中科大院士PNAS解析“垃圾”RNA
來自中國科技大學,英國鄧迪大學的研究人員圍繞一種關鍵小蛋白:Stc 1的結構和功能展開了研究,從中揭示出了裂殖酵母中RNAi與染色質修飾之間的分子作用機制,指出了非編碼RNA的又一重要作用。相關成果公布在《美國國家科學院院刊》(PNAS)雜志上。 文章的通訊作者是中國科技大學生命科學學院施蘊渝院士,以及鄧迪大學Elizabeth H. Bayne,其中施蘊渝院士研究組主要研究興趣包括用多維核磁共振波譜及計算生物學研究與重大疾病或重要生理功能相關的蛋白質結構,動力學與功能關系,以及蛋白質與蛋白質,蛋白質與核酸,蛋白質與小分子配基的相互作用等。 ENCODE項目的研究數據表明,四分之三的人類基因組是能轉錄的,但其中只有最多不過1.5%的能編碼出蛋白,其余的非編碼RNAs(ncRNA)——“垃圾”RNA,包括5'和3'非翻譯區mRNAs,都發揮著表觀遺傳,轉錄和轉錄后基因網絡調控等方面的作用。 研究表明,......閱讀全文
研究發現激酶解鎖異染色質的“遞進修飾”模式
11月24日,《細胞死亡&分化》(Cell Death & Differentiation)在線發表了中國科學院廣州生物醫藥與健康研究院劉興國/裴端卿/陳可實團隊的最新研究成果MAP2K6 Remodels Chromatin and Facilitates Reprogramming by A
研究揭示染色質修飾調控植物基因表達新機制
8月6日,中國科學院分子植物科學卓越創新中心/植物生理生態研究所植物逆境生物學研究中心植物分子遺傳國家重點實驗室何躍輝研究組(與劉仁義研究組合作)和杜嘉木研究組(與美國威斯康辛大學鐘雪花研究組合作)在《自然-遺傳學》背靠背分別發表題為Polycomb-mediated gene silencin
m6A修飾新功能——調控染色質狀態和轉錄活性
m6A是真核生物中最常見的一類化學修飾,能夠在多種生物過程中發揮重要作用,包括癌癥發生發展、細胞分化、壓力應答、免疫反應以及神經發育等方面。目前大部分研究主要探究m6A對蛋白編碼基因的調控——即影響mRNA穩定性或翻譯效率。2020年1月17日,美國芝加哥大學何川,中科院北京基因組研究所韓大力和同濟
莊小威院士:新成像方法測量染色質的表觀遺傳修飾
空間組學方法的最新發展使得單細胞轉錄組分析和三維基因組組織具有較高的空間分辨率。空間分辨單細胞表觀基因組學方法將擴展空間組學工具的知識庫,加速對細胞和組織功能的空間調節的理解。 2022年10月21日,哈佛大學莊小威團隊在Cell 在線發表題為“Spatially resolved epige
染色質修飾如何調控基因表達?-中國學者提出新見解
中科院分子植物科學卓越創新中心/植物生理生態研究所植物逆境生物學研究中心的研究人員最新發表兩篇Nature Genetics文章,利用生化、分子、遺傳、組學及結構生物學等研究方法,分別揭示了植物特有染色質凝縮蛋白EMF1與含BAH結構域的SHL和EBS形成BAH-EMF1復合體而介導植物基因沉默
揭秘m6A修飾新功能----調控染色質狀態和轉錄活性
文章導讀 m6A是真核生物中最常見的一類化學修飾,能夠在多種生物過程中發揮重要作用,包括癌癥發生發展、細胞分化、壓力應答、免疫反應以及神經發育等方面。目前大部分研究主要探究m6A對蛋白編碼基因的調控——即影響mRNA穩定性或翻譯效率。 2020年1月17日,美國芝加哥大學何川,中科院
生命科學:染色質修飾沉默植物基因表達領域獲重要突破
在國家自然科學基金(項目編號:31721001)等資助下,中國科學院上海生命科學研究院植物逆境生物學研究中心何躍輝課題組在染色質修飾沉默植物基因表達領域獲重要突破,發現了植物特有的染色質凝縮蛋白EMF1與含BAH結構域的蛋白形成BAH-EMF1蛋白復合體,以介導高等植物基因沉默的分子機制。研究成
揭秘m6A修飾新功能----調控染色質狀態和轉錄活性
