科學家繪制水稻幼苗根葉單細胞轉錄圖譜
水稻幼苗葉和根的單細胞轉錄組二維UMAP圖與組織解剖圖 圖片來源：錢文峰等 中國科學院遺傳與發育生物學研究所錢文峰研究組應用單細胞轉錄組測序技術，獲得了水稻幼苗葉和根超過20萬個單細胞的轉錄組信息，利用細胞類型標記基因和原位雜交技術，對每個細胞的身份進行了鑒定，構建了水稻幼苗葉和根的單細胞轉錄圖譜。相關結果近日發表于《遺傳學和基因組學期刊》。 水稻作為重要的糧食作物，為全球一半以上的人口提供主糧；同時，水稻作為單子葉模式植物，其個體發育與細胞分化受到了科研人員持續和廣泛的關注。細胞功能的分化常常可以體現為基因表達的差異。新興的單細胞轉錄組測序技術使高通量探究細胞的功能分化成為可能。 錢文峰等構建了水稻幼苗葉和根的單細胞轉錄圖譜。基于該圖譜進一步發現，盡管葉和根的同種類型組織（如葉和根各自的維管組織，葉肉細胞和根皮層細胞）具有顯著的轉錄組相似性，葉和根表皮組織的轉錄組卻具有較大的差異，這可能與地上部和地下部表皮組織所處外......閱讀全文
科學家繪制水稻幼苗根葉單細胞轉錄圖譜
中國科學院遺傳與發育生物學研究所錢文峰研究組應用單細胞轉錄組測序技術，獲得了水稻幼苗葉和根超過20萬個單細胞的轉錄組信息，利用細胞類型標記基因和原位雜交技術，對每個細胞的身份進行了鑒定，構建了水稻幼苗葉和根的單細胞轉錄圖譜。相關結果近日發表于《遺傳學和基因組學期刊》。水稻幼苗葉和根的單細胞轉錄組
科學家繪制水稻幼苗根葉單細胞轉錄圖譜
水稻幼苗葉和根的單細胞轉錄組二維UMAP圖與組織解剖圖 圖片來源：錢文峰等 中國科學院遺傳與發育生物學研究所錢文峰研究組應用單細胞轉錄組測序技術，獲得了水稻幼苗葉和根超過20萬個單細胞的轉錄組信息，利用細胞類型標記基因和原位雜交技術，對每個細胞的身份進行了鑒定，構建了水稻幼苗葉和根的單細胞轉錄
花生光暗幼苗的單細胞轉錄組圖譜構建成功
原文地址：http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2024/3/518535.shtm近日，廣東省農業科學院作物研究所花生研究團隊與合作者，在花生光暗形態轉變的單細胞基因表達譜研究方面取得進展，成功構建的花生光暗幼苗的單細胞轉錄組圖譜。相關成果發表于《植物生物技術雜志》
轉錄圖譜的轉錄圖譜的意義
在于它能有效地反應在正常或受控條件中表達的全基因的時空圖。通過這張圖可以了解某一基因在不同時間不同組織、不同水平的表達；也可以了解一種組織中不同時間、不同基因中不同水平的表達，還可以了解某一特定時間、不同組織中的不同基因不同水平的表達。人類基因組是一個國際合作項目：表征人類基因組，選擇的模式生物的D
轉錄圖譜的原理
所有生物性狀和疾病都是由結構或功能蛋白質決定的，而已知的所有蛋白質都是由mRNA編碼的，這樣可以把mRNA通過反轉錄酶合成cDNA或稱作EST的部分的cDNA片段，也可根據mRNA的信息人工合成cDNA或cDNA片段，然后，再用這種穩定的cDNA或EST作為“探針”進行分子雜交，鑒別出與轉錄有關的基
轉錄圖譜的定義
轉錄圖譜是在識別基因組所包含的蛋白質編碼序列的基礎上繪制的結合有關基因序列、位置及表達模式等信息的圖譜。在人類基因組中鑒別出占具2%~5%長度的全部基因的位置、結構與功能，最主要的方法是通過基因的表達產物mRNA反追到染色體的位置。
水稻幼苗或其它禾木科植物提取
實驗概要本實驗以水稻幼苗(禾本科)、李(蘋果)葉子為材料，學習基因組DNA提取的一般方法。實驗原理基因組DNA的提取通常用于構建基因組文庫、Southern雜交(包括RFLP)及PCR分離基因等。利用基因組DNA較長的特性，可以將其與細胞器或質粒等小分子DNA分離。加入一定量的異丙醇或乙醇，基因組的
借助人工氣候箱研究高產水稻幼苗的耐冷性
華南雙季稻區早稻育秧期問常常會遇到低溫侵襲而發生爛秧死苗, 過去對爛秧的原因和防止的途徑以前也有所介紹。近年來, 生產上推廣薄膜育秧技術, 使發生爛秧死苗的狀況得到緩解, 但仍未根除, 每遇強低溫的威脅仍有不少秧苗遭受傷害。所以, 要獲得早稻高產穩產, 抵抗低溫、培育壯秧就是首先要面對的課題。在實驗
