細胞化學基礎結構域的性質
又稱基元。蛋白質分子的一種折疊單位,是較大的蛋白質分子或亞基三維折疊中的一個層次或一種相對獨立的三維實體。一條長鏈多肽鏈最后一步折疊就是結構域締合(association),而成一個有活性的蛋白質分子或亞基。在一級(維)結構中的氨基酸序列的某些區域相鄰的氨基酸殘基形成有規則的二級(維)結構(如α-螺旋、β-折疊、β-轉角和無規卷曲等);然后再把相鄰的二級結構片段集裝在一起,形成超二級結構;在此基礎上,多肽鏈再進一步折疊,或為近乎球狀的三維(級)結構而成(一個)結構域。對于一個較大球狀蛋白質分子來說,一條龐大的多肽鏈往往由兩個或兩個以上相對獨立的三維實體締合而成三維結構體。最常見的結構域約含有100~200個氨基酸殘基,一般至少40個、多的可至400個以上;對于較小的蛋白質分子或亞基,“結構域”和“三級結構”往往是一個概念,也就是說,這些蛋白質是屬于單結構域分子(如卵溶菌酶等)。從功能角度看,很多屬于多結構域的酶蛋白,其活性中心都......閱讀全文
細胞化學基礎結構域的性質
又稱基元。蛋白質分子的一種折疊單位,是較大的蛋白質分子或亞基三維折疊中的一個層次或一種相對獨立的三維實體。一條長鏈多肽鏈最后一步折疊就是結構域締合(association),而成一個有活性的蛋白質分子或亞基。在一級(維)結構中的氨基酸序列的某些區域相鄰的氨基酸殘基形成有規則的二級(維)結構(如α-螺
細胞化學基礎βαβ結構域
中文名稱:β-α-β結構域英文名稱:β-α-β motif;betaalpha-beta motif定 義:蛋白質超二級結構之一,由β折疊-α螺旋-β折疊所構成的功能結構域。應用學科:細胞生物學(一級學科),細胞化學(二級學科)
細胞化學基礎HMG框結構域
高速泳動族非組蛋白HMG1和HMG2有A、B和C 3個結構域:A、B結構相似,C含有酸性的羧基端尾部,與H1結合。RNA聚合酶Ⅰ相關的轉錄分子UBF的DNA結合結構域是85個氨基酸殘基的重復區,與HMG1和HMG2的A、B結構相似,所以這種特征性結構被命名為“HMG"結構域。中文名稱:HMG框結構域
細胞化學基礎螺旋袢螺旋結構域
中文名稱:螺旋-袢-螺旋結構域英文名稱:helix-loophelix motif定 義:存在于轉錄因子的DNA結合結構域中的一種蛋白質結構域。由兩個α螺旋和中間的一個袢組成,識別并結合特異的DNA序列。應用學科:細胞生物學(一級學科),細胞化學(二級學科)
細胞化學基礎螺旋轉角螺旋結構域
中文名稱:螺旋-轉角-螺旋結構域英文名稱:helix-turnhelix motif定 義:由兩個α螺旋間隔以一定角度的轉角構成的結構域。其中一個α螺旋可插入DNA大溝中與專一DNA序列結合。應用學科:細胞生物學(一級學科),細胞化學(二級學科)
細胞化學基礎結構域的基本分類
為了研究蛋白質分子結構的基本規律,人們用不同的方法從不同的角度對已知的蛋白質結構進行分類,有些是基于生物功能,有些是基于結構自身,有些是將二者結合在一起進行分類研究。例如,鋅金屬蛋白酶是一類可催化肽鏈內部肽鍵水解的肽鏈內切酶,盡管所屬的各個亞家族成員的整體空間結構差異顯著,但催化活性部位的結構非常類
細胞化學基礎結構域的定義和分類
結構域(domain)是位于超二級結構和三級結構間的一個層次。結構域是在蛋白質的三級結構內的獨立折疊單元,通常都是幾個超二級結構單元的組合。在較大的蛋白質分子中,由于多肽鏈上相鄰的超二級結構緊密聯系,進一步折疊形成一個或多個相對獨立的致密三維實體,即結構域。結構域與分子整體以共價鍵相連,一般難以分離
細胞化學基礎腺苷理化性質
密度:2.08 g/cm3熔點:234-236oC沸點:676.3oC閃點:362.8℃折射率:1.907外觀:白色結晶粉末溶解性:易溶于水,幾乎不溶于乙醇和乙醚
