代謝組學、脂質組學在病毒研究中的應用(二)
案例三基于代謝組學技術挖掘病毒感染宿主后代謝動態變化情況2019年發表在Viruses雜志上的另一篇文章,采用基于Orbitrap 的非靶標和靶標代謝組學方式研究了麻痹病毒(Cricket paralysis virus, CrPV)感染昆蟲Bm5細胞后宿主代謝的動態變化情況。研究人員發現,CrPV感染導致Bm5細胞的代謝具有顯著和特定階段的變化。比如,CrPV持續感染過程中葡萄糖和谷氨酰胺水平均顯著升高,隨后在致病期急劇下降。不同代謝產物的豐度和途徑分析進一步確定了病毒生命周期不同階段的特定代謝特征。為病毒感染宿主后的致病過程,疾病分期,以及藥物治療效果提供理論依據。新興傳染病往往是人畜共患疾病,可以從動物傳播給人類。通過蛋白、代謝和脂質等多組學技術可以幫助研究者還原宿主-病原體相互作用關系,從而為醫務人員和科研工作者提供理論依據。Orbitrap技術作為蛋白質組學的金標準,其高靈敏度、高精度,高通量等特性在代謝組學和脂質組學......閱讀全文
代謝組學的優勢、應用及研究內容介紹
我們知道細胞內的生命活動由眾多基因、蛋白質、以及小分子代謝產物來共同承擔,而上游的(核酸、蛋白質等)大分子的功能性變化最終會體現于代謝層面,如神經遞質的變化、激素調控、受體作用效應、細胞信號釋放、能量傳遞和細胞間通訊等,所以代謝組處于基因調控網絡和蛋白質作用網絡的下游,所提供的是生物學的終端信息
代謝組學的優勢、應用及研究內容介紹
我們知道細胞內的生命活動由眾多基因、蛋白質、以及小分子代謝產物來共同承擔,而上游的(核酸、蛋白質等)大分子的功能性變化最終會體現于代謝層面,如神經遞質的變化、激素調控、受體作用效應、細胞信號釋放、能量傳遞和細胞間通訊等,所以代謝組處于基因調控網絡和蛋白質作用網絡的下游,所提供的是生物學的終端信息。如
代謝組學的優勢、應用及研究內容介紹
我們知道細胞內的生命活動由眾多基因、蛋白質、以及小分子代謝產物來共同承擔,而上游的(核酸、蛋白質等)大分子的功能性變化最終會體現于代謝層面,如神經遞質的變化、激素調控、受體作用效應、細胞信號釋放、能量傳遞和細胞間通訊等,所以代謝組處于基因調控網絡和蛋白質作用網絡的下游,所提供的是生物學的終端信息
稅光厚:為什么要做脂質組學研究?
“精準分析”我們的成功故事系列 ——寫在前面的話 “精準分析?量化釋能”——我們的成功故事系列欄目,是SCIEX幫助科學家們分享有意義的科學發現和研究成果的科普平臺。我們期待讓更多的人感受到科學和“質譜”的力量,”讓質譜改變每個人的生活”始終是SCIEX最美好的愿景。SCIEX非常榮幸能夠參與到
“代謝組學”技術與方法研究
【基于質譜的分析方法聯用對”代謝組學”進行研究】 代謝組學”研究可分為:“發現代謝組學”和“靶標代謝組學”,兩者共同組成了“代謝組學”研究的“生態系統”。本文將介紹基于質譜的分析方法聯合統計學分析法對“代謝組學”進行研究。質譜能在一個廣泛的動態范圍內保持極高的檢測靈敏度、高度
“代謝組學”技術與方法研究
【基于質譜的分析方法聯用對”代謝組學”進行研究】 代謝組學”研究可分為:“發現代謝組學”和“靶標代謝組學”,兩者共同組成了“代謝組學”研究的“生態系統”。本文將介紹基于質譜的分析方法聯合統計學分析法對“代謝組學”進行研究。質譜能在一個廣泛的動態范圍內保持極高的檢測靈敏度、高度的穩定性、重現
質譜儀在代謝組學和代謝研究中有著杰出表現
質譜儀以離子源、質量分析器和離子檢測器為核心。離子源是使試樣分子在高真空條件下離子化的裝置。電離后的分子因接受了過多的能量會進一步碎裂成較小質量的多種碎片離子和中性粒子。它們在加速電場作用下獲取具有相同能量的平均動能而進入質量分析器。質量分析器是將同時進入其中的不同質量的離子,按質荷比m/e大小分
島津超快速質譜助力靶向代謝組學研究
靶向代謝組學中,通常需要同時檢測多個目標組分,這對質譜數據的采集速度提出了很高的要求。 島津超快速質譜(UFMS)擁有業內首屈一指采集速度。以LCMS-8050為例,其駐留時間(Dwell time≥0.8 ms)、切換時間(Pause time≥1 ms)、掃描速度(Scan s
島津超快速質譜助力靶向代謝組學研究
