研究揭示藍細菌中賴氨酸甲基轉移酶的作用機制
蛋白質翻譯后修飾通過在一個或幾個氨基酸殘基上加上化學修飾基團而改變蛋白質的結構和功能,參與蛋白質的活性狀態、定位、折疊以及蛋白質-蛋白質間相互作用。賴氨酸甲基化是常見的蛋白質翻譯后修飾類型之一,其調控機制復雜,在生命調控過程中的地位較為重要,尤其在真核生物中的組蛋白上發生的甲基化修飾,對異染色質形成、基因印記和轉錄過程有重要的調控作用。目前在真核生物中已報道多種能夠催化關鍵細胞因子發生賴氨酸甲基化的修飾酶,并對各種關鍵通路進行精確的調節。然而,對原核生物中的賴氨酸甲基化修飾的功能卻知之甚少,特別是在藍細菌中,是否存在賴氨酸單甲基化修飾和甲基轉移酶,以及這些甲基化修飾與轉移酶的功能尚不清楚。 中國科學院水生生物研究所水生生物蛋白質組學課題組證實賴氨酸單甲基化修飾在藻類和植物中普遍存在,通過發展賴氨酸單甲基化蛋白質丙酰化修飾技術,結合修飾肽段富集與質譜鑒定等方法,實現模式藍細菌集胞藻PCC6803賴氨酸單甲基化修飾蛋白的系統性......閱讀全文
研究揭示藍細菌中賴氨酸甲基轉移酶的作用機制
蛋白質翻譯后修飾通過在一個或幾個氨基酸殘基上加上化學修飾基團而改變蛋白質的結構和功能,參與蛋白質的活性狀態、定位、折疊以及蛋白質-蛋白質間相互作用。賴氨酸甲基化是常見的蛋白質翻譯后修飾類型之一,其調控機制復雜,在生命調控過程中的地位較為重要,尤其在真核生物中的組蛋白上發生的甲基化修飾,對異染色質
組蛋白甲基化修飾研究再獲突破
日前,復旦大學徐彥輝課題組在組蛋白甲基化修飾研究領域獲得新進展,相關成果發布在《分子細胞》上,該項研究得到了國家自然科學基金面上項目的資助。 組蛋白甲基化修飾是一種非常重要的表觀遺傳修飾,參與調節異染色質形成、X染色體失活、基因印記及DNA的損傷修復等多種生命過程。關于組蛋白去甲基化酶的研究是
張鍇:組蛋白賴氨酸修飾的鑒定和定量研究
天津醫科大學 張鍇老師 2014年8月29日第三屆環渤海色譜質譜學術報告會在天津市萬源龍順莊園農業博覽館順利召開。大會邀請到多位色譜質譜屆專家學者做了精彩的報告。來自天津醫科大學的張鍇老師帶來了《組蛋白賴氨酸修飾的鑒定和定量研究》的報告。 在組蛋白賴氨酸修飾的生物學意義中張鍇老師表示賴
組蛋白修飾與DNA甲基化之間的關系
在引起基因沉默的過程中,沉默信號(DNA甲基化、組蛋白修飾、染色質重新裝配)是如何進行的?誰先誰后?這是一個“雞和蛋”的問題,目前仍處于研究階段,還沒有定論。研究發現DNA甲基化和組蛋白乙酰化是一個相互促進、加強的過程,如許多HDAC可以和DNMTl、3a、3b相互作用;而甲基化CpG結合蛋白—
研究發現全新組蛋白修飾類型——賴氨酸乙酰乙酰化
細胞代謝為生命過程提供能量。同時,代謝物可共價修飾蛋白質來發揮信號傳導功能。雖然許多代謝物在代謝通路中的作用廣為人知,但它們介導細胞信號調控的功能有待探索。酮體(包括丙酮、乙酰乙酸和β-羥基丁酸)為脂質代謝產物。在葡萄糖缺乏的狀態下,肝臟產生的酮體可用作多種組織的替代能源,且與多種病理生理狀態密
賴氨酸翻譯后修飾及對蛋白質功能調控作用中期總結召開
7月29日,科技部重大科學研究計劃“賴氨酸翻譯后修飾及對蛋白質功能的調控作用”項目中期總結會議在中國科學院上海生命科學研究院健康科學研究所學術報告廳召開。會議由項目首席科學家、健康所研究員秦樾主持。科技部基礎研究管理中心朱慶平副處長和健康所主持工作的副所長孔祥銀研究員出席會議并講話。 孔祥銀
關于組蛋白修飾的方式—甲基化的基本信息介紹
組蛋白甲基化是由組蛋白甲基化轉移酶(histonemethyl transferase,HMT)完成的。甲基化可發生在組蛋白的賴氨酸和精氨酸殘基上,而且賴氨酸殘基能夠發生單、雙、三甲基化,而精氨酸殘基能夠單、雙甲基化,這些不同程度的甲基化極大地增加了組蛋白修飾和調節基因表達的復雜性。甲基化的作用
關于組蛋白修飾的形式介紹
在哺乳動物基因組中,組蛋白則可以有很多修飾形式.。一個核小體由兩個H2A,兩個H2B,兩個H3,兩個H4組成的八聚體和147bp纏繞在外面的DNA組成. 組成核小體的組蛋白的核心部分狀態大致是均一的,游離在外的N-端則可以受到各種各樣的修飾,包括組蛋白末端的乙酰化,甲基化,磷酸化,泛素化,ADP
基因沉寂的基本原理