細胞化學基礎線粒體DNA基本性質
與核基因組相比,線粒體基因組有如下性質:所有的基因都位于一個單一的環狀DNA分子上。遺傳物質不為核膜所包被。DNA不為蛋白質所壓縮。基因組沒有包含那么多非編碼區域(調控區域或“內含子”)。一些密碼子與通用密碼子不同。相反,與一些紫色非硫細菌相似。一些堿基為兩個不同基因的一部分(重疊基因):某堿基作為
細胞化學基礎鳥嘌呤理化性質
密度:2.19g/cm3熔點:360℃沸點:561.5℃閃點:293.4℃logP:2.03折射率:2.047外觀:白色至淡黃色結晶性粉末溶解性:溶于氨水,氫氧化鉀水溶液、稀的酸類,微溶于醇、醚,幾乎不溶于水
細胞化學基礎二磷酸腺苷化學性質
1.常溫常壓下穩定2.避免的物料:水分/潮濕 氧化物
細胞化學基礎腺苷一磷酸理化性質
性狀: 白色結晶或粉末,無氣味,微咸。,濕敏感。密度(g/mL,25/4℃):2.2~2.4熔點(oC):197℃(分解)。沸點(oC,常壓):740.5~890.5比旋光度(o):[α]D20?-43±2°(C=0.5,0.5mol/L磷酸氫二鈉溶液中)。溶解性:微溶于乙醇和沸水,不溶于乙醚
細胞化學基礎?二硫鍵的結構性質
二硫鍵結合能力較強,典型的二硫鍵鍵離解能為60 kcal/mol (251 kJ/mol)。由于二硫鍵比C-C鍵和C-H鍵弱40%左右,在許多分子中二硫鍵往往是”弱鍵”。此外,S-S鍵反映了二價硫的極化特性,容易被極性試劑(包括親電試劑和親核試劑,特別是親核試劑)切斷 。二硫鍵的長度約為2.05 A
結構域的基本性質
又稱基元。蛋白質分子的一種折疊單位,是較大的蛋白質分子或亞基三維折疊中的一個層次或一種相對獨立的三維實體。一條長鏈多肽鏈最后一步折疊就是結構域締合(association),而成一個有活性的蛋白質分子或亞基。在一級(維)結構中的氨基酸序列的某些區域相鄰的氨基酸殘基形成有規則的二級(維)結構(如α-螺
結構域的基本性質
又稱基元。蛋白質分子的一種折疊單位,是較大的蛋白質分子或亞基三維折疊中的一個層次或一種相對獨立的三維實體。一條長鏈多肽鏈最后一步折疊就是結構域締合(association),而成一個有活性的蛋白質分子或亞基。在一級(維)結構中的氨基酸序列的某些區域相鄰的氨基酸殘基形成有規則的二級(維)結構(如α-螺
細胞化學基礎脫氧核糖核酸理化性質
DNA是高分子聚合物,其溶液為高分子溶液,具有很高的粘度,可被甲基綠染成綠色。DNA對紫外線(260nm)有吸收作用,利用這一特性,可以對DNA進行含量測定。當核酸變性時,吸光度升高,稱為增色效應;當變性核酸重新復性時,吸光度又會恢復到原來的水平。較高溫度、有機溶劑、酸堿試劑、尿素、酰胺等都可以引起
細胞化學基礎β轉角
β-轉角是一種常見的蛋白質二級結構,它通常出現在球狀蛋白表面,因此含有極性和帶電荷的氨基酸殘基。
細胞化學基礎嘌呤
嘌呤(Purine),分子式C5H4N4,是一種雜環芳香有機化合物,是新陳代謝過程中的一種代謝物。
細胞化學基礎腺苷
腺苷,是指由腺嘌呤的N-9與D-核糖的C-1通過β糖苷鍵連接而成的化合物,化學式為C10H13N5O4,其磷酸酯為腺苷酸。腺苷是一種遍布人體細胞的內源性核苷,可直接進入心肌經磷酸化生成腺苷酸,參與心肌能量代謝,同時還參與擴張冠脈血管,增加血流量。腺苷對心血管系統和肌體的許多其它系統及組織均有生理作用
細胞化學基礎α螺旋
α-螺旋(α-helix)是蛋白質二級結構的主要形式之一。指多肽鏈主鏈圍繞中心軸呈有規律的螺旋式上升,每3.6 個氨基酸殘基螺旋上升一圈,向上平移0.54nm,故螺距為0.54nm,兩個氨基酸殘基之間的距離為0.15nm。螺旋的方向為右手螺旋。氨基酸側鏈R基團伸向螺旋外側,每個肽鍵的肽鍵的羰基氧和第