靶向代謝組學中,通常需要同時檢測多個目標組分,這對質譜數據的采集速度提出了很高的要求。??島津超快速質譜(UFMS)擁有業內首屈一指采集速度。以LCMS-8050為例,其駐留時間(Dwell time≥0.8 ms)、切換時間(Pause time≥1 ms)、掃描速度(Scan speed≤3
全新角度探索生命奧秘:脂質組學
血漿中約70%的代謝物是脂類,脂類代謝是動植物的第一大類代謝。加上質譜法的廣泛應用,大大加速了脂質組學的發展,脂質組學已成為代謝組學中最為活躍的研究領域之一。 萬事萬物都存在著辯證,盡管我們對高血脂深惡痛絕,心痛它對我們身體的摧殘。但脂質卻又是人體無法舍棄的重要組成,少了它,生命將一團亂麻以至
脂質組學:全新角度探索生命奧秘
血漿中約70%的代謝物是脂類,脂類代謝是動植物的第一大類代謝。加上質譜法的廣泛應用,大大加速了脂質組學的發展,脂質組學已成為代謝組學中最為活躍的研究領域之一。 萬事萬物都存在著辯證,盡管我們對高血脂深惡痛絕,心痛它對我們身體的摧殘。但脂質卻又是人體無法舍棄的重要組成,少了它,生命將一團亂麻以至
長壽的代謝特征代謝組學研究的啟示
長生不老是人類自古以來的夙愿。 中國古代神話故事中,有菩提老祖的大品天仙訣,王母娘娘盛會上的蟠桃,太上老祖煉丹爐里的不老丹,還有妖怪們夢寐以求的唐僧肉都可以實現長生不老。在史學瀚海中,《史記》記載秦始皇東巡碣石,攜童男童女入海求仙,尋求長生不老藥;在現代科學中,衰老仍然是生物醫學領域熱門主題之
第三屆質譜論壇:質譜技術在組學研究中的應用
技術講座 沃特世科技(上海)有限公司技術專家 賈偉博士 來自沃特世科技(上海)有限公司技術專家賈偉博士帶來了題為《蛋白質結構質譜分析技術進行》的報告。賈博士在報告中重點介紹了蛋白質修飾分析、蛋白高級結構分析和蛋白差異構象分析這三方面內容。 蛋白質修飾分析 蛋白質
島津LCMS9030-QTOF質譜儀重新定義脂質組學和糖組學研究
分析測試百科網訊 近日,島津和PREMIER Biosoft宣布利用LCMS-9030四極桿飛行時間質譜系統推出的脂質組學和糖組學數據分析軟件解決方案。 兩家公司表示,他們將支持彼此的技術相結合,推進脂質組學和糖組學研究。LCMS-9030四極桿飛行時間質譜系統 與PREMIER Biosof
質譜技術在蛋白組研究中的應用(二)
6 質譜儀的最新進展?用質譜檢測蛋白,首先考慮到用PMF與 MALDI-TOF聯用,如果無法檢測,下一步就用ESI-MS/MS創建序列標簽。在PMF分析中,MALDI的平板中只需一小部分樣本就足以檢測,剩下的樣本就可以用來創建序列標簽。并且,在MALDI-TOF儀器上,用一種叫做“源后延遲”
CASMS分研討會:質譜技術在脂質組學的應用現狀和進展
分析測試百科網訊 美國東部時間2021年8月11日,首屆美國華人質譜學會(CASMS)學術研討會在線上討論了“Novel advances and current status of mass spectrometry-enabled lipidomics”主題。該主題邀請了6名卓越的質譜學者發
PB反應結緣小型質譜,脂質組學研究再添利器
近日,Nature Methods雜志(IF25.06)報道了清華大學歐陽證教授和瑕瑜教授在質譜小型化及脂質同分異構體研究領域取得的研究進展。圖片來源于Nature Methods PB反應解鎖脂類C=C雙鍵位置 哺乳動物細胞脂質組中含有較多的同分異構體,這對于脂質的定量和分析是一個挑戰。近
高分辨質譜脂質輪廓譜表征用于食品組學研究中...(一)
1. 前言食品組學(Foodomics)是食品科學中的一門新興學科,它通過運用或整合各種先進組學技術(-Omics)來研究食品與營養學中的相關科學問題,從而改善消費者的福祉與健康 [1]。按照研究目的與對象體系的不同,食品組學能從基因組學、蛋白組學與代謝組學等不同組學角度實施,可廣泛應用于食品產地溯
臨床代謝組學研究常見問題
分享一些我們舉辦完第一期微信公開課——臨床代謝組學研究策略后,所收集到的常見問題,供大家學習和參考。Q:如何設置驗證集和測試集?A:按我理解你想問的問題是:training set訓練集和test set測試集的設置問題。我們做分析化學、生物化學或者分子生物學的初學者通常會混淆這幾個數據集概念,通常
與轉錄組學和蛋白組學比較,代謝組學有何優點
