一次RNA甲基化測序的多項成果云序RNA甲基化測序技術...1
一次RNA甲基化測序的多項成果-云序RNA甲基化測序技術大公開文章導讀RNA修飾是表觀遺傳學中調控轉錄后基因表達的關鍵過程,目前對m6A RNA修飾的研究已進行的如火如荼,而除了m6A以外仍有多種RNA修飾類型參與調控轉錄后的基因表達,其中包括m1A、m5C、m7G、2’-O-甲基化修飾以及ac4C乙酰化修飾,在這些領域的研究中也不斷有高分文章的出現。云序生物是國內RNA修飾測序的領跑者,可針對mRNA和各種非編碼RNA提供各類RNA修飾測序服務 (m6A﹑m1A﹑m5C﹑m7G﹑ac4C﹑2’-O-甲基化等)。目前,云序已累計支持客戶發表32篇高水平文章,合計影響因子204分,是國內支持發文最多、累計影響因子最高的公司。近日,云序客戶分別在肝癌和胃癌中進行了m6A和m5C RNA甲基化的全轉錄組測序(circRNA、lncRNA和mRNA),其中在肝癌中進行的m5C測序數據發表了三篇表達譜的文章,實現了一次測序......閱讀全文
SMAD2/3與TGFβ影響轉錄因子發生m6ARNA甲基化調控干細胞發育
文章導讀: 胚胎干細胞作為一種全能性細胞,通過增殖和分化,產生動物體所有組織和器官的細胞。已有研究表明,胚胎干細胞發生m6A RNA甲基化,大多與細胞增殖[1-2],免疫應答[4]關系密切。然而,對于m6A修飾在胚胎干細胞向神經內胚層細胞分化過程中的分子機制目前并沒有相關報道。今天,分享一
揭秘m6A修飾新功能----調控染色質狀態和轉錄活性
m6A是真核生物中最常見的一類化學修飾,能夠在多種生物過程中發揮重要作用,包括癌癥發生發展、細胞分化、壓力應答、免疫反應以及神經發育等方面。目前大部分研究主要探究m6A對蛋白編碼基因的調控——即影響mRNA穩定性或翻譯效率。 2020年1月17日,美國芝加哥大學何川,中科院北京基因組研究所
m5C-RNA修飾表達譜文章教您如何另辟蹊徑快速發文
文章導讀隨著RNA修飾在生物領域的持續火熱,關于m6A修飾的研究已經廣 泛開展并發表,至今已覺不新鮮;5-甲基胞嘧啶RNA甲基化(m5C)是一類新的修飾方式,參與調控細胞應激、發育和基因表達等方面,目前m5C研究正處 方興未艾之際,大量的科學研究工作也亟待開展,非常適合有探索性和新穎性需求的老師。這
開啟2020年科研新熱點的染色體外環狀DNA(eccDNA)
近期,Nature與Cell相繼發表文章討論染色體外環狀DNA(eccDNA),這位超級明星在各家媒體、宣傳號上紛紛閃亮登場。一時間eccDNA走在了生物醫學研究舞臺的最中央,云序生物已經帶您領略過eccDNA在這兩篇重量級文章中的迷人風采(點擊鏈接:顛覆性發現:癌基因竟不在染色體上---環狀D
2019年,大牛們都在研究什么?—m6A文章盤點
19年悄悄的已經將近過半,但RNA甲基化研究馬不停歇。單單過去一個半月的時間里高分文章就有十多篇,Nature,Cell子刊均有相關文章發表;造血干細胞分化,癌細胞上皮間質轉化,樹突細胞活化,心肌細胞肥厚,內源性免疫應答調控都有它的身影。這里小編給大家列舉展示幾篇最新的m6A RNA甲基化研究成
2019年,大牛們都在研究什么?—m6A文章盤點
19年悄悄的已經將近過半,但RNA甲基化研究馬不停歇。單單過去一個半月的時間里高分文章就有十多篇,Nature,Cell子刊均有相關文章發表;造血干細胞分化,癌細胞上皮間質轉化,樹突細胞活化,心肌細胞肥厚,內源性免疫應答調控都有它的身影。這里小編給大家列舉展示幾篇最新的m6A RNA甲基化研究成
開啟2020年科研新熱點的染色體外環狀DNA(eccDNA)
近期,Nature與Cell相繼發表文章討論染色體外環狀DNA(eccDNA),這位超級明星在各家媒體、宣傳號上紛紛閃亮登場。一時間eccDNA走在了生物醫學研究舞臺的最中央,云序生物已經帶您領略過eccDNA在這兩篇重量級文章中的迷人風采(點擊鏈接:顛覆性發現:癌基因竟不在染色體上---環狀D
去甲基化酶ALKBH5在胰腺癌中的應用
文章導讀 表觀遺傳修飾如m6A甲基化在腫 瘤的發生和發展中起到重要作用。而甲基化酶對ai癥的影響也受到廣 泛關注。其中去甲基化酶ALKBH5已被報道過能通過維持乳腺ai細胞的干細胞性而促進腫 瘤的形成,還有文章探究過其在急性白血病中的作用,但其對胰腺ai的影響還缺乏研究。今年5月份發表在M
昨日明星LncRNA搭上m6A后逆襲為今天新星
