朱健康研究組發現促進植物低溫耐受的新機制
2020年1月7日,Cell Reports 雜志在線發表了中國科學院分子植物科學卓越創新中心上海植物逆境生物學研究中心朱健康研究組題為STCH4/REIL2 Confers Cold Stress Tolerance in Arabidopsis by Promoting rRNA Processing and CBF Protein Translation 的研究論文。該論文在模式植物擬南芥中發現核糖體加工蛋白STCH4/REIL2通過在低溫下維持rRNA加工,增強低溫下CBFs 蛋白翻譯,進而促進植物低溫耐受的分子機制。 以CBFs(C-repeat binding factors)/DREB1s (dehydration-responsive element-binding protein 1s)為核心的信號轉導是植物響應低溫的重要調控通路,在過去的二十年,CBF信號通路已被深入發掘與拓展,但對植物感受低溫的分子機......閱讀全文
翻譯后修飾蛋白質的定性和定量實驗(三)
2.2 糖基化糖 基 化 是 一 種 常 見 的 P T M , 并 且 已 經 證 明 能 夠 影 響 酶 的 活 性 、蛋 白 質 定 位 、穩 定 性 、信 號 轉 導 、細 胞 黏 附 和 蛋 白 質 相 互 作 用 (Spiro, 2002k 目 前 已 經 發 現 在 腫 瘤 惡
翻譯后修飾蛋白質的定性和定量實驗(二)
二、用 于 鑒 定 P T M 的富 集 技 術2.1 磷酸化絲氨酸、蘇氨酸、酪氨酸殘基的可逆磷酸化也許是研究最為深人的 PT M 。蛋白質磷酸化信號網絡介導細胞對與不同的應激因子、生長因子、細胞因子以及細胞間相互作用作出響應。憐酸化還影響多種細胞進程,如增殖、凋亡 、遷移 、轉錄和蛋白
翻譯后修飾蛋白質的定性和定量實驗(一)
一、引言蛋 白 質 翻 譯 后 修 飾 (P T M ) 在 細 胞 生 物 調 節 中 發 揮 著 基 本 作 用 。 P T M 是 m R N A 翻譯 后 蛋 白 質 的 酶 促 共 價 化 學 修 飾 。蛋 白 質 化 學 修 飾 非 常 重 要 ,因 為 它 們 會 潛 在 地
翻譯后修飾蛋白質的定性和定量實驗3
三、蛋白質的硝化修飾酪氨酸、色氨酸、甲硫氨酸、半胱氨酸側鏈的硝化與亞硝化作用構成了蛋白質硝化PT M 的主要部分。這些加成反應由發育、氧化應激及衰老過程中產生的活性氮介導。活性氮的增加是由一氧化氮和活性氧的過度反應或調控紊亂造成的(Yeo et al.,2008)。活性氮和活性氧能夠靶向于DNA、脂
RNA翻譯與蛋白質折疊之間的微妙舞蹈
在蛋白質的合成過程中,RNA翻譯會影響蛋白質的折疊,而蛋白質折疊也會影響RNA的翻譯。 在過去的十年里,我們對細胞內蛋白質合成方式的認知取得了快速的增長,其中包括蛋白質合成的各個基本步驟:轉運RNA(transfer RNA, tRNA)是如何高保真、高速率地對信使RNA(messenger
中外學者合作Cell子刊解析蛋白翻譯后修飾
來自密西根大學,中科院上海藥物研究所,芝加哥大學等處的研究人員發表了題為“SIRT5-Mediated Lysine Desuccinylation Impacts Diverse Metabolic Pathways”的文章,首次在哺乳動物細胞中對去乙酰化調控酶Sirt5調控的琥珀酰底
關于蛋白質合成真核生物翻譯起始的特點
一、真核生物翻譯起始的特點: 1.真核起始甲硫氨酸不需甲酰化。 2.真核mRNA沒有S-D序列,但5'端帽子結構與其在核蛋白體就位相關。帽結合蛋白(CBP)可與mRNA帽子結合,促進mRNA與小亞基結合。 3.肽鏈的延長 :延長階段為不斷循環進行的過程,也稱核蛋白體循環。分為進位、
翻譯后修飾蛋白質的定性和定量實驗(五)
六、CID、ECD和 ETD的對比基于質譜的蛋白質組學分析依賴于氣相中肽段在低碰撞能量下斷裂, 在質量譜圖中形成峰。進而通過峰圖確定肽段序列,再推斷出相關蛋白質。完成肽段斷裂最主要的方法就是碰撞誘導解離(collision induced dissociation,C I D ) ( S w
