基因組研究的“98K”——人工智能算法
每個分子遺傳學家都希望找到一個易于使用的程序，可以比較來自不同細胞條件的數據集，識別增強子區域，然后將其分配給目標基因。 如今，柏林馬克斯·普朗克分子遺傳學研究所的馬丁·溫格隆（Martin Vingron）領導的研究小組現已開發出一個掌握所有這些內容的程序。 “ DNA非常無聊，因為它在每個細胞中幾乎都一樣。如果將基因組比作生命之書，那么我對旁注則更感興趣。”這些“旁注”是指附著在DNA分子上的小化學標記，它們不會改變遺傳信息本身，但會影響相應位點上DNA發生的變化。換句話說，這些標記具有表觀遺傳作用。它們充當負責啟動子和增強子等基因激活和失活的基因組區域的調節劑。 在許多復雜的疾病中，基因的表觀遺傳控制無法正常工作，這對科學家非常感興趣。然而，在實驗室中對這些區域的分析通常是麻煩，費時且復雜的。這就是為什么Vingron和他的團隊決定開發一個新的程序包的過程。 該程序包稱為條件特定的調節單元預測（CRUP），它可以......閱讀全文
基因組研究的“98K”——人工智能算法
每個分子遺傳學家都希望找到一個易于使用的程序，可以比較來自不同細胞條件的數據集，識別增強子區域，然后將其分配給目標基因。 如今，柏林馬克斯·普朗克分子遺傳學研究所的馬丁·溫格隆（Martin Vingron）領導的研究小組現已開發出一個掌握所有這些內容的程序。 “ DNA非常無聊，因為它在每個
人工智能加速期：算法為王還是場景落地優先－？
人臉識別、語音識別是人工智能應用最為人熟知的兩個領域。智能音箱、人臉門禁也已經走進不少人的生活。去年大火的無人貨柜，則用到了“物品識別”技術。接下來，人工智能推廣應用會怎么走？靠算法的不斷提升嗎？ 海康威視高級副總裁徐習明說：“今天的人工智能還是一種弱人工智能。基于深度學習的算法精度會無限逼近
人工智能算法打開月球永久陰影區的神秘大門
以瑞士蘇黎世理工大學為首的一個國際研究小組利用人工智能算法觀察到月球上的永久陰影區。該人工智能有望“照亮”永久的陰影區，尤其是那些盡管旋轉但自然陽光仍無法到達的區域。這項近期刊載于《地球物理研究快報》上的研究也包含在美國國家航空航天局（NASA）“阿爾忒彌斯1號”任務計劃中，有助于為其將來的登月計劃
新算法提升基因融合檢測效率
近日，華大基因公開一種基因融合檢測算法SOAPfuse。模擬數據和真實驗證數據的綜合測評表明，該算法具有準確率高、敏感性強、精度高、資源消耗少等優點。該算法主要采用局部窮舉算法和一系列精細的過濾策略，從而對基因融合進行快速、精確的檢測。相關研究成果在《基因組生物學》（Genome
人工智能算法超越化學家,精確預測科學試驗
科學研究領域中，追求真理經常意味著穿著白大褂在實驗室做實驗，其中免不了做一些失敗的試驗。沒關系，因為失敗的試驗有時候也能帶來很多新發現。現在，哈佛大學正努力幫助科學家加速試驗研究的速度，通過一個可以預測化學反應成功率的機器學習算法，算法成功率超過了人類科學家。 算法分析了失敗實驗的數據。通
人工智能算法似乎在檢測皮膚癌方面效果更好
分析測試百科網 研究人員首次發現人工智能或機器學習的形式被稱為深度學習卷積神經網絡（CNN），它比經驗豐富的皮膚科醫生在檢測皮膚癌方面更好。 在今日（星期二）發表在主要癌癥雜志Annals of Oncology上的一項研究中，德國，美國和法國的研究人員通過向CNN展示100,000多幅惡性黑
人工智能算法準確描繪海洋浮游生物圖像真實色彩
你一定聽說過“藍眼淚”海灘。實際上，“藍眼淚”是海洋甲藻等多種海洋浮游生物發光產生的自然現象。 海洋浮游生物作為一類懸浮在水層常隨水流移動的海洋生物，是海洋生態系統的基本組成部分，對浮游生物的觀測不僅是海洋生態科學研究的基礎，也是現代海洋生態環境管理不可或缺的手段。 近期，來自中國科學院深圳
人工智能算法魅力:判斷癌癥患者能否從免疫治療獲益
免疫治療在癌癥統治的世界里不斷攻城略地。 癌癥患者看到了生的希望，但遺憾的是患者很難知道自己究竟是不是免疫治療澤被的那些人。 目前的臨床統計顯示，PD-1抑制劑只能在20%-50%的晚期實體瘤病人中發揮作用[1]。受益的患者究竟是誰？目前找到這些患者的手段有限。 因此，找到一種可靠的生物標
“量子人工智能”：向可擴展算法更進一步
原文地址：http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2023/2/494403.shtm 據英國《自然》雜志22日報道，谷歌科學家團隊改善了量子計算機的糾錯能力，演示了隨著糾錯規模增加，錯誤率反而降低的量子計算。這項工作意味著人們向可擴展的量子糾錯更進一步，使量子計算
人工智能算法有助于快速分析蛋白質折疊結構