基因沉寂需要經歷不同的反應過程才能實現,包括組蛋白N端結構域的賴氨酸殘基的去乙酰基化加工、甲基化修飾(由甲基轉移酶催化,修飾可以是一價、二價和三價甲基化修飾,后者又被稱為'過度’甲基化修飾(Hypermethylation) ) 、以及和甲基化修飾的組蛋白結合的蛋白質(MBP)形成“異染色質
基因沉寂的原理
基因沉寂需要經歷不同的反應過程才能實現,包括組蛋白N端結構域的賴氨酸殘基的去乙酰基化加工、甲基化修飾(由甲基轉移酶催化,修飾可以是一價、二價和三價甲基化修飾,后者又被稱為'過度’甲基化修飾(Hypermethylation) ) 、以及和甲基化修飾的組蛋白結合的蛋白質(MBP)形成“異染色質
簡述基因沉寂的原理介紹
基因沉寂需要經歷不同的反應過程才能實現,包括組蛋白N端結構域的賴氨酸殘基的去乙酰基化加工、甲基化修飾(由甲基轉移酶催化,修飾可以是一價、二價和三價甲基化修飾,后者又被稱為'過度’甲基化修飾(Hypermethylation) ) 、以及和甲基化修飾的組蛋白結合的蛋白質(MBP)形成“異染
表觀遺傳學修飾
組蛋白修飾 表觀遺傳學是指表觀遺傳學改變 (DNA 甲基化、組蛋白修飾和非編碼 RNA 如 miRNA) 對 表觀基因組基因表達的調節,這種調節不依賴基因序列的改變且可遺傳表觀。因素如 DNA 甲基化、組蛋白修飾和 miRNA 是對環境刺激因素變化的反映,這些表觀遺傳學因素相互作用以調節基因
基因沉寂的定義和原理
定義RNAi與轉錄后基因沉默(post-transcriptional gene silencing and transgene silencing)在分子層次上被證實是同一種現象。原理基因沉寂需要經歷不同的反應過程才能實現,包括組蛋白N端結構域的賴氨酸殘基的去乙酰基化加工、甲基化修飾(由甲基轉移酶
上海藥物所發現賴氨酸丙二酰化的新蛋白修飾及其調控酶
蛋白翻譯后修飾是調控諸多生物學過程和疾病的主要生物學通路之一,因而,蛋白翻譯后修飾通路研究正成為目前新藥研發的重要熱點之一。近日,中科院上海藥物研究所聯合美國芝加哥大學Ben May癌癥研究所趙英明教授實驗室建立的中科院上海藥物所化學蛋白質組學研究中心發現了細胞中賴氨酸丙二酰化的新蛋白修飾及
組蛋白的合成修飾的相關介紹
這是形成組蛋白各組分微不均一性的主要原因。修飾的方式有: ①乙酰化。有兩種: 一種是H1、H2A、H4組蛋白的氨基末端乙酰化,形成α-乙酰絲氨酸,組蛋白在細胞質內合成后輸入細胞核之前發生這一修飾。 另一種是在H2A、H2B、H3、H4的氨基末端區域的某些專一位置形成N6-乙酰賴氨酸。 ②
科學家開發出蛋白質甲基化分析新技術
近日,中國科學院大連化學物理研究所研究員葉明亮團隊與中國科學院分子細胞科學卓越創新中心研究員程紅團隊、中國科學院上海營養與健康研究所研究員王澤峰團隊、研究員李國輝團隊合作,開發了一種基于代謝標記的蛋白質甲基化分析新技術,實現了蛋白質甲基化組的全景式分析。該方法不需要預先設置甲基化修飾類型,可以對多種
科學家開發出蛋白質甲基化分析新技術
近日,中國科學院大連化學物理研究所研究員葉明亮團隊與中國科學院分子細胞科學卓越創新中心研究員程紅團隊、中國科學院上海營養與健康研究所研究員王澤峰團隊、研究員李國輝團隊合作,開發了一種基于代謝標記的蛋白質甲基化分析新技術,實現了蛋白質甲基化組的全景式分析。該方法不需要預先設置甲基化修飾類型,可以對
上海巴斯德所發現賴氨酸甲基化負調節IFITM3抗病毒功能
10月16日,國際學術期刊Journal of Biological Chemistry在線發表了中科院上海巴斯德研究所李斌課題組題為Negative Regulation of Interferon-Induced Transmembrane Protein 3 by SET7-media
生物物理所解析線蟲精氨酸對稱雙甲基化酶的晶體結構
線蟲PRMT5晶體結構示意圖,其活性單位為同源二聚體 12月5日,美國《國家科學院院刊》(PNAS) 在線發表了中科院生物物理研究所許瑞明、龔為民、劉迎芳研究組以及遺傳發育所鮑時來課題組合作的最新研究成果Structural Insights into Prote
李斌研究組JBC發現賴氨酸甲基化負調節IFITM3的抗病毒功能
