細胞化學基礎結構域的基本分類
為了研究蛋白質分子結構的基本規律,人們用不同的方法從不同的角度對已知的蛋白質結構進行分類,有些是基于生物功能,有些是基于結構自身,有些是將二者結合在一起進行分類研究。例如,鋅金屬蛋白酶是一類可催化肽鏈內部肽鍵水解的肽鏈內切酶,盡管所屬的各個亞家族成員的整體空間結構差異顯著,但催化活性部位的結構非常類似,故將它們歸屬于一類蛋白。然而,最為人們熟悉的還是M.Levitt和C.Chothia對蛋白質結構進行的分類。此方法認為二級結構的組合構成了大多數結構域結構的核心,并據此把蛋白質結構分為四類:α型、β型、α/β型以及其它類型的結構域結構。α型結構域結構主要由α-螺旋所構成,例如肌紅蛋白的結構等。β型結構域結構主要由反平行的卜回折所構成,通常是兩個卜回折相互包裹在一起,例如質體蘭素的結構等。α/β型結構域結構則是由α-螺旋所包裹的以平行β-鏈為主的;β-α-β花樣所構成的,例如丙糖磷酸異構酶、葡萄糖異構酶催化結構域的結構等。還有一些蛋......閱讀全文
細胞化學基礎結構域的基本分類
為了研究蛋白質分子結構的基本規律,人們用不同的方法從不同的角度對已知的蛋白質結構進行分類,有些是基于生物功能,有些是基于結構自身,有些是將二者結合在一起進行分類研究。例如,鋅金屬蛋白酶是一類可催化肽鏈內部肽鍵水解的肽鏈內切酶,盡管所屬的各個亞家族成員的整體空間結構差異顯著,但催化活性部位的結構非常類
細胞化學基礎結構域的定義和分類
結構域(domain)是位于超二級結構和三級結構間的一個層次。結構域是在蛋白質的三級結構內的獨立折疊單元,通常都是幾個超二級結構單元的組合。在較大的蛋白質分子中,由于多肽鏈上相鄰的超二級結構緊密聯系,進一步折疊形成一個或多個相對獨立的致密三維實體,即結構域。結構域與分子整體以共價鍵相連,一般難以分離
細胞化學基礎βαβ結構域
中文名稱:β-α-β結構域英文名稱:β-α-β motif;betaalpha-beta motif定 義:蛋白質超二級結構之一,由β折疊-α螺旋-β折疊所構成的功能結構域。應用學科:細胞生物學(一級學科),細胞化學(二級學科)
細胞化學基礎結構域的性質
又稱基元。蛋白質分子的一種折疊單位,是較大的蛋白質分子或亞基三維折疊中的一個層次或一種相對獨立的三維實體。一條長鏈多肽鏈最后一步折疊就是結構域締合(association),而成一個有活性的蛋白質分子或亞基。在一級(維)結構中的氨基酸序列的某些區域相鄰的氨基酸殘基形成有規則的二級(維)結構(如α-螺
細胞化學基礎HMG框結構域
高速泳動族非組蛋白HMG1和HMG2有A、B和C 3個結構域:A、B結構相似,C含有酸性的羧基端尾部,與H1結合。RNA聚合酶Ⅰ相關的轉錄分子UBF的DNA結合結構域是85個氨基酸殘基的重復區,與HMG1和HMG2的A、B結構相似,所以這種特征性結構被命名為“HMG"結構域。中文名稱:HMG框結構域
細胞化學基礎螺旋袢螺旋結構域
中文名稱:螺旋-袢-螺旋結構域英文名稱:helix-loophelix motif定 義:存在于轉錄因子的DNA結合結構域中的一種蛋白質結構域。由兩個α螺旋和中間的一個袢組成,識別并結合特異的DNA序列。應用學科:細胞生物學(一級學科),細胞化學(二級學科)
細胞化學基礎螺旋轉角螺旋結構域
中文名稱:螺旋-轉角-螺旋結構域英文名稱:helix-turnhelix motif定 義:由兩個α螺旋間隔以一定角度的轉角構成的結構域。其中一個α螺旋可插入DNA大溝中與專一DNA序列結合。應用學科:細胞生物學(一級學科),細胞化學(二級學科)
細胞化學基礎衛星DNA的分類
衛星DNA按其浮力密度的大小可以分成I、Ⅱ、Ⅲ、Ⅳ四類,其浮力密度分別是1.687,1.693,1.697和1.700g/cm3。各類衛星DNA都是由各種不同的重復序列家族所組成。衛星DNA通常是串聯重復序列。衛星DNA按其重復單元的核苷酸的多少,可以分為兩類。一類是小衛星DNA(minisatel
