強強聯合(脂質組+DIA),IF>10(二)
5.聚類分析為了進一步識別人群隊列中潛在的相似代謝,基于KODAMA值進行partition around medoids clustering分析,鑒定到4個cluster(A,B,C,D)。比較有意思的是,不同cluster的PEs的發生具有顯著差異,分別是Cluster A:71%,Cluster B:42%,Cluster C:29%,Cluster D:19%,其中cluster D發生PE的可能性最高。 結論 通過脂質組和蛋白組實驗,研究發現12種PCs,4種LPCs以及凝血途徑的PLG在對照組和PEs組具有顯著變化,且大多數脂質分子與PLG具有很強的相關性。無監督的聚類分析發現cluster D發生PE的可能性最高。這篇文章揭示了代謝失調可能會引起PEs的早期易感性,并提示這些PCs、LPCs、凝血和補體蛋白之間的相互作用。小編心得1.DIA定量準確性接近PRM,可用于靶向檢測相比傳統的DD......閱讀全文
強強聯合(脂質組+DIA),IF>10(二)
5.聚類分析為了進一步識別人群隊列中潛在的相似代謝,基于KODAMA值進行partition around medoids clustering分析,鑒定到4個cluster(A,B,C,D)。比較有意思的是,不同cluster的PEs的發生具有顯著差異,分別是Cluster A:71%,Clust
強強聯合(脂質組+DIA),IF>10(一)
脂質組學技術?相比其他組學技術,脂質組學技術發展較晚,新穎性高,僅僅只是純數據分析也可以發表在不錯的期刊上。如果希望研究得更高深入,可以往下游脂質功能或者往上游的蛋白或基因出發研究脂代謝調控機制。DIA技術 新一代、革命性的蛋白質組技術DIA,相比傳統的蛋白質組技術(shotgun,Label fr
最新高分文章套路-|-強強聯合(脂質組+DIA),IF>10
脂質組學技術 相比其他組學技術,脂質組學技術發展較晚,新穎性高,僅僅只是純數據分析也可以發表在不錯的期刊上。如果希望研究得更高深入,可以往下游脂質功能或者往上游的蛋白或基因出發研究脂代謝調控機制。 【純組學數據分析發文】 PNAS | 脂質組學揭示病毒感染引起的脂代謝異常及
最新高分文章套路-|-強強聯合(脂質組+DIA),IF>10
脂質組學技術 相比其他組學技術,脂質組學技術發展較晚,新穎性高,僅僅只是純數據分析也可以發表在不錯的期刊上。如果希望研究得更高深入,可以往下游脂質功能或者往上游的蛋白或基因出發研究脂代謝調控機制。 【純組學數據分析發文】 PNAS | 脂質組學揭示病毒感染引起的脂代謝異常及
代謝組學、脂質組學在病毒研究中的應用(二)
案例三基于代謝組學技術挖掘病毒感染宿主后代謝動態變化情況2019年發表在Viruses雜志上的另一篇文章,采用基于Orbitrap 的非靶標和靶標代謝組學方式研究了麻痹病毒(Cricket paralysis virus, CrPV)感染昆蟲Bm5細胞后宿主代謝的動態變化情況。研究人員發現,CrPV
脂質組-LC/MS自動化鑒定及相對定量(二)
第 1 步?數據分析模塊 — 峰提取?? 原始數據文件讀取? 智能峰提取?整合于 LipidSearch 軟件中的峰提取引擎能夠處理不同 MS 實驗和儀器平臺采集的數據。綜合獨特的峰提取算法、區分不同實驗和儀器類型、整合先進的譜圖處理功能,最終確保精確的譜峰提取。?第 2 步?鑒定模塊 — 脂質鑒定
高分辨質譜脂質輪廓譜表征用于食品組學研究中...(二)
3.2 分類與多元統計結果實驗挑選 6 種最為常見的食用植物油進行深度的多元統計分析。圖 5 為對 SIEVE 軟件獲得的脂質輪廓譜數據矩陣進行聚類分析的結果,可見, 6 種食用植物油樣品按照各自的植物基源,分類明確。隨后,為進一步明晰不同脂質分子在脂質整體輪廓分類中的貢獻,實驗又對這 6 種植物油
全新角度探索生命奧秘:脂質組學
血漿中約70%的代謝物是脂類,脂類代謝是動植物的第一大類代謝。加上質譜法的廣泛應用,大大加速了脂質組學的發展,脂質組學已成為代謝組學中最為活躍的研究領域之一。 萬事萬物都存在著辯證,盡管我們對高血脂深惡痛絕,心痛它對我們身體的摧殘。但脂質卻又是人體無法舍棄的重要組成,少了它,生命將一團亂麻以至
