云序超微量MeRIP測序技術在m6A甲基化文章發表的應用1
m6A甲基化是近年來一大熱門研究方向，種種研究表明m6A修飾在各種真核生物、各類組織細胞中普遍存在，并對多種生物學功能、疾病腫瘤的發生發展具有極大影響。m6A甲基化位點的檢測依賴于MeRIP-seq，其中的抗體免疫共沉淀（IP）環節要求樣品RNA起始量相較普通轉錄組測序要高，曾經令許多難以大量獲取的組織、細胞或體液樣本被拒在m6A研究的大門之外。云序生物自2018年推出了超微量RNA甲基化測序（超微量MeRIP-seq），對免疫共沉淀和高通量測序步驟進行優化，克服了常規抗體富集至少需要100μg總RNA的難題，實現了僅需500ng總RNA即可IP、建庫測序，為微量樣本研究m6A等甲基化修飾帶來福音。本期我們就為大家解析兩篇云序客戶近期發表的應用了超微量merip技術測序的m6A表達譜文章。文章1：高度近視眼晶狀體前囊膜的m6A修飾譜發表日期：2020.10.27研究單位：天津醫科大學眼科醫院孫靖教授團隊影響因子：4.251研究方......閱讀全文
同時檢測各類癌癥當中RNA甲基化相關酶RNA甲基化水平(下)
又到了一周云序生物課堂開講時間！你，準備好了嗎？ 上一期文章當中，云序通過引用這樣一張表格給大家傳遞了一個重要信息：表中的METLL3、METTL14、NSun2、FTO、ALKBH5、YTHDF2均是RNA甲基化重要的酶，而且這些酶在不同疾病當中意義有所不同，例如METTL3在AML、B
m6A修飾的YTHDF1與介導EIF3C對卵巢癌進展的影響
m6A是真核生物中最常見的一類RNA修飾，能夠在多種生物過程中發揮重要作用，例如癌癥發生發展、細胞分化、壓力應答、免疫反應以及神經發育等。2019年m6A修飾曾創下單月發表100+篇10分影響因子的輝煌。2020年1月何川教授團隊再次帶領m6A登上頂級期刊Science，預示著m6A等RNA修飾
快速檢測各類癌癥當中RNA甲基化相關酶RNA甲基化水平(下)
又到了一周云序生物課堂開講時間！你，準備好了嗎？ 上一期文章當中，云序通過引用這樣一張表格給大家傳遞了一個重要信息：表中的METLL3、METTL14、NSun2、FTO、ALKBH5、YTHDF2均是RNA甲基化重要的酶，而且這些酶在不同疾病當中意義有所不同，例如METTL3在AML、B
昨日明星LncRNA搭上m6A后逆襲為今天新星
m6A RNA甲基化是當前在LncRNA，環狀RNA等非編碼RNA之后最為火熱的科研明星，到底有多火？擺出數據告訴你！ 2019年才過去一半還不到，已發表文章數就已占去年的7成。RNA甲基化領域，不僅文章數量多，高分文章也有許多。據統計，僅2019年上半年就發表了多篇Nature，Cell
昨日明星LncRNA搭上m6A后逆襲為今天新星
m6A RNA甲基化是當前在LncRNA，環狀RNA等非編碼RNA之后最為火熱的科研明星，到底有多火？擺出數據告訴你！ 2019年才過去一半還不到，已發表文章數就已占去年的7成。RNA甲基化領域，不僅文章數量多，高分文章也有許多。據統計，僅2019年上半年就發表了多篇Nat
Mettl3介導m6A－RNA甲基化調控骨髓間充質干細胞骨質疏松癥
文章導讀： 近日，四川大學華西醫院的周學東和袁泉研究組，聯合中山大學第一附屬醫院的林水賓團隊合作研究共同揭示了Mettl3介導m6A RNA甲基化調控骨髓間充質干細胞和骨質疏松癥命運的新機制。該研究成果以Mettl3-mediated m6A RNA methylation regulat
云序生物為你解密ATACseq研究方案
ATAC-seq最近幾年是比較火的一種測序技術。那ATAC-seq技術到底什么呢？ATAC-seq的全稱是Assay for Transposase Accessible Chromatin using sequencing, 運用測序手段研究轉座酶可接近的染色質的一種技術。該技術通過轉座酶對某
circRNA_104075在促進肝癌發生和進展的機制研究
在全球范圍內原發性肝癌是造成癌癥相關死亡的三大原因之一。肝細胞癌(HCC)是最常見的原發性肝臟癌癥。由于缺乏高特異性和敏感性的早期診斷生物標志物，HCC患者往往得不到及時有效的治療。相比于長鏈非編碼RNA和miRNA，circRNA作為一種新型環狀RNA，具有共價閉合環狀結構，在組織和血液中具有
m6A修飾的YTHDF1與介導EIF3C對卵巢癌進展的影響（二）