水稻多器官單細胞多組學圖譜問世
記者楊舒從中國農業科學院生物技術研究所獲悉，該所作物耐逆性調控與改良創新團隊日前聯合國內外研究機構，構建了首個水稻的多器官單細胞多組學圖譜，系統解析了水稻不同細胞類型的功能及其對復雜性狀的調控作用，有力助力水稻設計育種。相關研究成果近日發表在國際學術期刊《自然》上。 單細胞組學是近年來生命科學
家蠶絲腺單細胞轉錄組圖譜繪成
中新網重慶6月15日電 (記者 鐘旖)記者15日從家蠶基因組生物學國家重點實驗室(西南大學)獲悉，我國家蠶研究又有新進展。該實驗室徐漢福教授課題組近日在國際知名期刊Nature Communications《自然通訊》上發表相關主題研究論文，以單細胞分辨率揭示了家蠶絲腺的全細胞異質性及其基因轉
首個萬份水稻群體變異圖譜發布
原文地址：http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2023/10/510525.shtm
首個萬份水稻群體變異圖譜發布
近日，中國農業科學院基因組研究所聯合海南三亞崖州灣實驗室、中國水稻研究所和河南大學等單位在《核酸研究》上在線發表了全球首個萬份水稻群體變異圖譜。 水稻是世界上最重要的糧食作物之一，其自然變異是基因改良和現代育種的重要遺傳基礎，因此廣泛挖掘水稻種質群體中的豐富變異具有重要意義。近年來，稀有變異對
首個水稻全景定量蛋白質組圖譜發布
中國農業科學院生物技術研究所近日聯合國內多家單位，共同繪制了水稻全景定量蛋白質組圖譜，為水稻的基因功能研究提供了重要的蛋白質表達量資源，也為基因組學、蛋白質組學等多組學數據支撐作物智能設計育種提供了新思路。相關研究成果發表在國際期刊《自然植物》上。植物的所有組織、器官中都富含蛋白質，它是構成細胞和生
首個水稻全景定量蛋白質組圖譜發布
中國農業科學院生物技術研究所近日聯合國內多家單位，共同繪制了水稻全景定量蛋白質組圖譜，為水稻的基因功能研究提供了重要的蛋白質表達量資源，也為基因組學、蛋白質組學等多組學數據支撐作物智能設計育種提供了新思路。相關研究成果發表在國際期刊《自然植物》上。 植物的所有組織、器官中都富含蛋白質，它是構成
Science：構建出真渦蟲細胞類型轉錄組圖譜
真渦蟲是一類相對簡單的動物，具有不同尋常的生物學特征：成年真渦蟲維持著其他有機體僅在胚胎中短暫存在的發育信息和祖細胞（progenitor cell）。真渦蟲獲得人們的大量研究，部分原因在于它們具有再生丟失的或受損的身體部位的獨特能力。圖片來自Christopher Fincher/Whiteh
人腦多區域時空發育轉錄組圖譜獲解析
原文地址：http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2023/12/514996.shtm
人腦多區域時空發育轉錄組圖譜獲解析
科學家通過單細胞和時空轉錄組研究，首次解析迄今為止跨時間點最廣（GW6-GW23）、面積最大（最大4cm x 3cm）的人腦多區域時空發育轉錄組圖譜，為解碼人腦發育及區域特化研究提供了新見解。日前，相關研究成果發表在《細胞》上。 腦是人類最復雜和神秘的器官。解剖學上，腦可以被劃分為不同的區域，
科學家揭示水稻轉錄因子高產抗病調控機制
近日，《科學》在線發表了四川農業大學陳學偉團隊、中科院遺傳與發育生物學研究所李家洋院士團隊及美國加州大學戴維斯分校Pamela Ronald團隊合作在水稻產量與抗病協同調控機制研究領域取得的最新進展，揭示了水稻理想株型建成的關鍵基因IPA1既能提高產量又能提高稻瘟病抗性的調控新機制。 高產抗病
構建水稻基因組倒位變異圖譜
近日，中國農業科學院深圳農業基因組研究所聯合國內多家單位發布了迄今為止最大的水稻群體水平倒位變異圖譜，并挖掘獲得了新的水稻耐熱優異等位基因，該研究對水稻育種改良具有重要意義。相關研究成果發表在《科學通報（Science Bulletin）》上。 水稻中的基因組倒位變異是指染色體上的DNA序列發
楊樹次生木質部單細胞轉錄組圖譜建立