m6A是真核生物中最常見的一類化學修飾,能夠在多種生物過程中發揮重要作用,包括癌癥發生發展、細胞分化、壓力應答、免疫反應以及神經發育等方面。目前大部分研究主要探究m6A對蛋白編碼基因的調控——即影響mRNA穩定性或翻譯效率。 2020年1月17日,美國芝加哥大學何川,中科院北京基因組研究所
陳捷凱課題組發現RNA-m6A修飾調控異染色質形成的新機制
近日,中國科學院廣州生物醫藥與健康研究院研究員陳捷凱課題組發現了RNA m6A修飾調控異染色質形成的新機制,闡明了RNA m6A閱讀器YTHDC1在這一機制中的關鍵作用:抑制基因組中廣泛分布的ERVK、IAP、LINE1等轉座元件限制胚胎干細胞向全能性干細胞轉化,相關研究成果以The RNA m
異染色質和常染色質的結構差異
染色質可以分為兩種類群,異染色質和常染色質。最開始,這兩種形式是通過其在染色之后的顏色深淺區分的,常染色質一般著色較淺,而異染色質著色很深,表明其緊密聚集。異染色質通常集中在細胞核的邊緣區域。然而,不同于這種早期的二分法,最近的研究表明在動物和植物體內都擁有不止這兩種染色體結構,可能會有四到五種,區
常染色質與異染色質的功能差異
常染色質區域的基因可以被轉錄為信使RNA。常染色質區域非折疊的結構允許基因調控蛋白和RNA聚合酶與其上的DNA序列結合,從而開啟轉錄過程。在轉錄過程中,并非所有的常染色質都會被轉錄,但基本上非轉錄的部分會折疊為異染色質以保護暫時其上不用的基因。因此細胞的活性與細胞核中的常染色質數目有直接關系。常染色
多肽熒光標記——FITC修飾和AMC修飾
熒光標記所依賴的化合物稱為熒光物質。熒光物質是指具有共軛雙鍵體系化學結構的化合物,受到紫外光或藍紫光照射時,可激發成為激發態,當從激發態恢復基態時,發出熒光。熒光標記技術指利用熒光物質共價結合或物理吸附在所要研究分子的某個基團上,利用它的熒光特性來提供被研究對象的信息。熒光標記的無放射物污染,操
PEG修飾及其修飾GLP1的意義
PEG修飾是一個使多肽或蛋白質在治療或生物技術方面的效力得以提高的重要過程。當PEG以適當的方式連接在蛋白質或多肽上時,它能改變許多的特征,而主要的生物活性功能,如酶活性或特異結合位點,可以保留下來。PEG修飾通過如下幾種途徑改善藥物的性能。首先,PEG連接在蛋白質或多肽的表面上,提高了它的分子大小
多肽熒光標記——FITC修飾和AMC修飾
熒光標記所依賴的化合物稱為熒光物質。熒光物質是指具有共軛雙鍵體系化學結構的化合物,受到紫外光或藍紫光照射時,可激發成為激發態,當從激發態恢復基態時,發出熒光。熒光標記技術指利用熒光物質共價結合或物理吸附在所要研究分子的某個基團上,利用它的熒光特性來提供被研究對象的信息。熒光標記的無放射物污染,操
異染色質的主要類型組成性異染色質
組成性異染色質,指除S期以外在整個細胞周期均處于聚縮狀態, DNA包裝比基本不變,可構成多個染色中心。
異染色質的主要類型兼性異染色質
在一定時期的特種細胞的細胞核內, 原來的常染色質可轉變成兼性異染色質。如雄性個體的細胞含有一個瘦小的Y染色體和一個大的X染色體, 由于X和Y染色體上很少有共同的基因, 對于雄性來說, X染色體上的基因就只有一個拷貝。雖然雌性細胞有兩條X染色體, 也只有一條具有轉錄活性, 另外一條X染色體像異染色質一
RNA加工修飾
中文名RNA加工修飾所屬領域生物學定義RNA加工修飾,主要加工方式是切斷和堿基修飾,真核生物tRNA前體一般無生物學特性,需要進行加工修飾。
翻譯后修飾
中文名翻譯后修飾外文名Post-translational modification定義翻譯后修飾是指蛋白質在翻譯后的化學修飾。對于大部分的蛋白質來說,這是蛋白質生物合成的較后步驟。
染色質的分類
間期染色質按其形態特征、活性狀態和染色性能區分為兩種類型:常染色質和異染色質。按功能狀態的不同可將染色質分為活性染色質和非活性染色質。
性染色質檢測