細胞化學基礎核酶
科學家在研究RNA的轉錄后加工時發現某些RNA有催化活性,可以催化RNA的剪接,這些由活細胞合成、起催化作用的RNA稱為核酶。許多核酶的底物也是RNA,甚至就是其自身,其催化反應也具有專一性。已經闡明的天然核酶有錘頭狀核酶、發夾狀核酶、I型內含子、Ⅱ型內含子、丁型肝炎病毒核酶、核糖核酸酶P、肽基轉移
細胞化學基礎堿基
堿基,在化學中本是“堿性基團”的簡稱。有機物中大部分的堿性基團都含有氮原子,稱為含氮堿基,氨基(-NH2)是最簡單的含氮堿基。堿基,在生物化學中又稱核堿基、含氮堿基,是形成核苷的含氮化合物,核苷又是核苷酸的組分。堿基、核苷和核苷酸等單體構成了核酸的基本構件。核堿基間可以形成堿基對,且彼此堆疊,所以,
細胞化學基礎鋅指
鋅指是一種常出現在DNA結合蛋白質中的一種結構基元。鋅螯合在氨基酸鏈中形成鋅的指狀結構。鋅是某些酶的活性輔助因子,也是某些蛋白質,包括RNA聚合酶的轉錄因子,如TFIIIA(transcription factor III,Asubtype)、類固醇受體等能結合脫氧核糖核酸(DNA)的蛋白質亦含有鋅
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又稱基元。蛋白質分子的一種折疊單位,是較大的蛋白質分子或亞基三維折疊中的一個層次或一種相對獨立的三維實體。一條長鏈多肽鏈最后一步折疊就是結構域締合(association),而成一個有活性的蛋白質分子或亞基。在一級(維)結構中的氨基酸序列的某些區域相鄰的氨基酸殘基形成有規則的二級(維)結構(如α
細胞化學基礎α螺旋的功能
α-螺旋在DNA結合基序(DNA binding motifs)中有非常重要的作用,比如在鋅指結構,亮氨酸拉鏈,螺旋-轉角-螺旋等基序中都含有α-螺旋。這是因為α-螺旋的直徑為1.2nm,正好和B-DNA大溝的直徑相等,所以能夠和B型DNA緊密結合。
細胞化學基礎α螺旋的結構
α螺旋是一種最常見的二級結構,最先由Linus Pauling和Robert Corey于1951年提出,其主要內容是:①肽鏈骨架圍繞一個軸以螺旋的方式伸展;②螺旋形成是自發的,肽鏈骨架上由n位氨基酸殘基上的-C=O與n+4位殘基上的-NH之間形成的氫鍵起著穩定的作用;被氫鍵封閉的環含有13個原子,
細胞化學基礎β轉角的定義
β-轉角是一種常見的蛋白質二級結構,它通常出現在球狀蛋白表面,因此含有極性和帶電荷的氨基酸殘基。已經發現的蛋白質的抗體識別、磷酸化、糖基化和羥基化位點經常出現在轉角和緊靠轉交。在β-轉角中第一個殘基的C=O與第四個殘基的N-H氫鍵鍵合形成一個緊密的環,使β-轉角成為比較穩定的結構,多處在蛋白質分子的
細胞化學基礎親脂性的概念
親脂性是指一個化合物融解在脂肪、油、脂質或非極性溶劑的能力。這些非極性溶劑本身就親脂,所以這告訴我們"喜歡什么就溶于什么"。因此親脂性的物質就會溶在親脂的溶劑,親水性的物質就會溶于親水性的溶劑內。當我們以倫敦力的角度來看,親脂性、疏水性和非極性可以互相替換,然而,親脂性和疏水性并不是同義字,我們可以
細胞化學基礎腺苷計算化學數據
疏水參數計算參考值(XlogP):無氫鍵供體數量:4氫鍵受體數量:8可旋轉化學鍵數量:2互變異構體數量:3拓撲分子極性表面積:140重原子數量:19表面電荷:0復雜度:335同位素原子數量:0確定原子立構中心數量:4不確定原子立構中心數量:0確定化學鍵立構中心數量:0不確定化學鍵立構中心數量:0
細胞化學基礎腺苷用途
抗心律失常藥,可使陣發性室上性心動過速轉為竇性心律。用于和房室有關的室上心律失常。治療心絞痛、心肌梗塞、冠脈功能不全、動脈硬化、原發性高血壓、腦血管障礙、中風后遺癥、進行性肌肉萎縮等。也可用于生化研究。