10月16日,國際學術期刊Journal of Biological Chemistry在線發表了中科院上海巴斯德研究所李斌課題組題為Negative Regulation of Interferon-Induced Transmembrane Protein 3 by SET7-media
多肽穩定標同位素記技術與甲基化修飾技術
1. 多肽穩定標同位素記技術? ? ?隨著多肽在生物醫藥領域越來越廣泛和深入的應用,標記和修飾性的多肽種類的需求越來越多,質量需求也越來越高。穩定同位素標記(同位素示蹤法)就是其中典型的一種。穩定同位素標記多肽是指用穩定同位素標記的氨基酸合成的多肽。與標準氨基酸相比,同位素標記是指用2H,13C或1
最新進展:RNA的甲基化與去甲基化修飾
德國慕尼黑的路德維希-馬克西米利安大學(LMU)研究人員發現了細菌RNA中一種新型的化學修飾形式。顯然,只有當細胞處于應激狀態時,這種修飾才會附著在分子上,并且在恢復過程中會迅速去除。 核糖核酸(RNA)在化學形式上與DNA密切相關,而DNA是所有細胞中遺傳信息的載體。實際上,RNA本身在將遺
我所開發出蛋白質甲基化分析新技術
近日,我所生物分離分析新材料與新技術研究組(1809組)葉明亮研究員團隊與中國科學院分子細胞科學卓越創新中心程紅研究員團隊、中國科學院上海營養與健康研究所王澤峰研究員團隊、李國輝研究員團隊合作,開發了一種基于代謝標記的蛋白質甲基化分析新技術,實現了蛋白質甲基化組的全景式分析。該方法不需要預先設置甲基
我國學者在組蛋白修飾領域取得進展
圖 Menin在核小體環境下識別H3K79me2的示意圖 在國家自然科學基金項目(批準號:21922708)資助下,香港大學李祥教授團隊在表觀遺傳領域取得新進展,破解了組蛋白H3賴氨酸79二甲基化(H3K79me2)修飾的表觀遺傳密碼,相關成果以“Menin在核小體環境中‘讀取’H3K79me2標
我國科學家揭示人類早期胚胎發育中的組蛋白修飾重編程
在真核生物中,組蛋白與帶負電荷的雙螺旋DNA組裝成核小體。因氨基酸成分和分子量不同,組蛋白主要分成5類:H1,H2A,H2B,H3和H4。除H1外,其他4種組蛋白均分別以二聚體形式相結合,形成核小體核心。DNA便纏繞在核小體的核心上。而H1則與核小體間的DNA結合。 組蛋白修飾(histone
甲基化的類型介紹
甲基化包括DNA甲基化和蛋白質甲基化。(1)DNA甲基化:脊椎動物的DNA甲基化一般發生在CpG位點(胞嘧啶-磷酸-鳥嘌呤位點,即DNA序列中胞嘧啶后緊連鳥嘌呤的位點)。經DNA甲基轉移酶催化胞嘧啶轉化為5-甲基胞嘧啶。人類基因中約80%-90%的CpG位點已被甲基化,但是在某些特定區域,如富含胞嘧
關于甲基化的類型的介紹
甲基化包括DNA甲基化或蛋白質甲基化 (1)DNA甲基化。脊椎動物的DNA甲基化一般發生在CpG位點(胞嘧啶-磷酸-鳥嘌呤位點,即DNA序列中胞嘧啶后緊連鳥嘌呤的位點)。經DNA甲基轉移酶催化胞嘧啶轉化為5-甲基胞嘧啶。人類基因中約80%-90%的CpG位點已被甲基化,但是在某些特定區域,如富
關于甲基化的類型介紹
甲基化包括DNA甲基化和蛋白質甲基化。 (1)DNA甲基化:脊椎動物的DNA甲基化一般發生在CpG位點(胞嘧啶-磷酸-鳥嘌呤位點,即DNA序列中胞嘧啶后緊連鳥嘌呤的位點)。經DNA甲基轉移酶催化胞嘧啶轉化為5-甲基胞嘧啶。人類基因中約80%-90%的CpG位點已被甲基化,但是在某些特定區域,如
北京大學癌癥研究刊登國際期刊
β-連環蛋白(β-Catenin)是一種多功能蛋白,是無翅型整合位點(Wnt)/β-catenin信號通路的一個關鍵中介物,通過調節許多不同的靶基因表達,在細胞增殖、細胞命運決定和腫瘤發生的過程中,發揮著重要的作用。雖然各種翻譯后修飾參與β-連環蛋白的活性,但是,賴氨酸甲基化在β-連環蛋白活性中
生物物理所等在神經細胞凋亡領域取得新進展
3月9日,中科院生物物理研究所袁增強研究組等在分子生物學雜志EMBO reports在線發表了題為Lysine methylation of FOXO3 regulates oxidative stress-induced neuronal cell death的論文,報道了轉錄因