細胞化學基礎核糖核酸分類
人體一個細胞含RNA約10pg(含DNA約7pg)。與DNA相比,RNA種類繁多,分子量較小,含量變化大。RNA可根據結構和功能的不同分為信使RNA和非編碼RNA。非編碼RNA分為非編碼大RNA和非編碼小RNA。非編碼大RNA包括核糖體RNA、長鏈非編碼RNA。非編碼小RNA包括轉移RNA、核酶、小
細胞化學基礎?作用力分類
定義:范德華力(又稱分子作用力)產生于分子或原子之間的靜電相互作用。其能量計算的經驗方程為:U =B/r12- A/r6?(對于2 個碳原子間,其參數值為B =11.5 ×10-6?kJ·nm12/mol ;A=5.96 × 10-3?kJ·nm6/mol;不同原子間A、B 有不同取值)當兩原子彼此
細胞化學基礎域的定義和分類
域(Domain),分類學術語,生物分類法中最高的類別。所有細胞生物原分為兩域:沒有核膜的生物(細菌和古細菌)被分入原核生物域,其他為真核生物域。Carl Woese 在 1977 年提出的生物分類中﹐將原核生物分成了兩大類﹐起初稱為真細菌(Eubacteria)和古細菌(Archaebacteri
細胞化學基礎?親水基得分分類
陰離子表面活性劑的親水基(團)有羧酸基、磺酸基、硫酸基與磷酸基等。陽離子表面活性劑有氨基、季銨基等。非離子表面活性劑有由含氧基團組成的醚基和羥基與羧酸酯、嵌段聚醚還有常見的醛基等。
細胞化學基礎α螺旋基本信息
α-螺旋(α-helix):蛋白質中常見的二級結構,肽鏈主鏈繞假想的中心軸盤繞成螺旋狀,一般都是右手螺旋結構,螺旋是靠鏈內氫鍵維持的。每個氨基酸殘基(第n個)的羰基與多肽鏈C端方向的第4個殘基(第4+n個)的酰胺氮形成氫鍵。在古典的右手α-螺旋結構中,螺距為0.54nm,每一圈含有3.6個氨基酸殘基
細胞化學基礎腺苷基本信息
中文名稱: 腺苷化學名稱:9-β-D-呋喃核糖基腺嘌呤英文名稱: AdenosineCAS號: 58-61-7分子式: C10H13N5O4分子量: 267.24CAS號:58-61-7MDL號:MFCD00005752EINECS號:200-389-9RTECS號:AU7175000BRN號:93
細胞化學基礎衛星DNA的基本信息
衛星DNA標記(microsatelliteDNA)是近十多年發展起來的一種新型的分子遺傳標記。它具有數量大、分布廣且均勻、多態信息含量高、檢測快速方便等特點,已經被廣泛應用于動、植物基因定位、連鎖分析、血緣關系鑒定、遺傳多樣性評估、系統發生樹構建、標記輔助選擇等方面。衛星DNA微衛星DNA又稱短串
細胞化學基礎線粒體DNA基本性質
與核基因組相比,線粒體基因組有如下性質:所有的基因都位于一個單一的環狀DNA分子上。遺傳物質不為核膜所包被。DNA不為蛋白質所壓縮。基因組沒有包含那么多非編碼區域(調控區域或“內含子”)。一些密碼子與通用密碼子不同。相反,與一些紫色非硫細菌相似。一些堿基為兩個不同基因的一部分(重疊基因):某堿基作為
細胞化學基礎黃嘌呤基本信息
中文名稱:黃嘌呤英文名稱:Xanthine別名名稱:3,7-二氫-1H-嘌呤-2,6-二酮;黃尿環; 黃嘌 2,6-二氧化嘌呤 ;海生丁; 黃花色精;2,6-Dihydroxypurine ;2,6-Dioxopurine ;2,6-Dioxo-1,2,3,6-tetrahydropurine分子式
結構域的分類
為了研究蛋白質分子結構的基本規律,人們用不同的方法從不同的角度對已知的蛋白質結構進行分類,有些是基于生物功能,有些是基于結構自身,有些是將二者結合在一起進行分類研究。例如,鋅金屬蛋白酶是一類可催化肽鏈內部肽鍵水解的肽鏈內切酶,盡管所屬的各個亞家族成員的整體空間結構差異顯著,但催化活性部位的結構非常類
胞化學基礎?氫鍵的分類
