胞化學基礎?氫鍵的鍵能數據
氫鍵的結合能是2—8千卡（Kcal）。氫鍵是一種比分子間作用力（范德華力）稍強，比共價鍵和離子鍵弱很多的相互作用。其穩定性弱于共價鍵和離子鍵。常見氫鍵的平均鍵能與鍵長數據為：常見氫鍵的平均鍵能與鍵長 ......閱讀全文
胞化學基礎?氫鍵的鍵能數據
氫鍵的結合能是2—8千卡（Kcal）。氫鍵是一種比分子間作用力（范德華力）稍強，比共價鍵和離子鍵弱很多的相互作用。其穩定性弱于共價鍵和離子鍵。常見氫鍵的平均鍵能與鍵長數據為：常見氫鍵的平均鍵能與鍵長?
胞化學基礎?氫鍵
氫原子與電負性大的原子X以共價鍵結合，若與電負性大、半徑小的原子Y（O F N等）接近，在X與Y之間以氫為媒介，生成X-H…Y形式的一種特殊的分子間或分子內相互作用，稱為氫鍵。[X與Y可以是同一種類分子，如水分子之間的氫鍵；也可以是不同種類分子，如一水合氨分子（NH3·H2O）之間的氫鍵]。
胞化學基礎?氫鍵的分類
同種分子之間現以HF為例說明氫鍵的形成。在HF分子中，由于F的電負性（4.0）很大，共用電子對強烈偏向F原子一邊，而H原子核外只有一個電子，其電子云向F原子偏移的結果，使得它幾乎要呈質子狀態。這個半徑很小、無內層電子的帶部分正電荷的氫原子，使附近另一個HF分子中含有負電子對并帶部分負電荷的F原子有可
胞化學基礎?氫鍵的形成過程
氫鍵通常可用X-H…Y來表示。其中X以共價鍵（或離子鍵）與氫相連，具有較高的電負性，可以穩定負電荷，因此氫易解離，具有酸性（質子給予體）。而Y則具有較高的電子密度，一般是含有孤對電子的原子，容易吸引氫質子，從而與X和H原子形成三中心四電子鍵。成鍵原子典型的氫鍵中，X和Y是電負性很強的F、N和O原子。
胞化學基礎?氫鍵的影響作用
氫鍵對化合物熔點和沸點的影響分子間形成氫鍵時，化合物的熔點、沸點顯著升高。HF和H2O等第二周期元素的氫化物，由于分子間氫鍵的存在，要使其固體熔化或液體氣化，必須給予額外的能量破壞分子間的氫鍵，所以它們的熔點、沸點均高于各自同族的氫化物。值得注意的是，能夠形成分子內氫鍵的物質，其分子間氫鍵的形成將被
胞化學基礎?氫鍵的形成條件
在蛋白質的a-螺旋的情況下是N-H…O型的氫鍵，DNA的雙螺旋情況下是N-H…O，N-H…N型的氫鍵，因為這些結構是穩定的，所以這樣的氫鍵很多。此外，水和其他溶媒是異質的，也由于在水分子間生成O-H—…O型氫鍵。因此，這也就成為疏水結合形成的原因。（1） 存在與電負性很大的原子A 形成強極性鍵的氫原
胞化學基礎?氫鍵的理化特性
氫鍵通常是物質在液態時形成的，但形成后有時也能繼續存在于某些晶態甚至氣態物質之中。例如在氣態、液態和固態的HF中都有氫鍵存在。能夠形成氫鍵的物質是很多的，如水、水合物、氨合物、無機酸和某些有機化合物。氫鍵的存在，影響到物質的某些性質。熔沸點分子間有氫鍵的物質熔化或氣化時，除了要克服純粹的分子間力外，
胞化學基礎?二硫鍵的還原反應
二硫鍵最重要的一個特性就是它在還原劑作用下的裂解。使二硫鍵裂解的還原劑較多。在生物化學中，常用的還原劑有硫醇如β-硫基乙醇（β-mercaptoethanol，β-ME）或二硫蘇糖醇（DTT）。通常要使用過量硫醇試劑保證二硫鍵的完全裂解。其它還原劑還有三羥甲基氨基甲烷磷化氫液[ tris(2-car
胞化學基礎?氫鍵與分子間作用力概念辨析
關于氫鍵，論壇爭論最多的在于不同筆者對氫鍵與分子間作用力從屬關系的爭論。傳統定義，將分子間作用力定義為：“分子的永久偶極和瞬間偶極引起的弱靜電相互作用”。隨著研究的深入,發現了許多用現有分子間作用力的作用機理無法說明的現象。比如鹵鍵，有機汞鹵化物時觀察到分子內鹵素原子與汞原子之間存在長距離弱的共價相