m6A RNA甲基化是當前在LncRNA,環狀RNA等非編碼RNA之后最為火熱的科研明星,到底有多火?擺出數據告訴你! 2019年才過去一半還不到,已發表文章數就已占去年的7成。RNA甲基化領域,不僅文章數量多,高分文章也有許多。據統計,僅2019年上半年就發表了多篇Nature,Cell
雙RNA測序技術
在發表于《自然》(Nature)雜志上的一篇研究論文中, 由來自德國、奧地利和美國的研究人員組成的一個研究小組發現,采用一種允許在感染過程中同時研究細菌與宿主小RNA的新技術,可以揭示出兩者轉錄譜的改變。該研究小組描繪了他們的技術、該技術如何更多地幫助了解細菌感染機制,以及在研究中獲得的重要發現
科研人員研發RNA甲基化7甲基鳥嘌呤測序技術
7-甲基鳥嘌呤(m7G)修飾是轉錄后調控中最常見的堿基修飾形式之一,廣泛分布于tRNA、rRNA以及真核生物mRNA的5’帽子區,對維持RNA的加工代謝、穩定、出核以及蛋白質翻譯具有重要作用。近期研究表明高等真核生物mRNA內部也含有m7G修飾,然而對其分布特征和調控作用目前尚不清楚。 中國科
RNA研究熱點技術介紹總匯
頭條消息:2019年8月16日,2019年國家自然科學基金評審結果發布,今年國自然重點資助項目743項,總金額達22.184億,北京大學、浙江大學位居前兩位,分別獲得37項和34項,總計超過1億元,而上海交通大學(30項)、復旦大學、清華大學、南京大學、中山大學、天津大學、華中科技大學、同濟大學
云序超微量MeRIP測序技術在m6A甲基化文章發表的應用2
3) m6A修飾與基因表達聯合分析通過m6A-MeRIP-seq和RNA-seq聯合分析,文章展示了m6A修飾水平與基因表達水平間的關系,統計發現表達高的基因分組中,受m6A修飾的基因比例也更高。4)甲基化相關酶的表達通過qPCR檢測了兩組樣品中6個甲基化相關酶的表達,發現在高度近視白內障患者中甲基
m6A-RNA甲基化在發表多篇10+文章的運用
最近小編檢索了關于m6A修飾的文章發表情況,發現目前2020年發表的關于m6A修飾的文章已經達到309篇,已經追平2019年整年度發表篇數,可以預見m6A RNA修飾下半年年發表文章會呈現出爆炸式增長。 圖1. 近6年m6A RNA修飾相關文章發表情況( data from PubMe
小白必看!RNA甲基化整體水平鑒定的方法匯總
RNA甲基化(RNA methylation)是一類表觀遺傳修飾,在已經發現的超過100種不同的RNA化學修飾中,主要有6-甲基腺嘌呤(N6-methyladenosine, m6A)、5-甲基胞嘧啶(C5-methylcytidine, m5C)和1-甲基腺嘌呤(N1-methyladenos
云序生物為你解密ATACseq研究方案
ATAC-seq最近幾年是比較火的一種測序技術。那ATAC-seq技術到底什么呢?ATAC-seq的全稱是Assay for Transposase Accessible Chromatin using sequencing, 運用測序手段研究轉座酶可接近的染色質的一種技術。該技術通過轉座酶對某
RNA研究熱點技術介紹總匯
頭條消息:2019年8月16日,2019年國家自然科學基金評審結果發布,今年國自然重點資助項目743項,總金額達22.184億,北京大學、浙江大學位居前兩位,分別獲得37項和34項,總計超過1億元,而上海交通大學(30項)、復旦大學、清華大學、南京大學、中山大學、天津大學、華中科技大學、同濟大學
METTL3調控m6A甲基化修飾對小鼠脂肪細胞發育的重要作用
今 天我們為大家解讀一篇今年4月3日發表在Nature communication(IF=11.878)的文章,作者研究了m6A修飾對小鼠脂肪組織發育的影響。 棕色脂肪組織(BAT)通過線粒體產生并耗散熱量,對機體起到保暖和控制肥胖的重要作用,而BAT的出生后發育,正是它們獲得這些功能的關
揭示Y染色體上LncRNA-TTTY15促進前列腺癌細胞的增殖和遷移
前列腺癌(Prostate cancer,PCa)作為男性發病率第二的癌癥,嚴重影響了患者生殖健康和生活質量。由于前列腺癌受多種基因調控,且目前缺乏相關機制方面的深入研究,治療效果往往不甚理想。隨著高通量技術的發展,使研究PCa相關分子標志物基因和作用機制成為可能。目前,已有報道指出許多明星Ln
解析檢測各類癌癥當中RNA甲基化相關酶RNA甲基化水平(上)
