普
擬南芥轉化
實驗概要本實驗以擬南芥為試材介紹了轉化及篩選的過程。主要試劑1. 滲透培養基:(1L)1/2xMurashige-Skoog5%蔗糖0. 5克MES用KOH調至pH5. 7再加:10微升lmg/ml的6-BA母液200微升Silwet L-77Top agar0. 1%瓊脂PNS或水溶液2. 篩選培
上海生科院發現調控種子印跡基因表達的新機制
圖A：ape1l 和zdp雙突變對種子發育的影響圖B：APE1L蛋白調控擬南芥中DNA主動去甲基化途徑的工作模型 1月8日，中國科學院上海生命科學研究院上海植物逆境生物學研究中心朱健康課題組與科爾多瓦大學合作研究發現，擬南芥主動去甲基化途徑中的新組件APE1L蛋白不僅是DNA主動去甲基化途徑中的一
朱健康院士Nature子刊表觀遺傳學成果
擬南芥5-甲基胞嘧啶（5mC）DNA糖基化酶的ROS1/DEMETER家族，是真核生物中第一個遺傳表征的DNA去甲基化酶。然而，ROS1靶基因位點的特征還沒有得到很好的理解。10月31日在《Nature Plants》發表的一項研究中，來自中科院上海植物逆境生物學中心和普渡大學的研究人員，對擬南芥C
染色質修飾如何調控基因表達？－中國學者提出新見解
中科院分子植物科學卓越創新中心/植物生理生態研究所植物逆境生物學研究中心的研究人員最新發表兩篇Nature Genetics文章，利用生化、分子、遺傳、組學及結構生物學等研究方法，分別揭示了植物特有染色質凝縮蛋白EMF1與含BAH結構域的SHL和EBS形成BAH-EMF1復合體而介導植物基因沉默