清華教授NatCommun發表論文：質譜的單細胞脂質組學分析
單細胞分析是研究細胞異質性的關鍵技術，對生物學過程研究及新藥研發有著重要意義。目前，單細胞基因組學技術較為成熟，單細胞轉錄組學和蛋白組學分析技術近年來獲得較多關注和投入。與其他組學相比，單細胞脂質組學分析剛剛起步，面臨諸多技術難點。由于脂質數量龐大，結構復雜，其在單細胞層面的結構表征和定量分析頗具挑戰。質譜儀因其高靈敏度、高特異性和準確定量能力，已成為單細胞脂質組分析的主要技術。然而，單個細胞內脂質等代謝物的精細結構鑒定（如碳碳雙鍵位置和sn-位置）與定量分析仍面臨著巨大挑戰。 脂質的結構異常復雜，根據頭基的不同，可將脂質劃分為不同類型。此外，脂質的脂肪酸鏈（fatty acyl chain）、脂肪酸鏈位置（sn-position）、碳碳雙鍵位置（C=C location）、雙鍵幾何構型（cis/trans）等結構特征均可變化，造成脂質異構體數量繁多。近年來，研究者們開發了多項技術，用于脂質的精細結構鑒定，包括臭氧誘導解......閱讀全文
第三屆質譜論壇：質譜技術在組學研究中的應用
技術講座 沃特世科技（上海）有限公司技術專家 賈偉博士 來自沃特世科技（上海）有限公司技術專家賈偉博士帶來了題為《蛋白質結構質譜分析技術進行》的報告。賈博士在報告中重點介紹了蛋白質修飾分析、蛋白高級結構分析和蛋白差異構象分析這三方面內容。 蛋白質修飾分析 蛋白質
1200萬！南京農業大學采購單細胞蛋白質組學質譜
近日，南京農業大學發布2022年11月政府采購意向，計劃以1200萬元預算采購單細胞蛋白質組學質譜。詳情如下：單細胞蛋白質組學質譜項目所在采購意向：南京農業大學2022年11月政府采購意向采購單位：南京農業大學采購項目名稱：單細胞蛋白質組學質譜預算金額：1200.000000萬元(人民幣)采購品目：
《Nature》：新方法提高單細胞蛋白質組學質譜定量準確度
單細胞蛋白質組學在蛋白豐度檢測、轉錄修飾和翻譯后修飾方面填補了單細胞轉錄組學的空白。單細胞蛋白質組學質譜（SCoPE-MS）是近年來興起的一種定量分析多功能單細胞蛋白質組的方法，這種方法采用同位素標記和載體蛋白質組學來分析單個細胞【1】。同位素標記具有相同質量的化學標簽，其中包含了獨特的質量條碼
島津超快速質譜助力靶向代謝組學研究
靶向代謝組學中，通常需要同時檢測多個目標組分，這對質譜數據的采集速度提出了很高的要求。 島津超快速質譜（UFMS）擁有業內首屈一指采集速度。以LCMS-8050為例，其駐留時間（Dwell time≥0.8 ms）、切換時間（Pause time≥1 ms）、掃描速度（Scan s
華盈視角：蛋白質組學——質譜技術
蛋白質作為功能的直接執行者，在生物醫學領域中有著重要意義，檢測蛋白質表達、修飾、互作等有助于我們理解生命機體的各類機制和活動規律，為疾病的治療、診斷，藥物的開發、優化等提供有力的支持。質譜技術作為檢測蛋白質組學的主流技術，有必要了解其核心原理，才能更好的服務于科學問題的解決。1.質譜的原理： 質譜是
島津超快速質譜助力靶向代謝組學研究
靶向代謝組學中，通常需要同時檢測多個目標組分，這對質譜數據的采集速度提出了很高的要求。??島津超快速質譜（UFMS）擁有業內首屈一指采集速度。以LCMS-8050為例，其駐留時間（Dwell time≥0.8 ms）、切換時間（Pause time≥1 ms）、掃描速度（Scan speed≤3
經典脂質組學增加保留時間算法實現精準定性
假陽性峰多？脂質數量不準確？定性結果有疑點？你了解的常規非靶脂質組檢測是怎樣的呢？會不會有以上情況發生。下面就讓我來告訴你這些問題如何解決吧~01經典脂質組?脂質組學（lipidomics）是對生物體、組織或細胞中的脂質以及與其相互作用的分子進行全面系統的分析、鑒定，了解脂質的結構和功能，進而揭示脂
強強聯合（脂質組+DIA），IF>10（一）
脂質組學技術?相比其他組學技術，脂質組學技術發展較晚，新穎性高，僅僅只是純數據分析也可以發表在不錯的期刊上。如果希望研究得更高深入，可以往下游脂質功能或者往上游的蛋白或基因出發研究脂代謝調控機制。DIA技術 新一代、革命性的蛋白質組技術DIA,相比傳統的蛋白質組技術（shotgun，Label fr