翻譯全局控制改善外源蛋白質的折疊效率
近日,華南理工大學林影教授和暨南大學張弓教授的團隊在Biotechnology for Biofuels雜志(生物工程類一區)上發表文章,使用翻譯全局控制方法,改善外源蛋白質在畢赤酵母中表達的折疊效率,有效提高活性蛋白質產量。據悉,這是翻譯組調控在真核生物細胞工廠底盤細胞中的首次成功應用,極大地
發現線粒體翻譯與細胞質翻譯協調機制
中科院生物物理所與中科院動物所、軍事醫學科學院以及天津科技大學等機構合作,揭示了線粒體翻譯與細胞質翻譯之間的“協調”機制。研究還揭示了一種全新的男性不育發病途徑,對男性不育臨床干預具有重要借鑒意義。相關成果4月11日在線發表于《自然—結構域分子生物學》期刊。生物物理所研究員秦燕為通訊作者,該所
神經退行性變與蛋白質翻譯相聯系
為探究與神經退行性與認知缺陷有關的新突變,研究人員已經發現在同一關鍵通路中起作用的兩個小鼠基因丟失時,就會導致神經退行性變。驚人的是,這兩個基因都與蛋白質翻譯有關,其中一個編碼在大腦特異表達的轉運RNA基因—這是首例在脊椎動物中差異表達的基因。在理論上,真核生物需要編碼大約42個不同的tRNA基因來
研究發現HYL1蛋白調控miRNA介導的翻譯抑制過程
中國科學院分子植物科學卓越創新中心/植物生理生態研究所研究員何玉科研究組在The Plant Cell上,發表了題為Cytoplasmic HYL1 modulates miRNA-mediated translational repression的研究論文。該研究組發現,HYL1蛋白除了介導m
蛋白翻譯后修飾的基金申請解析與研究注意點(一)
每年三月初,都是科研界的“高考”倒計時,因為距離國自然基金申請的截止日期已不到半月。縱觀歷年國自然申請情況,蛋白的翻譯后修飾都是申請中重大研究方向之一。2018年國自然統計表明,磷酸化、泛素化、乙酰化等修飾的相關基金項目,總研究資助金額超過2億。 繼上周的腸道微生物研究方案解析
蛋白翻譯后修飾的基金申請解析與研究注意點(二)
由此可見,泛素化相關基金無論是申請項目數還是金額數均在向磷酸化逼近,甚至從重點項目數看,18年泛素化的項目數已然超過了磷酸化。進一步統計表明,泛素化研究資助項目在醫學部中一共98項,總資助金額高達4700萬元。由此可見,泛素化的相關研究正是科研界的“當紅小生”,基金申請的一大熱點。圖2.國自然基金項
蛋白翻譯后修飾的基金申請解析與研究注意點(一)
每年三月初,都是科研界的“高考”倒計時,因為距離國自然基金申請的截止日期已不到半月。縱觀歷年國自然申請情況,蛋白的翻譯后修飾都是申請中重大研究方向之一。2018年國自然統計表明,磷酸化、泛素化、乙酰化等修飾的相關基金項目,總研究資助金額超過2億。繼上周的腸道微生物研究方案解析后(國自然沖刺:打通菌群
水生所蛋白質翻譯后修飾組學研究獲進展
蛋白質的翻譯后修飾,如磷酸化、乙酰化等,是調節蛋白質生物學功能的關鍵步驟,是蛋白質動態反應和相互作用的一個重要分子基礎,也是細胞信號網絡調控的重要靶點。由于翻譯后修飾蛋白質在樣本中含量低且動態范圍廣,其研究極具挑戰性。近期,中國科學院水生生物研究所葛峰研究員學科組在蛋白質翻譯后修飾組學及其功能方
新方法分析臨床樣本中的組蛋白翻譯后修飾
歐洲腫瘤研究所(EIO)等機構的研究人員開發出一種基于質譜的流程,可分析FFPE臨床樣本中的組蛋白翻譯后修飾。他們于上周在《Molecular & Cellular Proteomics》上詳細介紹了這種技術。 利用這種技術,研究人員分析了一系列乳腺癌樣本,發現Luminal A型乳腺癌和三陰
基因翻譯的延伸?
此過程在真核細胞和原核細胞中高度類似,下面只以原核細胞為例進行討論。涉及到的因子主要有EF·Tu和EF·G,在真核細胞中對應的名稱分別是是eEF1和eEF2。A. tRNA的轉運和入位(1)非起始AA·tRNA結合EF·Tu·GTP形成一個三元復合物;(2)該三元復合物結合至核糖體P位點,tRNA反
什么是翻譯調控?