化學鍵能數據庫iBonD在京發布
3月15日，清華大學基礎分子科學中心和南開大學元素有機化學國家重點實驗室程津培教授研究組在京發布了國際上首個涵蓋全面、數據可靠、使用快捷方便、專業權威的網絡版化學鍵能數據庫iBonD1.0版。 鍵能是化學領域中最基礎參數之一，因該參數直接反映出化合物的穩定性以及判斷化學反應是否能發生，從而成為
胞化學基礎?親水基
親水基又稱親水基團、疏油基團，具有溶于水，或容易與水親和的原子團。可能吸引水分子或溶解于水，這類分子形成的固體表面易被水潤濕。
細胞化學基礎?疏水鍵
疏水鍵是多肽鏈上的某些氨基酸的疏水基團或疏水側鏈（非極性側鏈），由于避開水而造成相互接近、粘附聚集在一起。它在維持蛋白質三級結構方面占有突出地位。
細胞化學基礎?疏水鍵的作用
蛋白質分子中許多氨基酸的疏水側鏈有形成疏水鍵的傾向，由于疏水效應，這些疏水殘基常被水驅入蛋白質分子內總聚集成簇，帶動肽鏈盤曲折疊，對蛋白質三、四級結構的形成和穩定起重要作用。
細胞化學基礎?二硫鍵簡介
二硫鍵（disulfide bond） 是連接不同肽鏈或同一肽鏈中，兩個不同半胱氨酸殘基的巰基的化學鍵。二硫鍵是比較穩定的共價鍵，在蛋白質分子中，起著穩定肽鏈空間結構的作用。二硫鍵數目越多，蛋白質分子對抗外界因素影響的穩定性就愈大。
細胞化學基礎?二硫鍵的功能
二硫鍵與蛋白質高級結構的生物活性有關，同時與蛋白質的復性也有關聯。如核糖核酸酶A經巰基乙醇（還原劑）和尿素（蛋白質變性劑）處理后，發生變性作用，4對二硫鍵斷裂，多肽鏈伸展開來，高級結構發生變化，失去生物活性。如果用透析法將大量還原劑和變性劑除去，在微量還原劑存在下，4對二硫鍵在原來的位置重新形成，伸
細胞化學基礎腺苷計算化學數據
疏水參數計算參考值（XlogP）：無氫鍵供體數量：4氫鍵受體數量：8可旋轉化學鍵數量：2互變異構體數量：3拓撲分子極性表面積：140重原子數量：19表面電荷：0復雜度：335同位素原子數量：0確定原子立構中心數量：4不確定原子立構中心數量：0確定化學鍵立構中心數量：0不確定化學鍵立構中心數量：0
化學鍵能數據庫iBonD向全球免費開放－減少重復性化學實驗
國際上首個網絡版化學鍵能數據庫iBonD正式上線。該數據庫是迄今為止國際上關于鍵能領域綜合度最高、收錄數目最多的大型數據庫，并免費向全球科研人員開放，同時支持PC端和移動端訪問。 3月15日上午，清華大學基礎分子科學中心和南開大學元素有機化學國家重點實驗室程津培院士研究組召開新聞發布會，宣布了
細胞化學基礎?疏水鍵的定義和特性
疏水鍵又稱疏水作用力。不是真正的化學鍵疏水鍵（hydrophobic bond）是兩個不溶于水的分子間的相互作用。當分子中烴基鏈與水接觸時，因不能被水溶劑化，界面水分子整齊地排列，導致系統熵值降低，能量增加，產生表面張力。為了克服表面張力，疏水基團會收縮、卷曲和結合，將原來規則排布于表面的水分子排擠
關于氫鍵的成鍵原子的相關介紹
氫鍵通常可用X-H…Y來表示。其中X以共價鍵（或離子鍵）與氫相連，具有較高的電負性，可以穩定負電荷，因此氫易解離，具有酸性（質子給予體）。而Y則具有較高的電子密度，一般是含有孤對電子的原子，容易吸引氫質子，從而與X和H原子形成三中心四電子鍵。 成鍵原子 典型的氫鍵中，X和Y是電負性很強的F、
細胞化學基礎黃嘌呤計算化學數據