為了全面探索YTHDF1及其靶基因之間的直接相互作用，作者對過表YTHDF1的A2780細胞，進行了eCLIP-seq，并鑒定了2,343個目標轉錄物，這些轉錄物大多數是mRNA。將eCLIP seq的結果2,343個基因和上面三組數據交集確定的647個基因取交集，產生175個基因，將其確定
三個月內搞定5分m6A甲基化譜文章
關于m6A修飾的研究在生物領域持續火熱，近年國自然立項和文章發表數目保持指數增長趨勢，2020年pubmed收錄文章已經高達652篇。云序生物在m6A修飾測序領域具有豐富的經驗，近期云序客戶又連發了5篇m6A甲基化測序研究的文章，下面小編就帶大家一起來分析下這幾篇發表文章的研究思路，給想短時間內發表
人類組織中m6A修飾的動態變化和進化（二）
5.進化角度分析人類m6A修飾位點作者通過比較人鼠之間保守m6A位點比例和保守對照A比例，來評估CDS區域m6A位點面臨的自然選擇壓力，發現發生于第 一個密碼子處的m6A的周圍序列保守程度低，可能由于此處的m6A會帶來不利的影響比如影響tRNA結合，而發生于第三個密碼子處的m6A則受到進化選
云序RNA修飾技術在華南農大余義勛課題組植物m1A修飾...2
2. m6A甲基轉移酶METTL3的泛素化調節其功能??發表期刊：Nucleic Acids Research影響因子：11.147發表日期：2018.06.01實驗方法：?m6A-seq，RNA-seq，MeRIP-PCR，RIP等（云序提供）??上海交通大學醫學院余健秀組在著名期刊《核酸研究》發
Nature－|－m6A－RNA甲基化識別蛋白YTHDF1參與記憶的形成
目前來說，調控m6A修飾過程的閱讀蛋白共有9種功能，今天不會大家一一來講，而是主要講參與蛋白編碼過程的YTHDF1蛋白，它主要通過與mRNA的m6A位點結合，在腦神經發育[1]，多巴胺分泌[2]和突觸形成[3]等過程中起重要作用。 文章導讀： 2018年10月31日，美國芝加哥大學何
RNA甲基化研究深度剖析
一、聽說最近 RNA甲基化很火，它是何方神圣？ 1、高分文章頻現 說起近來的科研熱點，RNA甲基化修飾的相關研究可以說是當前整個生命科學領域最熱門的方向之一，亮點文章頻出，著實讓人有些目不暇接。RNA甲基化的研究近3月發表的文章影響因子為10分以上的，就有高達 17 篇。
揭示eccDNA新功能—驅動神經母細胞瘤基因組重排
在剛剛過去不到一個月的時間，染色體外環狀DNA（eccDNA）重大科研成果相繼刊登上Nature、Cell、Nature Genetics等重量級期刊，這無疑將eccDNA推向21世紀20年代科學研究的風口浪尖，吸引無數科學工作者的眼球。前期報道表明eccDNA能導致原癌基因擴增，極大地促進腫瘤
RNA甲基化研究深度剖析（一）
一、聽說最近?RNA甲基化很火，它是何方神圣？1、高分文章頻現 說起近來的科研熱點，RNA甲基化修飾的相關研究可以說是當前整個生命科學領域最熱門的方向之一，亮點文章頻出，著實讓人有些目不暇接。RNA甲基化的研究近3月發表的文章影響因子為10分以上的，就有高達?17?篇。 圖：RNA甲基化近期高
Nature－Genetics－揭示eccDNA功能—驅動神經母細胞瘤基因組重排
在剛剛過去不到一個月的時間，染色體外環狀DNA（eccDNA）重大科研成果相繼刊登上Nature、Cell、Nature Genetics等重量級期刊，這無疑將eccDNA推向21世紀20年代科學研究的風口浪尖，吸引無數科學工作者的眼球。前期報道表明eccDNA能導致原癌基因擴增，極大地促進腫瘤
2018國自然研究熱點二：－RNA甲基化研究深度剖析
一、聽說最近 RNA甲基化很火，它是何方神圣？ 1、高分文章頻現 說起近來的科研熱點，RNA甲基化修飾的相關研究可以說是當前整個生命科學領域最熱門的方向之一，亮點文章頻出，著實讓人有些目不暇接。RNA甲基化的研究近3月發表的文章影響因子為10分以上的，就有高達 17 篇。 圖：
SMAD2/3與TGFβ影響轉錄因子發生m6ARNA甲基化調控干細胞發育
文章導讀： 胚胎干細胞作為一種全能性細胞，通過增殖和分化，產生動物體所有組織和器官的細胞。已有研究表明，胚胎干細胞發生m6A RNA甲基化，大多與細胞增殖[1-2]，免疫應答[4]關系密切。然而，對于m6A修飾在胚胎干細胞向神經內胚層細胞分化過程中的分子機制目前并沒有相關報道。今天，分享一
云序生物最新“RNA－甲基化”研究匯總擬南芥篇
