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  • 植物蛋白質組學和糖基化實驗(一)

    實驗材料 鏈霉親和素-過氧化物酶牛胰核糖核酸酶 B甲基比喃甘露糖苷卵清白蛋白試劑、試劑盒 DIG 糖鏈檢測試劑TTBS 緩沖液Lectin- biotinTBS 緩沖液實驗步驟 3.1 這個蛋白質是糖蛋白嗎只有一種方法能全面的回答“這個蛋白質是糖蛋白嗎?”這個問題。這需要使用能檢測并定量印記上糖蛋白的總糖檢測試劑盒。Roche Applied Science 公司商業出品----DIG 聚糖檢測試劑盒(產品包含使用說明)提供了這些測定所需的試劑。需要指出的是,在使用這個試劑盒時,蛋白質至少結合有一個糖苷部分才能獲得實驗結果,這些檢測無法提供參與糖基化的寡聚糖分子的類型和其與蛋白骨架連接的相關信息。3.2 蛋白質是怎樣被糖基化的有幾種方法可以用來進行糖蛋白上糖苷特性的鑒定,一種方法包括應用糖蛋白寡糖部分的特異性探針的 Western印跡實驗,這種探針有凝集素型和抗體型兩種類型......閱讀全文

    植物蛋白質組學和糖基化實驗

    實驗材料鏈霉親和素-過氧化物酶 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ?? 牛胰核糖核酸酶 B ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ?

    植物蛋白質組學和糖基化(一)

    ?1. 前言與其他真核細胞一樣,植物細胞中,糖基化通常發生在分泌蛋白質上,雖然在細胞質蛋白和核蛋白上也發現一些糖基化反應。根據寡糖部分和蛋白質骨架之間的連接方式,可將糖基化分為兩種類型:N -糖基化和 O-糖基化。植物中 N-糖基化研究最多。1.1 N-糖基化與其他真核細胞一樣,在植物細胞中,N-糖

    植物蛋白質組學和糖基化(二)

    4. 注釋( 1 ) 每個實驗均使用新鮮的 3 mol/L 甲醇- HCl 和硅烷化試劑。( 2 ) 要仔細識別蛋白質印跡,因為 WGA 既能識別 N-糖苷的 GlcNAc,也能識別 O-GlcNAc。( 3 ) 用于在硝酸纖維素印跡膜上封閉結合位點的溶液應避免糖蛋白污染。所以我們建議在這一步驟中使

    植物蛋白質組學和糖基化實驗(五)

    1. 含高甘露糖型 N-糖苷糖蛋白的鑒定本方法是我們實驗室以油菜籽為實驗材料建立的,本方法也適用于其他植物材料。( 1 ) 將 6 g 植物材料放入 4°C 預冷的研缽中,加入 50 ml 預冷的 TBS 緩沖液,研磨萃取蛋白質(見注釋 13),接著 10000 g 離心萃取物 30 min,去

    植物蛋白質組學和糖基化實驗(三)

    3. 糖基釋放后的蛋白質分析1 ) 糖基釋放的化學處理方法還原性氨化反可應選擇性的解離糖蛋白上的 O-糖苷(見注釋 10) 。去糖基化的蛋白用 1D SDS-PAGE 分析,將其遷移情況與其糖基化形式的蛋白進行比較,電泳遷移率的增加是 O-連糖苷出現在蛋白上的證據(見注釋 11)。( 1 ) 將 1

    植物蛋白質組學和糖基化實驗(四)

    3.3 我的糖基化蛋白在哪實驗人員可通過這個方法獲得關于糖苷在蛋白骨架上的分布及糖苷本身的結構信息。這類實驗可在純化的糖蛋白或者從 1D 或 2D 電泳膠上分離出來的蛋白上進行,首先,用蛋白內切酶消化蛋白質,通過高效液相色譜(HPLC) 分離消化后的肽和糖肽混合物。對含有糖苷的收集組分進行糖

    植物蛋白質組學和糖基化實驗2

    3. 糖基釋放后的蛋白質分析1 ) 糖基釋放的化學處理方法還原性氨化反可應選擇性的解離糖蛋白上的 O-糖苷(見注釋 10) 。去糖基化的蛋白用 1D SDS-PAGE 分析,將其遷移情況與其糖基化形式的蛋白進行比較,電泳遷移率的增加是 O-連糖苷出現在蛋白上的證據(見注釋 11)。( 1 ) 將 1

    植物蛋白質組學和糖基化實驗(一)

    實驗材料?鏈霉親和素-過氧化物酶牛胰核糖核酸酶 B甲基比喃甘露糖苷卵清白蛋白試劑、試劑盒?DIG 糖鏈檢測試劑TTBS 緩沖液Lectin- biotinTBS 緩沖液實驗步驟 3.1 這個蛋白質是糖蛋白嗎只有一種方法能全面的回答“這個蛋白質是糖蛋白嗎?”這個問題。這需要使用能檢測并定量印記上糖蛋白

    植物蛋白質組學和糖基化實驗1

    實驗材料鏈霉親和素-過氧化物酶牛胰核糖核酸酶 B甲基比喃甘露糖苷卵清白蛋白試劑、試劑盒DIG 糖鏈檢測試劑TTBS 緩沖液Lectin- biotinTBS 緩沖液實驗步驟3.1 這個蛋白質是糖蛋白嗎只有一種方法能全面的回答“這個蛋白質是糖蛋白嗎?”這個問題。這需要使用能檢測并定量印記上糖蛋白的總糖

    植物蛋白質組學和糖基化實驗(二)

    刀豆球蛋白 A (ConA)- 過氧化物酶方法(根據參考文獻 20 修改的方法)。( 1 ) 通過 1D 或 2D 電泳分離,并轉移到硝酸纖維素膜上。( 2 ) 用 TTBS 緩沖液浸泡印跡膜 1 h。( 3 ) 將印跡膜在含有 ConA ( 25 μg/ml)的 TTBS 緩沖液中,室溫下溫育 2

    甜蜜而富有挑戰性的糖基化蛋白質組學研究

       寫在前面的話:對于研究糖基化蛋白質組學的學者們來講,很多人喜歡用sweet這個詞來形容自己的研究課題。我個人也很喜歡這個單詞,這是一個讓人感到幸福而溫暖的詞語,會讓你對你的課題充滿了愛意。但回頭想想,當初懵懵懂懂讀到研究生,誤打誤撞進入蛋白質組學圈,好像也就是隨大流的主動抑或是被動選擇了博士階

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    蛋白質組與蛋白質組學簡介2

    3 甲基化干擾實驗用來檢測蛋白質的結合位點。甲基化修飾的DNA探針可以干擾蛋白質的結合。結合位點上未被修飾的DNA片段才能與蛋白結合,然后將DNA從被修飾的堿基處切割,電泳分離,結合蛋白的DNA在結合位點上不能被修飾,不能切斷,可確定結合位點的位置。 4 Dnase I 足紋分析 蛋白

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    頑拗性植物組織的蛋白質組學研究(苯酚法提取蛋白質)

    1. 前言提取蛋白質是蛋白質組學研究的第一步。植物組織的蛋白質含量較低,并且存在多種非蛋白質成分,如細胞壁及貯藏多糖、脂質和酚類化合物,使蛋白質的提取難度增大 。植物蛋白質的可溶性與它們的細胞內定位關系密切,傳統的蛋白質提取方法是用水合緩沖液、去垢劑或直接沉淀法 [1] 。除了普遍使用的 TCA

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