近日，英國《自然》雜志報道，美國哈佛大學醫學院生物學家AlQuraishi開發出新型人工智能算法，能夠快速分析預測蛋白質三維結構，大大提高蛋白質三維結構預測的效率，將預測時間從若干小時或幾天縮短至幾毫秒。 報道稱，蛋白質三維結構與蛋白質功能密切相關，當前生物學界一大挑戰在于如何基于氨基酸序列預測蛋
人工智能解鎖新領域－深度學習算法助力發現古人類遺跡
近年來，深度學習作為機器學習的一個分支，在考古學中迅速普及應用，使得考古工作的效率得到提升。除了用于發現考古遺跡，預測、翻譯古文字，人工智能還參與了部分文物的修復過程。 人工智能繼續探索新領域，這次是考古。 近日，來自美國賓夕法尼亞州立大學、澳大利大悉尼大學等4所研究機構的研究人員，在著名考
人工智能“進軍”基因檢測市場
據加拿大《環球郵報》報道，在利用機器學習檢測DNA（脫氧核糖核酸）中的致病突變十多年后，加拿大多倫多大學生物醫學工程教授布倫丹·弗雷近日成立了“深基因組學”公司，準備將其團隊開發的新技術推向市場。 弗雷將深基因組學技術比喻成基因突變領域的谷歌搜索：研究人員可對一個DNA序列進行查詢，系統將鑒別
識別黑色素瘤圖片－德國人工智能算法勝過醫生
德國研究人員最新開發出一種可用于診斷黑色素瘤的人工智能算法。在一場157名皮膚科醫生與人工智能算法的診斷比拼中，人工智能的準確度總體來講更勝一籌。 德國國家腫瘤疾病中心等機構研究人員在新一期《歐洲癌癥雜志》上發表研究報告說，他們開發出一種人工智能算法，可分析皮膚病變用于診斷。 為驗證該算法
基于影像學的多種人工智能算法在腫瘤研究中的應用進展
人工智能（artificial intelligence，AI）即為研究、探索如何模擬人類智能并對人類智能進行擴展延伸的一門學科。現如今人工智能已成為人們廣泛關注的焦點，其今后的發展將對各行各業產生深遠的影響。機器學習（machine learning，ML）是實現人工智能的方法之一，是使計算機
基于影像學的多種人工智能算法在腫瘤研究中的應用進展
人工智能（artificial intelligence，AI）即為研究、探索如何模擬人類智能并對人類智能進行擴展延伸的一門學科。現如今人工智能已成為人們廣泛關注的焦點，其今后的發展將對各行各業產生深遠的影響。機器學習（machine learning，ML）是實現人工智能的方法之一，是使計算機
注水算法
迭代注水算法是由Wei Yu提出的，它是一種多用戶功率分配算法。這是一種自私算法，當接收端和發送端沒有共享信道信息時，它的實現非常簡單，復雜度低。但是，當信道上有共享信 息，需要共享信道，這是網絡拓撲就會出現遠近效應，這就產生了非平衡狀態，引起用戶間信號干擾，信息傳輸效率下降。?????? 迭代注水
新算法比較分析可搜索癌癥基因突變
桑福德伯翰醫學研究所(Sanford Burnham Prebys Medical Discovery Institute,SBP)承擔了前所未有的對一個新興算法類別的比較分析，該算法通過聚焦內部基因結構，在癌癥數據庫中挖掘遺傳信息（即亞基因像素算法），這與專注于基因視其為單個單元的經典方法形成
香山科學會議：中國“材料基因”亟待算法創新
在美國最新發布的“先進制造業伙伴關系”計劃中，“材料基因”概念的身影有所顯現，而美國的“材料基因組計劃”（MGI）也受到了中國學者的廣泛關注。? 在近日舉行的第S14次香山科學會議上，學者們提出，要發展中國的材料基因組工程，當務之急是解決算法和程序包的原創問題。 預測先進材料靠計
人工智能進軍基因檢測市場
據加拿大《環球郵報》報道，在利用機器學習檢測DNA（脫氧核糖核酸）中的致病突變十多年后，加拿大多倫多大學生物醫學工程教授布倫丹·弗雷近日成立了“深基因組學”公司，準備將其團隊開發的新技術推向市場。 弗雷將深基因組學技術比喻成基因突變領域的谷歌搜索：研究人員可對一個DNA序列進行查詢，系統將鑒
雙向掃描算法和電梯調度算法區別
雙向掃描算法和電梯調度算法區別：1、雙向掃描(SCAN)算法不僅考慮到欲訪問的磁道與當前磁道間的距離，更優先考慮的是磁頭，當前的移動方向。例如，當磁頭正在自里向外移動時，SCAN算法所考慮的下一個訪問對象應足其欲訪問的磁道既在當前磁道之外，又是距離最近的。這樣自里向外地訪問直至再無更外的磁道需要訪問
測序儀巨頭推出AI算法，預測致病基因突變
ChatGPT等大模型點燃人工智能新一輪熱潮之際，另一種累積數百萬年的天書般“語言”也在試圖用該技術獲得最新解碼。近日，全球基因測序儀龍頭因美納（Illumina）宣布推出全新的人工智能算法PrimateAI-3D，以求更準確地預測患者致病基因突變。據美國國家衛生研究院發布的數據，每年生成的基因組數
接觸角、水滴角測量儀軟件應用人工智能算法提升自動...