關于RNA甲基化修飾的研究成果在Nature，Science，Cell等高分期刊上頻頻亮相，并一次次刷新人們對生命科學的認知。擬南芥作為植物界中研究RNA甲基化修飾的先行者，許多學者將它作為研究對象，并與最新m6A、m5C RNA甲基化測序技術結合，證實到RNA甲基化廣泛存在于擬南芥各個發育期，
開啟2020年科研新熱點的染色體外環狀DNA（eccDNA）
近期，Nature與Cell相繼發表文章討論染色體外環狀DNA（eccDNA），這位超級明星在各家媒體、宣傳號上紛紛閃亮登場。一時間eccDNA走在了生物醫學研究舞臺的最中央，云序生物已經帶您領略過eccDNA在這兩篇重量級文章中的迷人風采（點擊鏈接：顛覆性發現：癌基因竟不在染色體上---環狀D
解析檢測各類癌癥當中RNA甲基化相關酶RNA甲基化水平(上)
云序生物解析如何做到快速同時檢測各類癌癥當中RNA甲基化相關酶&RNA甲基化水平(上) RNA甲基化作為云序生物的主打科研產品，已經幫助多個研究團隊展開了RNA甲基化研究。作為國內RNA甲基化研究的領跑者，云序生物是國內RNA甲基化10分文章發表的成熟服務商，首發推出了非編碼RNA甲基化測
開啟2020年科研新熱點的染色體外環狀DNA（eccDNA）
近期，Nature與Cell相繼發表文章討論染色體外環狀DNA（eccDNA），這位超級明星在各家媒體、宣傳號上紛紛閃亮登場。一時間eccDNA走在了生物醫學研究舞臺的最中央，云序生物已經帶您領略過eccDNA在這兩篇重量級文章中的迷人風采（點擊鏈接：顛覆性發現：癌基因竟不在染色體上---環狀D
如何快速查找LncRNA序列
查找LncRNA序列的網站有很多，包括Genebank，Ensembl，RefSeq，UCSC數據庫等。今天，小編就給大家講講如何通過LncRNA ID號查找LncRNA的序列。 一．根據LncRNA來源數據庫，進入相應鏈接。 1. Genebank：https://www.ncb
小白必看！RNA甲基化整體水平鑒定的方法匯總
RNA甲基化（RNA methylation）是一類表觀遺傳修飾，在已經發現的超過100種不同的RNA化學修飾中，主要有6-甲基腺嘌呤（N6-methyladenosine, m6A）、5-甲基胞嘧啶（C5-methylcytidine, m5C）和1-甲基腺嘌呤（N1-methyladenos
同時檢測各類癌癥當中RNA甲基化相關酶RNA甲基化水平
RNA甲基化作為云序生物的主打科研產品，已經幫助多個研究團隊展開了RNA甲基化研究。作為國內RNA甲基化研究的領跑者，云序生物是國內RNA甲基化10分文章發表的成熟服務商，首發推出了非編碼RNA甲基化測序研究，首發推出了超微量RNA甲基化測序技術，首發推出RNA甲基化研究一站式系統性解決方案，云
SUMO化修飾調控m6A－RNA甲基化酶METTL3及其催化功能分子機制
RNA甲基化是目前最炙手可熱的研究領域，近3個月以來，該方向影響因子10分以上的文章數量竟接近20篇。云序生物曾對RNA甲基化研究方法及思路進行了深度剖析，感興趣的老師可瀏覽云序生物前期公眾號（2018國自然熱點二：RNA甲基化研究深度剖析）。 近三個月高分文章部分列表： 2月28日
云序高分文章利器：?ctDNA（羥）甲基化測序案例分享
新型腫瘤標志物篩選利器-----ctDNA（羥）甲基化測序 cfDNA（Cell free DNA）是人體組織排放到血液、尿液或腦脊液等循環體系中降解的DNA小片段，是一種新型的分子標記物。ctDNA（Circulating tumor DNA）特指來源于腫瘤細胞的cfDNA，是液體活檢主
云序高分文章利器：?ctDNA（羥）甲基化測序案例分享
新型腫瘤標志物篩選利器-----ctDNA（羥）甲基化測序 cfDNA（Cell free DNA）是人體組織排放到血液、尿液或腦脊液等循環體系中降解的DNA小片段，是一種新型的分子標記物。ctDNA（Circulating tumor DNA）特指來源于腫瘤細胞的cfDNA，是液體活檢主
解鎖5分m6A甲基化譜文章新思路
1.構建OSC細胞模型--MG63/DXR作者選擇人的OS細胞系--MG63，通過阿霉素DXR誘導，建立了多藥耐藥性細胞株--MG63 / DXR。并通過分析其特定的細胞表面標志物CD133和CD117 / STRO-1；干細胞相關基因的表達量；皮下注射對裸鼠的致瘤潛力等多個方面數據證明MG