脂質組學:全新角度探索生命奧秘
血漿中約70%的代謝物是脂類,脂類代謝是動植物的第一大類代謝。加上質譜法的廣泛應用,大大加速了脂質組學的發展,脂質組學已成為代謝組學中最為活躍的研究領域之一。 萬事萬物都存在著辯證,盡管我們對高血脂深惡痛絕,心痛它對我們身體的摧殘。但脂質卻又是人體無法舍棄的重要組成,少了它,生命將一團亂麻以至
LCMS在脂質組學中的應用
脂質組學(lipidomics)已經作為一門獨立的學科與非靶代謝組學、靶向代謝組成為代謝組學中“三大主要研究領域”。為什么脂質組學會成為研究熱點中的新寵?請聽我一一道來。 還記得上面這張18年初風靡全生物圈的“小鼠拔罐”圖嗎?今年2月,陸軍軍醫大學新橋醫院李詠生團隊發表在【Cellular P
Proteome-and-Phosphoproteome-Quantification-by-DIA-on-Orbitrap-(二)
FIGURE 2. Comparison of DDA and DIA raw data. (A) Comparison of MS1 base peak chromatograms. (B) Comparison of zoomedin chromatograms. (C) Composi
二醇脂質的概念和定義
中文名稱二醇脂質英文名稱diol lipid定 義學名:2-順-十六烯(9)酰-3-反-十八烯(11)酰-2,3-丁二醇。由二羥基醇與脂肪酸形成酯的中性脂肪。但不是甘油酯,少量存在種子油中。如見于薏苡仁的薏苡仁酯。應用學科生物化學與分子生物學(一級學科),脂質(二級學科)
二醇脂質的基本概念
中文名稱二醇脂質英文名稱diol lipid定 義學名:2-順-十六烯(9)酰-3-反-十八烯(11)酰-2,3-丁二醇。由二羥基醇與脂肪酸形成酯的中性脂肪。但不是甘油酯,少量存在種子油中。如見于薏苡仁的薏苡仁酯。應用學科生物化學與分子生物學(一級學科),脂質(二級學科)
代謝及脂質組學液質應用培訓班通知
基于質譜的代謝組學已成為疾病機理研究、臨床生物標志物發現、新藥靶點開發、環境暴露、食品真偽或溯源、農業和林業科學等方面的重要科研手段而被廣泛應用。為了助力代謝組學領域的質譜學者更好地運用LC-MS/MS系統進行研究,SCIEX將在天津舉辦“代謝及脂質組學液質應用培訓班”,內容主要涉及: 1)代
代謝組學、脂質組學在病毒研究中的應用(一)
在疫情逐步可控的情形下,一線的醫務工作者和科研人員將有更多精力和時間對冠狀病毒進行更深一步的研究和認識。我們此次調研了基于Orbitrap超高分辨的代謝組學,脂質組學,以及藥物治療在病毒學研究中的應用。致敬白衣天使和深耕醫學研究的學者。?目前的研究顯示,新型病毒進入細胞的路徑與SARS冠狀病毒一樣,
脂質第二信使的定義
中文名稱脂質第二信使英文名稱lipid second messenger定 義細胞內化學性質是脂質的第二信使。包括二酰甘油、肌醇-1,4,5-三磷酸、花生四烯酸、磷脂酸和神經酰胺等。通過受體與細胞外配體結合后其濃度的變化而介導信號轉導。應用學科生物化學與分子生物學(一級學科),信號轉導(二級學科)
PB反應結緣小型質譜,脂質組學研究再添利器
近日,Nature Methods雜志(IF25.06)報道了清華大學歐陽證教授和瑕瑜教授在質譜小型化及脂質同分異構體研究領域取得的研究進展。圖片來源于Nature Methods PB反應解鎖脂類C=C雙鍵位置 哺乳動物細胞脂質組中含有較多的同分異構體,這對于脂質的定量和分析是一個挑戰。近
單細胞脂質組學技術的機制及意義
5月17日,清華大學精密儀器系質譜研究團隊發文報道基于質譜的單細胞脂質組精細結構表征技術,實現了哺乳動物單細胞內脂質的大規模精細結構分析,解決了單細胞質譜領域長期面臨的關鍵技術挑戰。基于單細胞內多種類型脂質異構體的鑒定與相對定量,該團隊實現了野生型非小細胞肺癌(HCC827)細胞群體中耐藥細胞的
稅光厚:為什么要做脂質組學研究?