那年夏天Forever與轉錄組學和蛋白組學比較,代謝組學有以下優點:①代謝組學放大了基因和蛋白表達的微小變化,從而使檢測更容易;②代謝組學的研究不需建立全基因組測序及大量表達序列 標簽(EST)的數據庫,且代謝產物的種類要遠小于基因和蛋白的數目.③ 由于給定的代謝產物在每個組織中都是一樣的,所以研究
蛋白質組學在植物科學研究中的應用
1 植物群體遺傳蛋白質組學 1.l 遺傳多樣性蛋白質研究基于基因組學的一些遺傳標記,如RAPD(Random Amplified Polymorphic DNA)、RFLP(Restriction Fragment Length Polymorphism)、SSR(Simple Sequen
質譜在蛋白質組學中的應用實驗
實驗材料 冷凍干燥樣品試劑、試劑盒 校準標準品基質溶液甲醇儀器、耗材 MALDI 質譜儀MALDI 板實驗步驟 1.吸取 0.5ul 的基質溶液,加到 MALDI-MS 分析所用的金屬樣品板上的樣品孔中(為了準確起見,請使用2ul 的移液器)。2.在基質干燥之前,迅速加入 0.5ul 的標準品或樣品
質譜在蛋白質組學中的應用實驗
方案1 蛋白質和多肽 MALDI-MS 分析的一般方法 方案2 反相微型層析柱的制備實驗 方案3 固定化酶微型層析柱的制備 方案4 用于蛋白質組分析的微毛細管 HPLC 色譜及 ESI —體化裝置的制備和使用 方案5 利用 Nano-LC
Agilent將與新加坡國立大學合作推進脂類代謝組學研究
2011年3月29日 紐約(GenomeWeb新聞)—安捷倫科技和新加坡國立大學(NUS)今天宣布,將合作推進脂類代謝組學領域的研究進展。此次合作的目標是開發出新的分析解決方案,使研究人員可以更好的了解疾病的狀況。 按照合作協議,安捷倫將提供測試儀器,包括使用機器人系統從復雜混合
GCMS-HRAM-代謝組學數據庫-探索代謝組學的奧秘
鹽城4公分厚外墻巖棉板報價 巖棉制品是以精選的優質玄武巖為主要原料、經沖天爐熔化后,采用的四輥離心制棉工序,將玄武巖高溫熔體甩扭成4-7μm的非連續性纖維,再在巖棉纖維中加入一定量的粘結劑、防塵油、憎水劑,經過沉降、固化、切割等工藝,根據不同用途制成棉氈、半硬板、保溫帶、管殼等系列產品。
單細胞脂質組學技術的機制及意義
5月17日,清華大學精密儀器系質譜研究團隊發文報道基于質譜的單細胞脂質組精細結構表征技術,實現了哺乳動物單細胞內脂質的大規模精細結構分析,解決了單細胞質譜領域長期面臨的關鍵技術挑戰。基于單細胞內多種類型脂質異構體的鑒定與相對定量,該團隊實現了野生型非小細胞肺癌(HCC827)細胞群體中耐藥細胞的
“蛋白質組學/脂質組學研究進展網絡研討會”-第一輪通知
分析測試百科網訊 自從精準醫學概念提出以來,組學研究一直都是全球最熱的研究領域,其技術在臨床醫學、生物醫藥和食品安全等領域都占據十分重要的作用。2016年初,中國發起了精準醫學研究專項課題,目標在2017年至2019年構建重大疾病的預防診斷和治療大數據平臺,推動一批精準治療藥物和分子檢測產品進入
代謝組學新工具:METLIN
METLIN是由美國Scripps研究院Gary J Patti和Gary Siuzdak開發出的新型數據庫,將能用于解決代謝組學等領域研究中關于數據處理這個大問題。 超過上萬個代謝物 目前METLIN包括有超過10,000個代謝產物中帶有詳細,高分辨率串聯質譜信息的六萬化合物,
氨基酸和脂質預測糖尿病風險在代謝組學病例對照研...1
氨基酸和脂質預測糖尿病風險在代謝組學病例對照研究結果的應用近期,一項長達10年的巢試病例對照研究顯示,可以利用氨基酸和脂質的代謝變化來預測妊娠期患糖尿病(gestational diabetes mellitus,GDM)的女性,在產后患2型糖尿病(type 2 diabetes,T2D)的
氨基酸和脂質預測糖尿病風險在代謝組學病例對照研...2
通過T2D組與非T2D組對照,發現37個代謝產物表達差異有統計學意義(FDR < 0.05),其中23個表達上調,14個表達下調,這些差異代謝物有以下特征:①戊糖是增加最顯著的代謝物。②氨基酸代謝在T2D和非T2D對照中也有變化:11個氨基酸(組氨酸、異亮氨酸、絲氨酸、酪氨酸、亮氨酸、蛋氨酸