近日，北京林業大學教授張德強團隊在《植物生物技術雜志》發表研究論文。該研究以楊樹為研究模式，利用單細胞測序技術、基因組分析、RNA原位雜交、愈傷組織遺傳轉化等技術建立了楊樹次生木質部的單細胞轉錄組圖譜，重構了完整的楊樹次生木質部細胞類群，鑒定了調控木質部發育過程的關鍵轉錄因子，系統解答了次生木質
Science重要成果：人類癌癥反轉錄轉座子圖譜
在人類基因組中，稱為反轉錄轉座子(retrotransposon)的小DNA元件通過自我復制和重新插入到基因組的多個位點從而具有造成突變性破壞的潛力。正常的成人細胞通過抑制機制阻止這些元件四處跳躍，然而根據發表在6月28日《科學》(Science)雜志上的一篇研究報道，這些機制在某些癌癥中可能發
復旦大學Nature子刊繪制大鼠轉錄組圖譜
來自復旦大學、美國食品藥品監督管理局(FDA)國家毒理學研究中心、洛馬林達大學等機構的研究人員，成功繪制出了涵蓋11種器官和4個發育階段的大鼠RNA測序轉錄組圖譜，這一重要的研究成果發表在2月10日的《自然通訊》(Nature Communications)雜志上。 復旦大學的石樂明(
靈長類原腸胚期至早期器官發育轉錄組圖譜繪制
安徽醫科大學國家衛生健康委配子及生殖道異常研究重點實驗室教授蔣祥祥，與中科院動物研究所王紅梅、郭帆團隊，美國得克薩斯大學西南醫學中心吳軍團隊合作，繪制了食蟹猴CS8-CS11時期（E20-E29）胚胎的單細胞轉錄組圖譜。相關研究成果近日發表于《自然》。 上世紀早期，科學家將人類胚胎發育的前60
種子與幼苗實驗
實驗材料蠶豆? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ?? 菜豆 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ?豌豆 ? ? ? ?
種子與幼苗實驗
實驗材料蠶豆菜豆豌豆花生蓖麻或油桐種子玉米小麥水稻果實；小麥水稻穎果切片；大豆菜豆花生豌豆蓖麻小麥水稻玉米的幼苗試劑、試劑盒I-KI溶液1%番紅染液儀器、耗材顯微鏡解剖鏡培養皿刀片鑷子解剖針載玻片蓋玻片擦鏡紙紗布實驗步驟一、種子的結構與類型種子是種子植物的生殖器官，萌發后形成幼苗。1.菜豆、蠶豆、蓖
上海生科院等建立小鼠早期胚胎空間轉錄組圖譜
3月22日，國際學術期刊《細胞》子刊《發育細胞》在線發表了中國科學院上海生命科學研究院生物化學與細胞生物學研究所景乃禾研究組與中國科學院-馬普學會計算生物學伙伴研究所韓敬東研究組合作的最新研究成果“Spatial Transcriptome for the Molecular Annotatio
研究人員繪制七鰓鰻單細胞轉錄組圖譜
雷氏七鰓鰻作為現存的無頜脊椎動物代表，是一種由無脊椎動物向脊椎動物進化的過渡類型，被視為研究脊椎動物演化的重要模式生物。近日，華大生命科學研究院聯合遼寧師范大學七鰓鰻研究中心等單位在《自然—通訊》發表最新研究成果，團隊基于華大自主研發的DNBelab C4和 DNBSEQ測序平臺，采用單細胞RNA測
單細胞轉錄組測序構建胸腺器官發生的分子圖譜
2019年10月8日，四川大學胡洪波研究組、解放軍總醫院第五醫學中心劉兵研究組與暨南大學基礎醫學院蘭雨研究組合作在Immunity雜志在線發表了題為“Single-cell RNA Sequencing Resolves Spatiotemporal Development of Pre-thy
科學家構建小麥籽粒發育中的轉錄調控圖譜
近日，中國農業科學院作物科學研究所研究員路則府團隊在《生物技術通報（英文）》（aBIOTECH）發表了文章，構建了小麥籽粒發育不同階段的全基因組染色質開放圖譜以及基因表達圖譜，并對小麥籽粒發育中關鍵轉錄因子的調控網絡進行了解析，揭示了小麥籽粒發育中亞基因組的分化調控，同時發掘了共調控淀粉與蛋白合成的
科學家繪制大腦星形膠質細胞轉錄因子功能圖譜
在大腦中，除了神經元，還住著數量龐大的星形膠質細胞，它們如同守護星一樣，維持神經元正常運作。但當大腦生病，如患上阿爾茨海默病，這些“守護星”也會“黑化”，反而加速神經元死亡。 如何“馴化”星形膠質細胞，讓它們重新成為大腦的修復者？關鍵在于找到控制它們行為的“開關”——轉錄因子。它們就像細胞里的