強強聯合（脂質組+DIA），IF>10（二）
5.聚類分析為了進一步識別人群隊列中潛在的相似代謝，基于KODAMA值進行partition around medoids clustering分析，鑒定到4個cluster(A,B,C,D)。比較有意思的是，不同cluster的PEs的發生具有顯著差異，分別是Cluster A：71%，Clust
PNAS脂質組學揭示病毒感染引起的脂代謝異常潛在治療靶
關鍵詞：埃博拉病毒，脂質組學，治療靶點，脂質代謝 2014年，非洲爆發了有史以來最兇猛的一次埃博拉病毒疫情，震動全球。直到年底，疫情才終于得到控制。根據世衛組織的統計數字，截至2014年12月14日，全球范圍內已有超過1.8萬例感染者，近7000人死亡。因為疫情影響農業生產和貿易，西非疫區
第二次會議通知－|－2024國際脂質組學會議暨深圳醫科院結構脂質組學研討會
由國際脂質組學學會委托清華大學深圳國際研究生院、深圳醫學科學院及深圳清華大學研究院主辦，清譜科技（蘇州）有限公司協辦的《第三屆國際脂質組學學會會議暨深圳醫科院結構脂質組學研討會》（The 3rd International Lipidomics Society Conference & SMAR
定量蛋白質組學質譜采集技術進展（四）
無論是相對定量還是絕對定量方法,DIA很好地克服了DDA鳥槍法和SRM目標監測的種種不足, 在定量蛋白質組學中具有良好的應用前景。然而,目前DIA 方法的循環時間仍然較長,只能與納流液相聯用,并使用較長的梯度以獲得足夠的色譜峰寬,限制了DIA 的應用范圍。這也是DIA 技術下一步需要解決
定量蛋白質組學質譜采集技術進展（三）
然而PRM 的分析通量不如SRM。PRM 能同時監測最多10 ~15 個母離子,而SRM 能同時監測上百個離子對,因為高分辨質譜的有效掃描速度通常只有10 ~15 Hz,遠慢于SRM 的有效掃描速度。但是這一問題正逐步得到解決,多重累積(Multiplexing, MSX)技術的發展和使用有
定量蛋白質組學質譜采集技術進展（二）
同步母離子選擇(Synchronous precursor selection, SPS)技術的出現徹底解決了MS3 響應弱的問題。SPS 技術利用多頻切跡的選擇波形電壓(MultiNotch) [27] ,在線性離子阱中實現一次選擇同時獲得多個離子,最多可同時選擇15 個(圖2A)。利用這一原理,
定量蛋白質組學質譜采集技術進展（一）
摘要 質譜是定量蛋白組學的主要工具。近年來隨著定量蛋白質組學研究的深入,傳統質譜定量技術面臨著復雜基質干擾、分析通量限制等諸多問題。而最近一系列質譜新技術的發展,包括同步母離子選擇(SPS)、質量虧損標記、平行反應監測(PRM)、多重累積(MSX)和多種全新數據非依賴性采集(DIA)等,為解決目前蛋
ZenoTOF?－7600系統:揭開脂質結構神秘面紗，提供組學新視角
代謝組學和脂質組學已越來越成為生命科學研究的關鍵手段，然而脂質分子的精準結構闡釋、低豐度代謝物的準確定性和定量，依然存在挑戰。以花生四烯酸為例，其學名為二十碳四烯酸，屬Omega6族長鏈多元不飽和脂肪酸，這種具有四個雙鍵的20碳脂肪酸于1909年由 Percival Hartley 從哺乳動物組織中
品茗論譜－|－第一屆杭州西子質譜沙龍——大數據背景下的質譜組學研究
2024年4月2日，SCIEX舉辦的“第一屆杭州西子質譜沙龍——大數據背景下的質譜組學研究”在春意盎然的西湖畔順利落幕。來自復旦大學的特聘教授唐惠儒教授和西湖大學郭天南教授、浙江大學的徐飛教授和王保紅教授等浙江省內30余位質譜專家學者蒞臨沙龍；來自SCIEX全球和中國區的領導也參加沙龍交流。?沙龍伊
脂質組學揭示病毒感染引起的脂代謝異常及潛在治療靶點
關鍵詞：埃博拉病毒，脂質組學，治療靶點，脂質代謝 2014年，非洲爆發了有史以來最兇猛的一次埃博拉病毒疫情，震動全球。直到年底，疫情才終于得到控制。根據世衛組織的統計數字，截至2014年12月14日，全球范圍內已有超過1.8萬例感染者，近7000人死亡。因為疫情影響農業生產和貿易，西非疫區
脂質組學揭示病毒感染引起的脂代謝異常及潛在治療靶點