在mRNA翻譯成蛋白質的水平上進行控制,包括控制蛋白質合成的速度、mRNA穩定性的控制、翻譯起始的控制等。
A翻譯成中文
一、事由 今天2012年5月9日《北京青年報》C1版《天天副刊》,刊登了晉平先生的文章,其中有如下一段文字: 一次我的一個外國朋友問我“知道ABCD的A翻譯成中文是什么嗎?”在我滿頭霧水之后告訴我“A翻譯過來就是假的意思。”因為他在這里買的假貨都叫A貨。在豐富了知識的同時,我被他的幽默感嚇著
翻譯的生化基礎
翻譯的化學本質是單個氨基酸脫水縮合形成肽鏈,這一過程需要多種酶的參與。而在體內,多種酶參與的多種化學反應組成了翻譯的生物化學途徑。就化學層面來看,翻譯主要涉及到三個化學步驟:氨基酸的腺苷化(Amino Acid Adenylation)、tRNA裝載(tRNA charging)、肽鍵的形成。腺苷化
基因翻譯的終止
本過程細胞主要需完成以下目標:(1)使翻譯停止,不再有新的氨基酸摻入;(2)釋放合成的多肽鏈;(3)釋放結合在mRNA上的各組分;(4)確保核糖體大小亞基以及重要因子的重復利用。原核細胞和真核細胞在此過程的處理上有明顯不同,下面將分開介紹。?(一)原核細胞A.肽鏈的釋放(1)釋放因子RF1/2 (t
翻譯的過程簡述
翻譯過程需要的原料:mRNA、tRNA、21種氨基酸、能量、酶、核糖體。翻譯的過程大致可分作三個階段:起始、延長、終止。翻譯主要在細胞質內的核糖體中進行,氨基酸分子在氨基酰-tRNA合成酶的催化作用下與特定的轉運RNA結合并被帶到核糖體上。生成的多肽鏈(即氨基酸鏈)需要通過正確折疊形成蛋白質,許多蛋
關于基因表達的翻譯調控和翻譯后調控的介紹
1、基因表達的翻譯調控 翻譯調控的效果不如轉錄調控或調控mRNA的穩定性,但也偶爾得到使用。抑制蛋白質翻譯是毒素和抗生素的主要作用目標,因此它們可以通過超越其正常的基因表達控制來殺死細胞。蛋白質合成抑制劑包括抗生素新霉素和毒素蓖麻毒素。 2、基因表達的翻譯后調控 翻譯后修飾(PTM)是對蛋
ImmuneChem產品在蛋白質翻譯后生物修飾最新動向
最新Nature刊登的科技文獻指出: 通過比較Sigma,SantaCruz的同類產品, 只有ImmuneChem的抗生物素抗體Agarose填料達到PTM蛋白質組學質譜分析應用的質量。蛋白質翻譯后生物修飾是新的PTM研究領域。 抗生物素抗體Agarose填料也是非破壞性(Non-inv
科學家探討蛋白質翻譯后修飾對肉品質影響
我國生鮮肉加工、貯藏、流通過程存在品質劣變快、損耗高的突出問題。從分子水平揭示生鮮肉品質形成與劣變的代謝通路,精準控制生鮮肉劣變和靶向調控肉品質,是我國肉類產業亟待攻克的重大難題。 中國農科院肉品加工與品質調控創新團隊近十年來聚焦宰后早期能量代謝與蛋白質翻譯后修飾關聯調控肉品質的分子機制,取得系
環狀RNAs帽獨立的翻譯蛋白及其在癌中的作用
環狀RNA是一種共價封閉RNA,在真核生物中廣泛表達。circRNA參與多種生理和病理過程,但其調控機制尚不完全清楚。隨著RNA深度測序技術的發展和算法的改進,發現了一些circRNA通過cap-independent機制編碼蛋白質,參與腫瘤發生發展的重要過程。本文在概述CircRNAs的基礎上
用ETD線性離子阱質譜成功鑒定蛋白和翻譯后修飾
? ? 在翻譯后修飾和/或極堿肽的序列分析方面,電子轉移裂解( ETD )線性離子阱質譜是很有優勢的工具。傳統的誘導活化裂解(CAD)常用來鑒定蛋白,并試圖確定和找到他們修飾的位點,但這種技術有其本身固有的缺點,下面將詳細敘述。與線性離子阱的結合使用的ETD是蛋白質組學研究的一個可靠的技術,可以很容
用ETD線性離子阱質譜成功鑒定蛋白和翻譯后修飾
?在翻譯后修飾和/或極堿肽的序列分析方面,電子轉移裂解( ETD )線性離子阱質譜是很有優勢的工具。傳統的誘導活化裂解(CAD)常用來鑒定蛋白,并試圖確定和找到他們修飾的位點,但這種技術有其本身固有的缺點,下面將詳細敘述。與線性離子阱的結合使用的ETD是蛋白質組學研究的一個可靠的技術,可以很容易
用ETD線性離子阱質譜成功鑒定蛋白和翻譯后修飾
By Andreas Huhmer, Director of Proteomics Marketing, Thermo Fisher Scientific ????? 在翻譯后修飾和/或極堿肽的序列分析方面,電子轉移裂解( ETD )線性離子阱質譜是很有優勢的工具。傳統的誘導活化裂解(CAD)常用