云序生物解析如何做到快速同時檢測各類癌癥當中RNA甲基化相關酶&RNA甲基化水平(上) RNA甲基化作為云序生物的主打科研產品,已經幫助多個研究團隊展開了RNA甲基化研究。作為國內RNA甲基化研究的領跑者,云序生物是國內RNA甲基化10分文章發表的成熟服務商,首發推出了非編碼RNA甲基化測
METTL3調控m6A甲基化修飾對小鼠脂肪細胞發育的重要作用
今 天我們為大家解讀一篇今年4月3日發表在Nature communication(IF=11.878)的文章,作者研究了m6A修飾對小鼠脂肪組織發育的影響。 棕色脂肪組織(BAT)通過線粒體產生并耗散熱量,對機體起到保暖和控制肥胖的重要作用,而BAT的出生后發育,正是它們獲得這些功能的關
Mettl3介導m6A-RNA甲基化調控骨髓間充質干細胞骨質疏松癥
文章導讀: 近日,四川大學華西醫院的周學東和袁泉研究組,聯合中山大學第一附屬醫院的林水賓團隊合作研究共同揭示了Mettl3介導m6A RNA甲基化調控骨髓間充質干細胞和骨質疏松癥命運的新機制。該研究成果以Mettl3-mediated m6A RNA methylation regulat
檢測各類癌癥當中RNA甲基化相關酶RNA甲基化水平(下)
又到了一周云序生物課堂開講時間!你,準備好了嗎? 上一期文章當中,云序通過引用這樣一張表格給大家傳遞了一個重要信息:表中的METLL3、METTL14、NSun2、FTO、ALKBH5、YTHDF2均是RNA甲基化重要的酶,而且這些酶在不同疾病當中意義有所不同,例如METTL3在AML、B
同時檢測各類癌癥當中RNA甲基化相關酶RNA甲基化水平
RNA甲基化作為云序生物的主打科研產品,已經幫助多個研究團隊展開了RNA甲基化研究。作為國內RNA甲基化研究的領跑者,云序生物是國內RNA甲基化10分文章發表的成熟服務商,首發推出了非編碼RNA甲基化測序研究,首發推出了超微量RNA甲基化測序技術,首發推出RNA甲基化研究一站式系統性解決方案,云
m6A-RNA甲基化在發表多篇10+文章的運用(四)
1)m6A修飾PCR芯片?new!云序生物提供m6A修飾PCR芯片檢測,高效一次性檢測m6A相關的Writer,Eraser,Reader的表達情況,m6A PCR 芯片基因列表(34 個基因)-human如圖:??2)RNA修飾PCR芯片?new!云序生物提供多種RNA修飾PCR芯片檢測,高效一次
人類組織中m6A修飾的動態變化和進化
文章導讀 m6A是mRNA中普遍存在的一種內部修飾,通過多種機制,比如調控mRNA的剪接、表達、降解、翻譯等對mRNA的命運產生不同影響。為了探究m6A修飾在不同組織之間、不同發育階段的差異,m6A位點在轉錄本上的位置分布,以及這些分布差異可能對基因調控的進化產生怎樣的影響,近期Nucle
影響因子高達7.8分的直腸癌轉移肝癌環狀RNA文章思路解析
云序客戶發表首篇直腸癌轉移肝癌環狀RNA文章,影響因子高達7.8分!? 文章導讀: 在非編碼RNA的大家族中,環狀RNA是近年來繼microRNA和lncRNA之后又一個明星成員。因其3’-5’端成環,所以在生物體中具有穩定性高,不易被降解的特性。大部分環狀RNA通過直接或間接調控m
circRNA_104075在促進肝癌發生和進展的機制研究
在全球范圍內原發性肝癌是造成癌癥相關死亡的三大原因之一。肝細胞癌(HCC)是最常見的原發性肝臟癌癥。由于缺乏高特異性和敏感性的早期診斷生物標志物,HCC患者往往得不到及時有效的治療。相比于長鏈非編碼RNA和miRNA,circRNA作為一種新型環狀RNA,具有共價閉合環狀結構,在組織和血液中具有
云序RNA修飾技術在華南農大余義勛課題組植物m1A修飾...4
2)RNA修飾PCR芯片?new!? ? 云序生物提供多種RNA修飾PCR芯片檢測,高效一次性檢測6種RNA修飾相關的Writer,Eraser,Reader的表達情況,最全面的RNA修飾相關基因覆蓋,RNA 修飾芯片基因列表(68 個基因)-human如圖:??3)m6A相關酶預合成的慢(腺)病毒
m6A修飾的YTHDF1與介導EIF3C對卵巢癌進展的影響
m6A是真核生物中最常見的一類RNA修飾,能夠在多種生物過程中發揮重要作用,例如癌癥發生發展、細胞分化、壓力應答、免疫反應以及神經發育等。2019年m6A修飾曾創下單月發表100+篇10分影響因子的輝煌。2020年1月何川教授團隊再次帶領m6A登上頂級期刊Science,預示著m6A等RNA修飾