實驗方法原理 在間期細胞核中,女性X染色質和男性Y染色質均可用特殊染色法顯示出來。女性的兩個X染色體中的一個,在間期時的染色質呈異固縮(Heteropyconosis),呈深染的小體稱Barr氏體。Barr氏體位于間期細胞核內面,呈三角形或半月形小體,易為碳酸復紅或硫堇等染料著色。正常女性Barr氏
染色質的定義
染色體在細胞周期的間期時DNA的螺旋結構松散,呈網狀或斑塊狀不定形物,即染色質。以濃集狀態存在者,稱異染色質(1~eterochromatin);以分散狀態存在者,稱常染色質(euchromatin)。常染色質染色較淺且均勻,異染色質染色深。性染色質與性染色體(x染色體和Y染色體)有關,稱x染色
多肽熒光標記——FITC修飾和AMC修飾(一)
熒光標記所依賴的化合物稱為熒光物質。熒光物質是指具有共軛雙鍵體系化學結構的化合物,受到紫外光或藍紫光照射時,可激發成為激發態,當從激發態恢復基態時,發出熒光。熒光標記技術指利用熒光物質共價結合或物理吸附在所要研究分子的某個基團上,利用它的熒光特性來提供被研究對象的信息。熒光標記的無放射物污染,操作簡
多肽熒光標記——FITC修飾和AMC修飾(二)
(2)在整條肽中的某個Lys側鏈接入FITC,Lys側鏈為末端為-NH2的四碳直鏈烷基,直接起到了降低空間位阻的作用。這種修飾方式能夠靈活的在整條肽中任何位置進行FITC修飾,而不僅僅局限于末端。我們所采用的FITC修飾多肽的兩種形式,都具有操作簡便,成功率高,容易分離純化等優點。2.AMC修飾7-
染色質重塑的概念
染色質重塑chromatin remodeling :基因表達的復制和重組等過程中,染色質的包裝狀態、核小體中組蛋白以及對應DNA分子會發生改變的分子機理。
異染色質的定義
異染色質分為結構異染色質和功能異染色質兩種類型。結構異染色質是指各類細胞在整個細胞周期內處于凝集狀態的染色質,多定位于著絲粒區、端粒區,含有大量高度重復順序的脫氧核糖核酸(DNA),稱為衛星DNA(satellite DNA)。功能異染色質只在一定細胞類型或在生物一定發育階段凝集,如雌性哺乳動物
概述染色質的成分
通過分離胸腺、肝或其他組織細胞的核,用去垢劑處理后再離心收集染色質進行生化分析,確定染色質的主要成分是DNA和組蛋白,還有非組蛋白及少量RNA。大鼠肝細胞染色質常被當作染色質成分分析模型,其中組蛋白與DNA含量之比近于1:1,非組蛋白與DNA之比是0.6:1,RNA與DNA之比為0.1:1。DN
染色質的發現過程
1879年,W. Flemming提出了染色質(chromatin)這一術語,用以描述細胞核中能被堿性染料強烈著色的物質。1888年,Waldeyer正式提出染色體的命名。經過一個多世紀的研究,人們認識到,染色質和染色體是在細胞周期不同階段可以相互轉變的形態結構。
染色質重組的意義
染色質重組過程中,核小體滑動可能是一種重要機制,它不改變核小體結構,但改變核小體與DNA 的結合位置。實驗證明,這種滑動能被核小體上游的“十字形”結構阻斷。但“滑動”機制并不能解釋所有實驗現象。人們推測,在重組過程中,還有其他機制如核小體可能與DNA 分離,然后核小體經過重排,結構變化后,與DNA
異染色質的功能
關于異染色質的功能,還未深入了解。但以下的幾點是明顯的。 1結構型異染色質可以加強著絲點區,使著絲粒穩定,以確保染色體分離。 2可以隔離和保護重要基因(例如NOR區的18S和28S基因),防止或減少基因突變和交換。 3促進物種分化,同源染色體可通過其異染色質區的重復序列在減數分裂時配對,這
什么是常染色質?
常染色質是染色質(由DNA、RNA和蛋白質組成)的一種松散聚集的形式,這種聚集方式在基因中大量存在,并且相應的片段通常處于活躍的轉錄當中(但并非必要,即常染色質部分不一定都是高表達的序列)。常染色質構成了細胞核基因組中表達最活躍的一部分。 人類基因組中92%為常染色質。