1、 疏水參數計算參考值（XlogP）：-0.72、?氫鍵供體數量：33、 氫鍵受體數量：34、 可旋轉化學鍵數量：05、?互變異構體數量：156、 拓撲分子極性表面積（TPSA）：86.97、 重原子數量：118、 表面電荷：09、 復雜度：21710、?同位素原子數量：011、 確定原子立構中心
細胞化學基礎鳥嘌呤計算化學數據
1、疏水參數計算參考值（XlogP）：無2、氫鍵供體數量：33、氫鍵受體數量：24、可旋轉化學鍵數量：05、互變異構體數量：266、拓撲分子極性表面積：96.27、重原子數量：118、表面電荷：09、復雜度：22510、同位素原子數量：011、確定原子立構中心數量：012、不確定原子立構中心數量：0
哪些中性基團有氫鍵鍵合能力
一般來說，中性基團的氫鍵鍵合能力與原子的電負性和電子密度相關。以下是一些常見的中性基團，它們具有氫鍵鍵合能力：1. 酰胺基 (-CONH-)：酰胺基中的羰基原子處于電子虧損狀態，因此具有較高的電子親和力，可形成氫鍵。2. 羧基 (-COOH)：羧基中的羰基原子和氧原子都處于電子虧損狀態，因此也具有較
哪些中性基團有氫鍵鍵合能力
一般來說，中性基團的氫鍵鍵合能力與原子的電負性和電子密度相關。以下是一些常見的中性基團，它們具有氫鍵鍵合能力：1. 酰胺基 (-CONH-)：酰胺基中的羰基原子處于電子虧損狀態，因此具有較高的電子親和力，可形成氫鍵。2. 羧基 (-COOH)：羧基中的羰基原子和氧原子都處于電子虧損狀態，因此也具有較
哪些中性基團有氫鍵鍵合能力
一般來說，中性基團的氫鍵鍵合能力與原子的電負性和電子密度相關。以下是一些常見的中性基團，它們具有氫鍵鍵合能力：1. 酰胺基 (-CONH-)：酰胺基中的羰基原子處于電子虧損狀態，因此具有較高的電子親和力，可形成氫鍵。2. 羧基 (-COOH)：羧基中的羰基原子和氧原子都處于電子虧損狀態，因此也具有較
細胞化學基礎?二硫鍵的結構性質
二硫鍵結合能力較強，典型的二硫鍵鍵離解能為60 kcal/mol (251 kJ/mol)。由于二硫鍵比C-C鍵和C-H鍵弱40%左右，在許多分子中二硫鍵往往是”弱鍵”。此外，S-S鍵反映了二價硫的極化特性，容易被極性試劑（包括親電試劑和親核試劑，特別是親核試劑）切斷 。二硫鍵的長度約為2.05 A
細胞化學基礎?二硫鍵基本信息
在化學中，二硫鍵指結構為R-S-S-R '的官能團。二硫鍵通常由兩個硫醇基團耦合而成。在生物學中，兩個半胱氨酸殘基中硫醇基團間形成的二硫鍵是蛋白質二級結構和三級結構的重要組成部分。此鍵在蛋白質分子的立體結構形成上起著一定的重要作用。
細胞化學基礎腺苷一磷酸計算化學數據
疏水參數計算參考值（XlogP）：-2.7氫鍵供體數量5氫鍵受體數量：11可旋轉化學鍵數量：4互變異構體數量：3拓撲分子極性表面積（TPSA）：186重原子數量：23表面電荷：0復雜度：481同位素原子數量：0確定原子立構中心數量：4不確定原子立構中心數量：0確定化學鍵立構中心數量：0不確定化學鍵立
細胞化學基礎黃嘌呤物性數據
1. 性狀：白色鱗片狀或片狀結晶。2. 密度（g/mL,25/4℃）：不確定3. 相對蒸汽密度（g/mL,空氣=1）：不確定4. 熔點（oC）：3005. 沸點（oC,常壓）：不確定6. 沸點（oC, 5.2kPa）：不確定7. 折射率：不確定8.?閃點（oC）：不確定9.?比旋光度（o）：不確定1
氫鍵的結合能的計算
氫鍵的結合能是2—8千卡（Kcal）。氫鍵是一種比分子間作用力（范德華力）稍強，比共價鍵和離子鍵弱很多的相互作用。其穩定性弱于共價鍵和離子鍵。常見氫鍵的平均鍵能與鍵長數據為：
羥基能形成氫鍵，那么羧基能不能形成氫鍵
可以的。很多羧酸都以二聚體的形式存在，就是羧基之間形成了氫鍵。