2014年，非洲爆發了有史以來最兇猛的一次埃博拉病毒疫情，震動全球。直到年底，疫情才終于得到控制。根據世衛組織的統計數字，截至2014年12月14日，全球范圍內已有超過1.8萬例感染者，近7000人死亡。因為疫情影響農業生產和貿易，西非疫區國家將有百萬人面臨饑荒威脅。埃博拉病毒通常通過血液和其他體液
島津LCMS9030－QTOF質譜儀重新定義脂質組學和糖組學研究
分析測試百科網訊 近日，島津和PREMIER Biosoft宣布利用LCMS-9030四極桿飛行時間質譜系統推出的脂質組學和糖組學數據分析軟件解決方案。 兩家公司表示，他們將支持彼此的技術相結合，推進脂質組學和糖組學研究。LCMS-9030四極桿飛行時間質譜系統 與PREMIER Biosof
布魯克最新發布－|－4D代謝組學和4D脂質組學新突破
新型VIP-HESI離子源將4D-代謝組學、4D-脂質組學和小分子定量篩選工作流程的靈敏度提高了10倍以上； 數據庫全新發布包含CCS值的代謝物數據庫METLIN-4D； 數據處理軟件集成了代謝物CCS值預測功能CCS-Predict Pro； 新款代謝組學軟件MetaboScape 20
基于液質聯用的單細胞蛋白質組學研究進展
摘要????蛋白質是細胞功能的主要執行者，由于其無法在體外進行擴增，單細胞蛋白質組學技術相較單細胞基因組學和轉錄組學技術而言發展相對滯后。傳統的蛋白質組學技術可獲得大量細胞蛋白表達的平均值，但忽略了細胞亞型及細胞異質性等信息。單細胞水平的蛋白質分析有助于闡明細胞不同表型與異質性的分子基礎。隨著質譜儀
質譜在組學中的應用
質譜在組學中的應用無疑是當前最熱門的，而且各種組學都廣泛深入的得到了開展。這其中有一些比較有特色的應用領域，最近十分熱門，它們前景如何？技術瓶頸在哪里？市場推廣還有哪些問題，值得相關專業人士思考。??? ? 質譜成像技術（Imaging MS）誕生了近20年，最早主要是在二次離子質譜（SIMS）領域
質譜學的產生與發展
質譜學的產生和發展過程已經經歷了一個多世紀。1898年維恩（W. Wien）首先實現了使一束正離子在電場和磁場中發生偏轉。1912年托馬遜（J. J.Thompson）利用此原理把氖20和22兩個同位素分開。1918年丹普斯特（J. Dempster）和1919年阿斯頓（F. W.Aston）制造了
安捷倫與貝勒醫學院建立代謝組學質譜中心
近日，安捷倫和貝勒醫學院表示，他們已在BCM's Alkek Center for Molecular Discovery開啟安捷倫卓越質譜中心。 安捷倫將為中心提供兩個質譜代謝工作系統：6495 三重四極桿 LC/MS和6550 iFunnel QTOF LC / MS系統，具有可切換的GC
《自然》子刊專題：蛋白質組學中的質譜
涉及到蛋白質組學分析的研究人員都知道蛋白質組學研究的技術路線有兩條，一條是以雙向電泳加生物質譜的方法鑒定生物體系中各種蛋白的表達譜以及各蛋白表達程度的相對變化，另一條路線就是多維色譜與生物質譜相結合的稱之為鳥槍法的技術路線。其中質譜分析技術（Mass spectrometry，MS）是蛋白質組學常用
高分辨質譜Orbitrap直擊靶標代謝組學新熱點
在生命科學奇妙世界里，基因、核酸、蛋白和小分子代謝產物構成了細胞生命活動的基本要素，以這些物質為基礎的諸多組學技術的發展，推動著生命科學研究不斷向前。 基因-蛋白-代謝-表型之間的互動成為生命科學研究中研究的范式?1?，研究成果可謂精妙紛呈、大放異彩。?圖1：基因-蛋白-代謝-表型之間的互動成為生命
自由基誘導解離（OAD）技術加速非靶向脂質組學研究
?本文由東京農工大學教授、MS-DIAL首席專家Dr. Hiroshi Tsugawa，島津工程師Hidenori Takahashi，日本理化研究所Haruki Uchino，日本慶應義塾大學Omega-3脂質組學專家Dr. Makoto Arita共同合作完成。文章發表于COMMUNICATIO
自由基誘導解離（OAD）技術加速非靶向脂質組學研究
本文由東京農工大學教授、MS-DIAL首席專家Dr. Hiroshi Tsugawa，島津工程師Hidenori Takahashi，日本理化研究所Haruki Uchino，日本慶應義塾大學Omega-3脂質組學專家Dr. Makoto Arita共同合作完成。文章發表于COMMUNICATION