接觸角、水滴角測量儀軟件應用人工智能算法提升自動水平線的精度接觸角測量儀或水滴角測量儀通常的測試方法為側視法，在側視法原理條件下，除了硬件部件的結構要求必須具備樣品臺和鏡頭各自的獨立水平調整功能的保證外，基準線或水平線的查找同樣是一個zui為重要的功能。CAST3在原有自動水平線或基線的基礎上，引入
Nat－Comm|－張強鋒組利用人工智能算法分析單細胞ATACseq數據
近年來，深度學習等人工智能技術在圖像識別，自然語言處理等領域取得了令人矚目的成就。人工智能技術應用于生命科學，對生物信息多個領域產生了重大的影響。深度學習算法借助于生命科學大數據的飛速發展，從海量大數據中自動高效地提取特征進行學習，極大超越了依賴人工提取特征的傳統人工智能算法，在醫療圖像處理、結
從百萬基因組“駛向”人工智能
導讀： 7月28日，王俊接受了Nature和Science網站的專訪，暢談了他現在想將自己的一生都貢獻給一項新的“研究計劃”的原因，他想構建出一個人工智能健康監測系統，來識別人類個體基因組數據、生理性狀（表型）和生活方式之間的關系。 王俊（Jun Wang）是中國最著名的科學家之一。自從16
基因組算法立功！發現膀胱癌新靶點
膀胱癌是美國第六常見的癌癥，根據美國癌癥學會（ACS）的統計，2017年美國約有79000人被診斷為膀胱癌，將近17000人死于這種疾病。在過去幾年中，逐漸形成了根據基因表達模式對膀胱癌進行分類的趨勢。已知一種稱為p53樣膀胱癌（p53-like bladder cancer）的基因表達模式與侵
基因組算法立功！發現膀胱癌新靶點
膀胱癌是美國第六常見的癌癥，根據美國癌癥學會（ACS）的統計，2017年美國約有79000人被診斷為膀胱癌，將近17000人死于這種疾病。在過去幾年中，逐漸形成了根據基因表達模式對膀胱癌進行分類的趨勢。已知一種稱為p53樣膀胱癌（p53-like bladder cancer）的基因表達模式與侵
華大基因成功開發移植瘤生物信息分析新算法――PDXomics?
2012年7月17日，華大基因宣布其成功開發出一套適用于異種移植瘤模型生物信息學分析的新算法——PDXomics?，該算法能夠將移植瘤與宿主基因組序列進行區分，有效地排除后續分析中異源物種數據的污染，保證分析結果的準確性和可靠性，從而可使移植瘤模型更為有效的應用于腫瘤新藥開發和疾病機理研究。
三代基因測序組裝算法和軟件研發獲突破
DNA基因測序技術從上世紀70年代起，歷經三代技術后，目前已發展成為一項相對成熟的生物產業。測序技術的應用也擴展到了生物、醫學、制藥、健康、農林、園藝、花卉、環保、法醫等許多領域，并成為一項與我們衣食住行密切相關的高技術產業。據最新統計，2012年全球基因測序市場的產值已超過百億，按最近幾年增長
北京生科院提出基因組重復區域組裝新算法
2016年12月，國際學術期刊《核酸研究》（Nucleic Acids Research）發表了中國科學院北京生命科學研究院計算基因組學實驗室趙方慶團隊題為The combination of direct and paired link graphs can boost repetitive
北京基因組所開發出比較群體基因組學新算法
隨著基因組測序技術的發展，物種和群體水平基因組數據呈指數增長。這些數據為在基因組水平鑒定和解析自然選擇機制提供了機遇。然而，目前的分析方法面臨著技術瓶頸和挑戰。其中，關鍵問題是如何高效準確地檢測作用于非編碼區的自然選擇效應。同時，能夠高效、高性能地分析多物種大樣本數據，成為方法學方面的迫切要求。