同種分子之間現以HF為例說明氫鍵的形成。在HF分子中,由于F的電負性(4.0)很大,共用電子對強烈偏向F原子一邊,而H原子核外只有一個電子,其電子云向F原子偏移的結果,使得它幾乎要呈質子狀態。這個半徑很小、無內層電子的帶部分正電荷的氫原子,使附近另一個HF分子中含有負電子對并帶部分負電荷的F原子有可
細胞化學基礎分配系數基本信息
一定溫度下,一種溶質分配在互不相溶的兩種溶劑中的濃度比值為一常數。分配定律可由下式表達:分配系數分配系數式中K為分配系數;?為溶質B在溶劑α中的濃度,?為溶質B在溶劑β中的濃度。在分配定律表達式中,溶質在不同溶劑中的濃度可以用“mol/L”或“g/L”為單位來表示。?分配系數可以近似地看做此物質在兩
細胞化學基礎黃嘌呤基本信息簡介
黃嘌呤(英語:xanthine)是一種廣泛分布于人體及其他生物體的器官及體液內的一種嘌呤堿,常用作溫和的興奮劑和支氣管擴張劑,特別用于治療哮喘癥狀。咖啡因、茶堿及可可堿(主要在巧克力中發現)等常見的溫和興奮劑均由黃嘌呤衍生出來。黃嘌呤也是嘌呤代謝後的產物,并會在黃嘌呤氧化酶的作用下轉換為尿酸。黃嘌呤
細胞化學基礎堿基
堿基,在化學中本是“堿性基團”的簡稱。有機物中大部分的堿性基團都含有氮原子,稱為含氮堿基,氨基(-NH2)是最簡單的含氮堿基。堿基,在生物化學中又稱核堿基、含氮堿基,是形成核苷的含氮化合物,核苷又是核苷酸的組分。堿基、核苷和核苷酸等單體構成了核酸的基本構件。核堿基間可以形成堿基對,且彼此堆疊,所以,
細胞化學基礎鋅指
鋅指是一種常出現在DNA結合蛋白質中的一種結構基元。鋅螯合在氨基酸鏈中形成鋅的指狀結構。鋅是某些酶的活性輔助因子,也是某些蛋白質,包括RNA聚合酶的轉錄因子,如TFIIIA(transcription factor III,Asubtype)、類固醇受體等能結合脫氧核糖核酸(DNA)的蛋白質亦含有鋅
細胞化學基礎α螺旋
α-螺旋(α-helix)是蛋白質二級結構的主要形式之一。指多肽鏈主鏈圍繞中心軸呈有規律的螺旋式上升,每3.6 個氨基酸殘基螺旋上升一圈,向上平移0.54nm,故螺距為0.54nm,兩個氨基酸殘基之間的距離為0.15nm。螺旋的方向為右手螺旋。氨基酸側鏈R基團伸向螺旋外側,每個肽鍵的肽鍵的羰基氧和第
細胞化學基礎β轉角
β-轉角是一種常見的蛋白質二級結構,它通常出現在球狀蛋白表面,因此含有極性和帶電荷的氨基酸殘基。
細胞化學基礎嘌呤
嘌呤(Purine),分子式C5H4N4,是一種雜環芳香有機化合物,是新陳代謝過程中的一種代謝物。
細胞化學基礎核酶
科學家在研究RNA的轉錄后加工時發現某些RNA有催化活性,可以催化RNA的剪接,這些由活細胞合成、起催化作用的RNA稱為核酶。許多核酶的底物也是RNA,甚至就是其自身,其催化反應也具有專一性。已經闡明的天然核酶有錘頭狀核酶、發夾狀核酶、I型內含子、Ⅱ型內含子、丁型肝炎病毒核酶、核糖核酸酶P、肽基轉移
細胞化學基礎腺苷
腺苷,是指由腺嘌呤的N-9與D-核糖的C-1通過β糖苷鍵連接而成的化合物,化學式為C10H13N5O4,其磷酸酯為腺苷酸。腺苷是一種遍布人體細胞的內源性核苷,可直接進入心肌經磷酸化生成腺苷酸,參與心肌能量代謝,同時還參與擴張冠脈血管,增加血流量。腺苷對心血管系統和肌體的許多其它系統及組織均有生理作用
細胞化學基礎?二硫鍵基本信息
在化學中,二硫鍵指結構為R-S-S-R '的官能團。二硫鍵通常由兩個硫醇基團耦合而成。在生物學中,兩個半胱氨酸殘基中硫醇基團間形成的二硫鍵是蛋白質二級結構和三級結構的重要組成部分。此鍵在蛋白質分子的立體結構形成上起著一定的重要作用。
細胞化學基礎β轉角的定義
β-轉角是一種常見的蛋白質二級結構,它通常出現在球狀蛋白表面,因此含有極性和帶電荷的氨基酸殘基。已經發現的蛋白質的抗體識別、磷酸化、糖基化和羥基化位點經常出現在轉角和緊靠轉交。在β-轉角中第一個殘基的C=O與第四個殘基的N-H氫鍵鍵合形成一個緊密的環,使β-轉角成為比較穩定的結構,多處在蛋白質分子的