“精準分析”我們的成功故事系列 ——寫在前面的話 “精準分析?量化釋能”——我們的成功故事系列欄目,是SCIEX幫助科學家們分享有意義的科學發現和研究成果的科普平臺。我們期待讓更多的人感受到科學和“質譜”的力量,”讓質譜改變每個人的生活”始終是SCIEX最美好的愿景。SCIEX非常榮幸能夠參與到
【JOAT劉虎威編者按】專題:代謝組學和脂質組學
劉虎威教授擔任《Journal of Analysis and Testing》第三期特刊的客座主編。 近日,劉虎威教授擔任《Journal of Analysis and Testing》第三期特刊的客座主編進行了約稿審稿工作,并撰寫了題為“專題:代謝組學和脂質組學”的編者按。 代謝
常見的質譜掃描模式丨DDA--DIA
Data Dependent Acquisition DDA 1 之前已經提到,DDA可以同時獲得被測代謝物的一級質譜和碎片信息,母離子的篩選主要依靠研究者預先設定的條件,如信噪比,同位素分布,離子強度,選擇top-n等等。該方法由于采用了較窄的m/z(通常為~1Da)窗口進行篩選目標離子減
質譜立大功!首張人體肺部的脂質組圖譜出爐
美國太平洋西北國家實驗室和羅切斯特大學領導的研究團隊近日利用質譜分析技術,繪制出第一張人體器官特異的脂質組圖譜–肺部。 近年來,不同類型細胞的轉錄組和蛋白質組已經陸續發布,包括大腦、心臟和肝臟中的主要細胞類型,這些有助于我們更好地了解人體每個器官的功能。不過到目前為止,還沒有類似的脂質組(li
脂質第二信使的功能特點
中文名稱脂質第二信使英文名稱lipid second messenger定 義細胞內化學性質是脂質的第二信使。包括二酰甘油、肌醇-1,4,5-三磷酸、花生四烯酸、磷脂酸和神經酰胺等。通過受體與細胞外配體結合后其濃度的變化而介導信號轉導。應用學科生物化學與分子生物學(一級學科),信號轉導(二級學科)
PNAS脂質組學揭示病毒感染引起的脂代謝異常潛在治療靶
關鍵詞:埃博拉病毒,脂質組學,治療靶點,脂質代謝 2014年,非洲爆發了有史以來最兇猛的一次埃博拉病毒疫情,震動全球。直到年底,疫情才終于得到控制。根據世衛組織的統計數字,截至2014年12月14日,全球范圍內已有超過1.8萬例感染者,近7000人死亡。因為疫情影響農業生產和貿易,西非疫區
脂質組學技術揭示拔罐療法科學原理
中醫拔罐治療有什么科學依據和作用原理?22日,科技日報記者從陸軍軍醫大學第二附屬醫院(重慶新橋醫院)獲悉,該院全軍腫瘤研究所李詠生團隊率先使用小鼠拔罐模型,運用超高效液相-質譜聯用儀建立的脂質代謝組學平臺,揭示了拔罐療法導致體內抗炎/促炎脂質代謝譜的變化規律,為拔罐療法的潛在機制提供了科學支撐。
【網絡研討會】蛋白質組學/脂質組學研究進展
自從精準醫學概念提出以來,組學研究一直都是全球最熱的研究領域,其技術在臨床醫學、生物醫藥和食品安全等領域都占據十分重要的作用。2016年初,中國發起了精準醫學研究專項課題,目標在2017年至2019年構建重大疾病的預防診斷和治療大數據平臺,推動一批精準治療藥物和分子檢測產品進入國家醫保目錄。同時
清華教授Nat-Commun發表論文:質譜的單細胞脂質組學分析
單細胞分析是研究細胞異質性的關鍵技術,對生物學過程研究及新藥研發有著重要意義。目前,單細胞基因組學技術較為成熟,單細胞轉錄組學和蛋白組學分析技術近年來獲得較多關注和投入。與其他組學相比,單細胞脂質組學分析剛剛起步,面臨諸多技術難點。由于脂質數量龐大,結構復雜,其在單細胞層面的結構表征和定量分析頗
脂質組學揭示病毒感染引起的脂代謝異常及潛在治療靶點
關鍵詞:埃博拉病毒,脂質組學,治療靶點,脂質代謝 2014年,非洲爆發了有史以來最兇猛的一次埃博拉病毒疫情,震動全球。直到年底,疫情才終于得到控制。根據世衛組織的統計數字,截至2014年12月14日,全球范圍內已有超過1.8萬例感染者,近7000人死亡。因為疫情影響農業生產和貿易,西非疫區